MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40505	NC_013199	GCCC	2	8	2175989	2175996	0 %	0 %	25 %	75 %	258540334
40506	NC_013199	ATC	2	6	2175999	2176004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540334
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40512	NC_013199	GT	3	6	2176267	2176272	0 %	50 %	50 %	0 %	258540335
40513	NC_013199	CTTC	2	8	2176307	2176314	0 %	50 %	0 %	50 %	258540335
40514	NC_013199	CAT	2	6	2176356	2176361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540335
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40619	NC_013199	TTG	2	6	2181360	2181365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540340
40620	NC_013199	CCAT	2	8	2181400	2181407	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40621	NC_013199	A	7	7	2181443	2181449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40622	NC_013199	GATCC	2	10	2181545	2181554	20 %	20 %	20 %	40 %	258540341
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40624	NC_013199	CAT	2	6	2181613	2181618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540341
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40635	NC_013199	CAT	2	6	2182416	2182421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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40687	NC_013199	TTA	2	6	2184798	2184803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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40969	NC_013199	ATG	2	6	2200263	2200268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540358
40970	NC_013199	TGA	2	6	2200281	2200286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540358
40971	NC_013199	ACC	2	6	2200304	2200309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540358
40972	NC_013199	ATC	2	6	2200319	2200324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540358
40973	NC_013199	CG	3	6	2200333	2200338	0 %	0 %	50 %	50 %	258540358
40974	NC_013199	AATC	2	8	2200361	2200368	50 %	25 %	0 %	25 %	258540358
40975	NC_013199	GCATG	2	10	2200369	2200378	20 %	20 %	40 %	20 %	258540358
40976	NC_013199	GCA	2	6	2200452	2200457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540358
40977	NC_013199	AGC	2	6	2200649	2200654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540358
40978	NC_013199	TCA	2	6	2200662	2200667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540358
40979	NC_013199	GTT	2	6	2200675	2200680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540358
40980	NC_013199	TCA	3	9	2200714	2200722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540358
40981	NC_013199	CCTA	2	8	2200761	2200768	25 %	25 %	0 %	50 %	258540359
40982	NC_013199	GCC	2	6	2200800	2200805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540359
40983	NC_013199	AAAC	2	8	2200918	2200925	75 %	0 %	0 %	25 %	258540359
40984	NC_013199	TCA	2	6	2201020	2201025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540359
40985	NC_013199	GCTT	2	8	2201049	2201056	0 %	50 %	25 %	25 %	258540359
40986	NC_013199	T	6	6	2201082	2201087	0 %	100 %	0 %	0 %	258540359
40987	NC_013199	CG	3	6	2201102	2201107	0 %	0 %	50 %	50 %	258540359
40988	NC_013199	TGG	2	6	2201116	2201121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540359
40989	NC_013199	AAT	2	6	2201165	2201170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540359
40990	NC_013199	CTG	2	6	2201182	2201187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540359
40991	NC_013199	TGA	2	6	2201344	2201349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540359
40992	NC_013199	CG	3	6	2201372	2201377	0 %	0 %	50 %	50 %	258540359
40993	NC_013199	TGT	2	6	2201457	2201462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540359
40994	NC_013199	CCG	2	6	2201491	2201496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540359
40995	NC_013199	TAA	2	6	2201528	2201533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540359
40996	NC_013199	AATA	2	8	2201614	2201621	75 %	25 %	0 %	0 %	258540359
40997	NC_013199	AGG	2	6	2201668	2201673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258540359
40998	NC_013199	TCA	2	6	2201751	2201756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540359
40999	NC_013199	GATT	2	8	2201762	2201769	25 %	50 %	25 %	0 %	258540359
41000	NC_013199	CGC	2	6	2201777	2201782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540359

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