MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_014334	TGG	2	6	593685	593690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_014334	AAAC	2	8	593732	593739	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11503	NC_014334	GAA	2	6	593795	593800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065694
11504	NC_014334	CGTTTT	2	12	593917	593928	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	301065694
11505	NC_014334	CGC	2	6	593977	593982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065694
11506	NC_014334	CTT	2	6	594023	594028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065694
11507	NC_014334	CTT	2	6	594056	594061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065694
11508	NC_014334	TCC	2	6	594084	594089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065694
11509	NC_014334	GTC	2	6	594090	594095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065694
11510	NC_014334	ATG	2	6	594306	594311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065694
11511	NC_014334	GAACG	2	10	594335	594344	40 %	0 %	40 %	20 %	301065694
11512	NC_014334	GCGA	2	8	594355	594362	25 %	0 %	50 %	25 %	301065694
11513	NC_014334	GAA	2	6	594368	594373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065694
11514	NC_014334	TCC	2	6	594429	594434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065694
11515	NC_014334	TGC	2	6	594452	594457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065694
11516	NC_014334	TGA	2	6	594541	594546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065694
11517	NC_014334	AAT	2	6	594629	594634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065694
11518	NC_014334	CTA	2	6	594720	594725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11519	NC_014334	GGT	2	6	594786	594791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_014334	TGG	3	9	594861	594869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065695
11521	NC_014334	CA	3	6	594934	594939	50 %	0 %	0 %	50 %	301065695
11522	NC_014334	T	7	7	594991	594997	0 %	100 %	0 %	0 %	301065695
11523	NC_014334	GAC	2	6	595141	595146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065695
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11525	NC_014334	GCTG	2	8	595248	595255	0 %	25 %	50 %	25 %	301065695
11526	NC_014334	CGA	2	6	595381	595386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065695
11527	NC_014334	GCG	2	6	595432	595437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065695
11528	NC_014334	CTG	2	6	595439	595444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065695
11529	NC_014334	ATT	2	6	595469	595474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065695
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11532	NC_014334	ATC	2	6	595704	595709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065696
11533	NC_014334	TCA	2	6	595754	595759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065696
11534	NC_014334	ATT	3	9	595770	595778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065696
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11541	NC_014334	TGC	2	6	596161	596166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065696
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11544	NC_014334	CGC	2	6	596211	596216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065696
11545	NC_014334	CGCC	2	8	596229	596236	0 %	0 %	25 %	75 %	301065696
11546	NC_014334	GCA	2	6	596258	596263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065696
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11550	NC_014334	ATGT	2	8	596335	596342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_014334	GTA	2	6	596403	596408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_014334	TAA	2	6	596564	596569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_014334	T	7	7	596596	596602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_014334	ACT	2	6	596609	596614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11555	NC_014334	ATG	2	6	596640	596645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_014334	AAAC	2	8	596670	596677	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11557	NC_014334	ATTA	2	8	596710	596717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_014334	ACG	2	6	596746	596751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11560	NC_014334	GTC	2	6	596828	596833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_014334	TTC	2	6	596841	596846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_014334	CAT	2	6	596887	596892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11564	NC_014334	TGT	2	6	596915	596920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_014334	TGTT	2	8	596996	597003	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11567	NC_014334	TGTT	2	8	597085	597092	0 %	75 %	25 %	0 %	301065697
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11571	NC_014334	TGT	2	6	597237	597242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_014334	CAGA	2	8	597321	597328	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11573	NC_014334	ATT	2	6	597340	597345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_014334	AT	3	6	597351	597356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_014334	TG	3	6	597404	597409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_014334	CGG	2	6	597410	597415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11585	NC_014334	ATC	2	6	597905	597910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11587	NC_014334	AAT	2	6	597968	597973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_014334	TGA	2	6	598115	598120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065700
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11591	NC_014334	TAC	2	6	598255	598260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11593	NC_014334	TAC	2	6	598317	598322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11594	NC_014334	AAGC	2	8	598328	598335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11595	NC_014334	GCT	2	6	598344	598349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11596	NC_014334	ATTT	2	8	598372	598379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_014334	TCT	2	6	598411	598416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11601	NC_014334	TCGG	2	8	598758	598765	0 %	25 %	50 %	25 %	301065701
11602	NC_014334	TTC	2	6	598786	598791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065701
11603	NC_014334	AATT	2	8	598917	598924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_014334	CT	3	6	598958	598963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11605	NC_014334	TCC	2	6	598976	598981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11606	NC_014334	TGC	2	6	599031	599036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11607	NC_014334	GGT	2	6	599061	599066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_014334	AAG	2	6	599131	599136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_014334	AAG	2	6	599391	599396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_014334	ATA	2	6	599405	599410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_014334	CAG	2	6	599421	599426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11613	NC_014334	GAA	2	6	599528	599533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_014334	CT	3	6	599566	599571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11615	NC_014334	CAT	2	6	599643	599648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11617	NC_014334	A	7	7	599722	599728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11623	NC_014334	CAG	2	6	600253	600258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065702
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11870	NC_014334	TCA	2	6	612561	612566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065710
11871	NC_014334	ATA	2	6	612619	612624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11872	NC_014334	CA	3	6	612628	612633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11873	NC_014334	A	6	6	612724	612729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11874	NC_014334	TGC	2	6	612769	612774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11875	NC_014334	A	7	7	612793	612799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11876	NC_014334	TCA	2	6	612820	612825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11877	NC_014334	CG	3	6	612828	612833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11878	NC_014334	ATC	2	6	612847	612852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11891	NC_014334	TCAA	2	8	613635	613642	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11892	NC_014334	GTT	2	6	613665	613670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11895	NC_014334	ATT	2	6	613825	613830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11896	NC_014334	TAAAA	2	10	613836	613845	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11897	NC_014334	ATAA	2	8	613869	613876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11912	NC_014334	AACT	2	8	615066	615073	50 %	25 %	0 %	25 %	301065712
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11988	NC_014334	CGA	2	6	619411	619416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065716
11989	NC_014334	AGC	2	6	619528	619533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065716
11990	NC_014334	GTC	2	6	619652	619657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065716
11991	NC_014334	GCG	2	6	619752	619757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065716
11992	NC_014334	ATT	2	6	619777	619782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065716
11993	NC_014334	GAAC	2	8	619862	619869	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11994	NC_014334	AAAG	2	8	619881	619888	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11995	NC_014334	T	6	6	619913	619918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11996	NC_014334	GCT	2	6	619955	619960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11997	NC_014334	T	6	6	619960	619965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11998	NC_014334	CAA	2	6	620088	620093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065717
11999	NC_014334	CAA	2	6	620155	620160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065717
12000	NC_014334	AAC	2	6	620177	620182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065717

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