MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_013199	GAAA	2	8	1258348	1258355	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23502	NC_013199	T	6	6	1258371	1258376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23503	NC_013199	GGC	2	6	1258377	1258382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23504	NC_013199	TTG	2	6	1258403	1258408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23505	NC_013199	TCA	2	6	1258419	1258424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23506	NC_013199	CAA	2	6	1258451	1258456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23507	NC_013199	A	7	7	1258511	1258517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23508	NC_013199	GACG	2	8	1258527	1258534	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23509	NC_013199	ATT	2	6	1258544	1258549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23510	NC_013199	ACTGA	2	10	1258556	1258565	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23511	NC_013199	CAA	2	6	1258593	1258598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23512	NC_013199	TTG	2	6	1258617	1258622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23513	NC_013199	CAA	2	6	1258655	1258660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258539461
23514	NC_013199	CCTT	2	8	1258720	1258727	0 %	50 %	0 %	50 %	258539461
23515	NC_013199	GTC	2	6	1258734	1258739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539461
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23518	NC_013199	GC	3	6	1258908	1258913	0 %	0 %	50 %	50 %	258539461
23519	NC_013199	AAGCC	2	10	1258928	1258937	40 %	0 %	20 %	40 %	258539461
23520	NC_013199	CTT	2	6	1259003	1259008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258539461
23521	NC_013199	GC	3	6	1259020	1259025	0 %	0 %	50 %	50 %	258539461
23522	NC_013199	CGTT	2	8	1259047	1259054	0 %	50 %	25 %	25 %	258539461
23523	NC_013199	CGG	2	6	1259119	1259124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258539461
23524	NC_013199	TTG	2	6	1259125	1259130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539461
23525	NC_013199	GAC	2	6	1259156	1259161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539461
23526	NC_013199	GAC	2	6	1259201	1259206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539461
23527	NC_013199	TCC	2	6	1259252	1259257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23528	NC_013199	TAC	2	6	1259340	1259345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23529	NC_013199	GCCG	2	8	1259387	1259394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23530	NC_013199	CTG	2	6	1259395	1259400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23531	NC_013199	ATT	2	6	1259402	1259407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23532	NC_013199	GCG	2	6	1259438	1259443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258539462
23533	NC_013199	TCA	2	6	1259492	1259497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539462
23534	NC_013199	ATG	2	6	1259537	1259542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539462
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23536	NC_013199	GCTG	2	8	1259590	1259597	0 %	25 %	50 %	25 %	258539462
23537	NC_013199	TGCA	2	8	1259699	1259706	25 %	25 %	25 %	25 %	258539462
23538	NC_013199	GGTT	2	8	1259838	1259845	0 %	50 %	50 %	0 %	258539462
23539	NC_013199	ATA	3	9	1259876	1259884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258539462
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23541	NC_013199	T	7	7	1259960	1259966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23542	NC_013199	GAT	2	6	1260075	1260080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539463
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23544	NC_013199	ATT	2	6	1260091	1260096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539463
23545	NC_013199	GCT	2	6	1260115	1260120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539463
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23547	NC_013199	GCA	2	6	1260138	1260143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539463
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23549	NC_013199	AGCTG	2	10	1260312	1260321	20 %	20 %	40 %	20 %	258539463
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23553	NC_013199	GAT	2	6	1260508	1260513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539463
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23555	NC_013199	GCA	2	6	1260591	1260596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539463
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23579	NC_013199	GGCT	2	8	1261811	1261818	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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23582	NC_013199	TA	3	6	1261905	1261910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23584	NC_013199	TCA	2	6	1262106	1262111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23585	NC_013199	GGCT	2	8	1262146	1262153	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23586	NC_013199	TGA	2	6	1262222	1262227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539464
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23591	NC_013199	TAA	2	6	1262664	1262669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258539464
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23593	NC_013199	GATT	2	8	1262799	1262806	25 %	50 %	25 %	0 %	258539464
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23598	NC_013199	GTCA	2	8	1263421	1263428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23599	NC_013199	A	6	6	1263561	1263566	100 %	0 %	0 %	0 %	258539465
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23601	NC_013199	GTTGC	2	10	1263781	1263790	0 %	40 %	40 %	20 %	258539465
23602	NC_013199	TGA	2	6	1263794	1263799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539465
23603	NC_013199	CGG	2	6	1263841	1263846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258539465
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23607	NC_013199	CAG	2	6	1264037	1264042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539465
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23609	NC_013199	GATT	2	8	1264071	1264078	25 %	50 %	25 %	0 %	258539465
23610	NC_013199	CGTGG	2	10	1264108	1264117	0 %	20 %	60 %	20 %	258539465
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23616	NC_013199	CAAT	2	8	1264418	1264425	50 %	25 %	0 %	25 %	258539465
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23620	NC_013199	CCG	2	6	1264558	1264563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258539465
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23622	NC_013199	GC	4	8	1264636	1264643	0 %	0 %	50 %	50 %	258539465
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23651	NC_013199	TGGT	2	8	1266120	1266127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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23654	NC_013199	GGT	2	6	1266243	1266248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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23656	NC_013199	T	7	7	1266288	1266294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23657	NC_013199	GCGT	2	8	1266330	1266337	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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