MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34502	NC_013199	CCGC	2	8	1850955	1850962	0 %	0 %	25 %	75 %	258540028
34503	NC_013199	TCA	2	6	1851090	1851095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540028
34504	NC_013199	CTT	2	6	1851177	1851182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540028
34505	NC_013199	GCT	2	6	1851287	1851292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540028
34506	NC_013199	T	6	6	1851346	1851351	0 %	100 %	0 %	0 %	258540028
34507	NC_013199	TTC	2	6	1851433	1851438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540028
34508	NC_013199	TTG	2	6	1851445	1851450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540028
34509	NC_013199	TAA	2	6	1851468	1851473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540028
34510	NC_013199	GCA	2	6	1851476	1851481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540028
34511	NC_013199	TCA	2	6	1851482	1851487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540028
34512	NC_013199	AAT	2	6	1851496	1851501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540028
34513	NC_013199	ATC	2	6	1851551	1851556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540028
34514	NC_013199	GCT	2	6	1851593	1851598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540028
34515	NC_013199	ATCA	2	8	1851619	1851626	50 %	25 %	0 %	25 %	258540028
34516	NC_013199	CGA	2	6	1851630	1851635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540028
34517	NC_013199	TGT	2	6	1851653	1851658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540028
34518	NC_013199	CAGA	2	8	1851783	1851790	50 %	0 %	25 %	25 %	258540028
34519	NC_013199	GCG	2	6	1851883	1851888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540028
34520	NC_013199	CGT	2	6	1851895	1851900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540028
34521	NC_013199	GCA	2	6	1851950	1851955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540028
34522	NC_013199	TAA	2	6	1852024	1852029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540028
34523	NC_013199	CAT	2	6	1852035	1852040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540028
34524	NC_013199	ATG	2	6	1852070	1852075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540028
34525	NC_013199	TCA	2	6	1852077	1852082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540028
34526	NC_013199	CAT	2	6	1852128	1852133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540028
34527	NC_013199	TTTTG	2	10	1852155	1852164	0 %	80 %	20 %	0 %	258540028
34528	NC_013199	ATG	2	6	1852193	1852198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540028
34529	NC_013199	TAC	2	6	1852203	1852208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540028
34530	NC_013199	CTG	2	6	1852221	1852226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540028
34531	NC_013199	ATGC	2	8	1852242	1852249	25 %	25 %	25 %	25 %	258540028
34532	NC_013199	T	6	6	1852260	1852265	0 %	100 %	0 %	0 %	258540028
34533	NC_013199	CAGC	2	8	1852326	1852333	25 %	0 %	25 %	50 %	258540028
34534	NC_013199	GGC	2	6	1852366	1852371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540028
34535	NC_013199	ATC	2	6	1852418	1852423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540028
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34537	NC_013199	GC	3	6	1852671	1852676	0 %	0 %	50 %	50 %	258540028
34538	NC_013199	TTC	2	6	1852678	1852683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540028
34539	NC_013199	CAG	2	6	1852719	1852724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540028
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34541	NC_013199	GCTG	2	8	1852770	1852777	0 %	25 %	50 %	25 %	258540028
34542	NC_013199	CGA	2	6	1852805	1852810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540028
34543	NC_013199	GAC	2	6	1852903	1852908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540028
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34545	NC_013199	TAA	2	6	1852942	1852947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540028
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34548	NC_013199	GC	3	6	1853014	1853019	0 %	0 %	50 %	50 %	258540028
34549	NC_013199	CTT	2	6	1853029	1853034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540028
34550	NC_013199	T	6	6	1853115	1853120	0 %	100 %	0 %	0 %	258540028
34551	NC_013199	CTT	2	6	1853121	1853126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540028
34552	NC_013199	CTT	2	6	1853133	1853138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540028
34553	NC_013199	CCT	2	6	1853180	1853185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34554	NC_013199	TCTT	2	8	1853186	1853193	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34555	NC_013199	CAG	2	6	1853228	1853233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34556	NC_013199	ACA	2	6	1853260	1853265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34557	NC_013199	TTG	2	6	1853278	1853283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34558	NC_013199	AGGC	2	8	1853348	1853355	25 %	0 %	50 %	25 %	258540029
34559	NC_013199	AGT	2	6	1853371	1853376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540029
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34561	NC_013199	AAAT	2	8	1853702	1853709	75 %	25 %	0 %	0 %	258540030
34562	NC_013199	GAT	2	6	1853762	1853767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540030
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34567	NC_013199	TTG	2	6	1854149	1854154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540030
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34571	NC_013199	ATC	3	9	1854336	1854344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540030
34572	NC_013199	GTC	2	6	1854486	1854491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540030
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34575	NC_013199	TGC	2	6	1854759	1854764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540030
34576	NC_013199	CCCA	2	8	1854816	1854823	25 %	0 %	0 %	75 %	258540030
34577	NC_013199	CGA	2	6	1854834	1854839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540030
34578	NC_013199	TCC	2	6	1854855	1854860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34579	NC_013199	TCA	2	6	1854871	1854876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34581	NC_013199	T	6	6	1854950	1854955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34582	NC_013199	TCT	2	6	1855012	1855017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540031
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34585	NC_013199	CAA	2	6	1855196	1855201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540031
34586	NC_013199	TTG	2	6	1855383	1855388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540031
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34588	NC_013199	AGGC	2	8	1855532	1855539	25 %	0 %	50 %	25 %	258540031
34589	NC_013199	TTC	2	6	1855674	1855679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540031
34590	NC_013199	A	6	6	1855695	1855700	100 %	0 %	0 %	0 %	258540031
34591	NC_013199	TAA	2	6	1855759	1855764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540031
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34594	NC_013199	GCC	2	6	1855901	1855906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540032
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34598	NC_013199	AATCA	2	10	1856248	1856257	60 %	20 %	0 %	20 %	258540032
34599	NC_013199	TAA	2	6	1856296	1856301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540032
34600	NC_013199	CAT	2	6	1856437	1856442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540032
34601	NC_013199	CTT	2	6	1856455	1856460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540032
34602	NC_013199	GATCG	2	10	1856491	1856500	20 %	20 %	40 %	20 %	258540032
34603	NC_013199	CCTTG	2	10	1856511	1856520	0 %	40 %	20 %	40 %	258540032
34604	NC_013199	TCA	2	6	1856532	1856537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540032
34605	NC_013199	CAT	2	6	1856662	1856667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540032
34606	NC_013199	GCC	2	6	1856690	1856695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540032
34607	NC_013199	TTA	2	6	1856750	1856755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540032
34608	NC_013199	GCT	2	6	1856793	1856798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540032
34609	NC_013199	CGC	2	6	1856837	1856842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540032
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34611	NC_013199	AAT	2	6	1856883	1856888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540032
34612	NC_013199	AAC	2	6	1856939	1856944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540032
34613	NC_013199	CGC	2	6	1856960	1856965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540032
34614	NC_013199	T	6	6	1856966	1856971	0 %	100 %	0 %	0 %	258540032
34615	NC_013199	GTCT	2	8	1856972	1856979	0 %	50 %	25 %	25 %	258540032
34616	NC_013199	ATT	2	6	1856995	1857000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540033
34617	NC_013199	T	6	6	1857029	1857034	0 %	100 %	0 %	0 %	258540033
34618	NC_013199	GCG	2	6	1857166	1857171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540033
34619	NC_013199	ATAA	2	8	1857200	1857207	75 %	25 %	0 %	0 %	258540033
34620	NC_013199	AT	3	6	1857252	1857257	50 %	50 %	0 %	0 %	258540033
34621	NC_013199	ATCA	2	8	1857296	1857303	50 %	25 %	0 %	25 %	258540033
34622	NC_013199	CAT	2	6	1857343	1857348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540033
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34625	NC_013199	ATT	2	6	1857404	1857409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540033
34626	NC_013199	ATCGT	2	10	1857420	1857429	20 %	40 %	20 %	20 %	258540033
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34628	NC_013199	CAT	2	6	1857619	1857624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540033
34629	NC_013199	CTG	2	6	1857629	1857634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540033
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34632	NC_013199	CGC	2	6	1857929	1857934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540033
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34643	NC_013199	GAAA	2	8	1858339	1858346	75 %	0 %	25 %	0 %	258540033
34644	NC_013199	A	7	7	1858385	1858391	100 %	0 %	0 %	0 %	258540033
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34646	NC_013199	ATTCA	2	10	1858403	1858412	40 %	40 %	0 %	20 %	258540033
34647	NC_013199	TG	3	6	1858449	1858454	0 %	50 %	50 %	0 %	258540033
34648	NC_013199	TCA	2	6	1858456	1858461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540033
34649	NC_013199	ATTTA	2	10	1858513	1858522	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34650	NC_013199	ATA	2	6	1858523	1858528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34651	NC_013199	TA	3	6	1858540	1858545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34652	NC_013199	AAT	2	6	1858556	1858561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34653	NC_013199	AC	3	6	1858810	1858815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34654	NC_013199	AGCA	2	8	1858842	1858849	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34655	NC_013199	TTC	2	6	1858855	1858860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34657	NC_013199	TTA	2	6	1858923	1858928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34674	NC_013199	TTGA	2	8	1859790	1859797	25 %	50 %	25 %	0 %	258540035
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34689	NC_013199	GCC	2	6	1860606	1860611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540035
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34706	NC_013199	GCT	2	6	1862101	1862106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540037
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34716	NC_013199	ATA	2	6	1862754	1862759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540037
34717	NC_013199	CTG	2	6	1862799	1862804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540037
34718	NC_013199	CAT	2	6	1862843	1862848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540037
34719	NC_013199	GAT	2	6	1862894	1862899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540037
34720	NC_013199	CAG	2	6	1862940	1862945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540037
34721	NC_013199	CTG	2	6	1862946	1862951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540037
34722	NC_013199	T	6	6	1863017	1863022	0 %	100 %	0 %	0 %	258540037
34723	NC_013199	ATC	2	6	1863069	1863074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540037
34724	NC_013199	T	6	6	1863101	1863106	0 %	100 %	0 %	0 %	258540037
34725	NC_013199	GCC	2	6	1863176	1863181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540037
34726	NC_013199	T	6	6	1863276	1863281	0 %	100 %	0 %	0 %	258540037
34727	NC_013199	GCA	2	6	1863326	1863331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540037
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34729	NC_013199	CCTT	2	8	1863373	1863380	0 %	50 %	0 %	50 %	258540037
34730	NC_013199	CTG	2	6	1863393	1863398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540037
34731	NC_013199	GAAG	2	8	1863422	1863429	50 %	0 %	50 %	0 %	258540037
34732	NC_013199	GTT	2	6	1863436	1863441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540037
34733	NC_013199	AGCC	2	8	1863465	1863472	25 %	0 %	25 %	50 %	258540037
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