MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_014334	TGG	2	6	568873	568878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065669
11003	NC_014334	TGG	2	6	568891	568896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065669
11004	NC_014334	TGC	2	6	568974	568979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065669
11005	NC_014334	TGT	2	6	569037	569042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065669
11006	NC_014334	GGC	2	6	569053	569058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065669
11007	NC_014334	ATC	2	6	569114	569119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065669
11008	NC_014334	CGA	2	6	569197	569202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065669
11009	NC_014334	GGCA	2	8	569248	569255	25 %	0 %	50 %	25 %	301065669
11010	NC_014334	GAA	2	6	569300	569305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065669
11011	NC_014334	T	6	6	569485	569490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_014334	GA	3	6	569499	569504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_014334	TGA	2	6	569514	569519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_014334	GATT	2	8	569560	569567	25 %	50 %	25 %	0 %	301065670
11015	NC_014334	AGA	2	6	569573	569578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065670
11016	NC_014334	CG	3	6	569614	569619	0 %	0 %	50 %	50 %	301065670
11017	NC_014334	GTG	2	6	569694	569699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065670
11018	NC_014334	TTTC	2	8	569731	569738	0 %	75 %	0 %	25 %	301065670
11019	NC_014334	TAG	2	6	569740	569745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065670
11020	NC_014334	GCG	2	6	569793	569798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065670
11021	NC_014334	TGT	2	6	569834	569839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065670
11022	NC_014334	T	6	6	569850	569855	0 %	100 %	0 %	0 %	301065670
11023	NC_014334	GCT	2	6	569942	569947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065670
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11025	NC_014334	GTC	2	6	570030	570035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065670
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11029	NC_014334	TGG	2	6	570136	570141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065670
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11031	NC_014334	ATC	2	6	570193	570198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065670
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11041	NC_014334	CG	3	6	571050	571055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11042	NC_014334	T	6	6	571070	571075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_014334	GA	3	6	571104	571109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_014334	CTT	2	6	571147	571152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065671
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11047	NC_014334	TCT	2	6	571209	571214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065671
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11050	NC_014334	TGC	2	6	571331	571336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065671
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11055	NC_014334	ATG	2	6	571416	571421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065671
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11058	NC_014334	GCC	2	6	571508	571513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065671
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11062	NC_014334	TTTC	2	8	571774	571781	0 %	75 %	0 %	25 %	301065671
11063	NC_014334	TGA	2	6	571849	571854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065671
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11078	NC_014334	CAG	2	6	572366	572371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065673
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11089	NC_014334	GC	3	6	572924	572929	0 %	0 %	50 %	50 %	301065673
11090	NC_014334	TGGC	2	8	573050	573057	0 %	25 %	50 %	25 %	301065673
11091	NC_014334	GCGG	2	8	573060	573067	0 %	0 %	75 %	25 %	301065673
11092	NC_014334	GAG	2	6	573115	573120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065673
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11101	NC_014334	A	7	7	573724	573730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_014334	AAT	2	6	573736	573741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_014334	T	7	7	573748	573754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_014334	CAT	2	6	573799	573804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11105	NC_014334	TGT	3	9	573840	573848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_014334	TCA	2	6	573924	573929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065674
11107	NC_014334	GCT	2	6	574052	574057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065674
11108	NC_014334	T	7	7	574121	574127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_014334	TGCGAC	2	12	574163	574174	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11111	NC_014334	GCG	2	6	574184	574189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_014334	GTA	2	6	574199	574204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_014334	AGGC	2	8	574229	574236	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11114	NC_014334	TGC	2	6	574246	574251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065675
11115	NC_014334	CA	3	6	574267	574272	50 %	0 %	0 %	50 %	301065675
11116	NC_014334	CAA	2	6	574285	574290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065675
11117	NC_014334	ACAA	2	8	574309	574316	75 %	0 %	0 %	25 %	301065675
11118	NC_014334	CGC	2	6	574343	574348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065675
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11120	NC_014334	TGA	2	6	574379	574384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065675
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11123	NC_014334	GCAA	2	8	574421	574428	50 %	0 %	25 %	25 %	301065675
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11247	NC_014334	CCG	2	6	580348	580353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065681
11248	NC_014334	GCC	2	6	580386	580391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065681
11249	NC_014334	ATC	2	6	580432	580437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065681
11250	NC_014334	AAGG	2	8	580521	580528	50 %	0 %	50 %	0 %	301065681
11251	NC_014334	CCA	2	6	580569	580574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065681
11252	NC_014334	CAA	4	12	580616	580627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065681
11253	NC_014334	ATG	2	6	580774	580779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065681
11254	NC_014334	GCT	2	6	580884	580889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065681
11255	NC_014334	CTT	2	6	580916	580921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11256	NC_014334	CTT	2	6	581024	581029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11257	NC_014334	AACAAA	2	12	581121	581132	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	301065682
11258	NC_014334	CAT	2	6	581140	581145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065682
11259	NC_014334	CAT	2	6	581279	581284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065682
11260	NC_014334	CAG	2	6	581302	581307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065682
11261	NC_014334	AAG	2	6	581340	581345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065682
11262	NC_014334	AGC	2	6	581401	581406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065682
11263	NC_014334	CAAA	2	8	581420	581427	75 %	0 %	0 %	25 %	301065682
11264	NC_014334	ACA	2	6	581466	581471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065682
11265	NC_014334	CAG	2	6	581511	581516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065682
11266	NC_014334	GCAA	2	8	581519	581526	50 %	0 %	25 %	25 %	301065682
11267	NC_014334	CAC	2	6	581545	581550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065682
11268	NC_014334	AGC	3	9	581558	581566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065682
11269	NC_014334	GTCAC	2	10	581616	581625	20 %	20 %	20 %	40 %	301065682
11270	NC_014334	CAA	2	6	581642	581647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065682
11271	NC_014334	CAA	3	9	581660	581668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065682
11272	NC_014334	A	6	6	581701	581706	100 %	0 %	0 %	0 %	301065682
11273	NC_014334	GCA	2	6	581717	581722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065682
11274	NC_014334	CAG	2	6	581739	581744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065682
11275	NC_014334	AGC	2	6	581851	581856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065682
11276	NC_014334	CAGA	2	8	581868	581875	50 %	0 %	25 %	25 %	301065682
11277	NC_014334	AAG	2	6	581886	581891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065682
11278	NC_014334	CAA	2	6	581969	581974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065682
11279	NC_014334	CGG	2	6	582073	582078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065682
11280	NC_014334	CGAC	2	8	582115	582122	25 %	0 %	25 %	50 %	301065682
11281	NC_014334	CAG	2	6	582136	582141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065682
11282	NC_014334	AGC	2	6	582231	582236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065682
11283	NC_014334	ATG	2	6	582304	582309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065682
11284	NC_014334	TGA	2	6	582350	582355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065682
11285	NC_014334	CGA	3	9	582425	582433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065682
11286	NC_014334	AGC	2	6	582539	582544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065682
11287	NC_014334	ACG	2	6	582588	582593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065682
11288	NC_014334	ACT	2	6	582672	582677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065682
11289	NC_014334	GATC	2	8	582698	582705	25 %	25 %	25 %	25 %	301065682
11290	NC_014334	GAAT	2	8	582710	582717	50 %	25 %	25 %	0 %	301065682
11291	NC_014334	TTG	2	6	582850	582855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065682
11292	NC_014334	TGC	2	6	582860	582865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065682
11293	NC_014334	GCA	2	6	582971	582976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065682
11294	NC_014334	GC	3	6	582992	582997	0 %	0 %	50 %	50 %	301065682
11295	NC_014334	GGTC	2	8	583154	583161	0 %	25 %	50 %	25 %	301065682
11296	NC_014334	CCAAA	2	10	583176	583185	60 %	0 %	0 %	40 %	301065682
11297	NC_014334	ATGAC	2	10	583192	583201	40 %	20 %	20 %	20 %	301065682
11298	NC_014334	CAA	2	6	583232	583237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065682
11299	NC_014334	T	6	6	583398	583403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11300	NC_014334	GTT	2	6	583416	583421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11301	NC_014334	GT	3	6	583427	583432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11302	NC_014334	TGAA	2	8	583550	583557	50 %	25 %	25 %	0 %	301065683
11303	NC_014334	CGAA	2	8	583611	583618	50 %	0 %	25 %	25 %	301065683
11304	NC_014334	GCG	2	6	583654	583659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065683
11305	NC_014334	TCA	2	6	583713	583718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065683
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11308	NC_014334	A	6	6	583817	583822	100 %	0 %	0 %	0 %	301065683
11309	NC_014334	CTG	2	6	583914	583919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065683
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11313	NC_014334	GCT	2	6	584202	584207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065683
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11317	NC_014334	CAA	2	6	584419	584424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065683
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11322	NC_014334	TCG	2	6	584780	584785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065683
11323	NC_014334	CCG	2	6	584852	584857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065683
11324	NC_014334	AAG	2	6	584858	584863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065683
11325	NC_014334	CAGT	2	8	584919	584926	25 %	25 %	25 %	25 %	301065683
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11328	NC_014334	GAA	2	6	585253	585258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065683
11329	NC_014334	GCC	2	6	585305	585310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065683
11330	NC_014334	AAG	2	6	585323	585328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065683
11331	NC_014334	CGTGC	2	10	585351	585360	0 %	20 %	40 %	40 %	301065683
11332	NC_014334	ATG	2	6	585392	585397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065683
11333	NC_014334	AAC	2	6	585406	585411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065683
11334	NC_014334	TTGA	2	8	585435	585442	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11335	NC_014334	A	7	7	585476	585482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11336	NC_014334	CGG	2	6	585629	585634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11337	NC_014334	TTGAG	2	10	585676	585685	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11338	NC_014334	TGCTA	2	10	585695	585704	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11339	NC_014334	ATG	2	6	585705	585710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11340	NC_014334	AAC	2	6	585775	585780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11341	NC_014334	AGAAT	2	10	585787	585796	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11342	NC_014334	CTT	2	6	585845	585850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065684
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11344	NC_014334	AG	3	6	585899	585904	50 %	0 %	50 %	0 %	301065684
11345	NC_014334	ATG	2	6	585948	585953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065684
11346	NC_014334	GAC	2	6	586013	586018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065684
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11348	NC_014334	ATG	2	6	586113	586118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065684
11349	NC_014334	TAA	2	6	586269	586274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065685
11350	NC_014334	GAA	2	6	586289	586294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065685
11351	NC_014334	AAG	2	6	586355	586360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065685
11352	NC_014334	AAT	2	6	586376	586381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065685
11353	NC_014334	ACG	2	6	586549	586554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065685
11354	NC_014334	TTG	2	6	586599	586604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065685
11355	NC_014334	TTG	2	6	586608	586613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065685
11356	NC_014334	TGA	2	6	586652	586657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065685
11357	NC_014334	ATC	2	6	586668	586673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065685
11358	NC_014334	GGC	2	6	586779	586784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065686
11359	NC_014334	AAG	2	6	586803	586808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065686
11360	NC_014334	AATCAG	2	12	586842	586853	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	301065686
11361	NC_014334	GCT	2	6	586863	586868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065686
11362	NC_014334	AAGC	2	8	586872	586879	50 %	0 %	25 %	25 %	301065686
11363	NC_014334	T	6	6	586907	586912	0 %	100 %	0 %	0 %	301065686
11364	NC_014334	CTTG	2	8	586934	586941	0 %	50 %	25 %	25 %	301065686
11365	NC_014334	AGC	2	6	586989	586994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065686
11366	NC_014334	TCA	2	6	587021	587026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065686
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11471	NC_014334	A	6	6	591919	591924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11472	NC_014334	TGG	2	6	591995	592000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11474	NC_014334	TCA	2	6	592082	592087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065693
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11482	NC_014334	ATC	2	6	592429	592434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065693
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11485	NC_014334	CGG	2	6	592641	592646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065693
11486	NC_014334	TGC	2	6	592666	592671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065693
11487	NC_014334	CGC	2	6	592678	592683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065693
11488	NC_014334	GCG	2	6	592795	592800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065693
11489	NC_014334	GCC	2	6	592858	592863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065693
11490	NC_014334	TAA	2	6	592931	592936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065693
11491	NC_014334	ACAA	2	8	593006	593013	75 %	0 %	0 %	25 %	301065693
11492	NC_014334	TGA	2	6	593022	593027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065693
11493	NC_014334	CAT	2	6	593035	593040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065693
11494	NC_014334	AC	3	6	593055	593060	50 %	0 %	0 %	50 %	301065693
11495	NC_014334	ATG	2	6	593116	593121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065693
11496	NC_014334	CCA	2	6	593258	593263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065693
11497	NC_014334	A	6	6	593267	593272	100 %	0 %	0 %	0 %	301065693
11498	NC_014334	AAT	2	6	593311	593316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065693
11499	NC_014334	ATAGC	2	10	593394	593403	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11500	NC_014334	A	7	7	593483	593489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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