MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_013199	CAG	2	6	2277477	2277482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540431
42503	NC_013199	ATT	2	6	2277519	2277524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540431
42504	NC_013199	GC	3	6	2277528	2277533	0 %	0 %	50 %	50 %	258540431
42505	NC_013199	ATC	2	6	2277550	2277555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540431
42506	NC_013199	ACCA	2	8	2277603	2277610	50 %	0 %	0 %	50 %	258540431
42507	NC_013199	GTG	2	6	2277646	2277651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540431
42508	NC_013199	GCA	2	6	2277733	2277738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540431
42509	NC_013199	GCA	2	6	2277758	2277763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540431
42510	NC_013199	GTT	2	6	2277796	2277801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540431
42511	NC_013199	AAT	2	6	2277808	2277813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540431
42512	NC_013199	TAA	2	6	2277867	2277872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540431
42513	NC_013199	CCTC	2	8	2277886	2277893	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42514	NC_013199	GCC	2	6	2278104	2278109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540432
42515	NC_013199	AAG	2	6	2278115	2278120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540432
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42517	NC_013199	TGA	2	6	2278173	2278178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540432
42518	NC_013199	CCAA	2	8	2278270	2278277	50 %	0 %	0 %	50 %	258540432
42519	NC_013199	ATC	2	6	2278308	2278313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540432
42520	NC_013199	CGT	2	6	2278337	2278342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540432
42521	NC_013199	AAT	2	6	2278345	2278350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540432
42522	NC_013199	TAA	2	6	2278375	2278380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540432
42523	NC_013199	CCGC	2	8	2278526	2278533	0 %	0 %	25 %	75 %	258540432
42524	NC_013199	CAT	2	6	2278553	2278558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540432
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42526	NC_013199	GTGAGC	2	12	2278688	2278699	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258540432
42527	NC_013199	TGC	2	6	2278786	2278791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42528	NC_013199	TGAGC	2	10	2278811	2278820	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42529	NC_013199	ACC	2	6	2279097	2279102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42530	NC_013199	A	6	6	2279114	2279119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42531	NC_013199	CAA	2	6	2279179	2279184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42532	NC_013199	CAA	2	6	2279186	2279191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42533	NC_013199	ATA	2	6	2279298	2279303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540433
42534	NC_013199	CAT	2	6	2279321	2279326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540433
42535	NC_013199	GTC	2	6	2279340	2279345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540433
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42538	NC_013199	CTT	2	6	2279408	2279413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540433
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42542	NC_013199	GCT	2	6	2279532	2279537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540433
42543	NC_013199	CCAT	2	8	2279539	2279546	25 %	25 %	0 %	50 %	258540433
42544	NC_013199	ATA	2	6	2279555	2279560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540433
42545	NC_013199	A	7	7	2279579	2279585	100 %	0 %	0 %	0 %	258540433
42546	NC_013199	CAT	3	9	2279648	2279656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540433
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42549	NC_013199	TTCCG	2	10	2279807	2279816	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42550	NC_013199	GCA	2	6	2279817	2279822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42551	NC_013199	A	6	6	2279922	2279927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42552	NC_013199	GTG	2	6	2279931	2279936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42553	NC_013199	TGC	2	6	2279985	2279990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42554	NC_013199	T	7	7	2280088	2280094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42555	NC_013199	TTTTA	2	10	2280099	2280108	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42556	NC_013199	TCA	3	9	2280140	2280148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42557	NC_013199	A	6	6	2280178	2280183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42558	NC_013199	AGC	2	6	2280198	2280203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42559	NC_013199	A	7	7	2280262	2280268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42560	NC_013199	GAA	2	6	2280454	2280459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540434
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42563	NC_013199	CA	3	6	2280561	2280566	50 %	0 %	0 %	50 %	258540434
42564	NC_013199	AC	3	6	2280575	2280580	50 %	0 %	0 %	50 %	258540434
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42579	NC_013199	CAT	2	6	2281170	2281175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540434
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42589	NC_013199	GATT	2	8	2281699	2281706	25 %	50 %	25 %	0 %	258540435
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42591	NC_013199	AACC	2	8	2281808	2281815	50 %	0 %	0 %	50 %	258540435
42592	NC_013199	CAT	2	6	2281828	2281833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540435
42593	NC_013199	GTAA	2	8	2281850	2281857	50 %	25 %	25 %	0 %	258540435
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42599	NC_013199	AT	3	6	2282173	2282178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42600	NC_013199	CAT	2	6	2282206	2282211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540436
42601	NC_013199	GCA	2	6	2282259	2282264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540436
42602	NC_013199	ATG	2	6	2282358	2282363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540436
42603	NC_013199	GCC	2	6	2282463	2282468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540436
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42606	NC_013199	TAAAA	2	10	2282613	2282622	80 %	20 %	0 %	0 %	258540436
42607	NC_013199	CAAT	2	8	2282647	2282654	50 %	25 %	0 %	25 %	258540436
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42611	NC_013199	TAT	2	6	2282830	2282835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540436
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42614	NC_013199	ATAA	2	8	2283054	2283061	75 %	25 %	0 %	0 %	258540437
42615	NC_013199	CTTTGA	2	12	2283162	2283173	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	258540437
42616	NC_013199	CGC	2	6	2283182	2283187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540437
42617	NC_013199	TGT	2	6	2283200	2283205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540437
42618	NC_013199	ATC	2	6	2283291	2283296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540437
42619	NC_013199	CGC	2	6	2283303	2283308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540437
42620	NC_013199	CTG	2	6	2283324	2283329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540437
42621	NC_013199	TTCT	2	8	2283366	2283373	0 %	75 %	0 %	25 %	258540437
42622	NC_013199	CTGTT	2	10	2283412	2283421	0 %	60 %	20 %	20 %	258540438
42623	NC_013199	GGC	2	6	2283495	2283500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540438
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42625	NC_013199	TAA	2	6	2283703	2283708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540438
42626	NC_013199	ATC	2	6	2283739	2283744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540438
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42628	NC_013199	TTC	2	6	2283958	2283963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540438
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42630	NC_013199	CAT	2	6	2284120	2284125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540438
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42633	NC_013199	CAGC	2	8	2284230	2284237	25 %	0 %	25 %	50 %	258540438
42634	NC_013199	CAAA	2	8	2284266	2284273	75 %	0 %	0 %	25 %	258540438
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42645	NC_013199	GCT	2	6	2284638	2284643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540439
42646	NC_013199	ATA	2	6	2284690	2284695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540439
42647	NC_013199	TCC	2	6	2284696	2284701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42648	NC_013199	CATTC	2	10	2284737	2284746	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
42649	NC_013199	CGC	2	6	2284793	2284798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540440
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42652	NC_013199	TGA	2	6	2284944	2284949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540440
42653	NC_013199	GATCC	2	10	2284955	2284964	20 %	20 %	20 %	40 %	258540440
42654	NC_013199	GCCG	2	8	2285065	2285072	0 %	0 %	50 %	50 %	258540440
42655	NC_013199	CGA	2	6	2285098	2285103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540440
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42660	NC_013199	A	7	7	2285535	2285541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42661	NC_013199	ATC	2	6	2285545	2285550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42662	NC_013199	AGC	2	6	2285633	2285638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42663	NC_013199	GC	3	6	2285717	2285722	0 %	0 %	50 %	50 %	258540442
42664	NC_013199	GCT	2	6	2285748	2285753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540442
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42670	NC_013199	TCCT	2	8	2285919	2285926	0 %	50 %	0 %	50 %	258540443
42671	NC_013199	GC	3	6	2286031	2286036	0 %	0 %	50 %	50 %	258540443
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42679	NC_013199	TGG	2	6	2286628	2286633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42680	NC_013199	ATC	2	6	2286746	2286751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540444
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42683	NC_013199	TCAG	2	8	2287006	2287013	25 %	25 %	25 %	25 %	258540445
42684	NC_013199	AT	3	6	2287090	2287095	50 %	50 %	0 %	0 %	258540445
42685	NC_013199	GCT	2	6	2287145	2287150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540445
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42689	NC_013199	CGG	2	6	2287432	2287437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540445
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42695	NC_013199	CGT	2	6	2287650	2287655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540445
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42705	NC_013199	TCA	2	6	2288080	2288085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540445
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42712	NC_013199	GCA	2	6	2288371	2288376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540445
42713	NC_013199	TTC	2	6	2288569	2288574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540445
42714	NC_013199	TGC	2	6	2288617	2288622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540445
42715	NC_013199	AGCCA	2	10	2288727	2288736	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42716	NC_013199	ACA	2	6	2288756	2288761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42717	NC_013199	ACCT	2	8	2288824	2288831	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42718	NC_013199	TGC	2	6	2288835	2288840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42719	NC_013199	TTCC	2	8	2288841	2288848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42720	NC_013199	CAT	2	6	2288872	2288877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42721	NC_013199	A	6	6	2288972	2288977	100 %	0 %	0 %	0 %	258540446
42722	NC_013199	GCA	2	6	2288990	2288995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540446
42723	NC_013199	AAC	2	6	2289019	2289024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540446
42724	NC_013199	ACAA	2	8	2289173	2289180	75 %	0 %	0 %	25 %	258540446
42725	NC_013199	TCT	2	6	2289188	2289193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540446
42726	NC_013199	CGT	2	6	2289265	2289270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540446
42727	NC_013199	ACG	2	6	2289317	2289322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540446
42728	NC_013199	GCT	2	6	2289350	2289355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540446
42729	NC_013199	T	7	7	2289355	2289361	0 %	100 %	0 %	0 %	258540446
42730	NC_013199	AT	3	6	2289383	2289388	50 %	50 %	0 %	0 %	258540446
42731	NC_013199	TGAT	2	8	2289389	2289396	25 %	50 %	25 %	0 %	258540446
42732	NC_013199	TTC	2	6	2289503	2289508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42733	NC_013199	TGC	2	6	2289614	2289619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540447
42734	NC_013199	TCA	2	6	2289732	2289737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540447
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42853	NC_013199	ATC	2	6	2297042	2297047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540455
42854	NC_013199	TTC	2	6	2297129	2297134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540455
42855	NC_013199	TGAT	2	8	2297136	2297143	25 %	50 %	25 %	0 %	258540455
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42857	NC_013199	T	6	6	2297226	2297231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42858	NC_013199	TTGC	2	8	2297317	2297324	0 %	50 %	25 %	25 %	258540456
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42950	NC_013199	GACTTT	2	12	2302747	2302758	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	258540456
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42952	NC_013199	CTG	2	6	2302870	2302875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540456
42953	NC_013199	TTTA	2	8	2302981	2302988	25 %	75 %	0 %	0 %	258540456
42954	NC_013199	TTG	2	6	2302991	2302996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540456
42955	NC_013199	TGC	2	6	2303120	2303125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540456
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42957	NC_013199	TA	3	6	2303297	2303302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42958	NC_013199	TTA	2	6	2303339	2303344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42959	NC_013199	A	6	6	2303359	2303364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42960	NC_013199	GATT	2	8	2303507	2303514	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42961	NC_013199	GAA	2	6	2303519	2303524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540457
42962	NC_013199	A	6	6	2303523	2303528	100 %	0 %	0 %	0 %	258540457
42963	NC_013199	ATG	2	6	2303553	2303558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540457
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42965	NC_013199	CA	3	6	2303642	2303647	50 %	0 %	0 %	50 %	258540457
42966	NC_013199	ACC	2	6	2303682	2303687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540457
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