MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_013199	GCT	2	6	1337339	1337344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539534
25002	NC_013199	AGC	2	6	1337381	1337386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539534
25003	NC_013199	ACC	2	6	1337396	1337401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258539534
25004	NC_013199	TAT	2	6	1337516	1337521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539534
25005	NC_013199	ACA	3	9	1337602	1337610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258539534
25006	NC_013199	CA	3	6	1337613	1337618	50 %	0 %	0 %	50 %	258539534
25007	NC_013199	CGGT	2	8	1337841	1337848	0 %	25 %	50 %	25 %	258539534
25008	NC_013199	GC	3	6	1338038	1338043	0 %	0 %	50 %	50 %	258539534
25009	NC_013199	AAGCAA	2	12	1338044	1338055	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	258539534
25010	NC_013199	ATT	2	6	1338152	1338157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539534
25011	NC_013199	TCA	2	6	1338253	1338258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539534
25012	NC_013199	GCA	2	6	1338274	1338279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539534
25013	NC_013199	AACC	2	8	1338291	1338298	50 %	0 %	0 %	50 %	258539534
25014	NC_013199	TTTG	2	8	1338385	1338392	0 %	75 %	25 %	0 %	258539534
25015	NC_013199	AAC	2	6	1338415	1338420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258539534
25016	NC_013199	GCC	2	6	1338518	1338523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258539534
25017	NC_013199	CGG	2	6	1338649	1338654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258539535
25018	NC_013199	TTTA	2	8	1338665	1338672	25 %	75 %	0 %	0 %	258539535
25019	NC_013199	GCA	2	6	1338694	1338699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539535
25020	NC_013199	TGA	2	6	1338780	1338785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539535
25021	NC_013199	CCG	2	6	1338954	1338959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258539536
25022	NC_013199	TGG	2	6	1339006	1339011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258539536
25023	NC_013199	TGG	2	6	1339089	1339094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258539536
25024	NC_013199	CAG	2	6	1339217	1339222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539536
25025	NC_013199	CCG	2	6	1339244	1339249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258539536
25026	NC_013199	CAG	2	6	1339256	1339261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539536
25027	NC_013199	CAA	2	6	1339295	1339300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258539536
25028	NC_013199	GTG	2	6	1339304	1339309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258539536
25029	NC_013199	GGCG	2	8	1339313	1339320	0 %	0 %	75 %	25 %	258539536
25030	NC_013199	TGA	2	6	1339532	1339537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539537
25031	NC_013199	GGT	2	6	1339538	1339543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258539537
25032	NC_013199	GCG	2	6	1339548	1339553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258539537
25033	NC_013199	CG	3	6	1339572	1339577	0 %	0 %	50 %	50 %	258539537
25034	NC_013199	TGA	2	6	1339589	1339594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539537
25035	NC_013199	CTG	2	6	1339621	1339626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539537
25036	NC_013199	ATC	2	6	1339704	1339709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539537
25037	NC_013199	ATT	2	6	1339839	1339844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539537
25038	NC_013199	AGG	2	6	1339846	1339851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258539537
25039	NC_013199	CATC	2	8	1339871	1339878	25 %	25 %	0 %	50 %	258539537
25040	NC_013199	TCA	2	6	1339931	1339936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539537
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25042	NC_013199	ATT	2	6	1339990	1339995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539538
25043	NC_013199	CGC	2	6	1340010	1340015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258539538
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25051	NC_013199	A	7	7	1340475	1340481	100 %	0 %	0 %	0 %	258539538
25052	NC_013199	CGG	2	6	1340603	1340608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258539538
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25054	NC_013199	TTTGC	2	10	1340674	1340683	0 %	60 %	20 %	20 %	258539538
25055	NC_013199	CACC	2	8	1340700	1340707	25 %	0 %	0 %	75 %	258539538
25056	NC_013199	ATC	2	6	1340728	1340733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539538
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25058	NC_013199	A	6	6	1340856	1340861	100 %	0 %	0 %	0 %	258539538
25059	NC_013199	GCAAA	2	10	1340917	1340926	60 %	0 %	20 %	20 %	258539538
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25061	NC_013199	AGA	2	6	1341044	1341049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25062	NC_013199	A	6	6	1341057	1341062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25063	NC_013199	TTTG	2	8	1341071	1341078	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25064	NC_013199	TGT	2	6	1341091	1341096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25065	NC_013199	ATT	2	6	1341158	1341163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539539
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25084	NC_013199	GCT	2	6	1341799	1341804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539540
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25088	NC_013199	CAAT	2	8	1341951	1341958	50 %	25 %	0 %	25 %	258539540
25089	NC_013199	CCG	2	6	1341967	1341972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258539540
25090	NC_013199	TCGG	2	8	1342040	1342047	0 %	25 %	50 %	25 %	258539540
25091	NC_013199	GGT	2	6	1342141	1342146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258539540
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25101	NC_013199	TGC	2	6	1342571	1342576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539540
25102	NC_013199	GGCG	2	8	1342595	1342602	0 %	0 %	75 %	25 %	258539540
25103	NC_013199	ATT	2	6	1342624	1342629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539540
25104	NC_013199	TGA	2	6	1342715	1342720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539540
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25106	NC_013199	TGA	2	6	1342745	1342750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539540
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25117	NC_013199	TTGA	2	8	1343239	1343246	25 %	50 %	25 %	0 %	258539540
25118	NC_013199	TCC	2	6	1343280	1343285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258539540
25119	NC_013199	CG	3	6	1343293	1343298	0 %	0 %	50 %	50 %	258539540
25120	NC_013199	TGCA	2	8	1343312	1343319	25 %	25 %	25 %	25 %	258539540
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25150	NC_013199	CA	3	6	1345101	1345106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25151	NC_013199	TTA	2	6	1345111	1345116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25233	NC_013199	GAAA	2	8	1349712	1349719	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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25236	NC_013199	AGG	2	6	1349888	1349893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25237	NC_013199	T	6	6	1349898	1349903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25238	NC_013199	ACT	2	6	1349983	1349988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539547
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25351	NC_013199	TGT	2	6	1356014	1356019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25498	NC_013199	ATG	2	6	1364747	1364752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25499	NC_013199	T	6	6	1364768	1364773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25500	NC_013199	T	6	6	1364840	1364845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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