MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47501	NC_013199	TTTGAC	2	12	2543778	2543789	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47502	NC_013199	AT	3	6	2543837	2543842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47503	NC_013199	GCAG	2	8	2543933	2543940	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47504	NC_013199	CCA	2	6	2543941	2543946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47505	NC_013199	T	6	6	2543956	2543961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47506	NC_013199	A	6	6	2543970	2543975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47507	NC_013199	CCA	2	6	2544110	2544115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47508	NC_013199	ACT	2	6	2544141	2544146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47509	NC_013199	ATG	2	6	2544198	2544203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47510	NC_013199	CAA	2	6	2544278	2544283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47511	NC_013199	TCA	2	6	2544315	2544320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47512	NC_013199	CCA	2	6	2544413	2544418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47513	NC_013199	ACT	2	6	2544444	2544449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47514	NC_013199	GAG	2	6	2544480	2544485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47515	NC_013199	GGA	2	6	2544697	2544702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47516	NC_013199	TCC	2	6	2544763	2544768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47517	NC_013199	GCAG	2	8	2544798	2544805	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47518	NC_013199	ACT	2	6	2544816	2544821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47519	NC_013199	GAA	2	6	2544830	2544835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47520	NC_013199	CTT	2	6	2544873	2544878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47521	NC_013199	CCA	2	6	2544886	2544891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47522	NC_013199	TTG	3	9	2544930	2544938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47523	NC_013199	CG	3	6	2544971	2544976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47524	NC_013199	CACTTC	2	12	2545053	2545064	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
47525	NC_013199	ATC	2	6	2545080	2545085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47526	NC_013199	ATCTC	2	10	2545120	2545129	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
47527	NC_013199	G	6	6	2545132	2545137	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47528	NC_013199	GGC	2	6	2545200	2545205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47529	NC_013199	CTC	2	6	2545259	2545264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47530	NC_013199	ACG	2	6	2545308	2545313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47531	NC_013199	ACC	2	6	2545503	2545508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47532	NC_013199	AGG	2	6	2545639	2545644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47533	NC_013199	GTA	2	6	2545727	2545732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47534	NC_013199	CCA	2	6	2545735	2545740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47535	NC_013199	CCTA	2	8	2545779	2545786	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47536	NC_013199	TC	3	6	2545899	2545904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47537	NC_013199	GCC	2	6	2545996	2546001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47538	NC_013199	CAT	2	6	2546087	2546092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47539	NC_013199	GTT	2	6	2546130	2546135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47540	NC_013199	CTT	2	6	2546175	2546180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47541	NC_013199	TCGC	2	8	2546223	2546230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47542	NC_013199	CTC	2	6	2546246	2546251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47543	NC_013199	GGC	2	6	2546371	2546376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47544	NC_013199	CCT	2	6	2546442	2546447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47545	NC_013199	GGA	2	6	2546550	2546555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47546	NC_013199	TAT	2	6	2546729	2546734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47547	NC_013199	TGG	2	6	2546800	2546805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47548	NC_013199	GA	3	6	2547063	2547068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47549	NC_013199	ACAT	2	8	2547133	2547140	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47550	NC_013199	TCC	2	6	2547149	2547154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47551	NC_013199	GT	3	6	2547156	2547161	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47552	NC_013199	CAC	2	6	2547164	2547169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47553	NC_013199	CTAC	2	8	2547216	2547223	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47554	NC_013199	GCTCCG	2	12	2547251	2547262	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47555	NC_013199	TCC	2	6	2547467	2547472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47556	NC_013199	CCG	2	6	2547499	2547504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47557	NC_013199	CCG	2	6	2547529	2547534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47558	NC_013199	AAGC	2	8	2547635	2547642	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47559	NC_013199	TCGC	2	8	2547667	2547674	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47560	NC_013199	CTA	2	6	2547677	2547682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47562	NC_013199	GCC	2	6	2547743	2547748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47563	NC_013199	CTTA	2	8	2547826	2547833	25 %	50 %	0 %	25 %	258540699
47564	NC_013199	ATGCG	2	10	2547945	2547954	20 %	20 %	40 %	20 %	258540699
47565	NC_013199	TAT	2	6	2547961	2547966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540699
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47574	NC_013199	CCAT	2	8	2548654	2548661	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47575	NC_013199	GT	3	6	2548670	2548675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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47582	NC_013199	TTC	2	6	2548921	2548926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47583	NC_013199	CAGAC	2	10	2549154	2549163	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47584	NC_013199	GCC	2	6	2549165	2549170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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47586	NC_013199	AT	3	6	2549191	2549196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47592	NC_013199	CTT	2	6	2549484	2549489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47596	NC_013199	AAT	2	6	2549844	2549849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47597	NC_013199	CGC	2	6	2549881	2549886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47598	NC_013199	TGT	2	6	2549951	2549956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47599	NC_013199	T	7	7	2550115	2550121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47600	NC_013199	TTG	2	6	2550128	2550133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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47603	NC_013199	A	7	7	2550209	2550215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47604	NC_013199	T	6	6	2550228	2550233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47605	NC_013199	CAC	2	6	2550273	2550278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47606	NC_013199	GCC	2	6	2550310	2550315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47607	NC_013199	GGC	2	6	2550440	2550445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540705
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47610	NC_013199	T	6	6	2550510	2550515	0 %	100 %	0 %	0 %	258540705
47611	NC_013199	GCT	2	6	2550518	2550523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540705
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47616	NC_013199	AAG	2	6	2550725	2550730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540705
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47978	NC_013199	TGA	2	6	2568336	2568341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540719
47979	NC_013199	GGCAA	2	10	2568362	2568371	40 %	0 %	40 %	20 %	258540719
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47981	NC_013199	CAA	3	9	2568458	2568466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540719
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47991	NC_013199	CGA	2	6	2568787	2568792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540719
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