MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014334	ACC	2	6	670184	670189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065771
13002	NC_014334	CG	3	6	670215	670220	0 %	0 %	50 %	50 %	301065771
13003	NC_014334	AAG	2	6	670359	670364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065771
13004	NC_014334	TAT	2	6	670369	670374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065771
13005	NC_014334	CTG	2	6	670416	670421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065771
13006	NC_014334	GGC	2	6	670553	670558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065771
13007	NC_014334	TGA	2	6	670575	670580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065771
13008	NC_014334	ATC	2	6	670587	670592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065771
13009	NC_014334	GCA	2	6	670633	670638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065771
13010	NC_014334	GTTT	2	8	670656	670663	0 %	75 %	25 %	0 %	301065771
13011	NC_014334	ATT	2	6	670730	670735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065771
13012	NC_014334	TGA	2	6	670756	670761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065771
13013	NC_014334	GCG	2	6	670769	670774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065771
13014	NC_014334	GCC	2	6	670818	670823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065771
13015	NC_014334	ATC	2	6	670881	670886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065771
13016	NC_014334	TGG	2	6	670906	670911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065771
13017	NC_014334	CGGC	2	8	670972	670979	0 %	0 %	50 %	50 %	301065771
13018	NC_014334	CGG	2	6	671002	671007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065771
13019	NC_014334	GCAGAT	2	12	671101	671112	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	301065771
13020	NC_014334	T	7	7	671166	671172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_014334	GAT	3	9	671186	671194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_014334	AAC	2	6	671211	671216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_014334	A	6	6	671217	671222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_014334	AAT	2	6	671273	671278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_014334	ATGCT	2	10	671337	671346	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13026	NC_014334	AAGC	2	8	671365	671372	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13027	NC_014334	GTCC	2	8	671410	671417	0 %	25 %	25 %	50 %	301065772
13028	NC_014334	ATA	2	6	671433	671438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065772
13029	NC_014334	CGC	2	6	671486	671491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065772
13030	NC_014334	TGAT	2	8	671502	671509	25 %	50 %	25 %	0 %	301065772
13031	NC_014334	TG	3	6	671544	671549	0 %	50 %	50 %	0 %	301065772
13032	NC_014334	CA	3	6	671669	671674	50 %	0 %	0 %	50 %	301065772
13033	NC_014334	CAACC	2	10	671699	671708	40 %	0 %	0 %	60 %	301065772
13034	NC_014334	CGC	2	6	671716	671721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065772
13035	NC_014334	TAT	2	6	671785	671790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065772
13036	NC_014334	CCT	2	6	671802	671807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065772
13037	NC_014334	TGA	2	6	671878	671883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065772
13038	NC_014334	GTTCC	2	10	671884	671893	0 %	40 %	20 %	40 %	301065772
13039	NC_014334	ATG	2	6	671903	671908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065772
13040	NC_014334	CAT	2	6	671936	671941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065772
13041	NC_014334	CTTG	2	8	671950	671957	0 %	50 %	25 %	25 %	301065772
13042	NC_014334	CTT	2	6	671986	671991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065772
13043	NC_014334	ATT	2	6	672000	672005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065772
13044	NC_014334	ATT	2	6	672068	672073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065772
13045	NC_014334	GTC	2	6	672098	672103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065772
13046	NC_014334	TGA	2	6	672178	672183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065772
13047	NC_014334	GGC	2	6	672222	672227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065772
13048	NC_014334	TCA	2	6	672232	672237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065772
13049	NC_014334	GTTTG	2	10	672271	672280	0 %	60 %	40 %	0 %	301065772
13050	NC_014334	AGG	2	6	672300	672305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065772
13051	NC_014334	ATG	2	6	672372	672377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065772
13052	NC_014334	GAA	2	6	672388	672393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065772
13053	NC_014334	CGC	2	6	672496	672501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065772
13054	NC_014334	TCA	2	6	672549	672554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065772
13055	NC_014334	CTT	2	6	672598	672603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065772
13056	NC_014334	TTC	2	6	672683	672688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13057	NC_014334	CTGC	2	8	672750	672757	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13058	NC_014334	AGA	2	6	672828	672833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_014334	CCT	2	6	672871	672876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13060	NC_014334	CATGC	2	10	672878	672887	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13061	NC_014334	CCT	2	6	672965	672970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13062	NC_014334	CTG	2	6	673044	673049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_014334	AGA	2	6	673076	673081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_014334	ATG	2	6	673159	673164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065773
13065	NC_014334	ATG	2	6	673183	673188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065773
13066	NC_014334	AAG	2	6	673233	673238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065773
13067	NC_014334	GAT	2	6	673242	673247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065773
13068	NC_014334	TGA	2	6	673309	673314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065773
13069	NC_014334	TG	3	6	673319	673324	0 %	50 %	50 %	0 %	301065773
13070	NC_014334	AAT	2	6	673334	673339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065773
13071	NC_014334	TCA	2	6	673351	673356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065773
13072	NC_014334	AAT	2	6	673421	673426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065773
13073	NC_014334	GAT	2	6	673440	673445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065773
13074	NC_014334	ATG	2	6	673528	673533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065773
13075	NC_014334	GA	3	6	673542	673547	50 %	0 %	50 %	0 %	301065773
13076	NC_014334	ATA	2	6	673561	673566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065773
13077	NC_014334	GGT	2	6	673608	673613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065773
13078	NC_014334	TTG	2	6	673615	673620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065773
13079	NC_014334	GCT	2	6	673661	673666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065773
13080	NC_014334	T	7	7	673666	673672	0 %	100 %	0 %	0 %	301065773
13081	NC_014334	GCTG	2	8	673673	673680	0 %	25 %	50 %	25 %	301065773
13082	NC_014334	GCC	2	6	673689	673694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065773
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13084	NC_014334	AGGC	2	8	673778	673785	25 %	0 %	50 %	25 %	301065773
13085	NC_014334	GCAAA	2	10	673803	673812	60 %	0 %	20 %	20 %	301065773
13086	NC_014334	TCC	2	6	673900	673905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065773
13087	NC_014334	TGT	3	9	673929	673937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065773
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13089	NC_014334	CTT	2	6	674021	674026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065773
13090	NC_014334	CAA	2	6	674043	674048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065773
13091	NC_014334	TAA	2	6	674056	674061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065773
13092	NC_014334	TAGG	2	8	674139	674146	25 %	25 %	50 %	0 %	301065773
13093	NC_014334	TCC	2	6	674170	674175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13094	NC_014334	GCT	2	6	674244	674249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065774
13095	NC_014334	ATA	2	6	674288	674293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065774
13096	NC_014334	ATC	2	6	674330	674335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065774
13097	NC_014334	GTT	2	6	674379	674384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065774
13098	NC_014334	CAT	2	6	674482	674487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065774
13099	NC_014334	CCTC	2	8	674526	674533	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13100	NC_014334	GTAAA	2	10	674625	674634	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_014334	A	6	6	674632	674637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_014334	TTA	2	6	674676	674681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065775
13103	NC_014334	TGA	2	6	674696	674701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065775
13104	NC_014334	GAT	2	6	674739	674744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065775
13105	NC_014334	ATC	2	6	674803	674808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065775
13106	NC_014334	GAT	2	6	674856	674861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065775
13107	NC_014334	ACAT	2	8	674878	674885	50 %	25 %	0 %	25 %	301065775
13108	NC_014334	CCT	2	6	674993	674998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13109	NC_014334	AAG	2	6	675069	675074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_014334	AGG	2	6	675128	675133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_014334	AAG	2	6	675183	675188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065776
13112	NC_014334	ATG	2	6	675242	675247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065776
13113	NC_014334	AAC	2	6	675264	675269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065776
13114	NC_014334	ATG	2	6	675285	675290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065776
13115	NC_014334	TTGCGC	2	12	675293	675304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065776
13116	NC_014334	T	6	6	675476	675481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_014334	AAC	2	6	675520	675525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065777
13118	NC_014334	TTGAT	2	10	675617	675626	20 %	60 %	20 %	0 %	301065777
13119	NC_014334	AAC	2	6	675742	675747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065777
13120	NC_014334	CAA	2	6	675774	675779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065777
13121	NC_014334	GCT	2	6	675818	675823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065777
13122	NC_014334	GTG	2	6	675921	675926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065777
13123	NC_014334	AGC	2	6	675944	675949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065777
13124	NC_014334	GAT	2	6	675954	675959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065777
13125	NC_014334	T	6	6	675959	675964	0 %	100 %	0 %	0 %	301065777
13126	NC_014334	CGC	2	6	676029	676034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065777
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13130	NC_014334	GT	3	6	676234	676239	0 %	50 %	50 %	0 %	301065777
13131	NC_014334	CAT	2	6	676317	676322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065777
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13133	NC_014334	T	8	8	676595	676602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13134	NC_014334	TGA	2	6	676658	676663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065778
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13142	NC_014334	TGAT	2	8	677024	677031	25 %	50 %	25 %	0 %	301065779
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13176	NC_014334	GATT	2	8	679207	679214	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13181	NC_014334	GAG	2	6	679402	679407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13187	NC_014334	T	6	6	679651	679656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13188	NC_014334	CGTT	2	8	679684	679691	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13214	NC_014334	GAT	3	9	680879	680887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065784
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13230	NC_014334	TCAAA	2	10	681445	681454	60 %	20 %	0 %	20 %	301065785
13231	NC_014334	A	6	6	681505	681510	100 %	0 %	0 %	0 %	301065785
13232	NC_014334	TGG	2	6	681511	681516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065785
13233	NC_014334	GTA	2	6	681527	681532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065785
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13235	NC_014334	A	6	6	681611	681616	100 %	0 %	0 %	0 %	301065785
13236	NC_014334	ATC	2	6	681693	681698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065785
13237	NC_014334	GCA	2	6	681736	681741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065785
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13240	NC_014334	GCC	2	6	681962	681967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065786
13241	NC_014334	CTGC	2	8	682187	682194	0 %	25 %	25 %	50 %	301065786
13242	NC_014334	TCAA	2	8	682237	682244	50 %	25 %	0 %	25 %	301065786
13243	NC_014334	AAC	2	6	682323	682328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065786
13244	NC_014334	GC	3	6	682338	682343	0 %	0 %	50 %	50 %	301065786
13245	NC_014334	ACA	2	6	682400	682405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065786
13246	NC_014334	TGA	2	6	682454	682459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065786
13247	NC_014334	GAT	2	6	682503	682508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065786
13248	NC_014334	GCCA	2	8	682512	682519	25 %	0 %	25 %	50 %	301065786
13249	NC_014334	CG	3	6	682537	682542	0 %	0 %	50 %	50 %	301065786
13250	NC_014334	CGG	2	6	682550	682555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065786
13251	NC_014334	TCC	2	6	682577	682582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13252	NC_014334	TCA	2	6	682639	682644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065787
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13254	NC_014334	GGC	2	6	682689	682694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065787
13255	NC_014334	CAT	2	6	682708	682713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065787
13256	NC_014334	CAT	2	6	682718	682723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065787
13257	NC_014334	GTCA	2	8	682728	682735	25 %	25 %	25 %	25 %	301065787
13258	NC_014334	T	6	6	682743	682748	0 %	100 %	0 %	0 %	301065787
13259	NC_014334	TCA	2	6	682753	682758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065787
13260	NC_014334	T	6	6	682816	682821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13261	NC_014334	GCT	2	6	682863	682868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065788
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13268	NC_014334	GCT	2	6	683073	683078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065788
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13272	NC_014334	GTT	2	6	683223	683228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065788
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13280	NC_014334	TAACC	2	10	683825	683834	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13281	NC_014334	GGT	2	6	683930	683935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065789
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13301	NC_014334	TAA	2	6	684824	684829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13302	NC_014334	CGA	2	6	685076	685081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065791
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13327	NC_014334	CGTC	2	8	685970	685977	0 %	25 %	25 %	50 %	301065792
13328	NC_014334	GGCC	2	8	686017	686024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13329	NC_014334	TGACA	2	10	686111	686120	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13330	NC_014334	TGC	2	6	686152	686157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065793
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13350	NC_014334	CTGCT	2	10	686928	686937	0 %	40 %	20 %	40 %	301065793
13351	NC_014334	GT	3	6	686990	686995	0 %	50 %	50 %	0 %	301065793
13352	NC_014334	AGA	2	6	687033	687038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13353	NC_014334	CTG	2	6	687080	687085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13354	NC_014334	CTG	2	6	687122	687127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13355	NC_014334	AGA	2	6	687131	687136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13356	NC_014334	GCTG	2	8	687167	687174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13357	NC_014334	GCA	2	6	687201	687206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13358	NC_014334	TCGCAG	2	12	687316	687327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13359	NC_014334	ATT	2	6	687469	687474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065794
13360	NC_014334	CCA	2	6	687550	687555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065794
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13362	NC_014334	AAGC	2	8	687583	687590	50 %	0 %	25 %	25 %	301065794
13363	NC_014334	TGA	2	6	687641	687646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065794
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13482	NC_014334	ACAGC	2	10	693431	693440	40 %	0 %	20 %	40 %	301065799
13483	NC_014334	GCG	2	6	693461	693466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065799
13484	NC_014334	GAT	2	6	693514	693519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065799
13485	NC_014334	GCT	2	6	693637	693642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065799
13486	NC_014334	GCT	2	6	693646	693651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065799
13487	NC_014334	AGC	2	6	693670	693675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065799
13488	NC_014334	A	6	6	693712	693717	100 %	0 %	0 %	0 %	301065799
13489	NC_014334	TGA	2	6	693772	693777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065799
13490	NC_014334	GCT	3	9	693836	693844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065799
13491	NC_014334	CAC	2	6	693858	693863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065799
13492	NC_014334	CAT	2	6	694076	694081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065799
13493	NC_014334	ATG	2	6	694255	694260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13494	NC_014334	AAT	2	6	694338	694343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065800
13495	NC_014334	GGC	2	6	694386	694391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065800
13496	NC_014334	AGC	3	9	694422	694430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065800
13497	NC_014334	TGAG	2	8	694439	694446	25 %	25 %	50 %	0 %	301065800
13498	NC_014334	TTG	2	6	694494	694499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065800
13499	NC_014334	CTT	2	6	694607	694612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065800
13500	NC_014334	CGC	2	6	694671	694676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065800

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