MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7502	NC_014334	TTG	2	6	389258	389263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065512
7503	NC_014334	AAGA	2	8	389317	389324	75 %	0 %	25 %	0 %	301065512
7504	NC_014334	CTG	2	6	389336	389341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065512
7505	NC_014334	AAG	2	6	389426	389431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065513
7506	NC_014334	TTGA	2	8	389467	389474	25 %	50 %	25 %	0 %	301065513
7507	NC_014334	AGA	2	6	389481	389486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065513
7508	NC_014334	TCCT	2	8	389499	389506	0 %	50 %	0 %	50 %	301065513
7509	NC_014334	AGTC	2	8	389654	389661	25 %	25 %	25 %	25 %	301065513
7510	NC_014334	AC	3	6	389706	389711	50 %	0 %	0 %	50 %	301065513
7511	NC_014334	TCT	2	6	389830	389835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065513
7512	NC_014334	GGCA	2	8	389852	389859	25 %	0 %	50 %	25 %	301065513
7513	NC_014334	TAA	2	6	389883	389888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065513
7514	NC_014334	T	6	6	389893	389898	0 %	100 %	0 %	0 %	301065513
7515	NC_014334	TGA	2	6	389928	389933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065513
7516	NC_014334	GTC	2	6	389978	389983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065513
7517	NC_014334	TGAAT	2	10	390066	390075	40 %	40 %	20 %	0 %	301065513
7518	NC_014334	GCA	2	6	390138	390143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065513
7519	NC_014334	AGA	2	6	390255	390260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065513
7520	NC_014334	TGT	2	6	390263	390268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065513
7521	NC_014334	CAAA	2	8	390501	390508	75 %	0 %	0 %	25 %	301065513
7522	NC_014334	GTT	2	6	390531	390536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065513
7523	NC_014334	GAA	2	6	390553	390558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065513
7524	NC_014334	GCA	2	6	390569	390574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065513
7525	NC_014334	TTTA	2	8	390579	390586	25 %	75 %	0 %	0 %	301065513
7526	NC_014334	ATGA	2	8	390616	390623	50 %	25 %	25 %	0 %	301065513
7527	NC_014334	TTG	2	6	390680	390685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065513
7528	NC_014334	CAG	2	6	390689	390694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065513
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7530	NC_014334	TAT	2	6	390724	390729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065513
7531	NC_014334	TTCAGG	2	12	390785	390796	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	301065513
7532	NC_014334	CGA	2	6	390876	390881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065513
7533	NC_014334	GAT	2	6	390946	390951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065513
7534	NC_014334	CGG	2	6	390960	390965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065513
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7536	NC_014334	TGAT	2	8	391028	391035	25 %	50 %	25 %	0 %	301065513
7537	NC_014334	TCG	2	6	391050	391055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065513
7538	NC_014334	GCTC	2	8	391117	391124	0 %	25 %	25 %	50 %	301065513
7539	NC_014334	GAC	2	6	391152	391157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065513
7540	NC_014334	ATC	2	6	391223	391228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065513
7541	NC_014334	CA	3	6	391246	391251	50 %	0 %	0 %	50 %	301065513
7542	NC_014334	GAT	2	6	391405	391410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065513
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7544	NC_014334	AC	4	8	391468	391475	50 %	0 %	0 %	50 %	301065513
7545	NC_014334	GAT	2	6	391519	391524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065513
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7548	NC_014334	AATC	2	8	391637	391644	50 %	25 %	0 %	25 %	301065513
7549	NC_014334	CAG	2	6	391651	391656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065513
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7551	NC_014334	GCT	2	6	391822	391827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065513
7552	NC_014334	ATG	2	6	391880	391885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065513
7553	NC_014334	GAAG	2	8	391944	391951	50 %	0 %	50 %	0 %	301065513
7554	NC_014334	AAG	2	6	391970	391975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065513
7555	NC_014334	TTG	2	6	392024	392029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_014334	TCA	2	6	392041	392046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065514
7557	NC_014334	CAA	2	6	392130	392135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065514
7558	NC_014334	TCA	2	6	392242	392247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065514
7559	NC_014334	GAT	2	6	392313	392318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065514
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7564	NC_014334	TCG	2	6	392606	392611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065514
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7578	NC_014334	CTAT	2	8	393118	393125	25 %	50 %	0 %	25 %	301065514
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7589	NC_014334	TAC	2	6	393794	393799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7591	NC_014334	AGA	2	6	393857	393862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7592	NC_014334	T	6	6	393904	393909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7593	NC_014334	ATG	2	6	393912	393917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7594	NC_014334	A	6	6	393918	393923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7595	NC_014334	TAG	2	6	393967	393972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7596	NC_014334	AGA	2	6	393985	393990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7598	NC_014334	CAG	2	6	394009	394014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7599	NC_014334	ACCTTT	2	12	394029	394040	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7601	NC_014334	CAA	2	6	394109	394114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7602	NC_014334	ATG	2	6	394126	394131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_014334	GAA	2	6	394145	394150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7604	NC_014334	GTTG	2	8	394248	394255	0 %	50 %	50 %	0 %	301065515
7605	NC_014334	TGC	2	6	394266	394271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065515
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7613	NC_014334	TGCCT	2	10	394569	394578	0 %	40 %	20 %	40 %	301065515
7614	NC_014334	AG	3	6	394587	394592	50 %	0 %	50 %	0 %	301065515
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7618	NC_014334	ATCA	2	8	394975	394982	50 %	25 %	0 %	25 %	301065515
7619	NC_014334	CTG	2	6	395076	395081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7621	NC_014334	GGC	2	6	395096	395101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7622	NC_014334	GTAA	2	8	395114	395121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7994	NC_014334	ATT	2	6	414023	414028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065533
7995	NC_014334	TCA	2	6	414053	414058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065533
7996	NC_014334	ATG	2	6	414206	414211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065533
7997	NC_014334	CAT	2	6	414274	414279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065533
7998	NC_014334	TGG	2	6	414297	414302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065533
7999	NC_014334	AGC	2	6	414334	414339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065533
8000	NC_014334	GAA	2	6	414341	414346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065533

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