MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013199	T	7	7	181435	181441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_013199	T	7	7	181443	181449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_013199	ACA	2	6	181475	181480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_013199	TA	3	6	181494	181499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_013199	T	8	8	181540	181547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_013199	CAA	2	6	181598	181603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538361
3507	NC_013199	ACA	2	6	181631	181636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538361
3508	NC_013199	CAG	2	6	181752	181757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538361
3509	NC_013199	CAA	2	6	181775	181780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538361
3510	NC_013199	AGC	2	6	181850	181855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538361
3511	NC_013199	CAACCG	2	12	181856	181867	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	258538361
3512	NC_013199	CTG	2	6	181935	181940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538361
3513	NC_013199	CG	3	6	181955	181960	0 %	0 %	50 %	50 %	258538361
3514	NC_013199	TGAT	2	8	181986	181993	25 %	50 %	25 %	0 %	258538361
3515	NC_013199	GCC	2	6	182057	182062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538361
3516	NC_013199	CG	3	6	182106	182111	0 %	0 %	50 %	50 %	258538361
3517	NC_013199	CAA	2	6	182125	182130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538361
3518	NC_013199	TTA	2	6	182131	182136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538361
3519	NC_013199	ATT	2	6	182177	182182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538361
3520	NC_013199	GCAA	2	8	182240	182247	50 %	0 %	25 %	25 %	258538361
3521	NC_013199	TTCAT	2	10	182272	182281	20 %	60 %	0 %	20 %	258538361
3522	NC_013199	CTTT	2	8	182335	182342	0 %	75 %	0 %	25 %	258538361
3523	NC_013199	GAA	2	6	182345	182350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538361
3524	NC_013199	A	6	6	182558	182563	100 %	0 %	0 %	0 %	258538361
3525	NC_013199	A	7	7	182610	182616	100 %	0 %	0 %	0 %	258538361
3526	NC_013199	AAC	2	6	182648	182653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538361
3527	NC_013199	TCGAC	2	10	182749	182758	20 %	20 %	20 %	40 %	258538361
3528	NC_013199	TGA	2	6	182775	182780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538361
3529	NC_013199	GAT	2	6	182888	182893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538361
3530	NC_013199	CAT	2	6	182919	182924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538361
3531	NC_013199	GGC	2	6	182998	183003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538361
3532	NC_013199	GGT	2	6	183016	183021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538361
3533	NC_013199	CAC	2	6	183040	183045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538361
3534	NC_013199	GTC	2	6	183068	183073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538361
3535	NC_013199	A	6	6	183083	183088	100 %	0 %	0 %	0 %	258538361
3536	NC_013199	GATTTT	2	12	183119	183130	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	258538361
3537	NC_013199	ATT	2	6	183191	183196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538361
3538	NC_013199	CGG	2	6	183210	183215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538361
3539	NC_013199	AGTC	2	8	183222	183229	25 %	25 %	25 %	25 %	258538361
3540	NC_013199	AAC	3	9	183318	183326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538361
3541	NC_013199	AGG	2	6	183351	183356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258538361
3542	NC_013199	CAGT	2	8	183385	183392	25 %	25 %	25 %	25 %	258538361
3543	NC_013199	GGT	2	6	183518	183523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_013199	TGA	2	6	183530	183535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538362
3545	NC_013199	CTG	2	6	183547	183552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538362
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3547	NC_013199	CTT	2	6	183630	183635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538362
3548	NC_013199	ACC	3	9	183702	183710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538362
3549	NC_013199	AGA	2	6	183717	183722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538362
3550	NC_013199	ATG	2	6	183742	183747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538362
3551	NC_013199	CTA	2	6	183775	183780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538362
3552	NC_013199	TTG	2	6	183805	183810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538362
3553	NC_013199	ACAA	2	8	183826	183833	75 %	0 %	0 %	25 %	258538362
3554	NC_013199	GAA	2	6	183841	183846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538362
3555	NC_013199	TTAAGT	2	12	183961	183972	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	258538363
3556	NC_013199	CCGA	2	8	184035	184042	25 %	0 %	25 %	50 %	258538363
3557	NC_013199	TGG	2	6	184055	184060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538363
3558	NC_013199	TCGA	2	8	184092	184099	25 %	25 %	25 %	25 %	258538363
3559	NC_013199	CA	3	6	184178	184183	50 %	0 %	0 %	50 %	258538363
3560	NC_013199	GCT	2	6	184443	184448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538363
3561	NC_013199	GAT	2	6	184485	184490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538363
3562	NC_013199	ACC	2	6	184644	184649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538363
3563	NC_013199	TGA	2	6	184675	184680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_013199	GAA	2	6	184802	184807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538364
3565	NC_013199	A	6	6	184806	184811	100 %	0 %	0 %	0 %	258538364
3566	NC_013199	TGCC	2	8	184849	184856	0 %	25 %	25 %	50 %	258538364
3567	NC_013199	TGC	2	6	184886	184891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538364
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3570	NC_013199	TTCA	2	8	185442	185449	25 %	50 %	0 %	25 %	258538364
3571	NC_013199	CAAGC	2	10	185759	185768	40 %	0 %	20 %	40 %	258538364
3572	NC_013199	ATC	2	6	185823	185828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538364
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3574	NC_013199	CTT	2	6	185872	185877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538364
3575	NC_013199	GGC	2	6	185921	185926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_013199	AGA	2	6	185977	185982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538365
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3584	NC_013199	ATA	2	6	186430	186435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538366
3585	NC_013199	CTG	2	6	186492	186497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538366
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3588	NC_013199	GCT	2	6	186668	186673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538366
3589	NC_013199	TGG	2	6	186688	186693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538366
3590	NC_013199	CA	3	6	186695	186700	50 %	0 %	0 %	50 %	258538366
3591	NC_013199	AAC	2	6	186767	186772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538366
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3594	NC_013199	ATT	2	6	187023	187028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538366
3595	NC_013199	AGC	2	6	187063	187068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538366
3596	NC_013199	GAT	2	6	187206	187211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538366
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3598	NC_013199	T	6	6	187251	187256	0 %	100 %	0 %	0 %	258538366
3599	NC_013199	TGTT	2	8	187332	187339	0 %	75 %	25 %	0 %	258538366
3600	NC_013199	CGC	2	6	187346	187351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538366
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3603	NC_013199	CCG	2	6	187569	187574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538366
3604	NC_013199	TAAT	2	8	187597	187604	50 %	50 %	0 %	0 %	258538366
3605	NC_013199	AAG	2	6	187633	187638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538366
3606	NC_013199	GTT	2	6	187665	187670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_013199	T	7	7	187669	187675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_013199	GAA	2	6	187681	187686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_013199	AAC	2	6	187743	187748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_013199	CTT	2	6	187764	187769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_013199	TTTA	2	8	187770	187777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_013199	TAA	2	6	187797	187802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_013199	TTTC	2	8	187889	187896	0 %	75 %	0 %	25 %	258538367
3614	NC_013199	TGG	2	6	187938	187943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538367
3615	NC_013199	GAC	2	6	188012	188017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538367
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3619	NC_013199	GTG	2	6	188147	188152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538367
3620	NC_013199	TTG	2	6	188214	188219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538367
3621	NC_013199	TTG	2	6	188239	188244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538367
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3623	NC_013199	CTG	2	6	188268	188273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538367
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3995	NC_013199	AAG	2	6	208034	208039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538386
3996	NC_013199	ATG	2	6	208124	208129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538386
3997	NC_013199	TCT	2	6	208140	208145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538386
3998	NC_013199	GAA	2	6	208273	208278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538386
3999	NC_013199	CAAG	2	8	208297	208304	50 %	0 %	25 %	25 %	258538386
4000	NC_013199	GGT	2	6	208330	208335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538386

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