MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_013199	GCT	2	6	687931	687936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538863
13003	NC_013199	AGA	2	6	687966	687971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538863
13004	NC_013199	TGC	2	6	688004	688009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538863
13005	NC_013199	AGC	2	6	688037	688042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538863
13006	NC_013199	GTG	2	6	688127	688132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538863
13007	NC_013199	TTACC	2	10	688137	688146	20 %	40 %	0 %	40 %	258538863
13008	NC_013199	GGACA	2	10	688199	688208	40 %	0 %	40 %	20 %	258538863
13009	NC_013199	T	7	7	688209	688215	0 %	100 %	0 %	0 %	258538863
13010	NC_013199	TTA	2	6	688330	688335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538863
13011	NC_013199	A	6	6	688343	688348	100 %	0 %	0 %	0 %	258538863
13012	NC_013199	ATT	2	6	688351	688356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538863
13013	NC_013199	GTC	2	6	688414	688419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538863
13014	NC_013199	GGA	2	6	688518	688523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258538863
13015	NC_013199	ACA	2	6	688556	688561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538864
13016	NC_013199	TTTA	2	8	688568	688575	25 %	75 %	0 %	0 %	258538864
13017	NC_013199	ACT	2	6	688583	688588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538864
13018	NC_013199	T	7	7	688627	688633	0 %	100 %	0 %	0 %	258538864
13019	NC_013199	AAC	2	6	688678	688683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538864
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13021	NC_013199	GGT	2	6	688728	688733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538864
13022	NC_013199	TGG	2	6	688780	688785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538864
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13025	NC_013199	ATC	2	6	688806	688811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538864
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13035	NC_013199	GTA	2	6	689592	689597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538864
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13037	NC_013199	CAAA	2	8	689800	689807	75 %	0 %	0 %	25 %	258538864
13038	NC_013199	GGC	2	6	689869	689874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_013199	TGG	2	6	689883	689888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_013199	AGC	2	6	689904	689909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_013199	TTGG	2	8	689921	689928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_013199	ATT	2	6	689977	689982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538865
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13052	NC_013199	CTG	3	9	690425	690433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_013199	CGG	2	6	690475	690480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_013199	T	6	6	690511	690516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_013199	T	6	6	690531	690536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_013199	ATG	2	6	690540	690545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13058	NC_013199	ATTA	2	8	690600	690607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13119	NC_013199	AGGA	2	8	694206	694213	50 %	0 %	50 %	0 %	258538868
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13238	NC_013199	T	6	6	699514	699519	0 %	100 %	0 %	0 %	258538871
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13245	NC_013199	ATA	2	6	699785	699790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538871
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13486	NC_013199	TGGC	2	8	713728	713735	0 %	25 %	50 %	25 %	258538890
13487	NC_013199	GCT	2	6	713813	713818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538890
13488	NC_013199	GCA	2	6	713917	713922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538890
13489	NC_013199	TTGTAA	2	12	713979	713990	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	258538890
13490	NC_013199	A	6	6	714025	714030	100 %	0 %	0 %	0 %	258538890
13491	NC_013199	GCA	2	6	714121	714126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538890
13492	NC_013199	CTG	2	6	714136	714141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538890
13493	NC_013199	AAG	2	6	714184	714189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538890
13494	NC_013199	GA	3	6	714329	714334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13495	NC_013199	ACG	2	6	714335	714340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13496	NC_013199	A	6	6	714347	714352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13497	NC_013199	T	6	6	714355	714360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13498	NC_013199	AT	3	6	714363	714368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13499	NC_013199	AC	3	6	714382	714387	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13500	NC_013199	A	6	6	714429	714434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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