MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_014334	AGA	2	6	2851558	2851563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067917
55002	NC_014334	TGC	2	6	2851655	2851660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067917
55003	NC_014334	CAT	2	6	2851696	2851701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067917
55004	NC_014334	TCA	2	6	2851702	2851707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067917
55005	NC_014334	TCA	2	6	2851722	2851727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067917
55006	NC_014334	TGT	2	6	2851788	2851793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067917
55007	NC_014334	GTT	2	6	2851809	2851814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067917
55008	NC_014334	TCA	2	6	2851819	2851824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067917
55009	NC_014334	CGC	2	6	2851929	2851934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067917
55010	NC_014334	GCCA	2	8	2851970	2851977	25 %	0 %	25 %	50 %	301067917
55011	NC_014334	GCCC	2	8	2852049	2852056	0 %	0 %	25 %	75 %	301067917
55012	NC_014334	ATGAC	2	10	2852104	2852113	40 %	20 %	20 %	20 %	301067917
55013	NC_014334	CTG	2	6	2852152	2852157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067917
55014	NC_014334	ATC	2	6	2852160	2852165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067917
55015	NC_014334	CAC	2	6	2852173	2852178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067917
55016	NC_014334	GA	3	6	2852182	2852187	50 %	0 %	50 %	0 %	301067917
55017	NC_014334	TTGATC	2	12	2852238	2852249	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	301067917
55018	NC_014334	CAT	2	6	2852287	2852292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067917
55019	NC_014334	GCAT	2	8	2852301	2852308	25 %	25 %	25 %	25 %	301067917
55020	NC_014334	CCGC	2	8	2852374	2852381	0 %	0 %	25 %	75 %	301067917
55021	NC_014334	ATA	2	6	2852474	2852479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067917
55022	NC_014334	AGC	2	6	2852492	2852497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067917
55023	NC_014334	GTTT	2	8	2852499	2852506	0 %	75 %	25 %	0 %	301067917
55024	NC_014334	GCC	2	6	2852542	2852547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067917
55025	NC_014334	CT	3	6	2852622	2852627	0 %	50 %	0 %	50 %	301067918
55026	NC_014334	TGC	2	6	2852759	2852764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067918
55027	NC_014334	GCA	2	6	2852765	2852770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067918
55028	NC_014334	GC	3	6	2852797	2852802	0 %	0 %	50 %	50 %	301067918
55029	NC_014334	GCC	2	6	2852818	2852823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067918
55030	NC_014334	AAT	2	6	2852889	2852894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067918
55031	NC_014334	GAT	2	6	2852908	2852913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067918
55032	NC_014334	TGA	2	6	2852961	2852966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067918
55033	NC_014334	CAC	2	6	2852978	2852983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067918
55034	NC_014334	CGC	2	6	2852988	2852993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067918
55035	NC_014334	GCA	2	6	2853009	2853014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067918
55036	NC_014334	TGA	2	6	2853036	2853041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067918
55037	NC_014334	TAA	2	6	2853085	2853090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067918
55038	NC_014334	ATT	2	6	2853116	2853121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067919
55039	NC_014334	TGA	2	6	2853199	2853204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067919
55040	NC_014334	TAA	3	9	2853274	2853282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067919
55041	NC_014334	CCA	2	6	2853337	2853342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067919
55042	NC_014334	CTT	2	6	2853358	2853363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067919
55043	NC_014334	CGT	3	9	2853374	2853382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067919
55044	NC_014334	GCG	2	6	2853383	2853388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067919
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55049	NC_014334	CTT	2	6	2853556	2853561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067919
55050	NC_014334	CGA	2	6	2853592	2853597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067919
55051	NC_014334	TTGAT	2	10	2853655	2853664	20 %	60 %	20 %	0 %	301067919
55052	NC_014334	AT	3	6	2853753	2853758	50 %	50 %	0 %	0 %	301067919
55053	NC_014334	TC	3	6	2853808	2853813	0 %	50 %	0 %	50 %	301067919
55054	NC_014334	CTC	2	6	2853871	2853876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301067920
55055	NC_014334	TTA	2	6	2853903	2853908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067920
55056	NC_014334	T	6	6	2853918	2853923	0 %	100 %	0 %	0 %	301067920
55057	NC_014334	TGA	2	6	2853939	2853944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067920
55058	NC_014334	TTA	2	6	2853988	2853993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55059	NC_014334	GAAA	2	8	2854045	2854052	75 %	0 %	25 %	0 %	301067921
55060	NC_014334	CAG	2	6	2854093	2854098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067921
55061	NC_014334	GAC	2	6	2854150	2854155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067921
55062	NC_014334	TAA	2	6	2854168	2854173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067921
55063	NC_014334	A	7	7	2854196	2854202	100 %	0 %	0 %	0 %	301067921
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55065	NC_014334	A	7	7	2854315	2854321	100 %	0 %	0 %	0 %	301067922
55066	NC_014334	TC	3	6	2854427	2854432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55067	NC_014334	GGCT	2	8	2854437	2854444	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55068	NC_014334	A	7	7	2854452	2854458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55069	NC_014334	CGC	2	6	2854567	2854572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067923
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55071	NC_014334	CTT	2	6	2854717	2854722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067923
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55089	NC_014334	ACA	2	6	2855928	2855933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067923
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55100	NC_014334	TCC	2	6	2856404	2856409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55101	NC_014334	CGC	2	6	2856526	2856531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067924
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55109	NC_014334	T	6	6	2856832	2856837	0 %	100 %	0 %	0 %	301067924
55110	NC_014334	TG	3	6	2856920	2856925	0 %	50 %	50 %	0 %	301067924
55111	NC_014334	CACG	2	8	2857017	2857024	25 %	0 %	25 %	50 %	301067924
55112	NC_014334	CTC	2	6	2857033	2857038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301067924
55113	NC_014334	CAA	2	6	2857137	2857142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067924
55114	NC_014334	CCTTG	2	10	2857170	2857179	0 %	40 %	20 %	40 %	301067924
55115	NC_014334	AGC	2	6	2857235	2857240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067924
55116	NC_014334	TGG	2	6	2857245	2857250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067924
55117	NC_014334	TCA	2	6	2857256	2857261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067924
55118	NC_014334	CAA	2	6	2857536	2857541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067924
55119	NC_014334	ACA	2	6	2857565	2857570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067924
55120	NC_014334	TCA	2	6	2857619	2857624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067924
55121	NC_014334	CGC	2	6	2857632	2857637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067924
55122	NC_014334	GAT	2	6	2857847	2857852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55123	NC_014334	TG	3	6	2857966	2857971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55124	NC_014334	A	7	7	2858216	2858222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55125	NC_014334	ACT	2	6	2858276	2858281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55126	NC_014334	TTA	2	6	2858288	2858293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55127	NC_014334	AGTT	2	8	2858334	2858341	25 %	50 %	25 %	0 %	301067926
55128	NC_014334	ACGT	2	8	2858404	2858411	25 %	25 %	25 %	25 %	301067926
55129	NC_014334	ATG	2	6	2858450	2858455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067926
55130	NC_014334	CGT	2	6	2858539	2858544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067926
55131	NC_014334	TGA	2	6	2858633	2858638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067926
55132	NC_014334	CTT	2	6	2858666	2858671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067926
55133	NC_014334	GTG	2	6	2858746	2858751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067926
55134	NC_014334	TGG	2	6	2858807	2858812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067926
55135	NC_014334	T	6	6	2858874	2858879	0 %	100 %	0 %	0 %	301067926
55136	NC_014334	TCG	2	6	2858905	2858910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067926
55137	NC_014334	CGG	2	6	2858934	2858939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067926
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55139	NC_014334	TCC	2	6	2859111	2859116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55140	NC_014334	GTT	2	6	2859118	2859123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067927
55141	NC_014334	T	6	6	2859143	2859148	0 %	100 %	0 %	0 %	301067927
55142	NC_014334	CGCT	2	8	2859152	2859159	0 %	25 %	25 %	50 %	301067927
55143	NC_014334	TTCTTT	2	12	2859170	2859181	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	301067927
55144	NC_014334	CTG	2	6	2859242	2859247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067927
55145	NC_014334	ATC	2	6	2859339	2859344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067927
55146	NC_014334	GCT	2	6	2859353	2859358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067927
55147	NC_014334	GTTG	2	8	2859369	2859376	0 %	50 %	50 %	0 %	301067927
55148	NC_014334	CAT	2	6	2859380	2859385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067927
55149	NC_014334	TGA	2	6	2859491	2859496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067927
55150	NC_014334	TCA	2	6	2859606	2859611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067927
55151	NC_014334	CTT	2	6	2859650	2859655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067927
55152	NC_014334	GCG	2	6	2859673	2859678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067927
55153	NC_014334	CTG	2	6	2859686	2859691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067927
55154	NC_014334	TTGA	2	8	2859705	2859712	25 %	50 %	25 %	0 %	301067927
55155	NC_014334	GAT	2	6	2859743	2859748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067927
55156	NC_014334	AAT	2	6	2859761	2859766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067927
55157	NC_014334	GCCA	2	8	2859798	2859805	25 %	0 %	25 %	50 %	301067927
55158	NC_014334	ACA	2	6	2859831	2859836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067927
55159	NC_014334	TTTGA	2	10	2859938	2859947	20 %	60 %	20 %	0 %	301067927
55160	NC_014334	CT	3	6	2859968	2859973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55161	NC_014334	T	6	6	2859973	2859978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55162	NC_014334	GCCA	2	8	2860133	2860140	25 %	0 %	25 %	50 %	301067928
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55164	NC_014334	GCCA	2	8	2860172	2860179	25 %	0 %	25 %	50 %	301067928
55165	NC_014334	A	6	6	2860215	2860220	100 %	0 %	0 %	0 %	301067928
55166	NC_014334	TTC	2	6	2860314	2860319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067928
55167	NC_014334	CTT	2	6	2860429	2860434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067928
55168	NC_014334	T	6	6	2860433	2860438	0 %	100 %	0 %	0 %	301067928
55169	NC_014334	ATG	2	6	2860459	2860464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067928
55170	NC_014334	TTG	2	6	2860529	2860534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067928
55171	NC_014334	TGC	3	9	2860627	2860635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067928
55172	NC_014334	TCA	2	6	2860704	2860709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55173	NC_014334	GTTT	2	8	2860745	2860752	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55174	NC_014334	A	8	8	2860760	2860767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55175	NC_014334	ATA	2	6	2860796	2860801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067929
55176	NC_014334	TTGG	2	8	2860901	2860908	0 %	50 %	50 %	0 %	301067929
55177	NC_014334	GAC	2	6	2860930	2860935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55178	NC_014334	CCT	2	6	2860937	2860942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55179	NC_014334	TTA	2	6	2860960	2860965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55180	NC_014334	CAT	2	6	2860986	2860991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55181	NC_014334	T	6	6	2861026	2861031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55182	NC_014334	ATG	3	9	2861051	2861059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55183	NC_014334	GAA	2	6	2861172	2861177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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55185	NC_014334	T	6	6	2861344	2861349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55186	NC_014334	TGA	2	6	2861462	2861467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55187	NC_014334	TGC	2	6	2861509	2861514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55188	NC_014334	GCT	2	6	2861591	2861596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55189	NC_014334	CAG	2	6	2861656	2861661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55190	NC_014334	AAT	2	6	2861681	2861686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55191	NC_014334	TGA	2	6	2861709	2861714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55192	NC_014334	TA	3	6	2861779	2861784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55193	NC_014334	GGA	2	6	2861834	2861839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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