MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34004	NC_013199	CTT	2	6	1822570	1822575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258539998
34005	NC_013199	GTT	2	6	1822582	1822587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539998
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34099	NC_013199	GGCTG	2	10	1828353	1828362	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
34100	NC_013199	GTG	2	6	1828367	1828372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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34119	NC_013199	GGT	2	6	1829363	1829368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540004
34120	NC_013199	GTT	2	6	1829380	1829385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540004
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34224	NC_013199	T	6	6	1835292	1835297	0 %	100 %	0 %	0 %	258540009
34225	NC_013199	ATT	2	6	1835318	1835323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34226	NC_013199	GTCATT	2	12	1835439	1835450	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	258540010
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34228	NC_013199	TCAA	2	8	1835475	1835482	50 %	25 %	0 %	25 %	258540010
34229	NC_013199	ACTG	2	8	1835483	1835490	25 %	25 %	25 %	25 %	258540010
34230	NC_013199	GTTC	2	8	1835502	1835509	0 %	50 %	25 %	25 %	258540010
34231	NC_013199	CGG	2	6	1835580	1835585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540010
34232	NC_013199	CTT	2	6	1835633	1835638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540010
34233	NC_013199	CA	3	6	1835758	1835763	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34234	NC_013199	A	6	6	1835763	1835768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34235	NC_013199	CCGA	2	8	1835832	1835839	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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34237	NC_013199	A	6	6	1835855	1835860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34339	NC_013199	CTT	2	6	1841334	1841339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540016
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34358	NC_013199	GCC	2	6	1842180	1842185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34359	NC_013199	AC	3	6	1842189	1842194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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34470	NC_013199	CTTGG	2	10	1849077	1849086	0 %	40 %	40 %	20 %	258540025
34471	NC_013199	ATC	2	6	1849098	1849103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540025
34472	NC_013199	GCC	2	6	1849209	1849214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540025
34473	NC_013199	T	6	6	1849218	1849223	0 %	100 %	0 %	0 %	258540025
34474	NC_013199	TGC	2	6	1849242	1849247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540025
34475	NC_013199	GAT	2	6	1849272	1849277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540025
34476	NC_013199	AATC	2	8	1849412	1849419	50 %	25 %	0 %	25 %	258540025
34477	NC_013199	GAT	3	9	1849593	1849601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540025
34478	NC_013199	CCTTT	2	10	1849726	1849735	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
34479	NC_013199	T	6	6	1849733	1849738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34480	NC_013199	A	7	7	1849783	1849789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34481	NC_013199	ACCT	2	8	1849880	1849887	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34482	NC_013199	TCC	2	6	1849938	1849943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34483	NC_013199	TGA	2	6	1849957	1849962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34484	NC_013199	T	6	6	1850030	1850035	0 %	100 %	0 %	0 %	258540026
34485	NC_013199	CCAG	2	8	1850194	1850201	25 %	0 %	25 %	50 %	258540026
34486	NC_013199	TTG	2	6	1850220	1850225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540026
34487	NC_013199	TAA	2	6	1850235	1850240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540026
34488	NC_013199	CCA	2	6	1850390	1850395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540026
34489	NC_013199	CAT	2	6	1850396	1850401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540026
34490	NC_013199	TTG	2	6	1850433	1850438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540026
34491	NC_013199	CT	3	6	1850462	1850467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34492	NC_013199	T	6	6	1850504	1850509	0 %	100 %	0 %	0 %	258540027
34493	NC_013199	CGA	2	6	1850558	1850563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540027
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34495	NC_013199	GTG	2	6	1850620	1850625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540027
34496	NC_013199	AGGA	2	8	1850677	1850684	50 %	0 %	50 %	0 %	258540027
34497	NC_013199	GCAT	2	8	1850821	1850828	25 %	25 %	25 %	25 %	258540027
34498	NC_013199	CGC	2	6	1850829	1850834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540027
34499	NC_013199	CAA	2	6	1850886	1850891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34500	NC_013199	CGC	2	6	1850930	1850935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540028

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