MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014334	GAA	2	6	720470	720475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065829
14002	NC_014334	ATA	2	6	720480	720485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065829
14003	NC_014334	AAC	2	6	720492	720497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065829
14004	NC_014334	AGA	2	6	720571	720576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065829
14005	NC_014334	T	7	7	720647	720653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_014334	T	6	6	720709	720714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_014334	A	7	7	720746	720752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_014334	A	7	7	720776	720782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_014334	ACA	3	9	720817	720825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_014334	A	6	6	720851	720856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_014334	ATG	2	6	720894	720899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_014334	A	6	6	720919	720924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_014334	GATC	2	8	721068	721075	25 %	25 %	25 %	25 %	301065830
14014	NC_014334	ATC	2	6	721109	721114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065830
14015	NC_014334	GAA	2	6	721198	721203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065830
14016	NC_014334	TCAA	2	8	721213	721220	50 %	25 %	0 %	25 %	301065830
14017	NC_014334	AAC	2	6	721222	721227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065830
14018	NC_014334	ACAA	2	8	721253	721260	75 %	0 %	0 %	25 %	301065830
14019	NC_014334	GCGT	2	8	721419	721426	0 %	25 %	50 %	25 %	301065830
14020	NC_014334	TGA	2	6	721440	721445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065830
14021	NC_014334	AT	3	6	721482	721487	50 %	50 %	0 %	0 %	301065830
14022	NC_014334	TCA	2	6	721588	721593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065830
14023	NC_014334	ATT	2	6	721735	721740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065830
14024	NC_014334	GAT	2	6	721756	721761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065830
14025	NC_014334	GAA	2	6	721764	721769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065830
14026	NC_014334	GAA	2	6	721815	721820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065830
14027	NC_014334	CGG	2	6	722070	722075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065830
14028	NC_014334	TGA	3	9	722106	722114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065830
14029	NC_014334	AC	3	6	722165	722170	50 %	0 %	0 %	50 %	301065830
14030	NC_014334	TCT	2	6	722173	722178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065830
14031	NC_014334	CGG	2	6	722181	722186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065830
14032	NC_014334	GGT	2	6	722245	722250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065830
14033	NC_014334	CGC	2	6	722311	722316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065830
14034	NC_014334	CCA	2	6	722341	722346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065830
14035	NC_014334	CGG	3	9	722598	722606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065830
14036	NC_014334	TGC	2	6	722619	722624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065830
14037	NC_014334	TTC	2	6	722665	722670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065830
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14039	NC_014334	CAGT	2	8	722871	722878	25 %	25 %	25 %	25 %	301065830
14040	NC_014334	ATG	2	6	723068	723073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065830
14041	NC_014334	GAA	2	6	723225	723230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065830
14042	NC_014334	GC	3	6	723231	723236	0 %	0 %	50 %	50 %	301065830
14043	NC_014334	TCGC	2	8	723287	723294	0 %	25 %	25 %	50 %	301065830
14044	NC_014334	TGA	2	6	723321	723326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065830
14045	NC_014334	TCA	2	6	723353	723358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065830
14046	NC_014334	CAAG	2	8	723426	723433	50 %	0 %	25 %	25 %	301065830
14047	NC_014334	ATC	2	6	723517	723522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065830
14048	NC_014334	TGA	2	6	723525	723530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065830
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14050	NC_014334	T	7	7	723657	723663	0 %	100 %	0 %	0 %	301065831
14051	NC_014334	GGC	2	6	723766	723771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065832
14052	NC_014334	TAA	2	6	723789	723794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065832
14053	NC_014334	CTG	2	6	723821	723826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065832
14054	NC_014334	GAT	2	6	723840	723845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065832
14055	NC_014334	CAA	2	6	723846	723851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065832
14056	NC_014334	GAA	2	6	723859	723864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065832
14057	NC_014334	GGC	2	6	723924	723929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065832
14058	NC_014334	ATC	2	6	723944	723949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065832
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14060	NC_014334	CGG	2	6	724095	724100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065832
14061	NC_014334	CAA	2	6	724132	724137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065832
14062	NC_014334	TGAT	2	8	724193	724200	25 %	50 %	25 %	0 %	301065832
14063	NC_014334	TTGA	2	8	724210	724217	25 %	50 %	25 %	0 %	301065832
14064	NC_014334	GAT	2	6	724246	724251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065832
14065	NC_014334	ATC	2	6	724288	724293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065832
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14068	NC_014334	CGT	2	6	724488	724493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065833
14069	NC_014334	GCG	2	6	724532	724537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065833
14070	NC_014334	GAT	2	6	724548	724553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065833
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14072	NC_014334	GAT	2	6	724590	724595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065833
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14074	NC_014334	CATTA	2	10	724668	724677	40 %	40 %	0 %	20 %	301065833
14075	NC_014334	TGG	2	6	724721	724726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065833
14076	NC_014334	CATGGC	2	12	724742	724753	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	301065833
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14078	NC_014334	ATTA	2	8	724826	724833	50 %	50 %	0 %	0 %	301065833
14079	NC_014334	TGA	3	9	724901	724909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065833
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14081	NC_014334	TAT	2	6	725073	725078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065833
14082	NC_014334	TGCG	2	8	725251	725258	0 %	25 %	50 %	25 %	301065833
14083	NC_014334	AAG	3	9	725308	725316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065833
14084	NC_014334	GCA	2	6	725322	725327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065833
14085	NC_014334	CTGACA	2	12	725442	725453	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	301065833
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14087	NC_014334	GCT	3	9	725631	725639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065833
14088	NC_014334	AAT	2	6	725664	725669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065833
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14090	NC_014334	AGC	2	6	725807	725812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065833
14091	NC_014334	GCC	2	6	725836	725841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065833
14092	NC_014334	GGT	2	6	725921	725926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_014334	T	6	6	725935	725940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_014334	GGT	2	6	725988	725993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_014334	AGAA	2	8	726044	726051	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_014334	AACAG	2	10	726053	726062	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14097	NC_014334	TCAT	2	8	726132	726139	25 %	50 %	0 %	25 %	301065834
14098	NC_014334	GTA	2	6	726195	726200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065834
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14102	NC_014334	CAAG	2	8	726580	726587	50 %	0 %	25 %	25 %	301065834
14103	NC_014334	TAT	2	6	726642	726647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065834
14104	NC_014334	GAT	2	6	726758	726763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065834
14105	NC_014334	GAAC	2	8	726866	726873	50 %	0 %	25 %	25 %	301065834
14106	NC_014334	GTG	2	6	726980	726985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065834
14107	NC_014334	TCA	2	6	727008	727013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065834
14108	NC_014334	CAAA	2	8	727016	727023	75 %	0 %	0 %	25 %	301065834
14109	NC_014334	ACT	2	6	727041	727046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065834
14110	NC_014334	TGCT	2	8	727208	727215	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14111	NC_014334	TAAT	2	8	727251	727258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_014334	TCA	2	6	727346	727351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14113	NC_014334	AAG	2	6	727518	727523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065835
14114	NC_014334	CGA	2	6	727615	727620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065835
14115	NC_014334	TTGAT	2	10	727696	727705	20 %	60 %	20 %	0 %	301065835
14116	NC_014334	TGA	2	6	727816	727821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065835
14117	NC_014334	AGA	2	6	727859	727864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065835
14118	NC_014334	TGC	2	6	727868	727873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065835
14119	NC_014334	GCG	2	6	727905	727910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065835
14120	NC_014334	GAT	2	6	727926	727931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065835
14121	NC_014334	CAG	2	6	727932	727937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065835
14122	NC_014334	CGGT	2	8	728089	728096	0 %	25 %	50 %	25 %	301065835
14123	NC_014334	ATT	2	6	728098	728103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065835
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14127	NC_014334	CTG	2	6	728266	728271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065835
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14131	NC_014334	GCTG	2	8	728534	728541	0 %	25 %	50 %	25 %	301065835
14132	NC_014334	GCG	2	6	728585	728590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065835
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14149	NC_014334	GGC	2	6	729299	729304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065836
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14157	NC_014334	GGT	2	6	729561	729566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065836
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14161	NC_014334	GGT	2	6	729630	729635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065836
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14231	NC_014334	CCT	2	6	733886	733891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065839
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14233	NC_014334	CA	3	6	734176	734181	50 %	0 %	0 %	50 %	301065839
14234	NC_014334	CA	4	8	734227	734234	50 %	0 %	0 %	50 %	301065839
14235	NC_014334	GGCT	2	8	734238	734245	0 %	25 %	50 %	25 %	301065839
14236	NC_014334	GAAA	2	8	734370	734377	75 %	0 %	25 %	0 %	301065839
14237	NC_014334	A	6	6	734395	734400	100 %	0 %	0 %	0 %	301065839
14238	NC_014334	TGCGAT	2	12	734406	734417	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	301065839
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14241	NC_014334	TCG	2	6	734562	734567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065839
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14353	NC_014334	GCT	2	6	740980	740985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14355	NC_014334	AATG	2	8	741088	741095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14356	NC_014334	TAAA	2	8	741098	741105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14357	NC_014334	CAT	2	6	741118	741123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065848
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14359	NC_014334	T	6	6	741171	741176	0 %	100 %	0 %	0 %	301065848
14360	NC_014334	TAA	2	6	741238	741243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065848
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14362	NC_014334	CGAT	2	8	741361	741368	25 %	25 %	25 %	25 %	301065849
14363	NC_014334	CGC	2	6	741374	741379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065849
14364	NC_014334	CG	3	6	741391	741396	0 %	0 %	50 %	50 %	301065849
14365	NC_014334	CA	3	6	741416	741421	50 %	0 %	0 %	50 %	301065849
14366	NC_014334	AAG	2	6	741442	741447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065849
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14368	NC_014334	GCAT	2	8	741566	741573	25 %	25 %	25 %	25 %	301065849
14369	NC_014334	ATC	2	6	741645	741650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065849
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14372	NC_014334	ATT	2	6	741783	741788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065849
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14380	NC_014334	TGA	2	6	742381	742386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065849
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14392	NC_014334	GTT	2	6	743182	743187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065850
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14482	NC_014334	TGAGGC	2	12	747535	747546	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	301065854
14483	NC_014334	CTG	2	6	747648	747653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065854
14484	NC_014334	GAG	2	6	747722	747727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065854
14485	NC_014334	GAT	2	6	747785	747790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065854
14486	NC_014334	GAT	2	6	747917	747922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065854
14487	NC_014334	TAC	2	6	747940	747945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065854
14488	NC_014334	TGCT	2	8	747951	747958	0 %	50 %	25 %	25 %	301065854
14489	NC_014334	ATC	2	6	747966	747971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065854
14490	NC_014334	TGG	2	6	747984	747989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065854
14491	NC_014334	T	6	6	748061	748066	0 %	100 %	0 %	0 %	301065854
14492	NC_014334	GAA	2	6	748106	748111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065854
14493	NC_014334	A	7	7	748110	748116	100 %	0 %	0 %	0 %	301065854
14494	NC_014334	GA	3	6	748226	748231	50 %	0 %	50 %	0 %	301065855
14495	NC_014334	ACA	2	6	748251	748256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065855
14496	NC_014334	TGA	2	6	748305	748310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065855
14497	NC_014334	CAG	2	6	748321	748326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065855
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14499	NC_014334	GCT	2	6	748462	748467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065855
14500	NC_014334	CTGAT	2	10	748484	748493	20 %	40 %	20 %	20 %	301065855

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