MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47001	NC_013199	TTG	2	6	2514592	2514597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540681
47002	NC_013199	TCTCAT	2	12	2514773	2514784	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	258540681
47003	NC_013199	TCT	2	6	2514889	2514894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540681
47004	NC_013199	CG	3	6	2514922	2514927	0 %	0 %	50 %	50 %	258540681
47005	NC_013199	AT	3	6	2515090	2515095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47006	NC_013199	TTAA	2	8	2515130	2515137	50 %	50 %	0 %	0 %	258540682
47007	NC_013199	CCAA	2	8	2515144	2515151	50 %	0 %	0 %	50 %	258540682
47008	NC_013199	CAA	2	6	2515223	2515228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540682
47009	NC_013199	TGC	2	6	2515233	2515238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540682
47010	NC_013199	GTT	2	6	2515284	2515289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540682
47011	NC_013199	AAT	2	6	2515323	2515328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540682
47012	NC_013199	TCG	2	6	2515433	2515438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540682
47013	NC_013199	ACAA	2	8	2515557	2515564	75 %	0 %	0 %	25 %	258540682
47014	NC_013199	ATA	2	6	2515696	2515701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540682
47015	NC_013199	ATT	3	9	2515722	2515730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47016	NC_013199	CTT	2	6	2515837	2515842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47017	NC_013199	CCG	2	6	2515849	2515854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47018	NC_013199	A	7	7	2515858	2515864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47019	NC_013199	GT	3	6	2515886	2515891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47020	NC_013199	TTC	2	6	2515945	2515950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540683
47021	NC_013199	CTT	2	6	2515971	2515976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540683
47022	NC_013199	CCTG	2	8	2516033	2516040	0 %	25 %	25 %	50 %	258540683
47023	NC_013199	CAT	2	6	2516070	2516075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540683
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47025	NC_013199	TCA	2	6	2516147	2516152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540683
47026	NC_013199	TG	3	6	2516248	2516253	0 %	50 %	50 %	0 %	258540683
47027	NC_013199	GCC	2	6	2516266	2516271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540683
47028	NC_013199	GTAA	2	8	2516314	2516321	50 %	25 %	25 %	0 %	258540683
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47030	NC_013199	ATC	2	6	2516371	2516376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540683
47031	NC_013199	GCT	2	6	2516379	2516384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540683
47032	NC_013199	AAT	2	6	2516398	2516403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540683
47033	NC_013199	A	7	7	2516409	2516415	100 %	0 %	0 %	0 %	258540683
47034	NC_013199	GCA	2	6	2516628	2516633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540683
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47037	NC_013199	TTA	2	6	2516867	2516872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540683
47038	NC_013199	GTTT	3	12	2516888	2516899	0 %	75 %	25 %	0 %	258540683
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47041	NC_013199	TAA	3	9	2516983	2516991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47042	NC_013199	A	6	6	2517009	2517014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47043	NC_013199	ATC	2	6	2517025	2517030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47044	NC_013199	AAG	2	6	2517033	2517038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47045	NC_013199	CACT	2	8	2517088	2517095	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47046	NC_013199	GACC	2	8	2517261	2517268	25 %	0 %	25 %	50 %	258540684
47047	NC_013199	GC	3	6	2517304	2517309	0 %	0 %	50 %	50 %	258540684
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47049	NC_013199	A	6	6	2517331	2517336	100 %	0 %	0 %	0 %	258540684
47050	NC_013199	TGC	2	6	2517340	2517345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540684
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47055	NC_013199	CG	3	6	2517578	2517583	0 %	0 %	50 %	50 %	258540685
47056	NC_013199	CGCGAC	2	12	2517599	2517610	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258540685
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47084	NC_013199	ATG	2	6	2518807	2518812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540685
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47086	NC_013199	TTCATC	2	12	2518917	2518928	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	258540685
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47088	NC_013199	AC	3	6	2519192	2519197	50 %	0 %	0 %	50 %	258540685
47089	NC_013199	ATG	2	6	2519248	2519253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540685
47090	NC_013199	AGC	2	6	2519286	2519291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540685
47091	NC_013199	TGGTGA	2	12	2519294	2519305	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	258540685
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47096	NC_013199	TA	3	6	2519546	2519551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47097	NC_013199	ATA	2	6	2519565	2519570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47098	NC_013199	CTT	2	6	2519642	2519647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540686
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47101	NC_013199	GCG	2	6	2519670	2519675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540686
47102	NC_013199	TG	3	6	2519708	2519713	0 %	50 %	50 %	0 %	258540686
47103	NC_013199	GGT	2	6	2519759	2519764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540686
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47106	NC_013199	CTT	2	6	2519860	2519865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540686
47107	NC_013199	GTTC	2	8	2519881	2519888	0 %	50 %	25 %	25 %	258540686
47108	NC_013199	GTTT	2	8	2519892	2519899	0 %	75 %	25 %	0 %	258540686
47109	NC_013199	CAT	2	6	2519917	2519922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540686
47110	NC_013199	ATCA	2	8	2519954	2519961	50 %	25 %	0 %	25 %	258540686
47111	NC_013199	GCAT	2	8	2520049	2520056	25 %	25 %	25 %	25 %	258540686
47112	NC_013199	CCT	2	6	2520061	2520066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47113	NC_013199	GCT	2	6	2520090	2520095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47114	NC_013199	CGGCT	2	10	2520103	2520112	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47115	NC_013199	TGT	2	6	2520192	2520197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47116	NC_013199	CAT	3	9	2520198	2520206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47239	NC_013199	GTC	2	6	2528911	2528916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540688
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47255	NC_013199	T	6	6	2530126	2530131	0 %	100 %	0 %	0 %	258540688
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47284	NC_013199	ATT	2	6	2532067	2532072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47289	NC_013199	TACT	2	8	2532234	2532241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47290	NC_013199	CCAT	2	8	2532302	2532309	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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47292	NC_013199	GGT	2	6	2532339	2532344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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47340	NC_013199	CAGCAT	2	12	2535271	2535282	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258540691
47341	NC_013199	GC	3	6	2535283	2535288	0 %	0 %	50 %	50 %	258540691
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47345	NC_013199	GCGG	2	8	2535756	2535763	0 %	0 %	75 %	25 %	258540691
47346	NC_013199	GCA	2	6	2535828	2535833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540691
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47348	NC_013199	GTT	2	6	2535895	2535900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540691
47349	NC_013199	TGA	2	6	2535906	2535911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540691
47350	NC_013199	CCT	2	6	2535953	2535958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258540691
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47469	NC_013199	TG	3	6	2542375	2542380	0 %	50 %	50 %	0 %	258540694
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47499	NC_013199	TAAT	2	8	2543633	2543640	50 %	50 %	0 %	0 %	258540695
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