MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014334	GAAA	2	8	50374	50381	75 %	0 %	25 %	0 %	301065182
1002	NC_014334	AAAT	2	8	50415	50422	75 %	25 %	0 %	0 %	301065182
1003	NC_014334	AGG	2	6	50444	50449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065182
1004	NC_014334	AGT	2	6	50505	50510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065182
1005	NC_014334	AAT	2	6	50542	50547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065182
1006	NC_014334	TAA	2	6	50572	50577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065182
1007	NC_014334	TTGAA	2	10	50589	50598	40 %	40 %	20 %	0 %	301065182
1008	NC_014334	CAAA	2	8	50613	50620	75 %	0 %	0 %	25 %	301065182
1009	NC_014334	AAAG	2	8	50671	50678	75 %	0 %	25 %	0 %	301065182
1010	NC_014334	GCA	2	6	50679	50684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065182
1011	NC_014334	ATAAA	2	10	50735	50744	80 %	20 %	0 %	0 %	301065182
1012	NC_014334	TTA	2	6	50866	50871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_014334	T	6	6	50975	50980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_014334	AATAA	2	10	50981	50990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014334	CAAA	2	8	50996	51003	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_014334	A	7	7	51001	51007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014334	T	6	6	51041	51046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014334	T	6	6	51059	51064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_014334	CTT	2	6	51121	51126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065183
1020	NC_014334	TGCTGT	2	12	51127	51138	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	301065183
1021	NC_014334	GTT	2	6	51178	51183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065183
1022	NC_014334	CCG	2	6	51245	51250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065183
1023	NC_014334	TCAAT	2	10	51600	51609	40 %	40 %	0 %	20 %	301065183
1024	NC_014334	CCA	2	6	51620	51625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065183
1025	NC_014334	GCA	2	6	51659	51664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065183
1026	NC_014334	AAC	4	12	51676	51687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065183
1027	NC_014334	T	7	7	51732	51738	0 %	100 %	0 %	0 %	301065183
1028	NC_014334	CTG	2	6	51835	51840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_014334	TA	3	6	51870	51875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014334	AACGC	2	10	51916	51925	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1031	NC_014334	CAA	2	6	51947	51952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_014334	TC	3	6	51985	51990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_014334	A	8	8	52075	52082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_014334	A	6	6	52109	52114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_014334	ATT	2	6	52274	52279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065184
1036	NC_014334	AGGG	2	8	52289	52296	25 %	0 %	75 %	0 %	301065184
1037	NC_014334	ATGAA	2	10	52350	52359	60 %	20 %	20 %	0 %	301065184
1038	NC_014334	A	6	6	52389	52394	100 %	0 %	0 %	0 %	301065184
1039	NC_014334	TAT	2	6	52396	52401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065184
1040	NC_014334	GCT	2	6	52409	52414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065184
1041	NC_014334	ACA	2	6	52576	52581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065184
1042	NC_014334	ATT	2	6	52649	52654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065184
1043	NC_014334	ATT	2	6	52779	52784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065184
1044	NC_014334	A	6	6	52959	52964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_014334	T	6	6	53014	53019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_014334	AGA	2	6	53057	53062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065185
1047	NC_014334	TCAA	2	8	53148	53155	50 %	25 %	0 %	25 %	301065185
1048	NC_014334	GTG	2	6	53254	53259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065185
1049	NC_014334	CTT	2	6	53264	53269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065185
1050	NC_014334	GGC	2	6	53273	53278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065185
1051	NC_014334	TCA	2	6	53320	53325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065185
1052	NC_014334	CGCT	2	8	53343	53350	0 %	25 %	25 %	50 %	301065185
1053	NC_014334	T	8	8	53433	53440	0 %	100 %	0 %	0 %	301065185
1054	NC_014334	AGC	2	6	53443	53448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065185
1055	NC_014334	TTGCT	2	10	53461	53470	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1056	NC_014334	TTA	2	6	53515	53520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065186
1057	NC_014334	CTAT	2	8	53615	53622	25 %	50 %	0 %	25 %	301065186
1058	NC_014334	CCG	2	6	53692	53697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065186
1059	NC_014334	CGG	3	9	53711	53719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065186
1060	NC_014334	ATC	2	6	53779	53784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065186
1061	NC_014334	GTT	2	6	53787	53792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065186
1062	NC_014334	GAA	2	6	53795	53800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065186
1063	NC_014334	CTAG	2	8	53837	53844	25 %	25 %	25 %	25 %	301065186
1064	NC_014334	T	6	6	53848	53853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014334	ACAAA	2	10	53878	53887	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1066	NC_014334	TTCTTT	2	12	53923	53934	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1067	NC_014334	T	7	7	53943	53949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_014334	GCT	2	6	53988	53993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_014334	ATT	2	6	53994	53999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014334	CA	3	6	54000	54005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_014334	GAG	2	6	54009	54014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_014334	T	7	7	54062	54068	0 %	100 %	0 %	0 %	301065187
1073	NC_014334	CA	3	6	54086	54091	50 %	0 %	0 %	50 %	301065187
1074	NC_014334	AGC	2	6	54116	54121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065187
1075	NC_014334	CTT	2	6	54145	54150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065187
1076	NC_014334	CAG	2	6	54284	54289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065187
1077	NC_014334	AAAT	2	8	54464	54471	75 %	25 %	0 %	0 %	301065187
1078	NC_014334	TTTCT	2	10	54512	54521	0 %	80 %	0 %	20 %	301065187
1079	NC_014334	ACA	2	6	54816	54821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065187
1080	NC_014334	CT	3	6	54857	54862	0 %	50 %	0 %	50 %	301065187
1081	NC_014334	TGT	2	6	54875	54880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065187
1082	NC_014334	GAT	2	6	54893	54898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065187
1083	NC_014334	TCGTT	2	10	54909	54918	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1084	NC_014334	GGAG	2	8	54980	54987	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_014334	T	6	6	55115	55120	0 %	100 %	0 %	0 %	301065188
1086	NC_014334	ATG	2	6	55129	55134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065188
1087	NC_014334	T	6	6	55179	55184	0 %	100 %	0 %	0 %	301065188
1088	NC_014334	ATT	2	6	55193	55198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065188
1089	NC_014334	TGAT	2	8	55238	55245	25 %	50 %	25 %	0 %	301065188
1090	NC_014334	CAAA	2	8	55299	55306	75 %	0 %	0 %	25 %	301065188
1091	NC_014334	ATG	2	6	55337	55342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065188
1092	NC_014334	TGC	2	6	55428	55433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065188
1093	NC_014334	TTCTT	2	10	55460	55469	0 %	80 %	0 %	20 %	301065188
1094	NC_014334	CGA	2	6	55523	55528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065188
1095	NC_014334	GCA	2	6	55549	55554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065188
1096	NC_014334	TTA	2	6	55597	55602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065188
1097	NC_014334	AAAT	2	8	55608	55615	75 %	25 %	0 %	0 %	301065188
1098	NC_014334	A	6	6	55651	55656	100 %	0 %	0 %	0 %	301065188
1099	NC_014334	AGC	2	6	55713	55718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065188
1100	NC_014334	TCT	2	6	55727	55732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065188
1101	NC_014334	GTA	2	6	55811	55816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065188
1102	NC_014334	TGC	2	6	55818	55823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065188
1103	NC_014334	ATG	2	6	55856	55861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065188
1104	NC_014334	ATT	2	6	55887	55892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065188
1105	NC_014334	GGT	2	6	55974	55979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065188
1106	NC_014334	GAG	2	6	56042	56047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065188
1107	NC_014334	TGA	2	6	56145	56150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065188
1108	NC_014334	ATGACA	2	12	56167	56178	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	301065188
1109	NC_014334	TATT	2	8	56218	56225	25 %	75 %	0 %	0 %	301065188
1110	NC_014334	ACA	2	6	56243	56248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065188
1111	NC_014334	GGC	2	6	56371	56376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065188
1112	NC_014334	TTAGCA	2	12	56389	56400	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	301065188
1113	NC_014334	TTG	2	6	56432	56437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065188
1114	NC_014334	TTGA	2	8	56515	56522	25 %	50 %	25 %	0 %	301065188
1115	NC_014334	TCA	2	6	56529	56534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065188
1116	NC_014334	TGAT	2	8	56570	56577	25 %	50 %	25 %	0 %	301065188
1117	NC_014334	A	6	6	56627	56632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_014334	A	7	7	56679	56685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014334	TTG	2	6	56707	56712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014334	ATT	2	6	56755	56760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_014334	TGAA	2	8	56794	56801	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014334	TGAA	2	8	56836	56843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014334	CAT	2	6	56883	56888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_014334	GCT	2	6	56930	56935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065189
1125	NC_014334	CTG	2	6	56938	56943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065189
1126	NC_014334	CCGC	2	8	56946	56953	0 %	0 %	25 %	75 %	301065189
1127	NC_014334	CAA	2	6	56967	56972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065189
1128	NC_014334	ACCG	2	8	57034	57041	25 %	0 %	25 %	50 %	301065189
1129	NC_014334	GA	3	6	57042	57047	50 %	0 %	50 %	0 %	301065189
1130	NC_014334	TTG	2	6	57106	57111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065189
1131	NC_014334	TGG	2	6	57254	57259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065189
1132	NC_014334	CGA	2	6	57285	57290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065189
1133	NC_014334	GCC	2	6	57349	57354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065189
1134	NC_014334	CCG	2	6	57366	57371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065189
1135	NC_014334	GCA	2	6	57390	57395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065189
1136	NC_014334	GGCC	2	8	57402	57409	0 %	0 %	50 %	50 %	301065189
1137	NC_014334	AAG	2	6	57491	57496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065189
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1141	NC_014334	AGC	3	9	57692	57700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065189
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1144	NC_014334	ATA	2	6	57823	57828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065189
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1148	NC_014334	CAT	2	6	58349	58354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1149	NC_014334	GCA	2	6	58355	58360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1150	NC_014334	CTG	2	6	58369	58374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1151	NC_014334	A	7	7	58389	58395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1152	NC_014334	GCT	2	6	58446	58451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1153	NC_014334	TAA	2	6	58452	58457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1154	NC_014334	GTTA	2	8	58485	58492	25 %	50 %	25 %	0 %	301065190
1155	NC_014334	CCA	2	6	58500	58505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065190
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1162	NC_014334	CTG	2	6	58846	58851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1163	NC_014334	ATC	2	6	58898	58903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1164	NC_014334	A	6	6	58934	58939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1165	NC_014334	A	6	6	58958	58963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1166	NC_014334	CTG	2	6	59014	59019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1167	NC_014334	GAA	2	6	59067	59072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1168	NC_014334	AC	3	6	59083	59088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1169	NC_014334	ATT	2	6	59094	59099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1170	NC_014334	CAA	2	6	59141	59146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1171	NC_014334	T	6	6	59165	59170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1172	NC_014334	TTA	2	6	59224	59229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1173	NC_014334	TTC	2	6	59281	59286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1174	NC_014334	ATT	3	9	59320	59328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1175	NC_014334	A	6	6	59368	59373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1176	NC_014334	T	6	6	59407	59412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1177	NC_014334	CTG	2	6	59473	59478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1179	NC_014334	A	6	6	59562	59567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1180	NC_014334	T	7	7	59655	59661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1250	NC_014334	TCT	2	6	62900	62905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065194
1251	NC_014334	TTAA	2	8	62945	62952	50 %	50 %	0 %	0 %	301065194
1252	NC_014334	TGGC	2	8	62993	63000	0 %	25 %	50 %	25 %	301065194
1253	NC_014334	GCTG	2	8	63159	63166	0 %	25 %	50 %	25 %	301065194
1254	NC_014334	TTG	2	6	63286	63291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065194
1255	NC_014334	TGC	2	6	63294	63299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065194
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1257	NC_014334	AGGT	2	8	63491	63498	25 %	25 %	50 %	0 %	301065194
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1259	NC_014334	GTT	2	6	63566	63571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065194
1260	NC_014334	AAT	2	6	63591	63596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065194
1261	NC_014334	GTT	2	6	63655	63660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065194
1262	NC_014334	TTGG	2	8	63673	63680	0 %	50 %	50 %	0 %	301065194
1263	NC_014334	GAT	2	6	63703	63708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065194
1264	NC_014334	TGA	2	6	63726	63731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065194
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1275	NC_014334	AATGAA	2	12	64255	64266	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	301065194
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1278	NC_014334	CAGT	2	8	64581	64588	25 %	25 %	25 %	25 %	301065194
1279	NC_014334	T	6	6	64588	64593	0 %	100 %	0 %	0 %	301065194
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1283	NC_014334	CT	3	6	64676	64681	0 %	50 %	0 %	50 %	301065194
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1291	NC_014334	CAGTT	2	10	65112	65121	20 %	40 %	20 %	20 %	301065195
1292	NC_014334	ATG	2	6	65233	65238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065195
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1298	NC_014334	AAG	2	6	65537	65542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1299	NC_014334	A	8	8	65575	65582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1300	NC_014334	CCA	2	6	65583	65588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1301	NC_014334	TGG	2	6	65601	65606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1302	NC_014334	ACA	2	6	65633	65638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1303	NC_014334	CTC	2	6	65743	65748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065196
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1350	NC_014334	CATGCC	2	12	68021	68032	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	301065199
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1352	NC_014334	ATCA	2	8	68042	68049	50 %	25 %	0 %	25 %	301065199
1353	NC_014334	AGC	2	6	68100	68105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065199
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1369	NC_014334	ATCAGA	2	12	69134	69145	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	301065200
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1374	NC_014334	TTC	2	6	69283	69288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065200
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1377	NC_014334	ATC	2	6	69467	69472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065200
1378	NC_014334	GACA	2	8	69513	69520	50 %	0 %	25 %	25 %	301065200
1379	NC_014334	GTT	2	6	69612	69617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065200
1380	NC_014334	TCC	2	6	69636	69641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1381	NC_014334	GTT	2	6	69704	69709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1382	NC_014334	TTCA	2	8	69734	69741	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1383	NC_014334	AG	3	6	69750	69755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1384	NC_014334	CAT	2	6	69797	69802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1385	NC_014334	AAT	2	6	69836	69841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1386	NC_014334	TGT	2	6	69993	69998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1387	NC_014334	ACAA	2	8	70086	70093	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1388	NC_014334	TGC	2	6	70113	70118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1392	NC_014334	GT	3	6	70210	70215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1496	NC_014334	CTAC	2	8	74974	74981	25 %	25 %	0 %	50 %	301065207
1497	NC_014334	CGG	2	6	74997	75002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065207
1498	NC_014334	AAC	2	6	75058	75063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065207
1499	NC_014334	T	6	6	75194	75199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1500	NC_014334	AAG	2	6	75269	75274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065208

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