MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes 08-5923

Total Repeats: 68375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013768	ATGT	2	8	180521	180528	25 %	50 %	25 %	0 %	284993613
4002	NC_013768	TTA	2	6	180548	180553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993613
4003	NC_013768	GAT	2	6	180670	180675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993613
4004	NC_013768	TTG	2	6	180759	180764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993613
4005	NC_013768	TGT	2	6	180774	180779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993613
4006	NC_013768	TTTA	2	8	180784	180791	25 %	75 %	0 %	0 %	284993613
4007	NC_013768	AATT	2	8	180807	180814	50 %	50 %	0 %	0 %	284993613
4008	NC_013768	TGA	2	6	180828	180833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993613
4009	NC_013768	TTC	2	6	180844	180849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284993613
4010	NC_013768	AGTT	2	8	180871	180878	25 %	50 %	25 %	0 %	284993613
4011	NC_013768	CATT	2	8	180948	180955	25 %	50 %	0 %	25 %	284993613
4012	NC_013768	TGG	2	6	180961	180966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284993613
4013	NC_013768	GTGCT	2	10	180969	180978	0 %	40 %	40 %	20 %	284993613
4014	NC_013768	ATT	2	6	181013	181018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993613
4015	NC_013768	AGA	2	6	181039	181044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993613
4016	NC_013768	GTC	2	6	181052	181057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_013768	AAT	2	6	181060	181065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_013768	AT	3	6	181114	181119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_013768	GAAAC	2	10	181185	181194	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4020	NC_013768	GA	3	6	181205	181210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_013768	ATGAA	2	10	181211	181220	60 %	20 %	20 %	0 %	284993614
4022	NC_013768	ATTTTT	2	12	181224	181235	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	284993614
4023	NC_013768	TAT	2	6	181251	181256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993614
4024	NC_013768	AAG	2	6	181319	181324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993614
4025	NC_013768	AGAA	2	8	181367	181374	75 %	0 %	25 %	0 %	284993614
4026	NC_013768	GTG	2	6	181499	181504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284993614
4027	NC_013768	TA	3	6	181505	181510	50 %	50 %	0 %	0 %	284993614
4028	NC_013768	GGTAAA	2	12	181546	181557	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284993614
4029	NC_013768	A	6	6	181612	181617	100 %	0 %	0 %	0 %	284993614
4030	NC_013768	TAAA	2	8	181743	181750	75 %	25 %	0 %	0 %	284993614
4031	NC_013768	TA	3	6	181782	181787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_013768	A	7	7	181865	181871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_013768	TA	3	6	181984	181989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_013768	AAG	2	6	181995	182000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_013768	ATTC	2	8	182029	182036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4036	NC_013768	AATA	2	8	182037	182044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_013768	CTAA	2	8	182079	182086	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_013768	A	8	8	182105	182112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_013768	AGA	2	6	182158	182163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_013768	A	7	7	182163	182169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_013768	ACA	2	6	182182	182187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_013768	T	6	6	182193	182198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_013768	TTAT	2	8	182204	182211	25 %	75 %	0 %	0 %	284993615
4044	NC_013768	CAA	2	6	182224	182229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284993615
4045	NC_013768	TTTC	2	8	182230	182237	0 %	75 %	0 %	25 %	284993615
4046	NC_013768	CATT	2	8	182260	182267	25 %	50 %	0 %	25 %	284993615
4047	NC_013768	T	6	6	182308	182313	0 %	100 %	0 %	0 %	284993615
4048	NC_013768	ATG	2	6	182351	182356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993615
4049	NC_013768	AGT	2	6	182364	182369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993615
4050	NC_013768	T	6	6	182417	182422	0 %	100 %	0 %	0 %	284993615
4051	NC_013768	ACC	2	6	182462	182467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284993615
4052	NC_013768	ATA	2	6	182484	182489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993615
4053	NC_013768	ATT	2	6	182542	182547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993616
4054	NC_013768	CAG	2	6	182548	182553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993616
4055	NC_013768	CAG	2	6	182563	182568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993616
4056	NC_013768	CTT	2	6	182575	182580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284993616
4057	NC_013768	ACG	2	6	182585	182590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993616
4058	NC_013768	GGAA	2	8	182622	182629	50 %	0 %	50 %	0 %	284993616
4059	NC_013768	GATA	2	8	182636	182643	50 %	25 %	25 %	0 %	284993616
4060	NC_013768	TGG	2	6	182711	182716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284993616
4061	NC_013768	CCAA	2	8	182753	182760	50 %	0 %	0 %	50 %	284993616
4062	NC_013768	TACAAG	2	12	182786	182797	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284993616
4063	NC_013768	CAT	2	6	182855	182860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284993616
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4065	NC_013768	AAT	2	6	183159	183164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993616
4066	NC_013768	GCT	2	6	183168	183173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284993616
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4068	NC_013768	GCT	2	6	183249	183254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284993616
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4071	NC_013768	ACC	2	6	183452	183457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284993616
4072	NC_013768	GAA	2	6	183503	183508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993616
4073	NC_013768	ACT	2	6	183522	183527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284993616
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4077	NC_013768	GTT	2	6	183701	183706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993616
4078	NC_013768	TGA	2	6	183751	183756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993616
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4081	NC_013768	CATT	2	8	183844	183851	25 %	50 %	0 %	25 %	284993616
4082	NC_013768	T	6	6	183850	183855	0 %	100 %	0 %	0 %	284993616
4083	NC_013768	T	6	6	183863	183868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_013768	TTA	2	6	183924	183929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_013768	T	6	6	183944	183949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_013768	TCA	2	6	184030	184035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284993617
4087	NC_013768	TAA	2	6	184054	184059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993617
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4089	NC_013768	TAA	2	6	184133	184138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284993617
4090	NC_013768	GCT	2	6	184164	184169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284993617
4091	NC_013768	GCT	2	6	184218	184223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284993617
4092	NC_013768	CTG	2	6	184261	184266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284993617
4093	NC_013768	ATT	2	6	184293	184298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_013768	TCC	2	6	184299	184304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4095	NC_013768	TTAT	2	8	184326	184333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_013768	AT	3	6	184332	184337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_013768	T	6	6	184388	184393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_013768	T	7	7	184408	184414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_013768	GT	3	6	184415	184420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_013768	AC	3	6	184428	184433	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4101	NC_013768	TTG	2	6	184495	184500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_013768	GTG	2	6	184510	184515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_013768	GTT	2	6	184552	184557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_013768	ATC	2	6	184573	184578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_013768	TTG	2	6	184588	184593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_013768	TATT	2	8	184597	184604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_013768	TGT	2	6	184610	184615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_013768	T	6	6	184659	184664	0 %	100 %	0 %	0 %	284993618
4109	NC_013768	TTG	2	6	184671	184676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993618
4110	NC_013768	TGA	2	6	184717	184722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993618
4111	NC_013768	GTGA	2	8	184791	184798	25 %	25 %	50 %	0 %	284993618
4112	NC_013768	TTTGTA	2	12	184857	184868	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	284993618
4113	NC_013768	CGG	2	6	184951	184956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284993618
4114	NC_013768	CGG	2	6	185056	185061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284993618
4115	NC_013768	GAA	2	6	185108	185113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993618
4116	NC_013768	ATTT	2	8	185143	185150	25 %	75 %	0 %	0 %	284993618
4117	NC_013768	TAC	2	6	185170	185175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284993618
4118	NC_013768	CTT	2	6	185196	185201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284993618
4119	NC_013768	GTG	2	6	185217	185222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284993618
4120	NC_013768	ATT	2	6	185236	185241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284993618
4121	NC_013768	CAG	2	6	185293	185298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993618
4122	NC_013768	GGC	3	9	185334	185342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284993618
4123	NC_013768	TTG	2	6	185437	185442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284993618
4124	NC_013768	CG	3	6	185481	185486	0 %	0 %	50 %	50 %	284993618
4125	NC_013768	GAT	3	9	185498	185506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284993618
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4127	NC_013768	GGAA	2	8	185594	185601	50 %	0 %	50 %	0 %	284993618
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4253	NC_013768	AGA	2	6	191217	191222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284993621
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4499	NC_013768	GCA	2	6	202304	202309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284993635
4500	NC_013768	TGG	2	6	202333	202338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284993635

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