MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 40902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_013504	TAC	2	6	644861	644866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268319210
15003	NC_013504	ATC	2	6	644911	644916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268319210
15004	NC_013504	TAAT	2	8	644989	644996	50 %	50 %	0 %	0 %	268319210
15005	NC_013504	TTC	2	6	645029	645034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268319210
15006	NC_013504	A	6	6	645037	645042	100 %	0 %	0 %	0 %	268319210
15007	NC_013504	A	6	6	645088	645093	100 %	0 %	0 %	0 %	268319210
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15009	NC_013504	T	7	7	645219	645225	0 %	100 %	0 %	0 %	268319210
15010	NC_013504	TAC	2	6	645227	645232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268319210
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15015	NC_013504	AGT	2	6	645348	645353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268319210
15016	NC_013504	ATT	2	6	645376	645381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268319210
15017	NC_013504	AAATAT	2	12	645396	645407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268319210
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15020	NC_013504	AT	5	10	645478	645487	50 %	50 %	0 %	0 %	268319210
15021	NC_013504	AG	3	6	645500	645505	50 %	0 %	50 %	0 %	268319210
15022	NC_013504	AAT	2	6	645506	645511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268319210
15023	NC_013504	AGAA	2	8	645520	645527	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_013504	TCA	2	6	645540	645545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268319211
15025	NC_013504	T	7	7	645550	645556	0 %	100 %	0 %	0 %	268319211
15026	NC_013504	GTT	2	6	645624	645629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268319211
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15028	NC_013504	CTG	2	6	645676	645681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268319211
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15032	NC_013504	TTCTC	2	10	645863	645872	0 %	60 %	0 %	40 %	268319211
15033	NC_013504	GTG	3	9	645883	645891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268319211
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15052	NC_013504	TGA	2	6	646764	646769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268319212
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15054	NC_013504	AG	3	6	646908	646913	50 %	0 %	50 %	0 %	268319212
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15105	NC_013504	A	6	6	649227	649232	100 %	0 %	0 %	0 %	268319214
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15111	NC_013504	GCAA	2	8	649480	649487	50 %	0 %	25 %	25 %	268319214
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15114	NC_013504	A	7	7	649506	649512	100 %	0 %	0 %	0 %	268319214
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15123	NC_013504	TTG	2	6	649824	649829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268319214
15124	NC_013504	GAA	2	6	649910	649915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268319214
15125	NC_013504	CCAGG	2	10	649961	649970	20 %	0 %	40 %	40 %	268319214
15126	NC_013504	TAA	2	6	649981	649986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268319214
15127	NC_013504	TTG	2	6	650000	650005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268319214
15128	NC_013504	AGT	2	6	650030	650035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268319214
15129	NC_013504	CAT	2	6	650117	650122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268319214
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15131	NC_013504	ATG	2	6	650163	650168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268319214
15132	NC_013504	TAG	3	9	650232	650240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268319214
15133	NC_013504	ACT	2	6	650285	650290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268319214
15134	NC_013504	ACT	2	6	650294	650299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268319214
15135	NC_013504	ATTA	2	8	650318	650325	50 %	50 %	0 %	0 %	268319214
15136	NC_013504	A	6	6	650355	650360	100 %	0 %	0 %	0 %	268319214
15137	NC_013504	TGA	2	6	650389	650394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268319214
15138	NC_013504	TAA	2	6	650407	650412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268319214
15139	NC_013504	A	8	8	650474	650481	100 %	0 %	0 %	0 %	268319214
15140	NC_013504	TAA	2	6	650533	650538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268319214
15141	NC_013504	A	6	6	650545	650550	100 %	0 %	0 %	0 %	268319215
15142	NC_013504	ATT	2	6	650563	650568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268319215
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15146	NC_013504	GAG	2	6	650630	650635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268319215
15147	NC_013504	AGT	3	9	650676	650684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268319215
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15151	NC_013504	AGAT	2	8	650826	650833	50 %	25 %	25 %	0 %	268319215
15152	NC_013504	T	6	6	650842	650847	0 %	100 %	0 %	0 %	268319215
15153	NC_013504	ATTT	2	8	650872	650879	25 %	75 %	0 %	0 %	268319215
15154	NC_013504	CTT	2	6	650897	650902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268319215
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15161	NC_013504	A	6	6	651328	651333	100 %	0 %	0 %	0 %	268319215
15162	NC_013504	AGA	2	6	651339	651344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268319215
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15164	NC_013504	ATA	2	6	651472	651477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268319216
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15167	NC_013504	ATGG	2	8	651543	651550	25 %	25 %	50 %	0 %	268319216
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15180	NC_013504	T	7	7	652209	652215	0 %	100 %	0 %	0 %	268319217
15181	NC_013504	TGA	2	6	652273	652278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268319217
15182	NC_013504	AAAGT	2	10	652293	652302	60 %	20 %	20 %	0 %	268319217
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15186	NC_013504	TATGC	2	10	652448	652457	20 %	40 %	20 %	20 %	268319217
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15192	NC_013504	CAA	2	6	652875	652880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268319218
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15197	NC_013504	ATTTA	2	10	653029	653038	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15200	NC_013504	AAAT	2	8	653119	653126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15201	NC_013504	A	6	6	653131	653136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15202	NC_013504	TTC	2	6	653140	653145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15233	NC_013504	GCT	2	6	654744	654749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268319220
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15241	NC_013504	A	6	6	655122	655127	100 %	0 %	0 %	0 %	268319220
15242	NC_013504	ATG	2	6	655141	655146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268319220
15243	NC_013504	ATG	2	6	655165	655170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268319220
15244	NC_013504	GCCA	2	8	655174	655181	25 %	0 %	25 %	50 %	268319220
15245	NC_013504	TAC	2	6	655185	655190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268319220
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15247	NC_013504	ACAGCT	2	12	655278	655289	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	268319221
15248	NC_013504	TATTT	2	10	655327	655336	20 %	80 %	0 %	0 %	268319221
15249	NC_013504	ATG	2	6	655348	655353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268319221
15250	NC_013504	TTA	2	6	655401	655406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268319221
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15252	NC_013504	T	7	7	655508	655514	0 %	100 %	0 %	0 %	268319221
15253	NC_013504	GGCA	2	8	655588	655595	25 %	0 %	50 %	25 %	268319221
15254	NC_013504	TAG	2	6	655612	655617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268319221
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15256	NC_013504	TATT	2	8	655646	655653	25 %	75 %	0 %	0 %	268319221
15257	NC_013504	TTGC	2	8	655766	655773	0 %	50 %	25 %	25 %	268319221
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15270	NC_013504	AGAAA	2	10	656255	656264	80 %	0 %	20 %	0 %	268319221
15271	NC_013504	CAAT	2	8	656293	656300	50 %	25 %	0 %	25 %	268319221
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15278	NC_013504	A	6	6	656669	656674	100 %	0 %	0 %	0 %	268319221
15279	NC_013504	TGT	2	6	656723	656728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268319221
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15290	NC_013504	AAG	2	6	657214	657219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268319221
15291	NC_013504	AAGA	2	8	657231	657238	75 %	0 %	25 %	0 %	268319221
15292	NC_013504	AAT	3	9	657243	657251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268319221
15293	NC_013504	AAT	2	6	657256	657261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15296	NC_013504	TTG	2	6	657324	657329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268319222
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15322	NC_013504	TAAAC	2	10	658300	658309	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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15364	NC_013504	TGG	2	6	660216	660221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268319225
15365	NC_013504	CTA	2	6	660257	660262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268319225
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15486	NC_013504	TGA	2	6	665782	665787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268319229
15487	NC_013504	AAT	2	6	665805	665810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268319229
15488	NC_013504	TCA	2	6	665871	665876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268319229
15489	NC_013504	AAG	3	9	666000	666008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268319229
15490	NC_013504	GTA	2	6	666070	666075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268319229
15491	NC_013504	CAA	2	6	666108	666113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268319229
15492	NC_013504	GAA	2	6	666116	666121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268319229
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15495	NC_013504	ATTC	2	8	666169	666176	25 %	50 %	0 %	25 %	268319229
15496	NC_013504	CT	3	6	666234	666239	0 %	50 %	0 %	50 %	268319229
15497	NC_013504	TAA	2	6	666353	666358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268319229
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15500	NC_013504	TAC	2	6	666522	666527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268319229

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