MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42004	NC_013199	CGT	2	6	2254236	2254241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540408
42005	NC_013199	GCCAA	2	10	2254270	2254279	40 %	0 %	20 %	40 %	258540408
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42117	NC_013199	TCG	2	6	2259785	2259790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540413
42118	NC_013199	CCA	2	6	2259923	2259928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540413
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42123	NC_013199	CATC	2	8	2260071	2260078	25 %	25 %	0 %	50 %	258540414
42124	NC_013199	CATC	2	8	2260086	2260093	25 %	25 %	0 %	50 %	258540414
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42172	NC_013199	TAT	2	6	2262636	2262641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42174	NC_013199	CAAA	2	8	2262742	2262749	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42175	NC_013199	CAG	2	6	2262776	2262781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42232	NC_013199	TTGG	2	8	2265884	2265891	0 %	50 %	50 %	0 %	258540419
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42234	NC_013199	TCTT	2	8	2265962	2265969	0 %	75 %	0 %	25 %	258540419
42235	NC_013199	CAA	2	6	2265978	2265983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540419
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42282	NC_013199	T	6	6	2267817	2267822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42350	NC_013199	AAT	2	6	2270828	2270833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42354	NC_013199	CCCG	2	8	2270993	2271000	0 %	0 %	25 %	75 %	258540424
42355	NC_013199	ACT	2	6	2271031	2271036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540424
42356	NC_013199	TGC	2	6	2271082	2271087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540424
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42359	NC_013199	TCAA	2	8	2271391	2271398	50 %	25 %	0 %	25 %	258540424
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42362	NC_013199	CGGTT	2	10	2271525	2271534	0 %	40 %	40 %	20 %	258540424
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42376	NC_013199	TAT	2	6	2272126	2272131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42377	NC_013199	CGC	2	6	2272163	2272168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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42396	NC_013199	AAG	2	6	2273065	2273070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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42469	NC_013199	GAT	2	6	2276133	2276138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540429
42470	NC_013199	GC	3	6	2276155	2276160	0 %	0 %	50 %	50 %	258540429
42471	NC_013199	CCG	2	6	2276182	2276187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540429
42472	NC_013199	CAA	2	6	2276202	2276207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540429
42473	NC_013199	CAA	2	6	2276325	2276330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540429
42474	NC_013199	GGTCA	2	10	2276370	2276379	20 %	20 %	40 %	20 %	258540429
42475	NC_013199	CTT	2	6	2276396	2276401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540429
42476	NC_013199	CGC	2	6	2276406	2276411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540429
42477	NC_013199	GAC	2	6	2276444	2276449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540429
42478	NC_013199	CGC	2	6	2276468	2276473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540429
42479	NC_013199	TGA	2	6	2276482	2276487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540429
42480	NC_013199	GCT	2	6	2276565	2276570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540429
42481	NC_013199	AATT	2	8	2276583	2276590	50 %	50 %	0 %	0 %	258540429
42482	NC_013199	TGC	2	6	2276595	2276600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540429
42483	NC_013199	ATT	2	6	2276604	2276609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42484	NC_013199	CTC	2	6	2276610	2276615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42485	NC_013199	GAT	2	6	2276625	2276630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42486	NC_013199	CAT	3	9	2276668	2276676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540430
42487	NC_013199	ATA	2	6	2276687	2276692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540430
42488	NC_013199	T	6	6	2276696	2276701	0 %	100 %	0 %	0 %	258540430
42489	NC_013199	TTC	2	6	2276704	2276709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540430
42490	NC_013199	CCA	2	6	2276920	2276925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540430
42491	NC_013199	AGA	2	6	2276983	2276988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540430
42492	NC_013199	TCA	2	6	2277126	2277131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540430
42493	NC_013199	CGT	2	6	2277134	2277139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540430
42494	NC_013199	CAT	2	6	2277176	2277181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540431
42495	NC_013199	GTT	2	6	2277210	2277215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540431
42496	NC_013199	AAACCG	2	12	2277257	2277268	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	258540431
42497	NC_013199	AAT	2	6	2277360	2277365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540431
42498	NC_013199	CAA	2	6	2277395	2277400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540431
42499	NC_013199	CTGG	2	8	2277407	2277414	0 %	25 %	50 %	25 %	258540431
42500	NC_013199	AGC	3	9	2277436	2277444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540431

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