MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_014334	GGA	2	6	414733	414738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065533
8002	NC_014334	TAGGGT	2	12	414877	414888	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	301065534
8003	NC_014334	TCA	2	6	414905	414910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065534
8004	NC_014334	TGT	2	6	414938	414943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065534
8005	NC_014334	TTC	2	6	415043	415048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065534
8006	NC_014334	A	6	6	415238	415243	100 %	0 %	0 %	0 %	301065534
8007	NC_014334	AGC	2	6	415276	415281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065534
8008	NC_014334	TCA	3	9	415337	415345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065534
8009	NC_014334	AAG	2	6	415549	415554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065534
8010	NC_014334	GA	3	6	415566	415571	50 %	0 %	50 %	0 %	301065534
8011	NC_014334	GGC	2	6	415589	415594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065534
8012	NC_014334	GCA	2	6	415608	415613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065534
8013	NC_014334	GAC	2	6	415688	415693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065534
8014	NC_014334	GAAT	2	8	415778	415785	50 %	25 %	25 %	0 %	301065534
8015	NC_014334	TTA	2	6	415815	415820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065534
8016	NC_014334	TGC	2	6	415826	415831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065534
8017	NC_014334	TGA	2	6	415856	415861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065534
8018	NC_014334	AAGC	2	8	415863	415870	50 %	0 %	25 %	25 %	301065534
8019	NC_014334	GCA	2	6	415880	415885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065534
8020	NC_014334	GCGAAG	2	12	415986	415997	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	301065534
8021	NC_014334	TGCC	2	8	415999	416006	0 %	25 %	25 %	50 %	301065534
8022	NC_014334	CAA	2	6	416201	416206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065535
8023	NC_014334	ACA	2	6	416215	416220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065535
8024	NC_014334	T	6	6	416238	416243	0 %	100 %	0 %	0 %	301065535
8025	NC_014334	TTTA	2	8	416258	416265	25 %	75 %	0 %	0 %	301065535
8026	NC_014334	GCA	2	6	416288	416293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065535
8027	NC_014334	TAA	2	6	416307	416312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065535
8028	NC_014334	TGC	2	6	416359	416364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065536
8029	NC_014334	CGA	2	6	416445	416450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065536
8030	NC_014334	GGGC	2	8	416475	416482	0 %	0 %	75 %	25 %	301065536
8031	NC_014334	GGTA	3	12	416490	416501	25 %	25 %	50 %	0 %	301065536
8032	NC_014334	TG	3	6	416546	416551	0 %	50 %	50 %	0 %	301065536
8033	NC_014334	TGC	2	6	416568	416573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065536
8034	NC_014334	GTATG	2	10	416575	416584	20 %	40 %	40 %	0 %	301065536
8035	NC_014334	TCG	2	6	416612	416617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065536
8036	NC_014334	ATG	2	6	416627	416632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065536
8037	NC_014334	GCG	2	6	416642	416647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065536
8038	NC_014334	GT	3	6	416684	416689	0 %	50 %	50 %	0 %	301065536
8039	NC_014334	CTT	2	6	416829	416834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065536
8040	NC_014334	AATG	2	8	416885	416892	50 %	25 %	25 %	0 %	301065536
8041	NC_014334	T	7	7	416946	416952	0 %	100 %	0 %	0 %	301065536
8042	NC_014334	GGC	2	6	416974	416979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065536
8043	NC_014334	AAT	2	6	417016	417021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065536
8044	NC_014334	ATGA	2	8	417034	417041	50 %	25 %	25 %	0 %	301065536
8045	NC_014334	GGT	2	6	417064	417069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065536
8046	NC_014334	GT	3	6	417068	417073	0 %	50 %	50 %	0 %	301065536
8047	NC_014334	GAT	2	6	417094	417099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065536
8048	NC_014334	GGC	2	6	417121	417126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065536
8049	NC_014334	GGC	2	6	417202	417207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065536
8050	NC_014334	ATG	2	6	417244	417249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065536
8051	NC_014334	CTG	2	6	417261	417266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065536
8052	NC_014334	AAT	2	6	417295	417300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065536
8053	NC_014334	GCCTCC	2	12	417313	417324	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	301065537
8054	NC_014334	GCA	2	6	417328	417333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065537
8055	NC_014334	GT	3	6	417366	417371	0 %	50 %	50 %	0 %	301065537
8056	NC_014334	TTGCG	2	10	417429	417438	0 %	40 %	40 %	20 %	301065537
8057	NC_014334	ACA	2	6	417469	417474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065537
8058	NC_014334	ATC	2	6	417475	417480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065537
8059	NC_014334	GAT	2	6	417570	417575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065537
8060	NC_014334	CAATGC	2	12	417602	417613	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	301065537
8061	NC_014334	ACC	2	6	417624	417629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065537
8062	NC_014334	AGTT	2	8	417663	417670	25 %	50 %	25 %	0 %	301065537
8063	NC_014334	CAAG	2	8	417680	417687	50 %	0 %	25 %	25 %	301065537
8064	NC_014334	TTTG	2	8	417715	417722	0 %	75 %	25 %	0 %	301065537
8065	NC_014334	TGT	2	6	417770	417775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065537
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8067	NC_014334	GTT	2	6	417864	417869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065537
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8069	NC_014334	GTCA	2	8	418098	418105	25 %	25 %	25 %	25 %	301065538
8070	NC_014334	T	6	6	418114	418119	0 %	100 %	0 %	0 %	301065538
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8074	NC_014334	CAT	2	6	418346	418351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065538
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8076	NC_014334	GAT	2	6	418402	418407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065538
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8079	NC_014334	ATC	2	6	418539	418544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065538
8080	NC_014334	GTAGG	2	10	418574	418583	20 %	20 %	60 %	0 %	301065538
8081	NC_014334	AGT	2	6	418592	418597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065538
8082	NC_014334	AGT	3	9	418622	418630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065538
8083	NC_014334	CTG	2	6	418849	418854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065538
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8087	NC_014334	T	6	6	418938	418943	0 %	100 %	0 %	0 %	301065538
8088	NC_014334	TGA	2	6	418987	418992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_014334	GCT	2	6	419043	419048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8090	NC_014334	GAAT	2	8	419059	419066	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_014334	CAA	2	6	419083	419088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_014334	CAG	2	6	419111	419116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_014334	TGT	2	6	419122	419127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_014334	AAT	2	6	419129	419134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_014334	TGC	2	6	419252	419257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8097	NC_014334	AGC	2	6	419336	419341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_014334	ATC	2	6	419439	419444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_014334	GA	3	6	419463	419468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_014334	ATTG	2	8	419482	419489	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_014334	GAT	2	6	419594	419599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_014334	TTG	2	6	419600	419605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8109	NC_014334	CG	3	6	420171	420176	0 %	0 %	50 %	50 %	301065539
8110	NC_014334	TGC	2	6	420278	420283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065539
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8112	NC_014334	ACC	2	6	420394	420399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8113	NC_014334	CAA	2	6	420432	420437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_014334	CAC	2	6	420545	420550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8115	NC_014334	CTCTT	2	10	420582	420591	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8116	NC_014334	ATG	2	6	420608	420613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_014334	GT	3	6	420641	420646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_014334	ATTT	2	8	420680	420687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_014334	GTC	2	6	420721	420726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_014334	T	6	6	420728	420733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_014334	GCAT	2	8	420752	420759	25 %	25 %	25 %	25 %	301065540
8122	NC_014334	TAA	2	6	420792	420797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065540
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8124	NC_014334	TGCT	2	8	420841	420848	0 %	50 %	25 %	25 %	301065540
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8141	NC_014334	T	6	6	422073	422078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8365	NC_014334	CAT	2	6	433697	433702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065554
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8370	NC_014334	CAA	2	6	434045	434050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065554
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8489	NC_014334	TCT	2	6	439848	439853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8490	NC_014334	AGA	2	6	439864	439869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8491	NC_014334	AGC	2	6	439963	439968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8492	NC_014334	CCA	2	6	440052	440057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065559
8493	NC_014334	TTGC	2	8	440121	440128	0 %	50 %	25 %	25 %	301065559
8494	NC_014334	TCA	2	6	440244	440249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065559
8495	NC_014334	AGAACG	2	12	440250	440261	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	301065559
8496	NC_014334	GAG	2	6	440294	440299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065559
8497	NC_014334	GGC	2	6	440320	440325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065559
8498	NC_014334	GGC	2	6	440399	440404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065559
8499	NC_014334	AAC	2	6	440492	440497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065559
8500	NC_014334	GCC	2	6	440506	440511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065559

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