MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_013199	AC	3	6	2408130	2408135	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45002	NC_013199	TCC	2	6	2408137	2408142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45003	NC_013199	A	7	7	2408180	2408186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45004	NC_013199	TCATT	2	10	2408277	2408286	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45005	NC_013199	TAA	2	6	2408306	2408311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45006	NC_013199	CCT	2	6	2408325	2408330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45007	NC_013199	T	7	7	2408361	2408367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45008	NC_013199	TAAA	2	8	2408422	2408429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45009	NC_013199	T	6	6	2408571	2408576	0 %	100 %	0 %	0 %	258540554
45010	NC_013199	A	6	6	2408594	2408599	100 %	0 %	0 %	0 %	258540554
45011	NC_013199	ATC	2	6	2408607	2408612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540554
45012	NC_013199	ATA	2	6	2408616	2408621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540554
45013	NC_013199	CTA	2	6	2408638	2408643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540554
45014	NC_013199	ACA	2	6	2408718	2408723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540554
45015	NC_013199	T	6	6	2408826	2408831	0 %	100 %	0 %	0 %	258540554
45016	NC_013199	AGA	2	6	2408843	2408848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540554
45017	NC_013199	ATG	2	6	2408862	2408867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540554
45018	NC_013199	AAG	2	6	2408926	2408931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540554
45019	NC_013199	ACTG	2	8	2408944	2408951	25 %	25 %	25 %	25 %	258540554
45020	NC_013199	TTG	2	6	2408957	2408962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540554
45021	NC_013199	TGT	2	6	2408995	2409000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540554
45022	NC_013199	AAT	2	6	2409016	2409021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540554
45023	NC_013199	T	6	6	2409249	2409254	0 %	100 %	0 %	0 %	258540554
45024	NC_013199	T	6	6	2409340	2409345	0 %	100 %	0 %	0 %	258540554
45025	NC_013199	TTC	2	6	2409426	2409431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540554
45026	NC_013199	TCC	2	6	2409539	2409544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258540554
45027	NC_013199	ATC	2	6	2409627	2409632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540554
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45029	NC_013199	CTTGA	2	10	2409756	2409765	20 %	40 %	20 %	20 %	258540555
45030	NC_013199	ATA	2	6	2409805	2409810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540555
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45032	NC_013199	T	7	7	2409854	2409860	0 %	100 %	0 %	0 %	258540555
45033	NC_013199	TGG	2	6	2409866	2409871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540555
45034	NC_013199	TGC	3	9	2409949	2409957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540555
45035	NC_013199	ATC	2	6	2410041	2410046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540555
45036	NC_013199	TAAAG	2	10	2410060	2410069	60 %	20 %	20 %	0 %	258540555
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45038	NC_013199	GAT	2	6	2410182	2410187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540555
45039	NC_013199	TTGT	2	8	2410188	2410195	0 %	75 %	25 %	0 %	258540555
45040	NC_013199	AAT	2	6	2410236	2410241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540555
45041	NC_013199	ACCGGA	2	12	2410260	2410271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540555
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45044	NC_013199	T	6	6	2410347	2410352	0 %	100 %	0 %	0 %	258540555
45045	NC_013199	A	6	6	2410357	2410362	100 %	0 %	0 %	0 %	258540555
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45050	NC_013199	T	7	7	2410670	2410676	0 %	100 %	0 %	0 %	258540556
45051	NC_013199	GTA	2	6	2410845	2410850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540556
45052	NC_013199	AAC	2	6	2410955	2410960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540556
45053	NC_013199	GTT	3	9	2411022	2411030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540556
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45055	NC_013199	CCA	2	6	2411264	2411269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45056	NC_013199	TCC	2	6	2411298	2411303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45057	NC_013199	A	6	6	2411343	2411348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45058	NC_013199	GTTA	2	8	2411375	2411382	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45059	NC_013199	T	6	6	2411383	2411388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45060	NC_013199	ATT	2	6	2411399	2411404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45061	NC_013199	ACG	2	6	2411414	2411419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45062	NC_013199	CAA	2	6	2411479	2411484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45063	NC_013199	AT	3	6	2411501	2411506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45064	NC_013199	TTGC	2	8	2411516	2411523	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45065	NC_013199	GTT	2	6	2411589	2411594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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45069	NC_013199	CGA	2	6	2411780	2411785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540557
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45090	NC_013199	CAGC	2	8	2413418	2413425	25 %	0 %	25 %	50 %	258540558
45091	NC_013199	GC	3	6	2413424	2413429	0 %	0 %	50 %	50 %	258540558
45092	NC_013199	TTG	2	6	2413502	2413507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540558
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45101	NC_013199	TGC	2	6	2414052	2414057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540558
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45104	NC_013199	AGT	3	9	2414142	2414150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540559
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45107	NC_013199	TTC	2	6	2414522	2414527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540559
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45119	NC_013199	TAA	2	6	2415224	2415229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540559
45120	NC_013199	GT	3	6	2415376	2415381	0 %	50 %	50 %	0 %	258540559
45121	NC_013199	CAAT	2	8	2415397	2415404	50 %	25 %	0 %	25 %	258540559
45122	NC_013199	CCA	2	6	2415422	2415427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540559
45123	NC_013199	TCG	2	6	2415434	2415439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540559
45124	NC_013199	CCT	2	6	2415452	2415457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258540560
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45128	NC_013199	TG	3	6	2415787	2415792	0 %	50 %	50 %	0 %	258540560
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45130	NC_013199	GTTT	2	8	2415881	2415888	0 %	75 %	25 %	0 %	258540560
45131	NC_013199	GTTG	2	8	2415932	2415939	0 %	50 %	50 %	0 %	258540560
45132	NC_013199	GTG	2	6	2415946	2415951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540560
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45135	NC_013199	CCTG	2	8	2416212	2416219	0 %	25 %	25 %	50 %	258540560
45136	NC_013199	TTGA	2	8	2416296	2416303	25 %	50 %	25 %	0 %	258540560
45137	NC_013199	GT	3	6	2416325	2416330	0 %	50 %	50 %	0 %	258540560
45138	NC_013199	TTG	2	6	2416340	2416345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540560
45139	NC_013199	CTT	2	6	2416442	2416447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540560
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45143	NC_013199	CAC	2	6	2416632	2416637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540560
45144	NC_013199	GTA	3	9	2416671	2416679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540560
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45147	NC_013199	TCAA	2	8	2416822	2416829	50 %	25 %	0 %	25 %	258540560
45148	NC_013199	GCC	3	9	2416863	2416871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540560
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45150	NC_013199	TTCC	2	8	2417102	2417109	0 %	50 %	0 %	50 %	258540560
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45152	NC_013199	GTT	2	6	2417334	2417339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540560
45153	NC_013199	GAG	2	6	2417363	2417368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258540560
45154	NC_013199	GGAC	2	8	2417386	2417393	25 %	0 %	50 %	25 %	258540560
45155	NC_013199	AAT	2	6	2417541	2417546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540560
45156	NC_013199	TGA	2	6	2417577	2417582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540560
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45159	NC_013199	CGG	2	6	2417724	2417729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540560
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45170	NC_013199	GCTT	2	8	2418172	2418179	0 %	50 %	25 %	25 %	258540560
45171	NC_013199	GGC	2	6	2418180	2418185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540560
45172	NC_013199	GCT	2	6	2418211	2418216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540560
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45174	NC_013199	CAG	2	6	2418357	2418362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540560
45175	NC_013199	ATC	2	6	2418364	2418369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540560
45176	NC_013199	CCT	2	6	2418403	2418408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45177	NC_013199	TTG	2	6	2418428	2418433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45178	NC_013199	TAA	2	6	2418475	2418480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45179	NC_013199	TAAA	2	8	2418492	2418499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45180	NC_013199	CTT	2	6	2418518	2418523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45181	NC_013199	ATT	2	6	2418532	2418537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45182	NC_013199	AT	3	6	2418543	2418548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45183	NC_013199	A	6	6	2418592	2418597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45184	NC_013199	CAGA	2	8	2418625	2418632	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45185	NC_013199	AAC	2	6	2418638	2418643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45186	NC_013199	TTA	2	6	2418649	2418654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45195	NC_013199	TAA	2	6	2419299	2419304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45196	NC_013199	TTCA	2	8	2419353	2419360	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45197	NC_013199	TC	3	6	2419380	2419385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45198	NC_013199	AGT	2	6	2419424	2419429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540562
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45218	NC_013199	TGC	2	6	2420536	2420541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540562
45219	NC_013199	AATG	2	8	2420575	2420582	50 %	25 %	25 %	0 %	258540562
45220	NC_013199	TCA	2	6	2420618	2420623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45221	NC_013199	TTAG	2	8	2420659	2420666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45222	NC_013199	AAC	2	6	2420675	2420680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45223	NC_013199	A	7	7	2420696	2420702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45224	NC_013199	CG	3	6	2420931	2420936	0 %	0 %	50 %	50 %	258540563
45225	NC_013199	AGC	2	6	2420956	2420961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540563
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45227	NC_013199	TCACCT	2	12	2421113	2421124	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	258540563
45228	NC_013199	ACC	2	6	2421160	2421165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540563
45229	NC_013199	GGAA	2	8	2421182	2421189	50 %	0 %	50 %	0 %	258540563
45230	NC_013199	CCA	2	6	2421212	2421217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540563
45231	NC_013199	GCC	2	6	2421263	2421268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540563
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45233	NC_013199	GGC	2	6	2421304	2421309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540563
45234	NC_013199	ACC	2	6	2421413	2421418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540563
45235	NC_013199	AACT	2	8	2421480	2421487	50 %	25 %	0 %	25 %	258540563
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45356	NC_013199	CGA	2	6	2427897	2427902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540571
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45475	NC_013199	TTC	2	6	2433556	2433561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540576
45476	NC_013199	ACTT	2	8	2433574	2433581	25 %	50 %	0 %	25 %	258540576
45477	NC_013199	AGCTT	2	10	2433592	2433601	20 %	40 %	20 %	20 %	258540576
45478	NC_013199	ATC	2	6	2433608	2433613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540576
45479	NC_013199	ACCAC	2	10	2433614	2433623	40 %	0 %	0 %	60 %	258540576
45480	NC_013199	TCA	2	6	2433624	2433629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540576
45481	NC_013199	ACTTAA	2	12	2433884	2433895	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	258540576
45482	NC_013199	TTA	2	6	2433912	2433917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540576
45483	NC_013199	CCCG	2	8	2433918	2433925	0 %	0 %	25 %	75 %	258540576
45484	NC_013199	TTG	3	9	2433940	2433948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540576
45485	NC_013199	ACA	2	6	2434002	2434007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540576
45486	NC_013199	CAA	2	6	2434056	2434061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540576
45487	NC_013199	CAA	2	6	2434094	2434099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540576
45488	NC_013199	AGG	2	6	2434127	2434132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258540576
45489	NC_013199	AAAAC	2	10	2434148	2434157	80 %	0 %	0 %	20 %	258540576
45490	NC_013199	GCA	2	6	2434221	2434226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540577
45491	NC_013199	GAA	2	6	2434240	2434245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540577
45492	NC_013199	CAA	2	6	2434268	2434273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540577
45493	NC_013199	AACTG	2	10	2434281	2434290	40 %	20 %	20 %	20 %	258540577
45494	NC_013199	TCC	2	6	2434331	2434336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258540577
45495	NC_013199	GCG	2	6	2434367	2434372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540577
45496	NC_013199	TCA	2	6	2434424	2434429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540577
45497	NC_013199	CAA	2	6	2434491	2434496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540577
45498	NC_013199	AGAAA	2	10	2434515	2434524	80 %	0 %	20 %	0 %	258540577
45499	NC_013199	T	6	6	2434616	2434621	0 %	100 %	0 %	0 %	258540577
45500	NC_013199	AAG	2	6	2434916	2434921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540577

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