MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_013199	GTA	2	6	1125046	1125051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539329
21003	NC_013199	GCA	2	6	1125098	1125103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539329
21004	NC_013199	TGG	2	6	1125122	1125127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258539329
21005	NC_013199	A	7	7	1125348	1125354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21006	NC_013199	TTG	2	6	1125451	1125456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539330
21007	NC_013199	CAT	2	6	1125627	1125632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539330
21008	NC_013199	GGC	2	6	1125637	1125642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258539330
21009	NC_013199	T	6	6	1125687	1125692	0 %	100 %	0 %	0 %	258539330
21010	NC_013199	TCAA	2	8	1125704	1125711	50 %	25 %	0 %	25 %	258539330
21011	NC_013199	TCG	2	6	1125713	1125718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539330
21012	NC_013199	CG	3	6	1125717	1125722	0 %	0 %	50 %	50 %	258539330
21013	NC_013199	CGA	2	6	1125738	1125743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539330
21014	NC_013199	AAG	2	6	1125860	1125865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258539330
21015	NC_013199	CCG	2	6	1125869	1125874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258539330
21016	NC_013199	CGC	2	6	1125882	1125887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258539330
21017	NC_013199	TAA	2	6	1125917	1125922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258539330
21018	NC_013199	AAG	2	6	1125932	1125937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258539330
21019	NC_013199	CTT	2	6	1125963	1125968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258539330
21020	NC_013199	ATG	2	6	1125986	1125991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539330
21021	NC_013199	CGC	2	6	1126053	1126058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258539330
21022	NC_013199	ATT	2	6	1126066	1126071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539330
21023	NC_013199	TCT	2	6	1126103	1126108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258539330
21024	NC_013199	TGA	2	6	1126217	1126222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539330
21025	NC_013199	TGA	2	6	1126266	1126271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539330
21026	NC_013199	GTC	2	6	1126282	1126287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539330
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21030	NC_013199	CAT	2	6	1126368	1126373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539330
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21032	NC_013199	TGT	2	6	1126506	1126511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539330
21033	NC_013199	CGC	2	6	1126534	1126539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258539330
21034	NC_013199	CTT	2	6	1126554	1126559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258539330
21035	NC_013199	TCT	2	6	1126658	1126663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258539330
21036	NC_013199	GCC	2	6	1126756	1126761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258539330
21037	NC_013199	GCA	2	6	1126826	1126831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539330
21038	NC_013199	CCT	2	6	1126884	1126889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21039	NC_013199	GTA	2	6	1126982	1126987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539331
21040	NC_013199	GA	3	6	1127078	1127083	50 %	0 %	50 %	0 %	258539331
21041	NC_013199	TCCA	2	8	1127103	1127110	25 %	25 %	0 %	50 %	258539331
21042	NC_013199	CGGC	2	8	1127213	1127220	0 %	0 %	50 %	50 %	258539331
21043	NC_013199	AAT	2	6	1127244	1127249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258539331
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21047	NC_013199	CAGT	2	8	1127435	1127442	25 %	25 %	25 %	25 %	258539331
21048	NC_013199	TAG	2	6	1127459	1127464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539331
21049	NC_013199	GAAT	2	8	1127511	1127518	50 %	25 %	25 %	0 %	258539331
21050	NC_013199	ACG	2	6	1127572	1127577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539331
21051	NC_013199	AG	3	6	1127658	1127663	50 %	0 %	50 %	0 %	258539331
21052	NC_013199	CACG	2	8	1127693	1127700	25 %	0 %	25 %	50 %	258539331
21053	NC_013199	GGC	2	6	1127706	1127711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258539331
21054	NC_013199	CATG	2	8	1127816	1127823	25 %	25 %	25 %	25 %	258539331
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21058	NC_013199	CTG	2	6	1128143	1128148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539331
21059	NC_013199	CAT	3	9	1128189	1128197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539331
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21067	NC_013199	TTG	2	6	1128489	1128494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539331
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21070	NC_013199	T	6	6	1128584	1128589	0 %	100 %	0 %	0 %	258539331
21071	NC_013199	TGC	2	6	1128610	1128615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539331
21072	NC_013199	CAG	2	6	1128686	1128691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539331
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21083	NC_013199	GGCT	2	8	1129186	1129193	0 %	25 %	50 %	25 %	258539332
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21091	NC_013199	GAT	2	6	1129482	1129487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539332
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21101	NC_013199	TCG	2	6	1130126	1130131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539332
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21104	NC_013199	GAA	2	6	1130266	1130271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258539332
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21106	NC_013199	CAAG	2	8	1130480	1130487	50 %	0 %	25 %	25 %	258539332
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21112	NC_013199	AGC	2	6	1130644	1130649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539332
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21117	NC_013199	AATG	2	8	1130748	1130755	50 %	25 %	25 %	0 %	258539332
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21142	NC_013199	ATTA	2	8	1131923	1131930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21228	NC_013199	TTG	2	6	1136453	1136458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539338
21229	NC_013199	T	7	7	1136524	1136530	0 %	100 %	0 %	0 %	258539338
21230	NC_013199	CTC	2	6	1136540	1136545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21231	NC_013199	AT	3	6	1136549	1136554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21232	NC_013199	AGC	2	6	1136581	1136586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21233	NC_013199	TTC	2	6	1136624	1136629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21469	NC_013199	CGG	2	6	1149986	1149991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21470	NC_013199	T	7	7	1150016	1150022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21471	NC_013199	T	7	7	1150090	1150096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21472	NC_013199	A	6	6	1150113	1150118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21473	NC_013199	GAA	2	6	1150160	1150165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21474	NC_013199	ACGAT	2	10	1150237	1150246	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21475	NC_013199	AAAG	2	8	1150247	1150254	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21476	NC_013199	CTTG	2	8	1150294	1150301	0 %	50 %	25 %	25 %	258539352
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21479	NC_013199	GC	3	6	1150373	1150378	0 %	0 %	50 %	50 %	258539352
21480	NC_013199	GCT	2	6	1150437	1150442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539352
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21482	NC_013199	ACA	2	6	1150482	1150487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258539352
21483	NC_013199	AT	3	6	1150503	1150508	50 %	50 %	0 %	0 %	258539352
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21489	NC_013199	ATT	2	6	1150825	1150830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539352
21490	NC_013199	TGA	2	6	1150841	1150846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539352
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21492	NC_013199	TGT	2	6	1150931	1150936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539352
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21497	NC_013199	T	6	6	1151150	1151155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21498	NC_013199	TTGG	2	8	1151225	1151232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21499	NC_013199	AGG	2	6	1151302	1151307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21500	NC_013199	GTTC	2	8	1151356	1151363	0 %	50 %	25 %	25 %	258539353

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