MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53501	NC_013199	CCT	2	6	2869106	2869111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53502	NC_013199	AAT	2	6	2869116	2869121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258541015
53503	NC_013199	AAT	2	6	2869126	2869131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258541015
53504	NC_013199	CAC	2	6	2869152	2869157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258541015
53505	NC_013199	GCC	3	9	2869180	2869188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258541015
53506	NC_013199	CAT	2	6	2869318	2869323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258541015
53507	NC_013199	TAA	2	6	2869326	2869331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258541015
53508	NC_013199	CAA	2	6	2869350	2869355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258541015
53509	NC_013199	TGCA	2	8	2869478	2869485	25 %	25 %	25 %	25 %	258541015
53510	NC_013199	CTT	2	6	2869527	2869532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258541015
53511	NC_013199	CAG	2	6	2869533	2869538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258541015
53512	NC_013199	GTAC	2	8	2869574	2869581	25 %	25 %	25 %	25 %	258541015
53513	NC_013199	GGT	2	6	2869585	2869590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258541015
53514	NC_013199	CAA	2	6	2869594	2869599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258541015
53515	NC_013199	CGCAAT	2	12	2869621	2869632	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258541015
53516	NC_013199	AAT	2	6	2869675	2869680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258541015
53517	NC_013199	GCA	2	6	2869703	2869708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258541015
53518	NC_013199	TCT	2	6	2869930	2869935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53519	NC_013199	TCC	2	6	2869936	2869941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53520	NC_013199	TTC	2	6	2869983	2869988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258541016
53521	NC_013199	GAT	2	6	2870011	2870016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258541016
53522	NC_013199	CAT	2	6	2870050	2870055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258541016
53523	NC_013199	CAGC	2	8	2870056	2870063	25 %	0 %	25 %	50 %	258541016
53524	NC_013199	C	8	8	2870170	2870177	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53525	NC_013199	ATA	2	6	2870214	2870219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258541017
53526	NC_013199	GC	3	6	2870225	2870230	0 %	0 %	50 %	50 %	258541017
53527	NC_013199	GCC	2	6	2870233	2870238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258541017
53528	NC_013199	ATC	2	6	2870248	2870253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258541017
53529	NC_013199	ATC	2	6	2870267	2870272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258541017
53530	NC_013199	GCT	2	6	2870312	2870317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258541017
53531	NC_013199	TTC	2	6	2870330	2870335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258541017
53532	NC_013199	AAC	2	6	2870365	2870370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258541017
53533	NC_013199	GCA	2	6	2870424	2870429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258541017
53534	NC_013199	GCA	2	6	2870498	2870503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258541017
53535	NC_013199	AGC	2	6	2870509	2870514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258541017
53536	NC_013199	TTC	2	6	2870519	2870524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258541017
53537	NC_013199	CTTGAT	2	12	2870545	2870556	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	258541017
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53539	NC_013199	CTC	2	6	2870686	2870691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258541017
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53541	NC_013199	CCT	2	6	2870939	2870944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53542	NC_013199	ATA	2	6	2870968	2870973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53543	NC_013199	A	6	6	2870997	2871002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53544	NC_013199	A	6	6	2871075	2871080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53545	NC_013199	A	6	6	2871108	2871113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53546	NC_013199	T	7	7	2871116	2871122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53547	NC_013199	ATCGG	2	10	2871203	2871212	20 %	20 %	40 %	20 %	258541018
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53550	NC_013199	CGA	2	6	2871351	2871356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258541018
53551	NC_013199	GTC	2	6	2871374	2871379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258541018
53552	NC_013199	CAT	2	6	2871406	2871411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258541018
53553	NC_013199	GATT	2	8	2871429	2871436	25 %	50 %	25 %	0 %	258541018
53554	NC_013199	ATC	2	6	2871470	2871475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258541018
53555	NC_013199	AGA	2	6	2871494	2871499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258541018
53556	NC_013199	AAG	2	6	2871500	2871505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258541018
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53559	NC_013199	CAT	2	6	2871664	2871669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258541018
53560	NC_013199	GTT	2	6	2871672	2871677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258541018
53561	NC_013199	TGAC	2	8	2871687	2871694	25 %	25 %	25 %	25 %	258541018
53562	NC_013199	GT	3	6	2871720	2871725	0 %	50 %	50 %	0 %	258541018
53563	NC_013199	CAA	2	6	2871754	2871759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258541018
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53566	NC_013199	A	6	6	2871893	2871898	100 %	0 %	0 %	0 %	258541018
53567	NC_013199	CAG	2	6	2871940	2871945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258541018
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53570	NC_013199	ATC	2	6	2872157	2872162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258541018
53571	NC_013199	CG	3	6	2872199	2872204	0 %	0 %	50 %	50 %	258541018
53572	NC_013199	TCG	2	6	2872269	2872274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258541018
53573	NC_013199	GGC	2	6	2872291	2872296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258541018
53574	NC_013199	GCG	2	6	2872331	2872336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258541018
53575	NC_013199	AAT	2	6	2872339	2872344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258541018
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53577	NC_013199	TGA	2	6	2872465	2872470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53578	NC_013199	TTGT	2	8	2872473	2872480	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53579	NC_013199	GGC	2	6	2872493	2872498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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53584	NC_013199	ACA	2	6	2872787	2872792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258541019
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53589	NC_013199	CG	3	6	2873203	2873208	0 %	0 %	50 %	50 %	258541019
53590	NC_013199	TCAA	2	8	2873210	2873217	50 %	25 %	0 %	25 %	258541019
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53593	NC_013199	TTAT	2	8	2873484	2873491	25 %	75 %	0 %	0 %	258541019
53594	NC_013199	TCA	2	6	2873502	2873507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258541019
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53601	NC_013199	A	6	6	2874016	2874021	100 %	0 %	0 %	0 %	258541020
53602	NC_013199	ATGC	2	8	2874083	2874090	25 %	25 %	25 %	25 %	258541020
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53609	NC_013199	TTA	2	6	2874370	2874375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258541020
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53612	NC_013199	A	7	7	2874629	2874635	100 %	0 %	0 %	0 %	258541021
53613	NC_013199	TAA	2	6	2874644	2874649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258541021
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