MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_014334	GTC	2	6	620283	620288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065717
12003	NC_014334	TGGT	2	8	620358	620365	0 %	50 %	50 %	0 %	301065717
12004	NC_014334	GTA	2	6	620373	620378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065717
12005	NC_014334	TTA	2	6	620385	620390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065717
12006	NC_014334	TTTA	2	8	620480	620487	25 %	75 %	0 %	0 %	301065717
12007	NC_014334	TAT	2	6	620588	620593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065717
12008	NC_014334	CAG	2	6	620618	620623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065717
12009	NC_014334	GAC	2	6	620647	620652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065717
12010	NC_014334	CGG	2	6	620707	620712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065717
12011	NC_014334	TGG	2	6	620718	620723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065717
12012	NC_014334	TCG	2	6	620732	620737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065717
12013	NC_014334	GAT	2	6	620751	620756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065717
12014	NC_014334	AG	3	6	620769	620774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12015	NC_014334	CA	3	6	620787	620792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12016	NC_014334	CTG	2	6	620821	620826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12017	NC_014334	A	7	7	620883	620889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12018	NC_014334	GGC	2	6	620987	620992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12019	NC_014334	ATGAAA	2	12	621015	621026	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	301065718
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12021	NC_014334	A	6	6	621122	621127	100 %	0 %	0 %	0 %	301065718
12022	NC_014334	CAC	2	6	621148	621153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065718
12023	NC_014334	TGC	2	6	621295	621300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065718
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12028	NC_014334	GGT	2	6	621612	621617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065718
12029	NC_014334	A	7	7	621704	621710	100 %	0 %	0 %	0 %	301065718
12030	NC_014334	A	6	6	621733	621738	100 %	0 %	0 %	0 %	301065718
12031	NC_014334	AT	4	8	621762	621769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12033	NC_014334	ATT	2	6	621859	621864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12034	NC_014334	GAG	3	9	621926	621934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12035	NC_014334	AATT	2	8	621949	621956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12036	NC_014334	ACT	2	6	621982	621987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12037	NC_014334	ATA	2	6	622002	622007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12038	NC_014334	AAAC	2	8	622020	622027	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12039	NC_014334	ATTA	2	8	622028	622035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12040	NC_014334	GA	3	6	622045	622050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12041	NC_014334	TGA	2	6	622110	622115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065719
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12044	NC_014334	AAT	2	6	622399	622404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065719
12045	NC_014334	GGCCA	2	10	622414	622423	20 %	0 %	40 %	40 %	301065719
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12105	NC_014334	A	6	6	624972	624977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12106	NC_014334	TAA	2	6	625047	625052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12107	NC_014334	G	8	8	625083	625090	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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12110	NC_014334	CTTG	2	8	625273	625280	0 %	50 %	25 %	25 %	301065723
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12113	NC_014334	TGGT	2	8	625367	625374	0 %	50 %	50 %	0 %	301065723
12114	NC_014334	TGC	2	6	625375	625380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065723
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12117	NC_014334	CAT	2	6	625522	625527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065723
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12120	NC_014334	TTCAC	2	10	625578	625587	20 %	40 %	0 %	40 %	301065723
12121	NC_014334	TGA	2	6	625593	625598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065723
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12123	NC_014334	GCC	2	6	625833	625838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065723
12124	NC_014334	CTT	2	6	625908	625913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12125	NC_014334	TCA	2	6	625956	625961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065724
12126	NC_014334	ATG	2	6	626034	626039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065724
12127	NC_014334	CCAG	2	8	626079	626086	25 %	0 %	25 %	50 %	301065724
12128	NC_014334	AACC	2	8	626101	626108	50 %	0 %	0 %	50 %	301065724
12129	NC_014334	ACG	2	6	626193	626198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065724
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12132	NC_014334	CAG	2	6	626372	626377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065724
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12144	NC_014334	TCC	2	6	626869	626874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12147	NC_014334	GTCC	2	8	626993	627000	0 %	25 %	25 %	50 %	301065725
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12151	NC_014334	CAG	2	6	627094	627099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065725
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12155	NC_014334	CCT	3	9	627277	627285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065725
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12235	NC_014334	AC	3	6	630930	630935	50 %	0 %	0 %	50 %	301065730
12236	NC_014334	A	6	6	630955	630960	100 %	0 %	0 %	0 %	301065730
12237	NC_014334	TGATTT	2	12	630966	630977	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	301065730
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12242	NC_014334	GCT	2	6	631090	631095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065730
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12244	NC_014334	CGG	2	6	631178	631183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065730
12245	NC_014334	CTA	2	6	631217	631222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065730
12246	NC_014334	TGTT	2	8	631226	631233	0 %	75 %	25 %	0 %	301065730
12247	NC_014334	TGC	2	6	631292	631297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065730
12248	NC_014334	TTTA	2	8	631395	631402	25 %	75 %	0 %	0 %	301065730
12249	NC_014334	T	7	7	631434	631440	0 %	100 %	0 %	0 %	301065730
12250	NC_014334	GCT	2	6	631441	631446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065730
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12264	NC_014334	ATGCAG	2	12	632080	632091	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	301065731
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12300	NC_014334	GCT	2	6	634098	634103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065731
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12320	NC_014334	TGA	2	6	634970	634975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065731
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12329	NC_014334	T	8	8	635451	635458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12330	NC_014334	CAGG	2	8	635598	635605	25 %	0 %	50 %	25 %	301065733
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12332	NC_014334	CGC	2	6	635797	635802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12333	NC_014334	T	6	6	635845	635850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12334	NC_014334	AAT	2	6	635851	635856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12335	NC_014334	T	6	6	635921	635926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12336	NC_014334	A	6	6	635928	635933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12337	NC_014334	TCG	2	6	636091	636096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065735
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12343	NC_014334	ATG	2	6	636386	636391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065735
12344	NC_014334	GCAA	2	8	636446	636453	50 %	0 %	25 %	25 %	301065735
12345	NC_014334	CTGA	2	8	636503	636510	25 %	25 %	25 %	25 %	301065735
12346	NC_014334	AAT	2	6	636543	636548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065735
12347	NC_014334	TCA	2	6	636554	636559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065736
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12349	NC_014334	T	7	7	636731	636737	0 %	100 %	0 %	0 %	301065736
12350	NC_014334	CG	3	6	636852	636857	0 %	0 %	50 %	50 %	301065736
12351	NC_014334	AG	3	6	636862	636867	50 %	0 %	50 %	0 %	301065736
12352	NC_014334	GC	3	6	636938	636943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12353	NC_014334	CACT	2	8	637052	637059	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12354	NC_014334	ATG	2	6	637114	637119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065737
12355	NC_014334	ACAA	2	8	637120	637127	75 %	0 %	0 %	25 %	301065737
12356	NC_014334	GCC	2	6	637140	637145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065737
12357	NC_014334	GGC	2	6	637155	637160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065737
12358	NC_014334	TCATG	2	10	637236	637245	20 %	40 %	20 %	20 %	301065737
12359	NC_014334	TGC	2	6	637259	637264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065737
12360	NC_014334	TTA	2	6	637293	637298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065737
12361	NC_014334	TTA	2	6	637386	637391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065737
12362	NC_014334	TTG	2	6	637430	637435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065737
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12364	NC_014334	TGCC	2	8	637544	637551	0 %	25 %	25 %	50 %	301065737
12365	NC_014334	GTT	2	6	637584	637589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065737
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12373	NC_014334	AGA	2	6	638186	638191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065737
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12441	NC_014334	T	7	7	641642	641648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12472	NC_014334	GAA	2	6	643154	643159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065745
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12478	NC_014334	AAG	2	6	643318	643323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12479	NC_014334	AAC	2	6	643422	643427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065746
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12481	NC_014334	TGAT	2	8	643527	643534	25 %	50 %	25 %	0 %	301065747
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12484	NC_014334	CGG	2	6	643651	643656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065747
12485	NC_014334	CGGT	2	8	643683	643690	0 %	25 %	50 %	25 %	301065747
12486	NC_014334	CAAAA	2	10	643736	643745	80 %	0 %	0 %	20 %	301065747
12487	NC_014334	GTTG	2	8	643755	643762	0 %	50 %	50 %	0 %	301065747
12488	NC_014334	ATC	2	6	643769	643774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065747
12489	NC_014334	ACC	2	6	643902	643907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065747
12490	NC_014334	CAT	2	6	643939	643944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065747
12491	NC_014334	ATA	2	6	643983	643988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065747
12492	NC_014334	TGC	2	6	644022	644027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065747
12493	NC_014334	ATA	2	6	644037	644042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065747
12494	NC_014334	AGC	2	6	644081	644086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065747
12495	NC_014334	CAG	2	6	644101	644106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065747
12496	NC_014334	GAA	2	6	644225	644230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065747
12497	NC_014334	CCG	2	6	644277	644282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065747
12498	NC_014334	TCA	2	6	644287	644292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065747
12499	NC_014334	CTC	2	6	644323	644328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12500	NC_014334	GAT	2	6	644563	644568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065748

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