MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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51002	NC_014334	CTG	2	6	2645773	2645778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067715
51003	NC_014334	GC	3	6	2645848	2645853	0 %	0 %	50 %	50 %	301067715
51004	NC_014334	ATGGC	2	10	2645890	2645899	20 %	20 %	40 %	20 %	301067715
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51008	NC_014334	CTG	2	6	2646165	2646170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067716
51009	NC_014334	T	6	6	2646240	2646245	0 %	100 %	0 %	0 %	301067716
51010	NC_014334	TTGC	2	8	2646248	2646255	0 %	50 %	25 %	25 %	301067716
51011	NC_014334	AAC	2	6	2646313	2646318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067716
51012	NC_014334	TTG	2	6	2646396	2646401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067716
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51014	NC_014334	TCT	2	6	2646550	2646555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067716
51015	NC_014334	AAT	3	9	2646594	2646602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067716
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51118	NC_014334	AGA	2	6	2651628	2651633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067720
51119	NC_014334	ATA	2	6	2651642	2651647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067720
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51131	NC_014334	CAT	2	6	2652265	2652270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067720
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51133	NC_014334	A	6	6	2652354	2652359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51134	NC_014334	CT	3	6	2652388	2652393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51135	NC_014334	AGG	2	6	2652455	2652460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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51145	NC_014334	TCT	2	6	2652839	2652844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067721
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51154	NC_014334	AAGCC	2	10	2653147	2653156	40 %	0 %	20 %	40 %	301067721
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51171	NC_014334	CAA	2	6	2654285	2654290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51183	NC_014334	GCT	2	6	2654827	2654832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067722
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51188	NC_014334	CAA	2	6	2655065	2655070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51189	NC_014334	CTTTC	2	10	2655072	2655081	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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51196	NC_014334	TTAA	2	8	2655743	2655750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51200	NC_014334	AAGA	2	8	2655997	2656004	75 %	0 %	25 %	0 %	301067723
51201	NC_014334	G	6	6	2656078	2656083	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51202	NC_014334	TCAT	2	8	2656146	2656153	25 %	50 %	0 %	25 %	301067724
51203	NC_014334	GCA	2	6	2656242	2656247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067724
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51219	NC_014334	ATT	2	6	2657109	2657114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067724
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51221	NC_014334	GGC	2	6	2657142	2657147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067724
51222	NC_014334	CTG	2	6	2657149	2657154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067724
51223	NC_014334	GGC	2	6	2657175	2657180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067724
51224	NC_014334	TGGCG	2	10	2657181	2657190	0 %	20 %	60 %	20 %	301067724
51225	NC_014334	TGT	2	6	2657207	2657212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067724
51226	NC_014334	CCTG	2	8	2657231	2657238	0 %	25 %	25 %	50 %	301067724
51227	NC_014334	GTT	2	6	2657307	2657312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067724
51228	NC_014334	TTG	2	6	2657319	2657324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067724
51229	NC_014334	GTC	2	6	2657362	2657367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51230	NC_014334	GAT	2	6	2657437	2657442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067725
51231	NC_014334	ACT	2	6	2657472	2657477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067725
51232	NC_014334	ATC	2	6	2657480	2657485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067725
51233	NC_014334	A	6	6	2657558	2657563	100 %	0 %	0 %	0 %	301067725
51234	NC_014334	ATTA	2	8	2657584	2657591	50 %	50 %	0 %	0 %	301067725
51235	NC_014334	ATC	2	6	2657597	2657602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067725
51236	NC_014334	TGGT	2	8	2657615	2657622	0 %	50 %	50 %	0 %	301067725
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51238	NC_014334	CAT	2	6	2657781	2657786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067725
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51351	NC_014334	CGA	2	6	2665282	2665287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067731
51352	NC_014334	TTC	2	6	2665346	2665351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067731
51353	NC_014334	CAT	2	6	2665363	2665368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067731
51354	NC_014334	GTTT	2	8	2665377	2665384	0 %	75 %	25 %	0 %	301067731
51355	NC_014334	TGA	2	6	2665425	2665430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067732
51356	NC_014334	CAAC	2	8	2665439	2665446	50 %	0 %	0 %	50 %	301067732
51357	NC_014334	CAA	2	6	2665472	2665477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067732
51358	NC_014334	GAA	2	6	2665496	2665501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067732
51359	NC_014334	AACA	2	8	2665511	2665518	75 %	0 %	0 %	25 %	301067732
51360	NC_014334	GCT	2	6	2665527	2665532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067732
51361	NC_014334	TCG	2	6	2665569	2665574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067732
51362	NC_014334	CAACA	2	10	2665598	2665607	60 %	0 %	0 %	40 %	301067732
51363	NC_014334	ATC	2	6	2665629	2665634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067732
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51365	NC_014334	ACG	2	6	2665673	2665678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067732
51366	NC_014334	CAGC	2	8	2665693	2665700	25 %	0 %	25 %	50 %	301067732
51367	NC_014334	CAGAA	2	10	2665701	2665710	60 %	0 %	20 %	20 %	301067732
51368	NC_014334	CAA	2	6	2665816	2665821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067732
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51370	NC_014334	CAA	2	6	2665901	2665906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067732
51371	NC_014334	CTG	3	9	2665909	2665917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067732
51372	NC_014334	GTGA	2	8	2665937	2665944	25 %	25 %	50 %	0 %	301067732
51373	NC_014334	GAA	3	9	2665991	2665999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067732
51374	NC_014334	CTG	2	6	2666038	2666043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067732
51375	NC_014334	CATT	2	8	2666044	2666051	25 %	50 %	0 %	25 %	301067732
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51380	NC_014334	GCT	2	6	2666450	2666455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067733
51381	NC_014334	GCA	2	6	2666473	2666478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067733
51382	NC_014334	TTG	2	6	2666487	2666492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067733
51383	NC_014334	TTCA	2	8	2666538	2666545	25 %	50 %	0 %	25 %	301067733
51384	NC_014334	CTT	2	6	2666621	2666626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067734
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51387	NC_014334	GCCA	2	8	2666714	2666721	25 %	0 %	25 %	50 %	301067734
51388	NC_014334	GCACCG	2	12	2666743	2666754	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	301067734
51389	NC_014334	CAA	2	6	2666840	2666845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067734
51390	NC_014334	GCT	2	6	2666860	2666865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067734
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51393	NC_014334	TAT	2	6	2666941	2666946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51394	NC_014334	T	7	7	2667068	2667074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51395	NC_014334	AAGT	2	8	2667080	2667087	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51396	NC_014334	ACA	2	6	2667096	2667101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51397	NC_014334	T	6	6	2667103	2667108	0 %	100 %	0 %	0 %	301067735
51398	NC_014334	GCT	2	6	2667123	2667128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067735
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51401	NC_014334	TGC	2	6	2667383	2667388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067735
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51423	NC_014334	GAT	2	6	2668374	2668379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067736
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51439	NC_014334	ACA	2	6	2669369	2669374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51440	NC_014334	CAA	2	6	2669451	2669456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51441	NC_014334	TTTA	2	8	2669509	2669516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51442	NC_014334	A	7	7	2669560	2669566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51443	NC_014334	A	6	6	2669609	2669614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51444	NC_014334	T	6	6	2669644	2669649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51445	NC_014334	CTG	2	6	2669660	2669665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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51449	NC_014334	AAATT	2	10	2669781	2669790	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51452	NC_014334	GCT	2	6	2669895	2669900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067737
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51459	NC_014334	CCTT	2	8	2670402	2670409	0 %	50 %	0 %	50 %	301067737
51460	NC_014334	TGG	2	6	2670427	2670432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067737
51461	NC_014334	ATT	2	6	2670505	2670510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51462	NC_014334	TTA	2	6	2670639	2670644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067738
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51465	NC_014334	TCG	2	6	2670812	2670817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067739
51466	NC_014334	TCA	2	6	2670822	2670827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067739
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51468	NC_014334	GAC	2	6	2671004	2671009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067739
51469	NC_014334	AACT	2	8	2671031	2671038	50 %	25 %	0 %	25 %	301067740
51470	NC_014334	CAA	3	9	2671073	2671081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067740
51471	NC_014334	CTT	2	6	2671154	2671159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067740
51472	NC_014334	GCAG	2	8	2671219	2671226	25 %	0 %	50 %	25 %	301067740
51473	NC_014334	AAT	2	6	2671428	2671433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067740
51474	NC_014334	GC	3	6	2671551	2671556	0 %	0 %	50 %	50 %	301067740
51475	NC_014334	GCT	2	6	2671627	2671632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067740
51476	NC_014334	GCT	2	6	2671645	2671650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067740
51477	NC_014334	GCA	2	6	2671702	2671707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067740
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51479	NC_014334	CAT	2	6	2671772	2671777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067740
51480	NC_014334	TGATT	2	10	2671790	2671799	20 %	60 %	20 %	0 %	301067740
51481	NC_014334	AT	3	6	2671834	2671839	50 %	50 %	0 %	0 %	301067740
51482	NC_014334	CGCAA	2	10	2671910	2671919	40 %	0 %	20 %	40 %	301067740
51483	NC_014334	GCC	2	6	2671923	2671928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067740
51484	NC_014334	CAA	2	6	2672009	2672014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067740
51485	NC_014334	GCC	2	6	2672040	2672045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067740
51486	NC_014334	GCC	2	6	2672097	2672102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067740
51487	NC_014334	GCC	2	6	2672106	2672111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067740
51488	NC_014334	CCT	2	6	2672168	2672173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51489	NC_014334	CTT	2	6	2672191	2672196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067741
51490	NC_014334	GTTT	2	8	2672244	2672251	0 %	75 %	25 %	0 %	301067741
51491	NC_014334	CCG	2	6	2672286	2672291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067741
51492	NC_014334	TCA	2	6	2672299	2672304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067741
51493	NC_014334	GCA	2	6	2672454	2672459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067741
51494	NC_014334	GTA	2	6	2672474	2672479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067741
51495	NC_014334	AAG	2	6	2672487	2672492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067741
51496	NC_014334	TGC	2	6	2672531	2672536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067741
51497	NC_014334	TTC	2	6	2672606	2672611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067741
51498	NC_014334	AAT	2	6	2672624	2672629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067741
51499	NC_014334	TCA	2	6	2672635	2672640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067741
51500	NC_014334	CAA	2	6	2672645	2672650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067741

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