MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 69183

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_013766	GCA	2	6	1860521	1860526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284802115
42502	NC_013766	TC	3	6	1860527	1860532	0 %	50 %	0 %	50 %	284802115
42503	NC_013766	T	6	6	1860631	1860636	0 %	100 %	0 %	0 %	284802115
42504	NC_013766	TCC	2	6	1860713	1860718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284802116
42505	NC_013766	GCT	2	6	1860746	1860751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284802116
42506	NC_013766	TTC	2	6	1860757	1860762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802116
42507	NC_013766	CTT	2	6	1860927	1860932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802116
42508	NC_013766	CA	3	6	1860943	1860948	50 %	0 %	0 %	50 %	284802116
42509	NC_013766	TCAA	2	8	1860974	1860981	50 %	25 %	0 %	25 %	284802116
42510	NC_013766	TTCT	2	8	1861039	1861046	0 %	75 %	0 %	25 %	284802116
42511	NC_013766	AGCA	2	8	1861170	1861177	50 %	0 %	25 %	25 %	284802117
42512	NC_013766	TCT	2	6	1861189	1861194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802117
42513	NC_013766	ATC	2	6	1861314	1861319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802117
42514	NC_013766	TCC	2	6	1861378	1861383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284802117
42515	NC_013766	TGC	2	6	1861441	1861446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284802117
42516	NC_013766	ATA	2	6	1861491	1861496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802117
42517	NC_013766	CCT	2	6	1861538	1861543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284802117
42518	NC_013766	TCA	2	6	1861624	1861629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802117
42519	NC_013766	CTTC	2	8	1861645	1861652	0 %	50 %	0 %	50 %	284802117
42520	NC_013766	TAA	2	6	1861679	1861684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802117
42521	NC_013766	CAT	2	6	1861808	1861813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802117
42522	NC_013766	A	6	6	1861891	1861896	100 %	0 %	0 %	0 %	284802117
42523	NC_013766	ATG	2	6	1862009	1862014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284802117
42524	NC_013766	ATA	2	6	1862026	1862031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802117
42525	NC_013766	CCT	2	6	1862037	1862042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42526	NC_013766	GAT	2	6	1862072	1862077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42527	NC_013766	TGAC	2	8	1862221	1862228	25 %	25 %	25 %	25 %	284802118
42528	NC_013766	TGT	2	6	1862235	1862240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284802118
42529	NC_013766	AC	3	6	1862302	1862307	50 %	0 %	0 %	50 %	284802118
42530	NC_013766	AGT	2	6	1862328	1862333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284802118
42531	NC_013766	TA	3	6	1862363	1862368	50 %	50 %	0 %	0 %	284802118
42532	NC_013766	CATA	2	8	1862422	1862429	50 %	25 %	0 %	25 %	284802118
42533	NC_013766	GAA	2	6	1862504	1862509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284802118
42534	NC_013766	GCATAG	2	12	1862545	1862556	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284802118
42535	NC_013766	TCC	2	6	1862581	1862586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284802118
42536	NC_013766	GTT	2	6	1862711	1862716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284802118
42537	NC_013766	A	6	6	1862798	1862803	100 %	0 %	0 %	0 %	284802118
42538	NC_013766	CTC	2	6	1862835	1862840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284802118
42539	NC_013766	CAG	2	6	1862864	1862869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284802118
42540	NC_013766	ATC	2	6	1863013	1863018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802118
42541	NC_013766	AAT	2	6	1863021	1863026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802118
42542	NC_013766	GCA	2	6	1863049	1863054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284802118
42543	NC_013766	GCT	2	6	1863094	1863099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284802118
42544	NC_013766	CTG	2	6	1863104	1863109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284802118
42545	NC_013766	CAC	2	6	1863154	1863159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284802119
42546	NC_013766	A	6	6	1863247	1863252	100 %	0 %	0 %	0 %	284802119
42547	NC_013766	TCAT	2	8	1863334	1863341	25 %	50 %	0 %	25 %	284802119
42548	NC_013766	CATC	2	8	1863383	1863390	25 %	25 %	0 %	50 %	284802119
42549	NC_013766	CTG	2	6	1863447	1863452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284802119
42550	NC_013766	GCACAG	2	12	1863470	1863481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284802119
42551	NC_013766	GCC	2	6	1863525	1863530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284802119
42552	NC_013766	CAG	2	6	1863537	1863542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284802119
42553	NC_013766	TCC	2	6	1863662	1863667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42554	NC_013766	CTT	2	6	1863714	1863719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802120
42555	NC_013766	CTT	3	9	1863732	1863740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802120
42556	NC_013766	TTCT	2	8	1863799	1863806	0 %	75 %	0 %	25 %	284802120
42557	NC_013766	T	6	6	1863808	1863813	0 %	100 %	0 %	0 %	284802120
42558	NC_013766	CAG	2	6	1863886	1863891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284802120
42559	NC_013766	TCA	2	6	1863914	1863919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802120
42560	NC_013766	CAAT	2	8	1863921	1863928	50 %	25 %	0 %	25 %	284802120
42561	NC_013766	TAA	2	6	1863937	1863942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802120
42562	NC_013766	CTG	2	6	1863989	1863994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284802120
42563	NC_013766	AC	3	6	1864113	1864118	50 %	0 %	0 %	50 %	284802120
42564	NC_013766	TCA	2	6	1864148	1864153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802120
42565	NC_013766	ATTCA	2	10	1864228	1864237	40 %	40 %	0 %	20 %	284802120
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42567	NC_013766	ATA	2	6	1864331	1864336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802120
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42570	NC_013766	T	6	6	1864540	1864545	0 %	100 %	0 %	0 %	284802120
42571	NC_013766	ATA	2	6	1864618	1864623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802120
42572	NC_013766	CGT	2	6	1864629	1864634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284802120
42573	NC_013766	GCA	2	6	1864661	1864666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284802120
42574	NC_013766	TTCATA	2	12	1864730	1864741	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	284802120
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42578	NC_013766	TAA	2	6	1864802	1864807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42579	NC_013766	A	6	6	1864833	1864838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42582	NC_013766	ATT	2	6	1864912	1864917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42583	NC_013766	A	6	6	1864927	1864932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42584	NC_013766	TA	3	6	1864947	1864952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42585	NC_013766	AAT	2	6	1865005	1865010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42586	NC_013766	TTTTGA	2	12	1865017	1865028	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42587	NC_013766	TAT	2	6	1865267	1865272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42588	NC_013766	CACT	2	8	1865309	1865316	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42589	NC_013766	ACC	2	6	1865384	1865389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284802121
42590	NC_013766	CA	3	6	1865469	1865474	50 %	0 %	0 %	50 %	284802121
42591	NC_013766	ACTC	2	8	1865503	1865510	25 %	25 %	0 %	50 %	284802121
42592	NC_013766	TCC	2	6	1865634	1865639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284802121
42593	NC_013766	T	6	6	1865672	1865677	0 %	100 %	0 %	0 %	284802121
42594	NC_013766	GT	3	6	1865771	1865776	0 %	50 %	50 %	0 %	284802121
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42597	NC_013766	GT	3	6	1865895	1865900	0 %	50 %	50 %	0 %	284802121
42598	NC_013766	ATC	2	6	1865996	1866001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802121
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42600	NC_013766	AGAA	2	8	1866041	1866048	75 %	0 %	25 %	0 %	284802121
42601	NC_013766	AT	3	6	1866196	1866201	50 %	50 %	0 %	0 %	284802121
42602	NC_013766	TGC	2	6	1866214	1866219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284802121
42603	NC_013766	ATCAA	2	10	1866315	1866324	60 %	20 %	0 %	20 %	284802121
42604	NC_013766	AAC	2	6	1866328	1866333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284802121
42605	NC_013766	TTA	2	6	1866342	1866347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284802121
42606	NC_013766	CA	4	8	1866382	1866389	50 %	0 %	0 %	50 %	284802121
42607	NC_013766	TC	3	6	1866402	1866407	0 %	50 %	0 %	50 %	284802121
42608	NC_013766	CT	3	6	1866496	1866501	0 %	50 %	0 %	50 %	284802121
42609	NC_013766	AAT	2	6	1866577	1866582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802121
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42613	NC_013766	TGA	2	6	1866943	1866948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284802121
42614	NC_013766	TTTTC	2	10	1866949	1866958	0 %	80 %	0 %	20 %	284802121
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42617	NC_013766	CT	3	6	1867313	1867318	0 %	50 %	0 %	50 %	284802122
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42619	NC_013766	CAC	2	6	1867488	1867493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284802122
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