MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 chromosome

Total Repeats: 44115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_014136	TGA	2	6	1997490	1997495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112154
44002	NC_014136	ACC	2	6	1997500	1997505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296112154
44003	NC_014136	A	6	6	1997512	1997517	100 %	0 %	0 %	0 %	296112154
44004	NC_014136	GTTT	2	8	1997568	1997575	0 %	75 %	25 %	0 %	296112154
44005	NC_014136	GCT	2	6	1997591	1997596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112154
44006	NC_014136	TAT	2	6	1997673	1997678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296112154
44007	NC_014136	ATT	2	6	1997725	1997730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296112154
44008	NC_014136	ATTT	2	8	1997842	1997849	25 %	75 %	0 %	0 %	296112154
44009	NC_014136	ATT	3	9	1997867	1997875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296112154
44010	NC_014136	CAA	2	6	1997892	1997897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296112154
44011	NC_014136	ATTT	2	8	1997931	1997938	25 %	75 %	0 %	0 %	296112154
44012	NC_014136	TAAA	2	8	1997945	1997952	75 %	25 %	0 %	0 %	296112154
44013	NC_014136	ATA	2	6	1998010	1998015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44014	NC_014136	GT	3	6	1998117	1998122	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44015	NC_014136	AT	3	6	1998144	1998149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44016	NC_014136	AGG	2	6	1998153	1998158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44017	NC_014136	GA	3	6	1998229	1998234	50 %	0 %	50 %	0 %	296112155
44018	NC_014136	AG	3	6	1998242	1998247	50 %	0 %	50 %	0 %	296112155
44019	NC_014136	TGA	2	6	1998301	1998306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112155
44020	NC_014136	TTTA	2	8	1998369	1998376	25 %	75 %	0 %	0 %	296112155
44021	NC_014136	GTG	2	6	1998384	1998389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296112155
44022	NC_014136	TTC	2	6	1998403	1998408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296112155
44023	NC_014136	ATG	2	6	1998426	1998431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112155
44024	NC_014136	TCA	2	6	1998445	1998450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112155
44025	NC_014136	CGG	2	6	1998469	1998474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296112155
44026	NC_014136	CAG	2	6	1998522	1998527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112155
44027	NC_014136	TGG	2	6	1998544	1998549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296112155
44028	NC_014136	GTT	2	6	1998578	1998583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296112155
44029	NC_014136	TTGA	2	8	1998674	1998681	25 %	50 %	25 %	0 %	296112155
44030	NC_014136	ATA	2	6	1998690	1998695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296112155
44031	NC_014136	TGA	2	6	1998706	1998711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112155
44032	NC_014136	AGC	2	6	1998756	1998761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112155
44033	NC_014136	TTG	2	6	1998822	1998827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296112155
44034	NC_014136	TCA	2	6	1998871	1998876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112155
44035	NC_014136	ACA	2	6	1998946	1998951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296112155
44036	NC_014136	A	6	6	1998955	1998960	100 %	0 %	0 %	0 %	296112155
44037	NC_014136	ATG	2	6	1998962	1998967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296112155
44038	NC_014136	A	6	6	1998980	1998985	100 %	0 %	0 %	0 %	296112155
44039	NC_014136	ATT	2	6	1999012	1999017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44040	NC_014136	CA	3	6	1999034	1999039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44041	NC_014136	GA	3	6	1999204	1999209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44042	NC_014136	AAT	2	6	1999210	1999215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296112156
44043	NC_014136	ATT	2	6	1999249	1999254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296112156
44044	NC_014136	TAT	2	6	1999282	1999287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296112156
44045	NC_014136	CAA	2	6	1999302	1999307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296112156
44046	NC_014136	ATT	2	6	1999349	1999354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296112156
44047	NC_014136	TCA	2	6	1999394	1999399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112156
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44049	NC_014136	CCAA	2	8	1999514	1999521	50 %	0 %	0 %	50 %	296112156
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44052	NC_014136	ATA	2	6	1999635	1999640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296112156
44053	NC_014136	ACA	2	6	1999673	1999678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296112156
44054	NC_014136	GCT	2	6	1999724	1999729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296112156
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44056	NC_014136	GGGT	2	8	1999757	1999764	0 %	25 %	75 %	0 %	296112156
44057	NC_014136	TAA	2	6	1999795	1999800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296112156
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44060	NC_014136	ATT	2	6	1999833	1999838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296112156
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44074	NC_014136	ATGGC	2	10	2000637	2000646	20 %	20 %	40 %	20 %	296112156
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44084	NC_014136	T	7	7	2001051	2001057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44085	NC_014136	A	8	8	2001072	2001079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44086	NC_014136	GAT	2	6	2001080	2001085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44087	NC_014136	ATC	2	6	2001101	2001106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44088	NC_014136	T	6	6	2001107	2001112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44089	NC_014136	A	6	6	2001137	2001142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44090	NC_014136	GTTT	2	8	2001177	2001184	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44091	NC_014136	ATA	2	6	2001205	2001210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44092	NC_014136	TA	3	6	2001209	2001214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44093	NC_014136	A	7	7	2001271	2001277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44094	NC_014136	ATTTT	2	10	2001281	2001290	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44095	NC_014136	TGT	2	6	2001308	2001313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44096	NC_014136	ATTT	2	8	2001398	2001405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44097	NC_014136	T	6	6	2001456	2001461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44098	NC_014136	TTA	3	9	2001496	2001504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44099	NC_014136	TGA	2	6	2001574	2001579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44100	NC_014136	CAG	2	6	2001711	2001716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296112157
44101	NC_014136	CGTT	2	8	2001746	2001753	0 %	50 %	25 %	25 %	296112157
44102	NC_014136	CGTA	2	8	2001804	2001811	25 %	25 %	25 %	25 %	296112157
44103	NC_014136	TAAA	3	12	2001824	2001835	75 %	25 %	0 %	0 %	296112157
44104	NC_014136	CAT	2	6	2001924	2001929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112157
44105	NC_014136	ACCA	2	8	2001955	2001962	50 %	0 %	0 %	50 %	296112157
44106	NC_014136	TCA	2	6	2002020	2002025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112157
44107	NC_014136	ATT	2	6	2002060	2002065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296112157
44108	NC_014136	ATC	3	9	2002103	2002111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296112157
44109	NC_014136	ATCT	2	8	2002303	2002310	25 %	50 %	0 %	25 %	296112157
44110	NC_014136	TGAT	2	8	2002357	2002364	25 %	50 %	25 %	0 %	296112157
44111	NC_014136	TGCCA	2	10	2002425	2002434	20 %	20 %	20 %	40 %	296112157
44112	NC_014136	GT	3	6	2002465	2002470	0 %	50 %	50 %	0 %	296112157
44113	NC_014136	ATT	2	6	2002612	2002617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44114	NC_014136	TC	3	6	2002621	2002626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44115	NC_014136	AAC	2	6	2002686	2002691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.