MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_013199	TAAAA	2	10	2201969	2201978	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41002	NC_013199	CA	3	6	2202039	2202044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41003	NC_013199	TG	3	6	2202060	2202065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41004	NC_013199	CTCA	2	8	2202070	2202077	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41005	NC_013199	TCA	2	6	2202150	2202155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41006	NC_013199	TGA	2	6	2202156	2202161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41007	NC_013199	CCT	2	6	2202165	2202170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41008	NC_013199	ACT	2	6	2202191	2202196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41009	NC_013199	ACGG	2	8	2202202	2202209	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41010	NC_013199	GAACT	2	10	2202221	2202230	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41011	NC_013199	T	7	7	2202233	2202239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41012	NC_013199	ATG	2	6	2202384	2202389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540360
41013	NC_013199	CAA	2	6	2202407	2202412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540360
41014	NC_013199	ACA	2	6	2202440	2202445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540360
41015	NC_013199	CGG	2	6	2202542	2202547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540360
41016	NC_013199	T	6	6	2202591	2202596	0 %	100 %	0 %	0 %	258540360
41017	NC_013199	GGC	2	6	2202617	2202622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540360
41018	NC_013199	ATC	2	6	2202688	2202693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540360
41019	NC_013199	GTTA	2	8	2202738	2202745	25 %	50 %	25 %	0 %	258540360
41020	NC_013199	GGT	2	6	2202768	2202773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540360
41021	NC_013199	GGC	2	6	2202783	2202788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540360
41022	NC_013199	TTC	2	6	2202798	2202803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540360
41023	NC_013199	CAT	2	6	2202854	2202859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540360
41024	NC_013199	TGT	2	6	2202908	2202913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540360
41025	NC_013199	CAGC	2	8	2202923	2202930	25 %	0 %	25 %	50 %	258540360
41026	NC_013199	GTG	2	6	2202955	2202960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540360
41027	NC_013199	TAC	2	6	2202971	2202976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540360
41028	NC_013199	ACA	2	6	2203137	2203142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540361
41029	NC_013199	CATGG	2	10	2203175	2203184	20 %	20 %	40 %	20 %	258540361
41030	NC_013199	CTG	2	6	2203311	2203316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540361
41031	NC_013199	ATG	2	6	2203317	2203322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540361
41032	NC_013199	TTCA	2	8	2203343	2203350	25 %	50 %	0 %	25 %	258540361
41033	NC_013199	T	6	6	2203450	2203455	0 %	100 %	0 %	0 %	258540361
41034	NC_013199	TTA	2	6	2203515	2203520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540361
41035	NC_013199	CAGT	2	8	2203534	2203541	25 %	25 %	25 %	25 %	258540361
41036	NC_013199	TGT	2	6	2203573	2203578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540361
41037	NC_013199	GAA	2	6	2203663	2203668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540361
41038	NC_013199	AGC	2	6	2203706	2203711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540361
41039	NC_013199	CA	3	6	2203800	2203805	50 %	0 %	0 %	50 %	258540361
41040	NC_013199	TGA	2	6	2203842	2203847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540361
41041	NC_013199	TCA	2	6	2203879	2203884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540361
41042	NC_013199	GCG	2	6	2203938	2203943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41043	NC_013199	T	6	6	2203945	2203950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41044	NC_013199	GTG	2	6	2204000	2204005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540362
41045	NC_013199	TTGA	2	8	2204047	2204054	25 %	50 %	25 %	0 %	258540362
41046	NC_013199	TGAC	2	8	2204084	2204091	25 %	25 %	25 %	25 %	258540362
41047	NC_013199	ATC	2	6	2204125	2204130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540362
41048	NC_013199	AACT	2	8	2204134	2204141	50 %	25 %	0 %	25 %	258540362
41049	NC_013199	CAA	2	6	2204158	2204163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540362
41050	NC_013199	CAA	2	6	2204166	2204171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540362
41051	NC_013199	TTCA	2	8	2204209	2204216	25 %	50 %	0 %	25 %	258540362
41052	NC_013199	AAC	2	6	2204258	2204263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540362
41053	NC_013199	GAAA	2	8	2204265	2204272	75 %	0 %	25 %	0 %	258540362
41054	NC_013199	TGC	2	6	2204296	2204301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540362
41055	NC_013199	TTG	2	6	2204449	2204454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540362
41056	NC_013199	CTG	2	6	2204503	2204508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540362
41057	NC_013199	TAC	2	6	2204538	2204543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540362
41058	NC_013199	AAC	2	6	2204595	2204600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41059	NC_013199	GCG	2	6	2204654	2204659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41060	NC_013199	ATC	2	6	2204660	2204665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41061	NC_013199	TGC	2	6	2204681	2204686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41062	NC_013199	TGAA	2	8	2204765	2204772	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41063	NC_013199	AAG	2	6	2204808	2204813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540363
41064	NC_013199	GCA	2	6	2204832	2204837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540363
41065	NC_013199	ATG	2	6	2204842	2204847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540363
41066	NC_013199	TGG	2	6	2204858	2204863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540363
41067	NC_013199	TATC	2	8	2204895	2204902	25 %	50 %	0 %	25 %	258540363
41068	NC_013199	TTAC	2	8	2204975	2204982	25 %	50 %	0 %	25 %	258540363
41069	NC_013199	A	6	6	2204988	2204993	100 %	0 %	0 %	0 %	258540363
41070	NC_013199	CAG	2	6	2205007	2205012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540363
41071	NC_013199	TCA	2	6	2205051	2205056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540363
41072	NC_013199	ACC	2	6	2205145	2205150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540363
41073	NC_013199	CTA	2	6	2205151	2205156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540363
41074	NC_013199	ACC	2	6	2205160	2205165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540363
41075	NC_013199	ATCAA	2	10	2205250	2205259	60 %	20 %	0 %	20 %	258540363
41076	NC_013199	GGC	2	6	2205339	2205344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540363
41077	NC_013199	CGG	2	6	2205348	2205353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540363
41078	NC_013199	ACC	2	6	2205364	2205369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540363
41079	NC_013199	CAA	2	6	2205376	2205381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540363
41080	NC_013199	AGCA	2	8	2205440	2205447	50 %	0 %	25 %	25 %	258540363
41081	NC_013199	AAC	2	6	2205510	2205515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540363
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41084	NC_013199	GCT	3	9	2205634	2205642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540363
41085	NC_013199	CAA	2	6	2205690	2205695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540363
41086	NC_013199	CGG	2	6	2205741	2205746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540363
41087	NC_013199	TGG	2	6	2205811	2205816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540363
41088	NC_013199	TTA	2	6	2205850	2205855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540363
41089	NC_013199	CAGG	2	8	2205856	2205863	25 %	0 %	50 %	25 %	258540363
41090	NC_013199	TTA	2	6	2205880	2205885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540363
41091	NC_013199	TTC	2	6	2205922	2205927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540363
41092	NC_013199	TTC	2	6	2205935	2205940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540363
41093	NC_013199	GTT	2	6	2205951	2205956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540363
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41095	NC_013199	AGCT	2	8	2206034	2206041	25 %	25 %	25 %	25 %	258540363
41096	NC_013199	AATG	2	8	2206096	2206103	50 %	25 %	25 %	0 %	258540363
41097	NC_013199	AAG	2	6	2206134	2206139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540363
41098	NC_013199	TCA	2	6	2206152	2206157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540363
41099	NC_013199	TCT	2	6	2206209	2206214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540363
41100	NC_013199	GCTCAC	2	12	2206512	2206523	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41101	NC_013199	AAG	2	6	2206526	2206531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41102	NC_013199	CAA	2	6	2206552	2206557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540364
41103	NC_013199	AAC	2	6	2206584	2206589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540364
41104	NC_013199	GCC	2	6	2206658	2206663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540364
41105	NC_013199	CCG	2	6	2206707	2206712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540364
41106	NC_013199	AAT	2	6	2206721	2206726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540364
41107	NC_013199	CGC	2	6	2206924	2206929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540364
41108	NC_013199	TAT	2	6	2206954	2206959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540364
41109	NC_013199	TTG	2	6	2206993	2206998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540364
41110	NC_013199	ACC	2	6	2207004	2207009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540364
41111	NC_013199	GCA	2	6	2207319	2207324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540364
41112	NC_013199	ATT	2	6	2207327	2207332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540364
41113	NC_013199	TCC	2	6	2207409	2207414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258540364
41114	NC_013199	GAT	2	6	2207479	2207484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540364
41115	NC_013199	CAC	2	6	2207492	2207497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41116	NC_013199	CAGA	2	8	2207544	2207551	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41117	NC_013199	GCTTGT	2	12	2207568	2207579	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41118	NC_013199	TTTG	2	8	2207614	2207621	0 %	75 %	25 %	0 %	258540365
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41237	NC_013199	CT	3	6	2213814	2213819	0 %	50 %	0 %	50 %	258540370
41238	NC_013199	CTC	2	6	2213834	2213839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258540370
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41339	NC_013199	T	6	6	2219396	2219401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41340	NC_013199	AATA	2	8	2219468	2219475	75 %	25 %	0 %	0 %	258540376
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41350	NC_013199	GGC	2	6	2219950	2219955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540376
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41353	NC_013199	TAAT	2	8	2220093	2220100	50 %	50 %	0 %	0 %	258540376
41354	NC_013199	TCA	2	6	2220219	2220224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41355	NC_013199	CA	3	6	2220257	2220262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41356	NC_013199	GCT	2	6	2220305	2220310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41357	NC_013199	TTA	2	6	2220354	2220359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41358	NC_013199	TCA	2	6	2220402	2220407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41364	NC_013199	GTG	2	6	2220613	2220618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41365	NC_013199	GC	3	6	2220654	2220659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41366	NC_013199	GC	3	6	2220732	2220737	0 %	0 %	50 %	50 %	258540377
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41471	NC_013199	AAGT	2	8	2226099	2226106	50 %	25 %	25 %	0 %	258540381
41472	NC_013199	TGC	2	6	2226146	2226151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540381
41473	NC_013199	ATC	2	6	2226167	2226172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540381
41474	NC_013199	ACC	2	6	2226181	2226186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540381
41475	NC_013199	GAC	2	6	2226193	2226198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540381
41476	NC_013199	GCC	2	6	2226203	2226208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540381
41477	NC_013199	CAA	2	6	2226217	2226222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540381
41478	NC_013199	CTG	2	6	2226238	2226243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540381
41479	NC_013199	GCT	2	6	2226251	2226256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540381
41480	NC_013199	CAC	2	6	2226424	2226429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540381
41481	NC_013199	GAT	2	6	2226460	2226465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540381
41482	NC_013199	CAGC	2	8	2226468	2226475	25 %	0 %	25 %	50 %	258540381
41483	NC_013199	A	6	6	2226555	2226560	100 %	0 %	0 %	0 %	258540381
41484	NC_013199	GCCTAA	2	12	2226727	2226738	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258540381
41485	NC_013199	AAT	2	6	2226742	2226747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540381
41486	NC_013199	CAT	2	6	2226799	2226804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540381
41487	NC_013199	AGC	2	6	2226805	2226810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540381
41488	NC_013199	CCA	2	6	2226843	2226848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540381
41489	NC_013199	TAA	2	6	2226864	2226869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540381
41490	NC_013199	GAT	2	6	2226885	2226890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540381
41491	NC_013199	CAT	2	6	2226938	2226943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540382
41492	NC_013199	TGA	2	6	2226996	2227001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540382
41493	NC_013199	ATGA	2	8	2227025	2227032	50 %	25 %	25 %	0 %	258540382
41494	NC_013199	TCA	2	6	2227041	2227046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540382
41495	NC_013199	AACAA	2	10	2227080	2227089	80 %	0 %	0 %	20 %	258540382
41496	NC_013199	CTT	2	6	2227106	2227111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540382
41497	NC_013199	CGC	2	6	2227130	2227135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540382
41498	NC_013199	TCA	2	6	2227143	2227148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540382
41499	NC_013199	TAA	2	6	2227169	2227174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540382
41500	NC_013199	TGT	2	6	2227218	2227223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540382

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