MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_013199	CTG	2	6	826236	826241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539008
15503	NC_013199	TTC	2	6	826418	826423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258539008
15504	NC_013199	T	6	6	826424	826429	0 %	100 %	0 %	0 %	258539008
15505	NC_013199	AT	3	6	826431	826436	50 %	50 %	0 %	0 %	258539008
15506	NC_013199	CCT	2	6	826437	826442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15507	NC_013199	CTA	2	6	826451	826456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15508	NC_013199	ATT	2	6	826576	826581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_013199	ATT	2	6	826585	826590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_013199	T	6	6	826597	826602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15511	NC_013199	TGGTA	2	10	826697	826706	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15512	NC_013199	ATG	2	6	826719	826724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_013199	CTGT	2	8	826728	826735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15514	NC_013199	AGG	2	6	826883	826888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_013199	TTC	2	6	826900	826905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15516	NC_013199	ACA	2	6	826917	826922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15517	NC_013199	GTT	2	6	826981	826986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539009
15518	NC_013199	T	6	6	827028	827033	0 %	100 %	0 %	0 %	258539009
15519	NC_013199	GGC	2	6	827045	827050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258539009
15520	NC_013199	TTGG	2	8	827150	827157	0 %	50 %	50 %	0 %	258539009
15521	NC_013199	CAT	2	6	827166	827171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539009
15522	NC_013199	ATT	2	6	827197	827202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539009
15523	NC_013199	GGA	2	6	827289	827294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258539009
15524	NC_013199	ATC	2	6	827330	827335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539009
15525	NC_013199	GTT	2	6	827419	827424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539009
15526	NC_013199	GCG	2	6	827519	827524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258539009
15527	NC_013199	TCTTT	2	10	827544	827553	0 %	80 %	0 %	20 %	258539009
15528	NC_013199	TTA	2	6	827571	827576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539009
15529	NC_013199	TTA	2	6	827640	827645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539009
15530	NC_013199	ATT	2	6	827651	827656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539009
15531	NC_013199	TGCT	2	8	827703	827710	0 %	50 %	25 %	25 %	258539009
15532	NC_013199	ATGG	2	8	827715	827722	25 %	25 %	50 %	0 %	258539009
15533	NC_013199	GTTT	2	8	827809	827816	0 %	75 %	25 %	0 %	258539009
15534	NC_013199	CGTTT	2	10	827833	827842	0 %	60 %	20 %	20 %	258539009
15535	NC_013199	TGG	2	6	827874	827879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258539009
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15537	NC_013199	TGG	2	6	827946	827951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258539009
15538	NC_013199	CAT	2	6	828153	828158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539009
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15542	NC_013199	GTC	2	6	828389	828394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539009
15543	NC_013199	GGT	2	6	828409	828414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258539009
15544	NC_013199	TCATA	2	10	828439	828448	40 %	40 %	0 %	20 %	258539009
15545	NC_013199	CG	3	6	828469	828474	0 %	0 %	50 %	50 %	258539009
15546	NC_013199	A	6	6	828586	828591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15547	NC_013199	GCT	2	6	828634	828639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15548	NC_013199	GAT	2	6	828662	828667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15549	NC_013199	TATACT	2	12	828738	828749	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15550	NC_013199	ACAG	2	8	828795	828802	50 %	0 %	25 %	25 %	258539010
15551	NC_013199	GTG	2	6	828820	828825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258539010
15552	NC_013199	TCA	2	6	828872	828877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539010
15553	NC_013199	GAT	2	6	828915	828920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539010
15554	NC_013199	CGAAC	2	10	828926	828935	40 %	0 %	20 %	40 %	258539010
15555	NC_013199	GTTT	2	8	828959	828966	0 %	75 %	25 %	0 %	258539010
15556	NC_013199	AAC	2	6	829096	829101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258539010
15557	NC_013199	TATG	2	8	829133	829140	25 %	50 %	25 %	0 %	258539010
15558	NC_013199	GCG	2	6	829268	829273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258539010
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15560	NC_013199	GCT	2	6	829530	829535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539010
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15562	NC_013199	TAT	2	6	829599	829604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539010
15563	NC_013199	GACT	2	8	829651	829658	25 %	25 %	25 %	25 %	258539010
15564	NC_013199	GTT	2	6	829689	829694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539010
15565	NC_013199	GAT	2	6	829728	829733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539010
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15570	NC_013199	CTG	2	6	829855	829860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539010
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15577	NC_013199	TTG	2	6	830316	830321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539011
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15579	NC_013199	A	6	6	830433	830438	100 %	0 %	0 %	0 %	258539011
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15584	NC_013199	CTTTT	2	10	830584	830593	0 %	80 %	0 %	20 %	258539011
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15593	NC_013199	CAA	2	6	830990	830995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258539011
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15595	NC_013199	GAA	2	6	831037	831042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258539012
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15598	NC_013199	T	6	6	831169	831174	0 %	100 %	0 %	0 %	258539012
15599	NC_013199	TTA	2	6	831222	831227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539012
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15601	NC_013199	TGA	2	6	831390	831395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539012
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15604	NC_013199	GTGATT	2	12	831521	831532	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	258539012
15605	NC_013199	TAC	3	9	831554	831562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539012
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15615	NC_013199	TTG	2	6	832002	832007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539012
15616	NC_013199	A	7	7	832024	832030	100 %	0 %	0 %	0 %	258539012
15617	NC_013199	GGAT	2	8	832080	832087	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15618	NC_013199	AAATT	2	10	832097	832106	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15619	NC_013199	TGA	3	9	832158	832166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15620	NC_013199	TGGC	2	8	832214	832221	0 %	25 %	50 %	25 %	258539013
15621	NC_013199	CG	3	6	832228	832233	0 %	0 %	50 %	50 %	258539013
15622	NC_013199	CTT	2	6	832248	832253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258539013
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