MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_014334	CAATT	2	10	2594089	2594098	40 %	40 %	0 %	20 %	301067665
50003	NC_014334	GGC	2	6	2594239	2594244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067665
50004	NC_014334	AGC	2	6	2594268	2594273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067665
50005	NC_014334	AAG	2	6	2594279	2594284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067665
50006	NC_014334	TGCCAA	2	12	2594292	2594303	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	301067665
50007	NC_014334	GT	3	6	2594304	2594309	0 %	50 %	50 %	0 %	301067665
50008	NC_014334	TGA	2	6	2594379	2594384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067665
50009	NC_014334	ATC	2	6	2594386	2594391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067665
50010	NC_014334	GCC	2	6	2594410	2594415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067665
50011	NC_014334	A	7	7	2594432	2594438	100 %	0 %	0 %	0 %	301067665
50012	NC_014334	CTG	2	6	2594446	2594451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067665
50013	NC_014334	ACC	2	6	2594475	2594480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067665
50014	NC_014334	TCA	2	6	2594496	2594501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067666
50015	NC_014334	T	6	6	2594517	2594522	0 %	100 %	0 %	0 %	301067666
50016	NC_014334	A	6	6	2594595	2594600	100 %	0 %	0 %	0 %	301067666
50017	NC_014334	TGAT	2	8	2594637	2594644	25 %	50 %	25 %	0 %	301067666
50018	NC_014334	A	8	8	2594702	2594709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50019	NC_014334	AGGT	2	8	2594732	2594739	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50020	NC_014334	CCA	2	6	2594763	2594768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067667
50021	NC_014334	TGCC	2	8	2594851	2594858	0 %	25 %	25 %	50 %	301067667
50022	NC_014334	GCT	2	6	2594871	2594876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067667
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50024	NC_014334	CCG	2	6	2594985	2594990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067667
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50026	NC_014334	GCTT	2	8	2595278	2595285	0 %	50 %	25 %	25 %	301067667
50027	NC_014334	GTAAT	2	10	2595301	2595310	40 %	40 %	20 %	0 %	301067667
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50032	NC_014334	T	6	6	2595735	2595740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50033	NC_014334	GCT	2	6	2595743	2595748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50034	NC_014334	A	6	6	2595775	2595780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50035	NC_014334	TAA	2	6	2595879	2595884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50036	NC_014334	GC	3	6	2595966	2595971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50037	NC_014334	GCT	2	6	2596022	2596027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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50039	NC_014334	AGG	2	6	2596088	2596093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50040	NC_014334	TGG	2	6	2596113	2596118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067668
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50050	NC_014334	TGA	2	6	2596733	2596738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067668
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50052	NC_014334	GAT	2	6	2596965	2596970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067668
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50054	NC_014334	TGA	2	6	2597120	2597125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067668
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50088	NC_014334	CCCAA	2	10	2599241	2599250	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
50089	NC_014334	CTC	2	6	2599265	2599270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50090	NC_014334	TTA	2	6	2599359	2599364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50103	NC_014334	GCCA	2	8	2600325	2600332	25 %	0 %	25 %	50 %	301067673
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50119	NC_014334	GTT	2	6	2601238	2601243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067673
50120	NC_014334	CAT	2	6	2601270	2601275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067673
50121	NC_014334	CAT	2	6	2601333	2601338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067673
50122	NC_014334	TGA	2	6	2601374	2601379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067673
50123	NC_014334	ACCC	2	8	2601399	2601406	25 %	0 %	0 %	75 %	301067673
50124	NC_014334	GTCAAA	2	12	2601457	2601468	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	301067673
50125	NC_014334	CAC	2	6	2601534	2601539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067673
50126	NC_014334	TGT	2	6	2601600	2601605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067673
50127	NC_014334	GCT	2	6	2601608	2601613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067673
50128	NC_014334	TGA	2	6	2601654	2601659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067673
50129	NC_014334	ATT	2	6	2601691	2601696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067673
50130	NC_014334	GGA	2	6	2601750	2601755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301067673
50131	NC_014334	CAT	2	6	2601768	2601773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067673
50132	NC_014334	CAG	2	6	2601816	2601821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067673
50133	NC_014334	ATA	3	9	2601842	2601850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067673
50134	NC_014334	ATG	2	6	2601928	2601933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067673
50135	NC_014334	TTG	2	6	2601938	2601943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067673
50136	NC_014334	GCA	2	6	2602007	2602012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067673
50137	NC_014334	CAT	2	6	2602086	2602091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067673
50138	NC_014334	GTT	2	6	2602214	2602219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067673
50139	NC_014334	T	7	7	2602240	2602246	0 %	100 %	0 %	0 %	301067673
50140	NC_014334	GAT	2	6	2602419	2602424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067673
50141	NC_014334	GTT	2	6	2602441	2602446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067673
50142	NC_014334	TTG	2	6	2602457	2602462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067673
50143	NC_014334	CAG	2	6	2602485	2602490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067673
50144	NC_014334	GCC	2	6	2602517	2602522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067673
50145	NC_014334	CAA	2	6	2602546	2602551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067673
50146	NC_014334	TCA	2	6	2602587	2602592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067673
50147	NC_014334	TTTTG	2	10	2602628	2602637	0 %	80 %	20 %	0 %	301067674
50148	NC_014334	GCT	2	6	2602643	2602648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067674
50149	NC_014334	GAA	2	6	2602659	2602664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067674
50150	NC_014334	AGC	2	6	2602672	2602677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067674
50151	NC_014334	T	6	6	2602678	2602683	0 %	100 %	0 %	0 %	301067674
50152	NC_014334	CTT	2	6	2602703	2602708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067674
50153	NC_014334	CAA	2	6	2602711	2602716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067674
50154	NC_014334	ATA	2	6	2602753	2602758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067674
50155	NC_014334	ATG	2	6	2602826	2602831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067674
50156	NC_014334	CAC	2	6	2602845	2602850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067674
50157	NC_014334	AGT	2	6	2602866	2602871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067674
50158	NC_014334	GTA	2	6	2602876	2602881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067674
50159	NC_014334	CTTATC	2	12	2602882	2602893	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	301067674
50160	NC_014334	TCA	3	9	2603169	2603177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067674
50161	NC_014334	TG	3	6	2603184	2603189	0 %	50 %	50 %	0 %	301067674
50162	NC_014334	T	6	6	2603190	2603195	0 %	100 %	0 %	0 %	301067674
50163	NC_014334	TTC	2	6	2603240	2603245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067674
50164	NC_014334	T	6	6	2603270	2603275	0 %	100 %	0 %	0 %	301067674
50165	NC_014334	CAA	2	6	2603307	2603312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067674
50166	NC_014334	CTTGT	2	10	2603338	2603347	0 %	60 %	20 %	20 %	301067674
50167	NC_014334	CTG	2	6	2603353	2603358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067674
50168	NC_014334	TGT	2	6	2603404	2603409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067674
50169	NC_014334	AAGA	2	8	2603507	2603514	75 %	0 %	25 %	0 %	301067674
50170	NC_014334	TCA	2	6	2603598	2603603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067674
50171	NC_014334	AAC	2	6	2603656	2603661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50172	NC_014334	CAA	2	6	2603772	2603777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067675
50173	NC_014334	AAT	2	6	2603805	2603810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067675
50174	NC_014334	CAT	2	6	2603814	2603819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067675
50175	NC_014334	TCA	2	6	2603855	2603860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067675
50176	NC_014334	TCA	2	6	2603867	2603872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067675
50177	NC_014334	A	6	6	2603931	2603936	100 %	0 %	0 %	0 %	301067675
50178	NC_014334	GAT	2	6	2603991	2603996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067675
50179	NC_014334	GTG	2	6	2604012	2604017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067675
50180	NC_014334	AAC	2	6	2604020	2604025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067675
50181	NC_014334	AT	3	6	2604039	2604044	50 %	50 %	0 %	0 %	301067675
50182	NC_014334	TC	3	6	2604046	2604051	0 %	50 %	0 %	50 %	301067675
50183	NC_014334	GCTA	2	8	2604064	2604071	25 %	25 %	25 %	25 %	301067675
50184	NC_014334	GCTT	2	8	2604095	2604102	0 %	50 %	25 %	25 %	301067675
50185	NC_014334	GTCAG	2	10	2604110	2604119	20 %	20 %	40 %	20 %	301067675
50186	NC_014334	GT	3	6	2604144	2604149	0 %	50 %	50 %	0 %	301067675
50187	NC_014334	AAC	2	6	2604166	2604171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067675
50188	NC_014334	TC	3	6	2604190	2604195	0 %	50 %	0 %	50 %	301067675
50189	NC_014334	GATT	2	8	2604204	2604211	25 %	50 %	25 %	0 %	301067675
50190	NC_014334	ATCA	2	8	2604289	2604296	50 %	25 %	0 %	25 %	301067675
50191	NC_014334	GCA	2	6	2604317	2604322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067675
50192	NC_014334	ACGT	2	8	2604428	2604435	25 %	25 %	25 %	25 %	301067675
50193	NC_014334	GCC	2	6	2604442	2604447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067675
50194	NC_014334	CATGAC	2	12	2604501	2604512	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	301067675
50195	NC_014334	AAT	2	6	2604543	2604548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067675
50196	NC_014334	GCA	2	6	2604599	2604604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067675
50197	NC_014334	TTG	2	6	2604607	2604612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067675
50198	NC_014334	T	6	6	2604625	2604630	0 %	100 %	0 %	0 %	301067675
50199	NC_014334	TAA	2	6	2604664	2604669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067675
50200	NC_014334	GCTG	2	8	2604710	2604717	0 %	25 %	50 %	25 %	301067675
50201	NC_014334	GCG	2	6	2604728	2604733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067675
50202	NC_014334	CAT	2	6	2604817	2604822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067675
50203	NC_014334	T	6	6	2604840	2604845	0 %	100 %	0 %	0 %	301067675
50204	NC_014334	AGC	2	6	2604886	2604891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067675
50205	NC_014334	GCG	2	6	2604933	2604938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067675
50206	NC_014334	ACG	2	6	2605028	2605033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067675
50207	NC_014334	CAT	2	6	2605149	2605154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067675
50208	NC_014334	CCA	2	6	2605194	2605199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067675
50209	NC_014334	TAA	2	6	2605225	2605230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067675
50210	NC_014334	A	6	6	2605293	2605298	100 %	0 %	0 %	0 %	301067675
50211	NC_014334	TGGG	2	8	2605457	2605464	0 %	25 %	75 %	0 %	301067675
50212	NC_014334	A	6	6	2605490	2605495	100 %	0 %	0 %	0 %	301067675
50213	NC_014334	TAT	2	6	2605497	2605502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067675
50214	NC_014334	TGT	2	6	2605544	2605549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067675
50215	NC_014334	TGC	2	6	2605550	2605555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067675
50216	NC_014334	GCT	2	6	2605584	2605589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067675
50217	NC_014334	CCT	2	6	2605606	2605611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301067676
50218	NC_014334	CAC	2	6	2605613	2605618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067676
50219	NC_014334	TCT	2	6	2605680	2605685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067676
50220	NC_014334	ATCA	2	8	2605718	2605725	50 %	25 %	0 %	25 %	301067676
50221	NC_014334	GAC	2	6	2605844	2605849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067676
50222	NC_014334	AAT	2	6	2605862	2605867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067676
50223	NC_014334	TCA	2	6	2605879	2605884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067676
50224	NC_014334	GTT	2	6	2605974	2605979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067677
50225	NC_014334	TGC	2	6	2605997	2606002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067677
50226	NC_014334	GTG	2	6	2606073	2606078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067677
50227	NC_014334	GCG	2	6	2606142	2606147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067677
50228	NC_014334	CAC	2	6	2606148	2606153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067677
50229	NC_014334	GTT	2	6	2606231	2606236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067677
50230	NC_014334	AGACA	2	10	2606296	2606305	60 %	0 %	20 %	20 %	301067677
50231	NC_014334	T	6	6	2606366	2606371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50232	NC_014334	GTC	2	6	2606381	2606386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50233	NC_014334	CAA	2	6	2606510	2606515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067678
50234	NC_014334	CTT	3	9	2606547	2606555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067678
50235	NC_014334	TGCCA	2	10	2606674	2606683	20 %	20 %	20 %	40 %	301067678
50236	NC_014334	ATG	2	6	2606785	2606790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067678
50237	NC_014334	TGCAA	2	10	2606893	2606902	40 %	20 %	20 %	20 %	301067678
50238	NC_014334	CG	3	6	2606997	2607002	0 %	0 %	50 %	50 %	301067678
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50329	NC_014334	T	6	6	2611920	2611925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50330	NC_014334	A	6	6	2611961	2611966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50333	NC_014334	ATT	2	6	2612063	2612068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50334	NC_014334	ACCTAT	2	12	2612192	2612203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067684
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50342	NC_014334	GCCAA	2	10	2612519	2612528	40 %	0 %	20 %	40 %	301067684
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50344	NC_014334	AT	3	6	2612569	2612574	50 %	50 %	0 %	0 %	301067684
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50346	NC_014334	ATT	2	6	2612767	2612772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067684
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50348	NC_014334	TG	3	6	2612853	2612858	0 %	50 %	50 %	0 %	301067684
50349	NC_014334	ATG	2	6	2612874	2612879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067684
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50351	NC_014334	TCA	2	6	2612960	2612965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067685
50352	NC_014334	GAA	3	9	2612970	2612978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067685
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50354	NC_014334	GTT	2	6	2613237	2613242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067685
50355	NC_014334	GAT	2	6	2613296	2613301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067685
50356	NC_014334	CGC	2	6	2613303	2613308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067685
50357	NC_014334	ACT	2	6	2613314	2613319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067685
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50372	NC_014334	GTT	2	6	2613935	2613940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50373	NC_014334	AACT	2	8	2614011	2614018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50374	NC_014334	GTC	2	6	2614074	2614079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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50379	NC_014334	TGG	2	6	2614419	2614424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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50382	NC_014334	ATG	2	6	2614569	2614574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50383	NC_014334	CAA	2	6	2614596	2614601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50384	NC_014334	TCC	2	6	2614606	2614611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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50386	NC_014334	TGC	2	6	2614658	2614663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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50393	NC_014334	TGC	2	6	2614988	2614993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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50399	NC_014334	CGT	2	6	2615264	2615269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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50471	NC_014334	GAT	2	6	2619371	2619376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067689
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