MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_014334	ATA	2	6	543748	543753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065647
10503	NC_014334	TGG	2	6	543778	543783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065647
10504	NC_014334	TGG	2	6	543785	543790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065647
10505	NC_014334	CCTA	2	8	543832	543839	25 %	25 %	0 %	50 %	301065647
10506	NC_014334	ACA	2	6	543936	543941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_014334	AGTC	2	8	543961	543968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10508	NC_014334	T	6	6	543985	543990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_014334	GTG	2	6	544044	544049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065648
10510	NC_014334	GT	3	6	544079	544084	0 %	50 %	50 %	0 %	301065648
10511	NC_014334	GCC	2	6	544101	544106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065648
10512	NC_014334	GTG	2	6	544156	544161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065648
10513	NC_014334	TAG	2	6	544299	544304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065648
10514	NC_014334	GCA	2	6	544316	544321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065648
10515	NC_014334	CTGA	2	8	544428	544435	25 %	25 %	25 %	25 %	301065648
10516	NC_014334	CGGC	2	8	544463	544470	0 %	0 %	50 %	50 %	301065648
10517	NC_014334	CGC	2	6	544555	544560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065648
10518	NC_014334	GCA	2	6	544636	544641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065648
10519	NC_014334	CGC	2	6	544769	544774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065648
10520	NC_014334	A	6	6	544886	544891	100 %	0 %	0 %	0 %	301065648
10521	NC_014334	GAAA	2	8	544908	544915	75 %	0 %	25 %	0 %	301065648
10522	NC_014334	TGGT	2	8	544930	544937	0 %	50 %	50 %	0 %	301065648
10523	NC_014334	GCGA	2	8	544941	544948	25 %	0 %	50 %	25 %	301065648
10524	NC_014334	TGG	2	6	544970	544975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065648
10525	NC_014334	A	7	7	545014	545020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_014334	CATT	2	8	545108	545115	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10527	NC_014334	GAA	2	6	545116	545121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_014334	GTC	2	6	545148	545153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065649
10529	NC_014334	AGCC	2	8	545247	545254	25 %	0 %	25 %	50 %	301065649
10530	NC_014334	GCC	2	6	545264	545269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065649
10531	NC_014334	A	6	6	545303	545308	100 %	0 %	0 %	0 %	301065649
10532	NC_014334	GC	3	6	545326	545331	0 %	0 %	50 %	50 %	301065649
10533	NC_014334	AC	3	6	545359	545364	50 %	0 %	0 %	50 %	301065649
10534	NC_014334	CCATC	2	10	545396	545405	20 %	20 %	0 %	60 %	301065649
10535	NC_014334	CAA	2	6	545450	545455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065649
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10537	NC_014334	GGT	2	6	545505	545510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065649
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10539	NC_014334	CAA	2	6	545722	545727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065649
10540	NC_014334	AAT	2	6	545741	545746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065649
10541	NC_014334	TTC	2	6	545831	545836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065649
10542	NC_014334	CAG	2	6	545849	545854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065649
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10546	NC_014334	GAC	3	9	545978	545986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065649
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10552	NC_014334	CGC	2	6	546277	546282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065649
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10554	NC_014334	GCCC	2	8	546355	546362	0 %	0 %	25 %	75 %	301065649
10555	NC_014334	AGT	2	6	546519	546524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065649
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10559	NC_014334	GAT	2	6	547026	547031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065650
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10564	NC_014334	ATG	2	6	547238	547243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065650
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10567	NC_014334	CAT	2	6	547494	547499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065650
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10569	NC_014334	CCT	2	6	547589	547594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065650
10570	NC_014334	CCT	2	6	547653	547658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10571	NC_014334	CTT	2	6	547727	547732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10572	NC_014334	ATT	2	6	547755	547760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10574	NC_014334	A	6	6	547806	547811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10575	NC_014334	GA	3	6	547818	547823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_014334	A	6	6	547881	547886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10603	NC_014334	CAGCC	2	10	549229	549238	20 %	0 %	20 %	60 %	301065652
10604	NC_014334	CAC	2	6	549276	549281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065652
10605	NC_014334	TGA	2	6	549294	549299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065652
10606	NC_014334	GTT	2	6	549344	549349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_014334	AAT	2	6	549350	549355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10608	NC_014334	CAA	2	6	549383	549388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10609	NC_014334	TGA	2	6	549438	549443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_014334	TCTGG	2	10	549486	549495	0 %	40 %	40 %	20 %	301065653
10611	NC_014334	CCT	2	6	549604	549609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10612	NC_014334	AGAA	2	8	549682	549689	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_014334	GCA	3	9	549725	549733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065654
10614	NC_014334	GAC	2	6	549742	549747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065654
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10617	NC_014334	TGG	2	6	549892	549897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065654
10618	NC_014334	TGG	2	6	549915	549920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065654
10619	NC_014334	A	6	6	550017	550022	100 %	0 %	0 %	0 %	301065654
10620	NC_014334	GAA	2	6	550033	550038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065654
10621	NC_014334	GCT	2	6	550142	550147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065654
10622	NC_014334	GATCA	2	10	550183	550192	40 %	20 %	20 %	20 %	301065654
10623	NC_014334	TGT	2	6	550257	550262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065654
10624	NC_014334	TTG	2	6	550403	550408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065654
10625	NC_014334	CTT	2	6	550449	550454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065654
10626	NC_014334	G	6	6	550514	550519	0 %	0 %	100 %	0 %	301065654
10627	NC_014334	TGA	2	6	550541	550546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065654
10628	NC_014334	TGAG	2	8	550572	550579	25 %	25 %	50 %	0 %	301065654
10629	NC_014334	CCA	2	6	550606	550611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065655
10630	NC_014334	TGA	2	6	550615	550620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065655
10631	NC_014334	GGCA	2	8	550688	550695	25 %	0 %	50 %	25 %	301065655
10632	NC_014334	GAT	2	6	550715	550720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065655
10633	NC_014334	GTC	2	6	550871	550876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065655
10634	NC_014334	TGA	2	6	550885	550890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065655
10635	NC_014334	TGC	2	6	550948	550953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065655
10636	NC_014334	TCTT	2	8	551004	551011	0 %	75 %	0 %	25 %	301065655
10637	NC_014334	TCG	2	6	551043	551048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065655
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10640	NC_014334	CG	3	6	551296	551301	0 %	0 %	50 %	50 %	301065655
10641	NC_014334	TTCG	2	8	551380	551387	0 %	50 %	25 %	25 %	301065655
10642	NC_014334	TCT	2	6	551448	551453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065655
10643	NC_014334	TTC	2	6	551477	551482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065655
10644	NC_014334	CGT	2	6	551517	551522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065655
10645	NC_014334	GTT	3	9	551553	551561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065655
10646	NC_014334	TTCCG	2	10	551610	551619	0 %	40 %	20 %	40 %	301065655
10647	NC_014334	GCA	2	6	551649	551654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065655
10648	NC_014334	TTCA	2	8	551660	551667	25 %	50 %	0 %	25 %	301065655
10649	NC_014334	TTC	2	6	551783	551788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065655
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10651	NC_014334	TG	3	6	551940	551945	0 %	50 %	50 %	0 %	301065655
10652	NC_014334	AGA	2	6	552015	552020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065655
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10654	NC_014334	GCTTT	2	10	552137	552146	0 %	60 %	20 %	20 %	301065655
10655	NC_014334	CGTC	2	8	552193	552200	0 %	25 %	25 %	50 %	301065655
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10660	NC_014334	GC	3	6	552371	552376	0 %	0 %	50 %	50 %	301065655
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10662	NC_014334	TG	3	6	552441	552446	0 %	50 %	50 %	0 %	301065655
10663	NC_014334	T	6	6	552494	552499	0 %	100 %	0 %	0 %	301065655
10664	NC_014334	CG	3	6	552541	552546	0 %	0 %	50 %	50 %	301065655
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10669	NC_014334	TGC	2	6	552705	552710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065655
10670	NC_014334	CTGTG	2	10	552740	552749	0 %	40 %	40 %	20 %	301065655
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10672	NC_014334	TGT	3	9	552824	552832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065655
10673	NC_014334	TCC	2	6	552844	552849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10674	NC_014334	GGTGC	2	10	552923	552932	0 %	20 %	60 %	20 %	301065656
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10680	NC_014334	CT	3	6	553214	553219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10681	NC_014334	AAC	2	6	553232	553237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10682	NC_014334	TTTG	2	8	553303	553310	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10683	NC_014334	AAT	2	6	553362	553367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10684	NC_014334	A	6	6	553379	553384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10685	NC_014334	ACG	2	6	553430	553435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10687	NC_014334	TAC	2	6	553450	553455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10688	NC_014334	AT	3	6	553493	553498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10689	NC_014334	AAG	2	6	553539	553544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10690	NC_014334	AATA	2	8	553591	553598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10691	NC_014334	GAA	2	6	553633	553638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10692	NC_014334	CTC	2	6	553658	553663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10694	NC_014334	TAAA	2	8	553746	553753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10695	NC_014334	GGA	2	6	553754	553759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10700	NC_014334	CTC	2	6	554014	554019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065657
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10730	NC_014334	ACGC	2	8	555375	555382	25 %	0 %	25 %	50 %	301065658
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10736	NC_014334	TC	3	6	555580	555585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10737	NC_014334	TGG	2	6	555596	555601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10738	NC_014334	ACT	2	6	555618	555623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065659
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10740	NC_014334	GT	3	6	555663	555668	0 %	50 %	50 %	0 %	301065659
10741	NC_014334	A	6	6	555729	555734	100 %	0 %	0 %	0 %	301065659
10742	NC_014334	TAC	2	6	555748	555753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065659
10743	NC_014334	ACA	2	6	555777	555782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065659
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10745	NC_014334	AAC	2	6	555817	555822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065659
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10862	NC_014334	AC	3	6	562318	562323	50 %	0 %	0 %	50 %	301065665
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10986	NC_014334	ATT	2	6	568132	568137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065669
10987	NC_014334	ACT	2	6	568165	568170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065669
10988	NC_014334	ATTA	2	8	568180	568187	50 %	50 %	0 %	0 %	301065669
10989	NC_014334	GAA	2	6	568219	568224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065669
10990	NC_014334	TCA	2	6	568271	568276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065669
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