MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013199	GCC	2	6	155197	155202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538331
3002	NC_013199	CATT	2	8	155233	155240	25 %	50 %	0 %	25 %	258538331
3003	NC_013199	TGAT	2	8	155289	155296	25 %	50 %	25 %	0 %	258538331
3004	NC_013199	TGG	2	6	155419	155424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538331
3005	NC_013199	TGAT	2	8	155508	155515	25 %	50 %	25 %	0 %	258538331
3006	NC_013199	CAC	2	6	155521	155526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538331
3007	NC_013199	AAG	2	6	155555	155560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538331
3008	NC_013199	ATG	2	6	155568	155573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538331
3009	NC_013199	TCTGGG	2	12	155710	155721	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	258538331
3010	NC_013199	CCA	2	6	155835	155840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538331
3011	NC_013199	TTA	2	6	155991	155996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538331
3012	NC_013199	GAA	2	6	156062	156067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538331
3013	NC_013199	AAGG	2	8	156083	156090	50 %	0 %	50 %	0 %	258538331
3014	NC_013199	GAAC	2	8	156107	156114	50 %	0 %	25 %	25 %	258538331
3015	NC_013199	CCGATA	2	12	156180	156191	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258538331
3016	NC_013199	GAA	2	6	156289	156294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538331
3017	NC_013199	GAT	2	6	156338	156343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538331
3018	NC_013199	ACTG	2	8	156409	156416	25 %	25 %	25 %	25 %	258538331
3019	NC_013199	AAG	2	6	156440	156445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538331
3020	NC_013199	TAC	2	6	156479	156484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538331
3021	NC_013199	GTC	2	6	156788	156793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538331
3022	NC_013199	CAA	2	6	156823	156828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538331
3023	NC_013199	ACGG	2	8	156843	156850	25 %	0 %	50 %	25 %	258538331
3024	NC_013199	GAA	2	6	156854	156859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538331
3025	NC_013199	ATC	2	6	156860	156865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538331
3026	NC_013199	CGC	2	6	156911	156916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538331
3027	NC_013199	ATA	2	6	156952	156957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_013199	TTG	2	6	157175	157180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538332
3029	NC_013199	ATT	2	6	157183	157188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538332
3030	NC_013199	TCT	2	6	157205	157210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538332
3031	NC_013199	CCT	2	6	157212	157217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258538332
3032	NC_013199	GCG	2	6	157251	157256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538332
3033	NC_013199	A	6	6	157357	157362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_013199	TGA	2	6	157528	157533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538333
3035	NC_013199	GC	3	6	157538	157543	0 %	0 %	50 %	50 %	258538333
3036	NC_013199	GGC	2	6	157603	157608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538333
3037	NC_013199	ATCC	2	8	157668	157675	25 %	25 %	0 %	50 %	258538333
3038	NC_013199	AGC	2	6	157719	157724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538333
3039	NC_013199	AGG	2	6	157740	157745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258538333
3040	NC_013199	TCG	2	6	157746	157751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538333
3041	NC_013199	GATG	2	8	157765	157772	25 %	25 %	50 %	0 %	258538333
3042	NC_013199	GAC	2	6	157780	157785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538333
3043	NC_013199	AAGC	2	8	157866	157873	50 %	0 %	25 %	25 %	258538334
3044	NC_013199	GAT	3	9	157884	157892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538334
3045	NC_013199	GACGAG	2	12	157926	157937	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	258538334
3046	NC_013199	CCA	2	6	158079	158084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538334
3047	NC_013199	GCC	2	6	158131	158136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538334
3048	NC_013199	CAT	2	6	158145	158150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538334
3049	NC_013199	CAG	2	6	158156	158161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538334
3050	NC_013199	TAA	2	6	158210	158215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538334
3051	NC_013199	TCG	2	6	158236	158241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538334
3052	NC_013199	TTG	2	6	158358	158363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538334
3053	NC_013199	TG	3	6	158387	158392	0 %	50 %	50 %	0 %	258538334
3054	NC_013199	CTG	2	6	158403	158408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538334
3055	NC_013199	ACC	2	6	158434	158439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_013199	AGG	2	6	158462	158467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_013199	GCAAG	2	10	158477	158486	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3058	NC_013199	GC	3	6	158500	158505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_013199	A	6	6	158576	158581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_013199	AAAT	2	8	158585	158592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_013199	ATC	2	6	158650	158655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_013199	T	7	7	158764	158770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_013199	CAAA	2	8	158903	158910	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3064	NC_013199	CCAC	2	8	158938	158945	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3065	NC_013199	A	6	6	158960	158965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_013199	CACC	2	8	159013	159020	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3067	NC_013199	CGGC	2	8	159045	159052	0 %	0 %	50 %	50 %	258538335
3068	NC_013199	CTT	2	6	159064	159069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538335
3069	NC_013199	AGA	2	6	159246	159251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538335
3070	NC_013199	CGC	2	6	159310	159315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538335
3071	NC_013199	CGGA	2	8	159330	159337	25 %	0 %	50 %	25 %	258538335
3072	NC_013199	ATG	2	6	159464	159469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538335
3073	NC_013199	TAA	2	6	159499	159504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538335
3074	NC_013199	TCG	2	6	159518	159523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538335
3075	NC_013199	TGC	2	6	159618	159623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538335
3076	NC_013199	TTGA	2	8	159668	159675	25 %	50 %	25 %	0 %	258538335
3077	NC_013199	GAT	2	6	159785	159790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538335
3078	NC_013199	ACAA	2	8	159805	159812	75 %	0 %	0 %	25 %	258538335
3079	NC_013199	ATA	2	6	159827	159832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538335
3080	NC_013199	CAG	2	6	159927	159932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538335
3081	NC_013199	CAA	2	6	159940	159945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538335
3082	NC_013199	CAA	2	6	159963	159968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538335
3083	NC_013199	TCCC	2	8	160027	160034	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3084	NC_013199	CTG	2	6	160286	160291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538336
3085	NC_013199	TTG	2	6	160346	160351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538336
3086	NC_013199	TCT	2	6	160413	160418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538336
3087	NC_013199	TCG	2	6	160494	160499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538336
3088	NC_013199	GCC	2	6	160541	160546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538336
3089	NC_013199	TGC	2	6	160596	160601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538336
3090	NC_013199	GCA	2	6	160725	160730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538336
3091	NC_013199	AAG	2	6	160773	160778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538336
3092	NC_013199	TGG	2	6	160831	160836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538336
3093	NC_013199	ATC	2	6	160928	160933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538336
3094	NC_013199	ATG	2	6	160950	160955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538336
3095	NC_013199	AAT	2	6	161023	161028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538336
3096	NC_013199	TCC	2	6	161076	161081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258538336
3097	NC_013199	GCA	2	6	161112	161117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538336
3098	NC_013199	T	6	6	161189	161194	0 %	100 %	0 %	0 %	258538336
3099	NC_013199	CTTT	2	8	161243	161250	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3100	NC_013199	T	6	6	161288	161293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_013199	TGAA	2	8	161390	161397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_013199	A	6	6	161406	161411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_013199	GGA	2	6	161442	161447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_013199	CTG	2	6	161471	161476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538337
3105	NC_013199	GCCG	2	8	161485	161492	0 %	0 %	50 %	50 %	258538337
3106	NC_013199	CCG	2	6	161515	161520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538337
3107	NC_013199	GT	3	6	161578	161583	0 %	50 %	50 %	0 %	258538337
3108	NC_013199	CAT	2	6	161608	161613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538337
3109	NC_013199	CAT	2	6	161708	161713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_013199	CA	3	6	161761	161766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_013199	GTG	2	6	161973	161978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538338
3112	NC_013199	CAGG	2	8	161985	161992	25 %	0 %	50 %	25 %	258538338
3113	NC_013199	TTG	2	6	161993	161998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538338
3114	NC_013199	AAG	2	6	162032	162037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538338
3115	NC_013199	TGA	2	6	162104	162109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538338
3116	NC_013199	GGC	2	6	162131	162136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538338
3117	NC_013199	TGA	2	6	162138	162143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538338
3118	NC_013199	TTC	2	6	162268	162273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538338
3119	NC_013199	GCC	2	6	162364	162369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538338
3120	NC_013199	CGC	2	6	162448	162453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538338
3121	NC_013199	CTT	2	6	162480	162485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538338
3122	NC_013199	GTT	2	6	162547	162552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538338
3123	NC_013199	CAC	2	6	162591	162596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538338
3124	NC_013199	TGC	2	6	162666	162671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538338
3125	NC_013199	TTG	2	6	162686	162691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538338
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3129	NC_013199	CAT	2	6	163105	163110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3205	NC_013199	ATT	2	6	166658	166663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3230	NC_013199	CAT	2	6	168258	168263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538344
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3232	NC_013199	GTT	2	6	168482	168487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3233	NC_013199	ATA	2	6	168578	168583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3234	NC_013199	T	6	6	168584	168589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3235	NC_013199	T	6	6	168602	168607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3236	NC_013199	GCTT	2	8	168688	168695	0 %	50 %	25 %	25 %	258538345
3237	NC_013199	GAG	2	6	168767	168772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258538345
3238	NC_013199	GCAAT	2	10	168786	168795	40 %	20 %	20 %	20 %	258538345
3239	NC_013199	ATT	2	6	168801	168806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538345
3240	NC_013199	GA	3	6	168822	168827	50 %	0 %	50 %	0 %	258538345
3241	NC_013199	TGA	2	6	168885	168890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538345
3242	NC_013199	ACAA	2	8	168918	168925	75 %	0 %	0 %	25 %	258538345
3243	NC_013199	ATG	2	6	168995	169000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538345
3244	NC_013199	GCA	2	6	169099	169104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538345
3245	NC_013199	CAG	2	6	169119	169124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3246	NC_013199	TGA	2	6	169183	169188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_013199	ATT	2	6	169229	169234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538346
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3495	NC_013199	ATG	2	6	181089	181094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3496	NC_013199	AAGTC	2	10	181293	181302	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3497	NC_013199	TTAA	2	8	181309	181316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3498	NC_013199	A	6	6	181315	181320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3499	NC_013199	ATA	2	6	181377	181382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3500	NC_013199	GTTT	2	8	181411	181418	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

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