MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44003	NC_013199	T	6	6	2357030	2357035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44004	NC_013199	CA	3	6	2357055	2357060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44005	NC_013199	A	7	7	2357103	2357109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44022	NC_013199	TGC	2	6	2357908	2357913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540508
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44101	NC_013199	CAT	2	6	2362565	2362570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44103	NC_013199	ATA	2	6	2362586	2362591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44105	NC_013199	ACGC	2	8	2362610	2362617	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44106	NC_013199	GCCAT	2	10	2362629	2362638	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44107	NC_013199	AACCT	2	10	2362640	2362649	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44108	NC_013199	A	6	6	2362653	2362658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44109	NC_013199	CCTG	2	8	2362696	2362703	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44110	NC_013199	A	6	6	2362722	2362727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44113	NC_013199	AACC	2	8	2362867	2362874	50 %	0 %	0 %	50 %	258540513
44114	NC_013199	A	6	6	2362892	2362897	100 %	0 %	0 %	0 %	258540513
44115	NC_013199	GAT	2	6	2362948	2362953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44117	NC_013199	TTTTA	2	10	2362979	2362988	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44118	NC_013199	GTC	2	6	2363058	2363063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44119	NC_013199	A	6	6	2363096	2363101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44120	NC_013199	T	6	6	2363104	2363109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44121	NC_013199	CA	3	6	2363132	2363137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44122	NC_013199	GC	3	6	2363158	2363163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44123	NC_013199	TTC	2	6	2363207	2363212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540514
44124	NC_013199	ATC	2	6	2363428	2363433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540514
44125	NC_013199	TCA	3	9	2363450	2363458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540514
44126	NC_013199	TGA	2	6	2363748	2363753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540514
44127	NC_013199	CTT	2	6	2363758	2363763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540514
44128	NC_013199	CTT	2	6	2363896	2363901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540514
44129	NC_013199	GGT	2	6	2363945	2363950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540514
44130	NC_013199	CAT	2	6	2363964	2363969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540514
44131	NC_013199	GCA	2	6	2364015	2364020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540514
44132	NC_013199	ACC	2	6	2364053	2364058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540514
44133	NC_013199	CGC	2	6	2364105	2364110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540514
44134	NC_013199	CTTGGC	2	12	2364211	2364222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540514
44135	NC_013199	GCA	2	6	2364224	2364229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540514
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44138	NC_013199	GCA	2	6	2364546	2364551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540514
44139	NC_013199	TGT	2	6	2364564	2364569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540514
44140	NC_013199	AATA	2	8	2364578	2364585	75 %	25 %	0 %	0 %	258540514
44141	NC_013199	CCGT	2	8	2364597	2364604	0 %	25 %	25 %	50 %	258540514
44142	NC_013199	CA	3	6	2364867	2364872	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44143	NC_013199	CGC	2	6	2364936	2364941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44144	NC_013199	TCG	2	6	2364962	2364967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44145	NC_013199	A	6	6	2365015	2365020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44146	NC_013199	TCA	2	6	2365074	2365079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44147	NC_013199	CAC	2	6	2365083	2365088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44148	NC_013199	ATT	2	6	2365111	2365116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44149	NC_013199	CCTT	2	8	2365156	2365163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44150	NC_013199	CAG	2	6	2365304	2365309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540515
44151	NC_013199	TTC	2	6	2365313	2365318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540515
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44153	NC_013199	ATC	2	6	2365656	2365661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540515
44154	NC_013199	GCC	2	6	2365667	2365672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540515
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44156	NC_013199	GC	3	6	2365789	2365794	0 %	0 %	50 %	50 %	258540515
44157	NC_013199	GT	3	6	2365816	2365821	0 %	50 %	50 %	0 %	258540515
44158	NC_013199	GAA	2	6	2365877	2365882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540515
44159	NC_013199	GAA	2	6	2365898	2365903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540515
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44168	NC_013199	CAC	2	6	2366225	2366230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540516
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44172	NC_013199	AGCA	2	8	2366623	2366630	50 %	0 %	25 %	25 %	258540516
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44183	NC_013199	ATCA	2	8	2367119	2367126	50 %	25 %	0 %	25 %	258540517
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44188	NC_013199	CTT	2	6	2367475	2367480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44189	NC_013199	CAT	2	6	2367500	2367505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44192	NC_013199	T	7	7	2367564	2367570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44193	NC_013199	ACG	2	6	2367587	2367592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44218	NC_013199	CGC	2	6	2369332	2369337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44219	NC_013199	TTTG	2	8	2369381	2369388	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44220	NC_013199	GCA	2	6	2369489	2369494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44221	NC_013199	CAAT	2	8	2369526	2369533	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44222	NC_013199	GTT	2	6	2369549	2369554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44223	NC_013199	TTG	2	6	2369564	2369569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44224	NC_013199	T	6	6	2369616	2369621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44225	NC_013199	CCA	2	6	2369645	2369650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44226	NC_013199	A	7	7	2369650	2369656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44227	NC_013199	GATTTA	2	12	2369705	2369716	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44228	NC_013199	AAC	2	6	2369782	2369787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540519
44229	NC_013199	CTG	2	6	2369798	2369803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540519
44230	NC_013199	GCT	2	6	2369886	2369891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540519
44231	NC_013199	GTT	2	6	2369920	2369925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540519
44232	NC_013199	TGC	2	6	2370000	2370005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540519
44233	NC_013199	TG	3	6	2370154	2370159	0 %	50 %	50 %	0 %	258540519
44234	NC_013199	ACC	2	6	2370510	2370515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540519
44235	NC_013199	TCA	2	6	2370562	2370567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540519
44236	NC_013199	TCG	2	6	2370704	2370709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540519
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44238	NC_013199	CAT	2	6	2370779	2370784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540519
44239	NC_013199	AC	3	6	2370787	2370792	50 %	0 %	0 %	50 %	258540519
44240	NC_013199	CAC	2	6	2370795	2370800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540519
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44249	NC_013199	ATTA	2	8	2371134	2371141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44250	NC_013199	AC	3	6	2371250	2371255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44251	NC_013199	GTT	2	6	2371315	2371320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44475	NC_013199	AAC	2	6	2383180	2383185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540531
44476	NC_013199	CAT	2	6	2383258	2383263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540531
44477	NC_013199	CATG	2	8	2383393	2383400	25 %	25 %	25 %	25 %	258540531
44478	NC_013199	TAC	2	6	2383430	2383435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540531
44479	NC_013199	CGG	2	6	2383455	2383460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540531
44480	NC_013199	CAG	2	6	2383468	2383473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540531
44481	NC_013199	CGCT	2	8	2383512	2383519	0 %	25 %	25 %	50 %	258540531
44482	NC_013199	TCA	3	9	2383569	2383577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540531
44483	NC_013199	GCA	2	6	2383592	2383597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540531
44484	NC_013199	TAAA	2	8	2383603	2383610	75 %	25 %	0 %	0 %	258540531
44485	NC_013199	ATG	2	6	2383620	2383625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540532
44486	NC_013199	AATTAC	2	12	2383627	2383638	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	258540532
44487	NC_013199	TCAT	2	8	2383675	2383682	25 %	50 %	0 %	25 %	258540532
44488	NC_013199	TGC	2	6	2383756	2383761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540532
44489	NC_013199	GATT	2	8	2383762	2383769	25 %	50 %	25 %	0 %	258540532
44490	NC_013199	GAT	2	6	2383881	2383886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540532
44491	NC_013199	AGC	2	6	2384035	2384040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540532
44492	NC_013199	CTTTG	2	10	2384043	2384052	0 %	60 %	20 %	20 %	258540532
44493	NC_013199	GGC	2	6	2384063	2384068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540532
44494	NC_013199	GC	3	6	2384127	2384132	0 %	0 %	50 %	50 %	258540532
44495	NC_013199	ATT	2	6	2384175	2384180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540532
44496	NC_013199	AAT	2	6	2384199	2384204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540532
44497	NC_013199	ATC	2	6	2384250	2384255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540532
44498	NC_013199	AAC	3	9	2384275	2384283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540532
44499	NC_013199	GAA	2	6	2384307	2384312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540532
44500	NC_013199	GCA	2	6	2384339	2384344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540532

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