MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37502	NC_013199	TCA	2	6	2012900	2012905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540182
37503	NC_013199	ATT	2	6	2012974	2012979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540182
37504	NC_013199	GAT	2	6	2012986	2012991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540182
37505	NC_013199	TCC	2	6	2013095	2013100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37506	NC_013199	ATG	2	6	2013105	2013110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37507	NC_013199	ATT	2	6	2013138	2013143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37508	NC_013199	GCT	2	6	2013164	2013169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37509	NC_013199	TGT	2	6	2013227	2013232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37510	NC_013199	TCC	2	6	2013324	2013329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37511	NC_013199	TCA	2	6	2013358	2013363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540183
37512	NC_013199	TCT	2	6	2013388	2013393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540183
37513	NC_013199	A	7	7	2013424	2013430	100 %	0 %	0 %	0 %	258540183
37514	NC_013199	CCA	2	6	2013439	2013444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540183
37515	NC_013199	GAT	2	6	2013578	2013583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540183
37516	NC_013199	ACA	2	6	2013596	2013601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540183
37517	NC_013199	AAC	2	6	2013687	2013692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540183
37518	NC_013199	ACT	2	6	2013718	2013723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540183
37519	NC_013199	GAT	2	6	2013731	2013736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540183
37520	NC_013199	CAT	2	6	2013758	2013763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540183
37521	NC_013199	AGGT	2	8	2013795	2013802	25 %	25 %	50 %	0 %	258540183
37522	NC_013199	TAA	2	6	2013821	2013826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540183
37523	NC_013199	TAA	2	6	2013992	2013997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540183
37524	NC_013199	GCG	3	9	2014000	2014008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540183
37525	NC_013199	ATC	2	6	2014075	2014080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540183
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37527	NC_013199	TGA	2	6	2014205	2014210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540183
37528	NC_013199	T	6	6	2014211	2014216	0 %	100 %	0 %	0 %	258540183
37529	NC_013199	ACA	2	6	2014270	2014275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540183
37530	NC_013199	ATCA	2	8	2014389	2014396	50 %	25 %	0 %	25 %	258540183
37531	NC_013199	TGC	2	6	2014410	2014415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540183
37532	NC_013199	TAA	2	6	2014455	2014460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540183
37533	NC_013199	AAC	2	6	2014506	2014511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540183
37534	NC_013199	ATAC	2	8	2014520	2014527	50 %	25 %	0 %	25 %	258540183
37535	NC_013199	CAG	2	6	2014565	2014570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540183
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37537	NC_013199	C	6	6	2014658	2014663	0 %	0 %	0 %	100 %	258540183
37538	NC_013199	A	6	6	2014771	2014776	100 %	0 %	0 %	0 %	258540183
37539	NC_013199	TAAAA	2	10	2014854	2014863	80 %	20 %	0 %	0 %	258540183
37540	NC_013199	AAC	2	6	2014902	2014907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540183
37541	NC_013199	ATC	2	6	2015010	2015015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540183
37542	NC_013199	TAAT	2	8	2015035	2015042	50 %	50 %	0 %	0 %	258540183
37543	NC_013199	AAT	2	6	2015073	2015078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540183
37544	NC_013199	ATC	2	6	2015153	2015158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37545	NC_013199	ATA	2	6	2015178	2015183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37546	NC_013199	AAC	2	6	2015221	2015226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37547	NC_013199	CGAC	2	8	2015227	2015234	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37548	NC_013199	TTA	2	6	2015279	2015284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37549	NC_013199	CTG	2	6	2015435	2015440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540184
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37551	NC_013199	TGGTA	2	10	2015488	2015497	20 %	40 %	40 %	0 %	258540184
37552	NC_013199	TCT	2	6	2015530	2015535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540184
37553	NC_013199	TAAC	2	8	2015553	2015560	50 %	25 %	0 %	25 %	258540184
37554	NC_013199	TAGA	2	8	2015569	2015576	50 %	25 %	25 %	0 %	258540184
37555	NC_013199	CCTAA	2	10	2015640	2015649	40 %	20 %	0 %	40 %	258540184
37556	NC_013199	TGA	2	6	2015695	2015700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540184
37557	NC_013199	TCGCAG	2	12	2015746	2015757	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258540184
37558	NC_013199	TAG	2	6	2015839	2015844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540184
37559	NC_013199	GTC	2	6	2015880	2015885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540184
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37564	NC_013199	A	6	6	2016181	2016186	100 %	0 %	0 %	0 %	258540184
37565	NC_013199	TTA	2	6	2016264	2016269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540184
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37573	NC_013199	GT	3	6	2016790	2016795	0 %	50 %	50 %	0 %	258540184
37574	NC_013199	GCA	2	6	2016903	2016908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540184
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37588	NC_013199	A	7	7	2017485	2017491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37589	NC_013199	CTGAAC	2	12	2017570	2017581	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258540185
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37593	NC_013199	AATA	2	8	2017779	2017786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37602	NC_013199	A	7	7	2018453	2018459	100 %	0 %	0 %	0 %	258540186
37603	NC_013199	ACC	2	6	2018523	2018528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540186
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37607	NC_013199	AG	3	6	2018795	2018800	50 %	0 %	50 %	0 %	258540186
37608	NC_013199	A	8	8	2018826	2018833	100 %	0 %	0 %	0 %	258540186
37609	NC_013199	AGC	2	6	2018882	2018887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540186
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37614	NC_013199	TCC	2	6	2019027	2019032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37615	NC_013199	ACG	2	6	2019104	2019109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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37973	NC_013199	A	6	6	2038656	2038661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37974	NC_013199	GTC	2	6	2038662	2038667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37975	NC_013199	GAC	2	6	2038688	2038693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37976	NC_013199	ACC	2	6	2038706	2038711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37977	NC_013199	GCA	2	6	2038805	2038810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37978	NC_013199	ACC	2	6	2038811	2038816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37979	NC_013199	CCTA	2	8	2038830	2038837	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37980	NC_013199	ACT	2	6	2038844	2038849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37981	NC_013199	CG	3	6	2038938	2038943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37982	NC_013199	GCG	2	6	2038996	2039001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540209
37983	NC_013199	GGT	2	6	2039010	2039015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540209
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37986	NC_013199	CAGCCA	2	12	2039345	2039356	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37987	NC_013199	GCA	2	6	2039403	2039408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540210
37988	NC_013199	GCT	2	6	2039443	2039448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540210
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38000	NC_013199	ATC	2	6	2039982	2039987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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