MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_014334	TCA	2	6	362848	362853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065486
7003	NC_014334	TTC	2	6	362865	362870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065486
7004	NC_014334	ATT	2	6	362880	362885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065486
7005	NC_014334	TTG	2	6	362896	362901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065486
7006	NC_014334	TTG	2	6	362958	362963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065486
7007	NC_014334	CAC	2	6	362978	362983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065486
7008	NC_014334	TGT	2	6	362998	363003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065486
7009	NC_014334	GCC	2	6	363120	363125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065486
7010	NC_014334	AGT	2	6	363128	363133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065486
7011	NC_014334	GCAG	2	8	363134	363141	25 %	0 %	50 %	25 %	301065486
7012	NC_014334	TTG	2	6	363178	363183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065486
7013	NC_014334	GGCC	2	8	363257	363264	0 %	0 %	50 %	50 %	301065486
7014	NC_014334	GT	3	6	363339	363344	0 %	50 %	50 %	0 %	301065486
7015	NC_014334	AC	3	6	363375	363380	50 %	0 %	0 %	50 %	301065486
7016	NC_014334	CTTC	2	8	363416	363423	0 %	50 %	0 %	50 %	301065486
7017	NC_014334	ATTG	2	8	363425	363432	25 %	50 %	25 %	0 %	301065486
7018	NC_014334	GTT	3	9	363443	363451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065486
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7020	NC_014334	GTT	2	6	363476	363481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065486
7021	NC_014334	GTT	2	6	363572	363577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065486
7022	NC_014334	T	7	7	363638	363644	0 %	100 %	0 %	0 %	301065486
7023	NC_014334	GCT	2	6	363647	363652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065486
7024	NC_014334	TTG	2	6	363708	363713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065486
7025	NC_014334	TGC	2	6	363841	363846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065486
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7027	NC_014334	CACTT	2	10	363983	363992	20 %	40 %	0 %	40 %	301065486
7028	NC_014334	CAC	2	6	364073	364078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065486
7029	NC_014334	CGC	2	6	364088	364093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065486
7030	NC_014334	TTG	2	6	364108	364113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065486
7031	NC_014334	GCT	2	6	364140	364145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065486
7032	NC_014334	TGT	2	6	364165	364170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065486
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7040	NC_014334	GGCA	2	8	364858	364865	25 %	0 %	50 %	25 %	301065488
7041	NC_014334	GAT	2	6	364902	364907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065488
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7048	NC_014334	AGC	2	6	365497	365502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7049	NC_014334	T	6	6	365517	365522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_014334	TG	4	8	365582	365589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_014334	GCA	2	6	365604	365609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_014334	AG	3	6	365623	365628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_014334	TTA	2	6	365652	365657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_014334	AAAT	2	8	365670	365677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_014334	TTGA	2	8	365683	365690	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_014334	T	6	6	365722	365727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_014334	TAA	2	6	365746	365751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_014334	ATA	2	6	365752	365757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_014334	T	6	6	365760	365765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_014334	TCC	2	6	365774	365779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7061	NC_014334	TAT	2	6	365815	365820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_014334	GAG	2	6	365847	365852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_014334	TGG	3	9	365956	365964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065490
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7094	NC_014334	TGA	3	9	367748	367756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_014334	TGT	2	6	367915	367920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065493
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7099	NC_014334	ACA	3	9	368150	368158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_014334	AGGG	2	8	368161	368168	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_014334	TGA	2	6	368214	368219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065494
7102	NC_014334	TGGT	2	8	368229	368236	0 %	50 %	50 %	0 %	301065494
7103	NC_014334	CAAA	2	8	368283	368290	75 %	0 %	0 %	25 %	301065494
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7107	NC_014334	AGC	2	6	368421	368426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065494
7108	NC_014334	A	6	6	368451	368456	100 %	0 %	0 %	0 %	301065494
7109	NC_014334	GAA	2	6	368564	368569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065494
7110	NC_014334	GGC	2	6	368582	368587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065494
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7113	NC_014334	ATTG	2	8	368642	368649	25 %	50 %	25 %	0 %	301065494
7114	NC_014334	CTCGA	2	10	368651	368660	20 %	20 %	20 %	40 %	301065494
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7117	NC_014334	ATCA	2	8	368867	368874	50 %	25 %	0 %	25 %	301065494
7118	NC_014334	A	7	7	368885	368891	100 %	0 %	0 %	0 %	301065494
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7123	NC_014334	GGC	2	6	369131	369136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065494
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7125	NC_014334	TGA	2	6	369322	369327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065494
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7234	NC_014334	TGA	2	6	375174	375179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7242	NC_014334	GA	3	6	375847	375852	50 %	0 %	50 %	0 %	301065501
7243	NC_014334	TAA	2	6	375916	375921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7244	NC_014334	TTGTAA	2	12	375980	375991	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7245	NC_014334	A	8	8	376055	376062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7246	NC_014334	TTTA	2	8	376071	376078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7373	NC_014334	ATT	2	6	382406	382411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065508
7374	NC_014334	AAT	2	6	382414	382419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065508
7375	NC_014334	TGG	2	6	382425	382430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065508
7376	NC_014334	TA	5	10	382453	382462	50 %	50 %	0 %	0 %	301065508
7377	NC_014334	GGCT	2	8	382485	382492	0 %	25 %	50 %	25 %	301065508
7378	NC_014334	TCT	2	6	382507	382512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065508
7379	NC_014334	T	7	7	382707	382713	0 %	100 %	0 %	0 %	301065508
7380	NC_014334	ATCTGA	2	12	382896	382907	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	301065508
7381	NC_014334	TGC	2	6	383007	383012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065508
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7383	NC_014334	TGGC	2	8	383132	383139	0 %	25 %	50 %	25 %	301065508
7384	NC_014334	GCG	2	6	383158	383163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065508
7385	NC_014334	GATT	2	8	383202	383209	25 %	50 %	25 %	0 %	301065508
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7387	NC_014334	GTT	2	6	383326	383331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065508
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7389	NC_014334	GATT	2	8	383442	383449	25 %	50 %	25 %	0 %	301065508
7390	NC_014334	CCAA	2	8	383482	383489	50 %	0 %	0 %	50 %	301065508
7391	NC_014334	GTT	2	6	383566	383571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065508
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7393	NC_014334	GATT	2	8	383682	383689	25 %	50 %	25 %	0 %	301065508
7394	NC_014334	ACC	2	6	383721	383726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7395	NC_014334	A	6	6	383738	383743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7396	NC_014334	AG	3	6	383790	383795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7397	NC_014334	CGC	2	6	383877	383882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065509
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7399	NC_014334	AGCCA	2	10	384143	384152	40 %	0 %	20 %	40 %	301065509
7400	NC_014334	AGA	2	6	384181	384186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065509
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7402	NC_014334	GCT	2	6	384316	384321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065509
7403	NC_014334	TGG	2	6	384419	384424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065509
7404	NC_014334	CTA	2	6	384582	384587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065509
7405	NC_014334	CAA	2	6	384634	384639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065509
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7407	NC_014334	TAT	2	6	384733	384738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7408	NC_014334	GAT	2	6	384813	384818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065510
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7410	NC_014334	ATG	2	6	384970	384975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065510
7411	NC_014334	GTG	2	6	385078	385083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065510
7412	NC_014334	GAAA	2	8	385235	385242	75 %	0 %	25 %	0 %	301065510
7413	NC_014334	ACT	2	6	385248	385253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065510
7414	NC_014334	TGCA	2	8	385254	385261	25 %	25 %	25 %	25 %	301065510
7415	NC_014334	TGA	2	6	385388	385393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065510
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7422	NC_014334	CA	3	6	385753	385758	50 %	0 %	0 %	50 %	301065510
7423	NC_014334	CTA	2	6	385793	385798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065510
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7433	NC_014334	TGAAT	2	10	386260	386269	40 %	40 %	20 %	0 %	301065511
7434	NC_014334	AGTG	2	8	386323	386330	25 %	25 %	50 %	0 %	301065511
7435	NC_014334	CGG	2	6	386338	386343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065511
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7452	NC_014334	GGT	2	6	386915	386920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065511
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7475	NC_014334	ATC	2	6	388163	388168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065512
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7490	NC_014334	CAA	2	6	388780	388785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065512
7491	NC_014334	CT	3	6	388822	388827	0 %	50 %	0 %	50 %	301065512
7492	NC_014334	ATT	2	6	388831	388836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065512
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7494	NC_014334	GGC	2	6	388878	388883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065512
7495	NC_014334	CGC	2	6	388931	388936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065512
7496	NC_014334	TGT	2	6	388998	389003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065512
7497	NC_014334	TGA	2	6	389019	389024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065512
7498	NC_014334	CAT	2	6	389048	389053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065512
7499	NC_014334	TTA	2	6	389056	389061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065512
7500	NC_014334	TCA	2	6	389114	389119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065512

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