MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013199	TAA	2	6	25285	25290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538216
502	NC_013199	GATGC	2	10	25313	25322	20 %	20 %	40 %	20 %	258538216
503	NC_013199	CTG	2	6	25380	25385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538216
504	NC_013199	TCA	2	6	25395	25400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538216
505	NC_013199	TTAA	3	12	25434	25445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_013199	GTT	2	6	25500	25505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013199	A	6	6	25579	25584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_013199	CAT	2	6	25706	25711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538217
509	NC_013199	GAATA	2	10	25784	25793	60 %	20 %	20 %	0 %	258538217
510	NC_013199	TGG	2	6	25912	25917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538217
511	NC_013199	TGT	2	6	25948	25953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538217
512	NC_013199	GAC	2	6	25967	25972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538217
513	NC_013199	TGT	2	6	26035	26040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538217
514	NC_013199	GGT	3	9	26057	26065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538217
515	NC_013199	ATG	2	6	26087	26092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538217
516	NC_013199	CAG	2	6	26096	26101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538217
517	NC_013199	CTG	3	9	26123	26131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538217
518	NC_013199	ACGA	2	8	26147	26154	50 %	0 %	25 %	25 %	258538217
519	NC_013199	GTT	2	6	26188	26193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538217
520	NC_013199	AG	3	6	26207	26212	50 %	0 %	50 %	0 %	258538217
521	NC_013199	CAG	2	6	26275	26280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538217
522	NC_013199	TCG	2	6	26281	26286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538217
523	NC_013199	TGC	2	6	26470	26475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538217
524	NC_013199	T	6	6	26527	26532	0 %	100 %	0 %	0 %	258538217
525	NC_013199	CCG	2	6	26676	26681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538217
526	NC_013199	TGAA	2	8	26752	26759	50 %	25 %	25 %	0 %	258538217
527	NC_013199	GCG	2	6	26835	26840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538217
528	NC_013199	CAC	2	6	26864	26869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538217
529	NC_013199	GAT	2	6	26870	26875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538217
530	NC_013199	AGC	2	6	26907	26912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538217
531	NC_013199	GAT	2	6	27023	27028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538217
532	NC_013199	ACC	2	6	27029	27034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538217
533	NC_013199	GCA	2	6	27051	27056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538217
534	NC_013199	CTT	2	6	27130	27135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538217
535	NC_013199	GGT	2	6	27152	27157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538217
536	NC_013199	GAA	3	9	27182	27190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538217
537	NC_013199	GGC	2	6	27212	27217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538217
538	NC_013199	ATC	2	6	27260	27265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538217
539	NC_013199	TGG	2	6	27297	27302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538217
540	NC_013199	GGCA	2	8	27383	27390	25 %	0 %	50 %	25 %	258538217
541	NC_013199	TGG	2	6	27412	27417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538217
542	NC_013199	CGC	2	6	27428	27433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538217
543	NC_013199	CAGG	2	8	27598	27605	25 %	0 %	50 %	25 %	258538217
544	NC_013199	GCT	2	6	27743	27748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538217
545	NC_013199	TCA	2	6	27816	27821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538217
546	NC_013199	GGC	2	6	27835	27840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538217
547	NC_013199	GATT	2	8	27859	27866	25 %	50 %	25 %	0 %	258538217
548	NC_013199	T	6	6	27874	27879	0 %	100 %	0 %	0 %	258538217
549	NC_013199	ACA	2	6	27897	27902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538217
550	NC_013199	TGAC	2	8	27961	27968	25 %	25 %	25 %	25 %	258538217
551	NC_013199	AGT	2	6	28001	28006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538217
552	NC_013199	ATA	2	6	28116	28121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538217
553	NC_013199	ATG	2	6	28122	28127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538217
554	NC_013199	TCG	2	6	28242	28247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538218
555	NC_013199	TGC	2	6	28252	28257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538218
556	NC_013199	CAT	2	6	28267	28272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538218
557	NC_013199	CAA	2	6	28279	28284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538218
558	NC_013199	TGA	2	6	28321	28326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538218
559	NC_013199	TCA	2	6	28416	28421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538218
560	NC_013199	TTC	2	6	28440	28445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538218
561	NC_013199	TGC	2	6	28473	28478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538218
562	NC_013199	GTG	2	6	28545	28550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538218
563	NC_013199	AGCC	2	8	28576	28583	25 %	0 %	25 %	50 %	258538218
564	NC_013199	GTC	2	6	28602	28607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538218
565	NC_013199	AAAAC	2	10	28635	28644	80 %	0 %	0 %	20 %	258538218
566	NC_013199	ATCC	2	8	28736	28743	25 %	25 %	0 %	50 %	258538218
567	NC_013199	TGA	2	6	28846	28851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538218
568	NC_013199	AT	3	6	28896	28901	50 %	50 %	0 %	0 %	258538218
569	NC_013199	CCT	2	6	28912	28917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_013199	GTT	2	6	28966	28971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013199	TAA	2	6	28976	28981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013199	TGT	2	6	29030	29035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013199	ATG	2	6	29076	29081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538219
574	NC_013199	AAT	2	6	29094	29099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538219
575	NC_013199	CGG	2	6	29100	29105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538219
576	NC_013199	GCG	2	6	29133	29138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538219
577	NC_013199	TTG	2	6	29139	29144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538219
578	NC_013199	ATT	2	6	29252	29257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538219
579	NC_013199	TTA	2	6	29277	29282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538219
580	NC_013199	ATGAC	2	10	29317	29326	40 %	20 %	20 %	20 %	258538219
581	NC_013199	TCA	2	6	29353	29358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538219
582	NC_013199	CA	3	6	29357	29362	50 %	0 %	0 %	50 %	258538219
583	NC_013199	AGC	2	6	29372	29377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538219
584	NC_013199	ATT	2	6	29382	29387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538219
585	NC_013199	GTCC	2	8	29424	29431	0 %	25 %	25 %	50 %	258538219
586	NC_013199	CAGACG	2	12	29436	29447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538219
587	NC_013199	TTA	2	6	29498	29503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538219
588	NC_013199	GCC	2	6	29637	29642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_013199	GAAA	2	8	29669	29676	75 %	0 %	25 %	0 %	258538220
590	NC_013199	TTG	2	6	29718	29723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538220
591	NC_013199	GCC	2	6	29741	29746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538220
592	NC_013199	TCAA	2	8	29773	29780	50 %	25 %	0 %	25 %	258538220
593	NC_013199	ATC	2	6	29907	29912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538220
594	NC_013199	ATC	2	6	30061	30066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538220
595	NC_013199	A	7	7	30071	30077	100 %	0 %	0 %	0 %	258538220
596	NC_013199	CTGAT	2	10	30082	30091	20 %	40 %	20 %	20 %	258538220
597	NC_013199	GGC	2	6	30092	30097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538220
598	NC_013199	CCGG	2	8	30170	30177	0 %	0 %	50 %	50 %	258538220
599	NC_013199	GCG	2	6	30208	30213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538220
600	NC_013199	GCC	2	6	30274	30279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538220
601	NC_013199	ATG	2	6	30303	30308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538220
602	NC_013199	CAT	2	6	30365	30370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538220
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604	NC_013199	GTG	2	6	30512	30517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538221
605	NC_013199	T	6	6	30532	30537	0 %	100 %	0 %	0 %	258538221
606	NC_013199	TGC	2	6	30540	30545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538221
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608	NC_013199	TTA	2	6	30683	30688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538221
609	NC_013199	CAT	2	6	30749	30754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538221
610	NC_013199	ATG	2	6	30867	30872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013199	CGC	2	6	30917	30922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_013199	GCG	2	6	30943	30948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_013199	TTGC	2	8	30952	30959	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
614	NC_013199	GCC	2	6	31015	31020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538222
615	NC_013199	TGC	2	6	31035	31040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538222
616	NC_013199	AAT	2	6	31041	31046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538222
617	NC_013199	TAA	2	6	31053	31058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538222
618	NC_013199	GCG	2	6	31071	31076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538222
619	NC_013199	GAT	2	6	31080	31085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538222
620	NC_013199	GCC	2	6	31098	31103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538222
621	NC_013199	GTG	2	6	31153	31158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538222
622	NC_013199	TTC	2	6	31207	31212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538222
623	NC_013199	GCA	2	6	31279	31284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538222
624	NC_013199	CTT	2	6	31340	31345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538222
625	NC_013199	CGC	2	6	31428	31433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538222
626	NC_013199	GAT	2	6	31434	31439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538222
627	NC_013199	CAAT	2	8	31478	31485	50 %	25 %	0 %	25 %	258538222
628	NC_013199	AGA	2	6	31486	31491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538222
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632	NC_013199	AACC	2	8	31586	31593	50 %	0 %	0 %	50 %	258538222
633	NC_013199	TGG	2	6	31638	31643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538222
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653	NC_013199	AT	3	6	32548	32553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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750	NC_013199	AAGGA	2	10	37663	37672	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
751	NC_013199	TA	3	6	37691	37696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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766	NC_013199	T	6	6	38207	38212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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776	NC_013199	GAA	2	6	38763	38768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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