MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus crispatus ST1

Total Repeats: 44792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7003	NC_014106	GAT	2	6	318297	318302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692162
7004	NC_014106	AAG	2	6	318303	318308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692162
7005	NC_014106	GAA	2	6	318363	318368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692162
7006	NC_014106	TCG	2	6	318455	318460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692162
7007	NC_014106	TAAC	2	8	318481	318488	50 %	25 %	0 %	25 %	295692162
7008	NC_014106	AGA	2	6	318527	318532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692162
7009	NC_014106	CAA	2	6	318533	318538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692162
7010	NC_014106	AGG	2	6	318544	318549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7013	NC_014106	GTG	3	9	318718	318726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692163
7014	NC_014106	CAAA	2	8	318731	318738	75 %	0 %	0 %	25 %	295692163
7015	NC_014106	ATC	2	6	318747	318752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692163
7016	NC_014106	TTGCT	2	10	318829	318838	0 %	60 %	20 %	20 %	295692163
7017	NC_014106	AAG	2	6	319022	319027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692163
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7019	NC_014106	TCA	2	6	319113	319118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692163
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7021	NC_014106	GTTG	2	8	319192	319199	0 %	50 %	50 %	0 %	295692163
7022	NC_014106	TGG	3	9	319253	319261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692163
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7029	NC_014106	GTA	2	6	319420	319425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692164
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7042	NC_014106	AGGA	2	8	319698	319705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7121	NC_014106	GCT	3	9	324299	324307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692176
7122	NC_014106	GCAAAG	2	12	324332	324343	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	295692176
7123	NC_014106	TGT	2	6	324355	324360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692176
7124	NC_014106	TGC	2	6	324412	324417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692176
7125	NC_014106	GTT	2	6	324547	324552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692177
7126	NC_014106	TGC	2	6	324576	324581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692177
7127	NC_014106	TTG	4	12	324584	324595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692177
7128	NC_014106	AAG	2	6	324638	324643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692177
7129	NC_014106	AGA	2	6	324669	324674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692177
7130	NC_014106	AAG	2	6	324679	324684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692177
7131	NC_014106	TAC	2	6	324711	324716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692177
7132	NC_014106	CTG	2	6	324770	324775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692177
7133	NC_014106	TGC	2	6	324792	324797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692177
7134	NC_014106	TGG	2	6	324798	324803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692177
7135	NC_014106	CGTA	2	8	324807	324814	25 %	25 %	25 %	25 %	295692177
7136	NC_014106	GTT	2	6	324883	324888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692177
7137	NC_014106	GAA	2	6	324909	324914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692177
7138	NC_014106	GAA	2	6	324928	324933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692177
7139	NC_014106	CAA	2	6	325035	325040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692178
7140	NC_014106	TGT	2	6	325085	325090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692178
7141	NC_014106	GCT	2	6	325104	325109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692178
7142	NC_014106	GTG	2	6	325114	325119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692178
7143	NC_014106	ATT	2	6	325121	325126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692178
7144	NC_014106	AGG	2	6	325177	325182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7145	NC_014106	CTG	2	6	325215	325220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692179
7146	NC_014106	GGT	2	6	325346	325351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692179
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7148	NC_014106	GAT	2	6	325430	325435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692179
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7150	NC_014106	AGTTA	2	10	325546	325555	40 %	40 %	20 %	0 %	295692179
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7152	NC_014106	AAGC	2	8	325589	325596	50 %	0 %	25 %	25 %	295692179
7153	NC_014106	GAA	2	6	325647	325652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692180
7154	NC_014106	ATCGG	2	10	325715	325724	20 %	20 %	40 %	20 %	295692180
7155	NC_014106	TGG	3	9	325812	325820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692180
7156	NC_014106	GCT	2	6	325887	325892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692180
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7160	NC_014106	CTG	2	6	326102	326107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692180
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7172	NC_014106	ACT	2	6	326557	326562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692180
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7174	NC_014106	TGA	2	6	326726	326731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692180
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7180	NC_014106	TCA	2	6	326918	326923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692180
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7190	NC_014106	TAA	2	6	327583	327588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692181
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7193	NC_014106	GGA	2	6	327659	327664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7194	NC_014106	GAT	2	6	327680	327685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692182
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7197	NC_014106	TG	3	6	327937	327942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7202	NC_014106	AGG	2	6	328408	328413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7203	NC_014106	CGT	2	6	328448	328453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692184
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7224	NC_014106	TCAA	2	8	329456	329463	50 %	25 %	0 %	25 %	295692185
7225	NC_014106	TGC	2	6	329485	329490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692185
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7229	NC_014106	AAG	2	6	329588	329593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692185
7230	NC_014106	GTTC	2	8	329627	329634	0 %	50 %	25 %	25 %	295692185
7231	NC_014106	ATG	2	6	329702	329707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692185
7232	NC_014106	GAA	2	6	329738	329743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692185
7233	NC_014106	AAAT	2	8	329749	329756	75 %	25 %	0 %	0 %	295692185
7234	NC_014106	AAG	2	6	329784	329789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692185
7235	NC_014106	AGG	2	6	329809	329814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7236	NC_014106	ACT	2	6	329882	329887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692186
7237	NC_014106	TAC	2	6	329914	329919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692186
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7239	NC_014106	GAT	2	6	329959	329964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692186
7240	NC_014106	GCG	2	6	329979	329984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295692186
7241	NC_014106	AGC	2	6	329989	329994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692186
7242	NC_014106	AGA	2	6	329996	330001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692186
7243	NC_014106	GCT	2	6	330005	330010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692186
7244	NC_014106	GAA	2	6	330044	330049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692186
7245	NC_014106	GTT	3	9	330059	330067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692186
7246	NC_014106	TGG	2	6	330124	330129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692186
7247	NC_014106	GCT	2	6	330173	330178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692186
7248	NC_014106	GAT	2	6	330268	330273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7249	NC_014106	GAT	2	6	330296	330301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7250	NC_014106	ATC	2	6	330305	330310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7251	NC_014106	T	8	8	330326	330333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7252	NC_014106	T	7	7	330338	330344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7253	NC_014106	TAA	2	6	330358	330363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7254	NC_014106	A	6	6	330446	330451	100 %	0 %	0 %	0 %	295692187
7255	NC_014106	TAAAA	2	10	330475	330484	80 %	20 %	0 %	0 %	295692187
7256	NC_014106	ATTA	2	8	330544	330551	50 %	50 %	0 %	0 %	295692187
7257	NC_014106	TAA	2	6	330577	330582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692187
7258	NC_014106	TTG	2	6	330681	330686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692187
7259	NC_014106	GAT	2	6	330701	330706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692187
7260	NC_014106	TA	3	6	330797	330802	50 %	50 %	0 %	0 %	295692187
7261	NC_014106	TGG	2	6	330826	330831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692187
7262	NC_014106	ATT	3	9	330881	330889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692187
7263	NC_014106	GA	3	6	330925	330930	50 %	0 %	50 %	0 %	295692187
7264	NC_014106	ATT	2	6	330944	330949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692187
7265	NC_014106	AAAG	2	8	330958	330965	75 %	0 %	25 %	0 %	295692187
7266	NC_014106	AGA	2	6	330966	330971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692187
7267	NC_014106	TGA	2	6	331003	331008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692187
7268	NC_014106	TGA	2	6	331021	331026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692187
7269	NC_014106	ATG	2	6	331041	331046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692187
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7271	NC_014106	TAAAT	2	10	331147	331156	60 %	40 %	0 %	0 %	295692187
7272	NC_014106	A	6	6	331273	331278	100 %	0 %	0 %	0 %	295692188
7273	NC_014106	TTG	2	6	331319	331324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692188
7274	NC_014106	GCA	2	6	331365	331370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692188
7275	NC_014106	GAT	2	6	331567	331572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692188
7276	NC_014106	GGA	2	6	331657	331662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295692188
7277	NC_014106	GCG	2	6	331668	331673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295692188
7278	NC_014106	TGA	2	6	331698	331703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692188
7279	NC_014106	CAG	2	6	331730	331735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692188
7280	NC_014106	ATG	2	6	331765	331770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692188
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7282	NC_014106	ATA	2	6	331823	331828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692188
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7284	NC_014106	GAT	2	6	331852	331857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692188
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7286	NC_014106	ATG	2	6	331892	331897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692188
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7296	NC_014106	TGG	2	6	332328	332333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692189
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7299	NC_014106	ATTA	2	8	332415	332422	50 %	50 %	0 %	0 %	295692189
7300	NC_014106	TAC	2	6	332448	332453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692189
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7315	NC_014106	A	6	6	333288	333293	100 %	0 %	0 %	0 %	295692190
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7321	NC_014106	TAGTA	2	10	333684	333693	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7322	NC_014106	GGA	2	6	333747	333752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7323	NC_014106	TAC	2	6	333765	333770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692191
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7327	NC_014106	CGTTAT	2	12	333921	333932	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	295692191
7328	NC_014106	AGATT	2	10	333944	333953	40 %	40 %	20 %	0 %	295692191
7329	NC_014106	CTA	2	6	333981	333986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692191
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7333	NC_014106	TTGC	2	8	334036	334043	0 %	50 %	25 %	25 %	295692191
7334	NC_014106	TAA	2	6	334044	334049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692191
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7339	NC_014106	CATTAA	2	12	334369	334380	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	295692192
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7344	NC_014106	GAA	2	6	334571	334576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692192
7345	NC_014106	TA	3	6	334628	334633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7346	NC_014106	T	7	7	334662	334668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7347	NC_014106	ATA	2	6	334706	334711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7348	NC_014106	A	7	7	334727	334733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7349	NC_014106	T	6	6	334774	334779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7350	NC_014106	AAAG	2	8	334843	334850	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7351	NC_014106	GAA	2	6	334864	334869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692193
7352	NC_014106	ACT	2	6	334885	334890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692193
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7356	NC_014106	ATA	2	6	334959	334964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692193
7357	NC_014106	AGC	2	6	334972	334977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692193
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7359	NC_014106	GGT	2	6	335036	335041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692193
7360	NC_014106	TAC	2	6	335104	335109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692193
7361	NC_014106	AAG	2	6	335120	335125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692193
7362	NC_014106	TAA	2	6	335134	335139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692193
7363	NC_014106	GAA	2	6	335206	335211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692194
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