MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria seeligeri serovar 1/2b str. SLCC3954 chromosome

Total Repeats: 65023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_013891	CGT	2	6	1826506	1826511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289435141
42502	NC_013891	CGT	2	6	1826554	1826559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289435141
42503	NC_013891	AATA	2	8	1826560	1826567	75 %	25 %	0 %	0 %	289435141
42504	NC_013891	TG	3	6	1826613	1826618	0 %	50 %	50 %	0 %	289435141
42505	NC_013891	AT	3	6	1826706	1826711	50 %	50 %	0 %	0 %	289435141
42506	NC_013891	GCT	2	6	1826733	1826738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289435141
42507	NC_013891	ACC	2	6	1826741	1826746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289435141
42508	NC_013891	TAATT	2	10	1826747	1826756	40 %	60 %	0 %	0 %	289435141
42509	NC_013891	A	6	6	1826820	1826825	100 %	0 %	0 %	0 %	289435141
42510	NC_013891	TCG	2	6	1826836	1826841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289435141
42511	NC_013891	AGT	2	6	1826897	1826902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289435141
42512	NC_013891	TAT	2	6	1826920	1826925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289435141
42513	NC_013891	T	7	7	1826935	1826941	0 %	100 %	0 %	0 %	289435141
42514	NC_013891	ACCA	2	8	1826956	1826963	50 %	0 %	0 %	50 %	289435141
42515	NC_013891	TGA	2	6	1826991	1826996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289435141
42516	NC_013891	CAA	2	6	1827019	1827024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289435141
42517	NC_013891	TCA	2	6	1827036	1827041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289435141
42518	NC_013891	ACG	2	6	1827062	1827067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289435141
42519	NC_013891	AT	3	6	1827098	1827103	50 %	50 %	0 %	0 %	289435141
42520	NC_013891	TTA	2	6	1827105	1827110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289435141
42521	NC_013891	A	6	6	1827116	1827121	100 %	0 %	0 %	0 %	289435141
42522	NC_013891	CCAA	2	8	1827122	1827129	50 %	0 %	0 %	50 %	289435141
42523	NC_013891	AATC	2	8	1827154	1827161	50 %	25 %	0 %	25 %	289435141
42524	NC_013891	TTA	2	6	1827186	1827191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289435141
42525	NC_013891	CTG	2	6	1827244	1827249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289435141
42526	NC_013891	A	8	8	1827413	1827420	100 %	0 %	0 %	0 %	289435141
42527	NC_013891	TCT	2	6	1827426	1827431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289435141
42528	NC_013891	T	7	7	1827451	1827457	0 %	100 %	0 %	0 %	289435141
42529	NC_013891	ATTA	2	8	1827464	1827471	50 %	50 %	0 %	0 %	289435141
42530	NC_013891	CCATT	2	10	1827543	1827552	20 %	40 %	0 %	40 %	289435141
42531	NC_013891	TTC	2	6	1827572	1827577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289435141
42532	NC_013891	AAT	2	6	1827596	1827601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289435141
42533	NC_013891	CTG	2	6	1827666	1827671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42534	NC_013891	AC	4	8	1827674	1827681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42535	NC_013891	TAA	2	6	1827725	1827730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289435142
42536	NC_013891	GGAA	2	8	1827797	1827804	50 %	0 %	50 %	0 %	289435142
42537	NC_013891	ACT	2	6	1827917	1827922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289435142
42538	NC_013891	TCC	2	6	1827926	1827931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289435142
42539	NC_013891	CCA	2	6	1827939	1827944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289435142
42540	NC_013891	CGTCGG	2	12	1828006	1828017	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	289435142
42541	NC_013891	TCCG	2	8	1828181	1828188	0 %	25 %	25 %	50 %	289435142
42542	NC_013891	CAA	2	6	1828372	1828377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289435142
42543	NC_013891	TC	3	6	1828383	1828388	0 %	50 %	0 %	50 %	289435142
42544	NC_013891	TCGGCA	2	12	1828404	1828415	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289435142
42545	NC_013891	CGTCAG	2	12	1828468	1828479	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289435142
42546	NC_013891	GCATCG	2	12	1828533	1828544	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289435142
42547	NC_013891	TCGGCA	2	12	1828596	1828607	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289435142
42548	NC_013891	GCATCG	2	12	1828677	1828688	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289435142
42549	NC_013891	GCATCA	2	12	1828707	1828718	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289435142
42550	NC_013891	TCCGCA	2	12	1828746	1828757	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289435142
42551	NC_013891	GCATCA	2	12	1828863	1828874	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289435142
42552	NC_013891	GCGTCA	2	12	1829001	1829012	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289435142
42553	NC_013891	GCATCG	3	18	1829013	1829030	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289435142
42554	NC_013891	GCGTCA	2	12	1829127	1829138	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289435142
42555	NC_013891	GCATCG	2	12	1829163	1829174	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289435142
42556	NC_013891	GCGTCA	2	12	1829175	1829186	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289435142
42557	NC_013891	CGTCAG	2	12	1829224	1829235	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289435142
42558	NC_013891	TCAGCA	2	12	1829244	1829255	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289435142
42559	NC_013891	TCGGCA	5	30	1829310	1829339	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289435142
42560	NC_013891	GCATCG	3	18	1829373	1829390	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289435142
42561	NC_013891	TCCGCA	2	12	1829406	1829417	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289435142
42562	NC_013891	GCATCG	2	12	1829577	1829588	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289435142
42563	NC_013891	TCCGCA	2	12	1829610	1829621	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289435142
42564	NC_013891	GCATCA	2	12	1829625	1829636	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	289435142
42565	NC_013891	GCATCG	2	12	1829673	1829684	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289435142
42566	NC_013891	CAA	2	6	1829762	1829767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289435142
42567	NC_013891	GCA	2	6	1829799	1829804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289435142
42568	NC_013891	AATC	2	8	1829860	1829867	50 %	25 %	0 %	25 %	289435142
42569	NC_013891	TAC	2	6	1829887	1829892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289435142
42570	NC_013891	CTA	2	6	1829940	1829945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289435142
42571	NC_013891	ATTACT	2	12	1829960	1829971	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	289435142
42572	NC_013891	TTCCTA	2	12	1830007	1830018	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	289435142
42573	NC_013891	AGA	2	6	1830077	1830082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289435142
42574	NC_013891	ATA	2	6	1830110	1830115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289435142
42575	NC_013891	TGC	2	6	1830122	1830127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289435142
42576	NC_013891	TAG	2	6	1830220	1830225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289435142
42577	NC_013891	CAT	2	6	1830299	1830304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289435142
42578	NC_013891	GTT	2	6	1830306	1830311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289435142
42579	NC_013891	GTA	2	6	1830312	1830317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289435142
42580	NC_013891	AGC	2	6	1830323	1830328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289435142
42581	NC_013891	T	6	6	1830389	1830394	0 %	100 %	0 %	0 %	289435142
42582	NC_013891	CAT	2	6	1830395	1830400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289435142
42583	NC_013891	CAT	2	6	1830423	1830428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42584	NC_013891	TTAA	2	8	1830465	1830472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42585	NC_013891	TAA	2	6	1830480	1830485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42586	NC_013891	AGTA	2	8	1830493	1830500	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42587	NC_013891	CCCT	2	8	1830554	1830561	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42588	NC_013891	TAA	2	6	1830591	1830596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42589	NC_013891	TA	3	6	1830615	1830620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42590	NC_013891	AGA	2	6	1830653	1830658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42591	NC_013891	A	7	7	1830658	1830664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42592	NC_013891	TTA	2	6	1830720	1830725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42593	NC_013891	ATA	2	6	1830746	1830751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42594	NC_013891	TTC	2	6	1830823	1830828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42595	NC_013891	TAT	2	6	1830832	1830837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42596	NC_013891	A	7	7	1830851	1830857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42597	NC_013891	TAA	2	6	1830896	1830901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289435143
42598	NC_013891	T	7	7	1830909	1830915	0 %	100 %	0 %	0 %	289435143
42599	NC_013891	TTTC	2	8	1830951	1830958	0 %	75 %	0 %	25 %	289435143
42600	NC_013891	TCA	2	6	1830995	1831000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289435143
42601	NC_013891	GCG	2	6	1831004	1831009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289435143
42602	NC_013891	AT	3	6	1831013	1831018	50 %	50 %	0 %	0 %	289435143
42603	NC_013891	CAG	2	6	1831038	1831043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289435143
42604	NC_013891	T	6	6	1831060	1831065	0 %	100 %	0 %	0 %	289435143
42605	NC_013891	T	6	6	1831099	1831104	0 %	100 %	0 %	0 %	289435143
42606	NC_013891	GCA	2	6	1831112	1831117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289435143
42607	NC_013891	ATC	2	6	1831141	1831146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289435143
42608	NC_013891	CTG	2	6	1831218	1831223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289435143
42609	NC_013891	AGAAC	2	10	1831235	1831244	60 %	0 %	20 %	20 %	289435143
42610	NC_013891	A	6	6	1831270	1831275	100 %	0 %	0 %	0 %	289435143
42611	NC_013891	ATC	2	6	1831300	1831305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289435143
42612	NC_013891	TCAA	2	8	1831328	1831335	50 %	25 %	0 %	25 %	289435143
42613	NC_013891	TTG	2	6	1831356	1831361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289435143
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42615	NC_013891	GCTTT	2	10	1831458	1831467	0 %	60 %	20 %	20 %	289435143
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42852	NC_013891	TGCATC	2	12	1841134	1841145	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289435151
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42957	NC_013891	T	6	6	1845716	1845721	0 %	100 %	0 %	0 %	289435155
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42965	NC_013891	CTT	2	6	1845978	1845983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42966	NC_013891	ATC	2	6	1846108	1846113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289435156
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42970	NC_013891	TTG	2	6	1846416	1846421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289435156
42971	NC_013891	TGAAT	2	10	1846484	1846493	40 %	40 %	20 %	0 %	289435156
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42973	NC_013891	ACC	2	6	1846566	1846571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289435156
42974	NC_013891	GTT	2	6	1846649	1846654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289435156
42975	NC_013891	CAG	2	6	1846697	1846702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289435156
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42980	NC_013891	ATC	3	9	1846961	1846969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289435157
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42998	NC_013891	TTG	2	6	1847558	1847563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289435157
42999	NC_013891	TTC	2	6	1847678	1847683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289435157
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