MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_013199	ATC	2	6	1877885	1877890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35002	NC_013199	TCA	2	6	1877954	1877959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540043
35003	NC_013199	TAA	2	6	1878004	1878009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540043
35004	NC_013199	TGCCAT	2	12	1878036	1878047	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258540043
35005	NC_013199	GTT	2	6	1878139	1878144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540043
35006	NC_013199	TTTG	2	8	1878178	1878185	0 %	75 %	25 %	0 %	258540043
35007	NC_013199	TTGA	2	8	1878234	1878241	25 %	50 %	25 %	0 %	258540043
35008	NC_013199	CAT	2	6	1878294	1878299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540043
35009	NC_013199	GTC	2	6	1878315	1878320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35010	NC_013199	GCT	2	6	1878416	1878421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540044
35011	NC_013199	CGC	2	6	1878498	1878503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540044
35012	NC_013199	GCA	2	6	1878545	1878550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540044
35013	NC_013199	TG	3	6	1878685	1878690	0 %	50 %	50 %	0 %	258540044
35014	NC_013199	ATTA	2	8	1878742	1878749	50 %	50 %	0 %	0 %	258540044
35015	NC_013199	CCT	2	6	1878796	1878801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35016	NC_013199	TCA	2	6	1878814	1878819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35017	NC_013199	TA	3	6	1878895	1878900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35018	NC_013199	ATT	3	9	1878916	1878924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35019	NC_013199	T	6	6	1879100	1879105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35020	NC_013199	CAA	2	6	1879137	1879142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35021	NC_013199	AAG	2	6	1879257	1879262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35022	NC_013199	GGA	2	6	1879350	1879355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35023	NC_013199	TTC	2	6	1879405	1879410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540045
35024	NC_013199	TAT	2	6	1879447	1879452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540045
35025	NC_013199	CTG	2	6	1879460	1879465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540045
35026	NC_013199	TGA	2	6	1879469	1879474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540045
35027	NC_013199	TTA	2	6	1879478	1879483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540045
35028	NC_013199	AGC	2	6	1879521	1879526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540045
35029	NC_013199	CCA	2	6	1879535	1879540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540045
35030	NC_013199	TAT	2	6	1879544	1879549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540045
35031	NC_013199	TCG	2	6	1879550	1879555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540045
35032	NC_013199	TTGA	2	8	1879597	1879604	25 %	50 %	25 %	0 %	258540045
35033	NC_013199	T	6	6	1879660	1879665	0 %	100 %	0 %	0 %	258540045
35034	NC_013199	ATG	2	6	1879681	1879686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540045
35035	NC_013199	AAG	2	6	1879724	1879729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540045
35036	NC_013199	TTAT	2	8	1879753	1879760	25 %	75 %	0 %	0 %	258540045
35037	NC_013199	AATT	2	8	1879832	1879839	50 %	50 %	0 %	0 %	258540045
35038	NC_013199	TGT	2	6	1879863	1879868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540045
35039	NC_013199	T	6	6	1879885	1879890	0 %	100 %	0 %	0 %	258540045
35040	NC_013199	CTT	2	6	1879905	1879910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540045
35041	NC_013199	A	7	7	1879918	1879924	100 %	0 %	0 %	0 %	258540045
35042	NC_013199	ATC	2	6	1879954	1879959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540045
35043	NC_013199	ATC	2	6	1879972	1879977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540045
35044	NC_013199	GGC	2	6	1879987	1879992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540045
35045	NC_013199	AAG	2	6	1880003	1880008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540045
35046	NC_013199	GGAA	2	8	1880019	1880026	50 %	0 %	50 %	0 %	258540045
35047	NC_013199	GCC	2	6	1880031	1880036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540045
35048	NC_013199	GGC	2	6	1880110	1880115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540045
35049	NC_013199	TAC	2	6	1880149	1880154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540045
35050	NC_013199	CGG	2	6	1880232	1880237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540045
35051	NC_013199	AT	3	6	1880265	1880270	50 %	50 %	0 %	0 %	258540045
35052	NC_013199	TCAT	2	8	1880354	1880361	25 %	50 %	0 %	25 %	258540045
35053	NC_013199	TCT	2	6	1880379	1880384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540045
35054	NC_013199	TCA	3	9	1880435	1880443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540045
35055	NC_013199	CAA	2	6	1880543	1880548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540045
35056	NC_013199	GGT	2	6	1880643	1880648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540045
35057	NC_013199	GCC	2	6	1880749	1880754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540045
35058	NC_013199	GTTA	2	8	1880796	1880803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35059	NC_013199	GCTCAC	2	12	1880943	1880954	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35060	NC_013199	CGA	2	6	1881043	1881048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540046
35061	NC_013199	TCA	2	6	1881153	1881158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540046
35062	NC_013199	T	6	6	1881179	1881184	0 %	100 %	0 %	0 %	258540046
35063	NC_013199	CAT	2	6	1881392	1881397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540046
35064	NC_013199	GCAT	2	8	1881504	1881511	25 %	25 %	25 %	25 %	258540046
35065	NC_013199	TTA	2	6	1881520	1881525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540046
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35067	NC_013199	TAC	2	6	1881728	1881733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540046
35068	NC_013199	GGGC	2	8	1881803	1881810	0 %	0 %	75 %	25 %	258540046
35069	NC_013199	CGC	2	6	1881823	1881828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540046
35070	NC_013199	GGAA	2	8	1881921	1881928	50 %	0 %	50 %	0 %	258540046
35071	NC_013199	CCG	2	6	1882014	1882019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540046
35072	NC_013199	TAC	2	6	1882065	1882070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540046
35073	NC_013199	GCA	2	6	1882126	1882131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540046
35074	NC_013199	TCCAA	2	10	1882151	1882160	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35075	NC_013199	TCA	2	6	1882187	1882192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35076	NC_013199	CAA	2	6	1882196	1882201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35077	NC_013199	A	6	6	1882200	1882205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35078	NC_013199	T	6	6	1882249	1882254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35079	NC_013199	ATT	2	6	1882262	1882267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35080	NC_013199	CAG	2	6	1882280	1882285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35081	NC_013199	CGC	2	6	1882333	1882338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540047
35082	NC_013199	CCA	2	6	1882506	1882511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540047
35083	NC_013199	TGA	3	9	1882550	1882558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540047
35084	NC_013199	TCC	2	6	1882640	1882645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35085	NC_013199	CTA	2	6	1882699	1882704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35086	NC_013199	TCA	2	6	1882737	1882742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35087	NC_013199	AACC	2	8	1882770	1882777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35088	NC_013199	CGTT	2	8	1882823	1882830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35089	NC_013199	ATC	2	6	1882978	1882983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540048
35090	NC_013199	TAA	2	6	1882996	1883001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540048
35091	NC_013199	GGCA	2	8	1883062	1883069	25 %	0 %	50 %	25 %	258540048
35092	NC_013199	CGC	2	6	1883089	1883094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540048
35093	NC_013199	GCA	2	6	1883111	1883116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540048
35094	NC_013199	A	7	7	1883158	1883164	100 %	0 %	0 %	0 %	258540048
35095	NC_013199	GCAC	2	8	1883300	1883307	25 %	0 %	25 %	50 %	258540048
35096	NC_013199	TCC	2	6	1883369	1883374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258540048
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35101	NC_013199	GGT	2	6	1883641	1883646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540048
35102	NC_013199	CAT	2	6	1883676	1883681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540048
35103	NC_013199	TGG	2	6	1883730	1883735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540048
35104	NC_013199	CAA	2	6	1883820	1883825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540048
35105	NC_013199	CTT	2	6	1883869	1883874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540048
35106	NC_013199	GGC	2	6	1883908	1883913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540048
35107	NC_013199	GAT	2	6	1883958	1883963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540048
35108	NC_013199	ATAAAG	2	12	1883980	1883991	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	258540048
35109	NC_013199	ATC	2	6	1883992	1883997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540048
35110	NC_013199	TGC	2	6	1884026	1884031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540048
35111	NC_013199	GTT	2	6	1884079	1884084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540048
35112	NC_013199	CAA	2	6	1884141	1884146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540048
35113	NC_013199	TCAGC	2	10	1884210	1884219	20 %	20 %	20 %	40 %	258540048
35114	NC_013199	GAT	2	6	1884241	1884246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540048
35115	NC_013199	ACG	2	6	1884247	1884252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540048
35116	NC_013199	CAC	2	6	1884271	1884276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540048
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35118	NC_013199	TCG	2	6	1884402	1884407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540048
35119	NC_013199	TTG	2	6	1884477	1884482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540048
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35479	NC_013199	CAGC	2	8	1904058	1904065	25 %	0 %	25 %	50 %	258540071
35480	NC_013199	GTC	2	6	1904104	1904109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540071
35481	NC_013199	AAGA	2	8	1904259	1904266	75 %	0 %	25 %	0 %	258540071
35482	NC_013199	TCCGAT	2	12	1904277	1904288	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258540071
35483	NC_013199	CAA	2	6	1904342	1904347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540071
35484	NC_013199	TAC	2	6	1904363	1904368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540071
35485	NC_013199	GTT	2	6	1904534	1904539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540072
35486	NC_013199	CAA	2	6	1904608	1904613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540072
35487	NC_013199	ATT	2	6	1904624	1904629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540072
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35489	NC_013199	GCTCAC	2	12	1904773	1904784	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258540072
35490	NC_013199	A	7	7	1904787	1904793	100 %	0 %	0 %	0 %	258540072
35491	NC_013199	TGT	2	6	1904809	1904814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35492	NC_013199	AAC	2	6	1904969	1904974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540073
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35496	NC_013199	ACTC	2	8	1905075	1905082	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35497	NC_013199	CA	3	6	1905084	1905089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35498	NC_013199	AACTC	2	10	1905095	1905104	40 %	20 %	0 %	40 %	258540074
35499	NC_013199	TTG	2	6	1905133	1905138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540074
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