MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_014334	ATC	2	6	440546	440551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065559
8502	NC_014334	TGC	2	6	440560	440565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065559
8503	NC_014334	GTT	2	6	440607	440612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065559
8504	NC_014334	CGA	2	6	440641	440646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065559
8505	NC_014334	TGA	2	6	440655	440660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065559
8506	NC_014334	TG	3	6	440741	440746	0 %	50 %	50 %	0 %	301065559
8507	NC_014334	CGA	2	6	440791	440796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065559
8508	NC_014334	TGA	2	6	440842	440847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065559
8509	NC_014334	TGT	2	6	440857	440862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065559
8510	NC_014334	AGAT	2	8	440886	440893	50 %	25 %	25 %	0 %	301065559
8511	NC_014334	GAA	2	6	440938	440943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065559
8512	NC_014334	ATT	2	6	440984	440989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065559
8513	NC_014334	TTG	2	6	440997	441002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065559
8514	NC_014334	TGA	2	6	441096	441101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065559
8515	NC_014334	TTC	2	6	441137	441142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065559
8516	NC_014334	TTG	2	6	441170	441175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065559
8517	NC_014334	TGC	2	6	441206	441211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065559
8518	NC_014334	AAAG	2	8	441224	441231	75 %	0 %	25 %	0 %	301065559
8519	NC_014334	TAG	2	6	441263	441268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065559
8520	NC_014334	AGT	2	6	441276	441281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065559
8521	NC_014334	ACA	2	6	441303	441308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065559
8522	NC_014334	TGT	2	6	441361	441366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065559
8523	NC_014334	GCA	2	6	441468	441473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065559
8524	NC_014334	TGG	2	6	441493	441498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065559
8525	NC_014334	A	6	6	441534	441539	100 %	0 %	0 %	0 %	301065559
8526	NC_014334	CAA	2	6	441551	441556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065559
8527	NC_014334	CAA	2	6	441634	441639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065559
8528	NC_014334	TGG	2	6	441640	441645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065559
8529	NC_014334	AAT	2	6	441657	441662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065559
8530	NC_014334	CAG	2	6	441680	441685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065559
8531	NC_014334	GCG	2	6	441689	441694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065559
8532	NC_014334	GTTT	2	8	441729	441736	0 %	75 %	25 %	0 %	301065559
8533	NC_014334	GAT	2	6	441912	441917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065560
8534	NC_014334	ATG	2	6	441931	441936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065560
8535	NC_014334	ATG	3	9	441955	441963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065560
8536	NC_014334	GCG	2	6	441975	441980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065560
8537	NC_014334	GAT	2	6	442071	442076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065560
8538	NC_014334	CTT	2	6	442130	442135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065560
8539	NC_014334	CAT	2	6	442145	442150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065560
8540	NC_014334	CGC	2	6	442190	442195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065560
8541	NC_014334	GCG	2	6	442220	442225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065560
8542	NC_014334	A	6	6	442259	442264	100 %	0 %	0 %	0 %	301065560
8543	NC_014334	T	7	7	442292	442298	0 %	100 %	0 %	0 %	301065560
8544	NC_014334	TTG	2	6	442320	442325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065560
8545	NC_014334	ACCG	2	8	442338	442345	25 %	0 %	25 %	50 %	301065560
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8550	NC_014334	CGT	2	6	442656	442661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065560
8551	NC_014334	GTG	2	6	442702	442707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065560
8552	NC_014334	GCC	2	6	442731	442736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065560
8553	NC_014334	GCA	2	6	442747	442752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065560
8554	NC_014334	TGG	2	6	442867	442872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065560
8555	NC_014334	GTAC	2	8	442880	442887	25 %	25 %	25 %	25 %	301065560
8556	NC_014334	GTG	2	6	443048	443053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065560
8557	NC_014334	GCC	2	6	443076	443081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065560
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8560	NC_014334	CG	3	6	443111	443116	0 %	0 %	50 %	50 %	301065560
8561	NC_014334	TGA	2	6	443168	443173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065560
8562	NC_014334	CAG	2	6	443223	443228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065560
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8566	NC_014334	GTT	2	6	443405	443410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065560
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8568	NC_014334	TTG	2	6	443577	443582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_014334	TGAAGA	2	12	443615	443626	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_014334	GTAG	2	8	443653	443660	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_014334	ATAA	2	8	443667	443674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_014334	GCC	2	6	443675	443680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8573	NC_014334	TGC	2	6	443727	443732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8574	NC_014334	GCTCG	2	10	443735	443744	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8575	NC_014334	GAC	2	6	443746	443751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8577	NC_014334	CCA	2	6	443808	443813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8578	NC_014334	AT	3	6	443901	443906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8579	NC_014334	TA	3	6	443916	443921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8580	NC_014334	AAG	2	6	443987	443992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8581	NC_014334	GGT	2	6	443995	444000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8582	NC_014334	AGG	2	6	444043	444048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8583	NC_014334	GTT	2	6	444096	444101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065561
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8585	NC_014334	AGC	2	6	444221	444226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8587	NC_014334	AT	4	8	444278	444285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_014334	TTGA	2	8	444352	444359	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_014334	GTG	2	6	444367	444372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8590	NC_014334	AAT	2	6	444480	444485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065562
8591	NC_014334	GAAG	2	8	444557	444564	50 %	0 %	50 %	0 %	301065562
8592	NC_014334	GCA	2	6	444641	444646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065562
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8595	NC_014334	ACGT	2	8	444871	444878	25 %	25 %	25 %	25 %	301065562
8596	NC_014334	GCG	2	6	444904	444909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065562
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8599	NC_014334	AGC	2	6	445030	445035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065562
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8603	NC_014334	CAT	2	6	445289	445294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065562
8604	NC_014334	T	6	6	445319	445324	0 %	100 %	0 %	0 %	301065562
8605	NC_014334	AGCG	2	8	445335	445342	25 %	0 %	50 %	25 %	301065562
8606	NC_014334	TTGA	2	8	445377	445384	25 %	50 %	25 %	0 %	301065562
8607	NC_014334	TTG	2	6	445391	445396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065562
8608	NC_014334	CAG	2	6	445491	445496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065562
8609	NC_014334	A	6	6	445555	445560	100 %	0 %	0 %	0 %	301065562
8610	NC_014334	GCA	2	6	445651	445656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065562
8611	NC_014334	CAT	2	6	445757	445762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065562
8612	NC_014334	GGC	2	6	445830	445835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065562
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8619	NC_014334	TTGA	2	8	446268	446275	25 %	50 %	25 %	0 %	301065562
8620	NC_014334	TGG	2	6	446342	446347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065562
8621	NC_014334	TTG	2	6	446373	446378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065562
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8991	NC_014334	GCA	2	6	465826	465831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065583
8992	NC_014334	TGA	2	6	465941	465946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065583
8993	NC_014334	ATT	2	6	465988	465993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065583
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8997	NC_014334	A	6	6	466085	466090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8999	NC_014334	GCC	2	6	466150	466155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065584
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