MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_013199	TCA	2	6	2842881	2842886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53002	NC_013199	TTC	2	6	2842892	2842897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540988
53003	NC_013199	TTG	2	6	2842905	2842910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540988
53004	NC_013199	TGC	2	6	2842937	2842942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540988
53005	NC_013199	GT	3	6	2843003	2843008	0 %	50 %	50 %	0 %	258540988
53006	NC_013199	TGA	2	6	2843049	2843054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540988
53007	NC_013199	CAT	2	6	2843055	2843060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540988
53008	NC_013199	GCC	2	6	2843075	2843080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540988
53009	NC_013199	GCC	2	6	2843104	2843109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540988
53010	NC_013199	AAC	2	6	2843215	2843220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540988
53011	NC_013199	TTGA	2	8	2843239	2843246	25 %	50 %	25 %	0 %	258540988
53012	NC_013199	TCA	2	6	2843261	2843266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540988
53013	NC_013199	CTG	2	6	2843312	2843317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540988
53014	NC_013199	AATT	2	8	2843343	2843350	50 %	50 %	0 %	0 %	258540988
53015	NC_013199	ACCTG	2	10	2843357	2843366	20 %	20 %	20 %	40 %	258540988
53016	NC_013199	GGT	2	6	2843440	2843445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540988
53017	NC_013199	GCG	2	6	2843532	2843537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540988
53018	NC_013199	CAC	2	6	2843722	2843727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540988
53019	NC_013199	TCTT	2	8	2843759	2843766	0 %	75 %	0 %	25 %	258540988
53020	NC_013199	ATAA	2	8	2843770	2843777	75 %	25 %	0 %	0 %	258540988
53021	NC_013199	TGA	2	6	2843809	2843814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540988
53022	NC_013199	ACT	2	6	2843815	2843820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540988
53023	NC_013199	ACT	2	6	2843827	2843832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540988
53024	NC_013199	AAC	2	6	2843920	2843925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540988
53025	NC_013199	GAC	2	6	2843929	2843934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540988
53026	NC_013199	TTGA	2	8	2843977	2843984	25 %	50 %	25 %	0 %	258540988
53027	NC_013199	ACC	3	9	2844076	2844084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540988
53028	NC_013199	CCA	2	6	2844092	2844097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540988
53029	NC_013199	CAA	2	6	2844117	2844122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540988
53030	NC_013199	TTC	3	9	2844143	2844151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540988
53031	NC_013199	CCG	2	6	2844159	2844164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540988
53032	NC_013199	TCC	2	6	2844230	2844235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53033	NC_013199	ATT	2	6	2844269	2844274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53034	NC_013199	AAC	2	6	2844302	2844307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53035	NC_013199	T	6	6	2844315	2844320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53036	NC_013199	TGA	2	6	2844373	2844378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53037	NC_013199	TCC	2	6	2844570	2844575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53038	NC_013199	A	7	7	2844585	2844591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53039	NC_013199	GTC	2	6	2844619	2844624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53040	NC_013199	CA	3	6	2844663	2844668	50 %	0 %	0 %	50 %	258540989
53041	NC_013199	ACAA	2	8	2844669	2844676	75 %	0 %	0 %	25 %	258540989
53042	NC_013199	CAA	2	6	2844746	2844751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540989
53043	NC_013199	TTG	2	6	2844783	2844788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540989
53044	NC_013199	CATC	2	8	2844841	2844848	25 %	25 %	0 %	50 %	258540989
53045	NC_013199	GCATCG	2	12	2844972	2844983	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258540989
53046	NC_013199	ATG	2	6	2845052	2845057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540989
53047	NC_013199	GCA	2	6	2845080	2845085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540989
53048	NC_013199	AAC	2	6	2845149	2845154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540989
53049	NC_013199	TCA	2	6	2845336	2845341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540989
53050	NC_013199	GCT	3	9	2845424	2845432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540989
53051	NC_013199	TG	3	6	2845707	2845712	0 %	50 %	50 %	0 %	258540990
53052	NC_013199	ATT	2	6	2845727	2845732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540990
53053	NC_013199	TCA	2	6	2845780	2845785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540990
53054	NC_013199	TAAC	2	8	2845836	2845843	50 %	25 %	0 %	25 %	258540990
53055	NC_013199	AG	3	6	2845940	2845945	50 %	0 %	50 %	0 %	258540990
53056	NC_013199	CATACT	2	12	2845954	2845965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540990
53057	NC_013199	TTC	2	6	2846022	2846027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540990
53058	NC_013199	CTG	2	6	2846093	2846098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540990
53059	NC_013199	GT	3	6	2846112	2846117	0 %	50 %	50 %	0 %	258540990
53060	NC_013199	CG	3	6	2846203	2846208	0 %	0 %	50 %	50 %	258540990
53061	NC_013199	CTG	2	6	2846261	2846266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540990
53062	NC_013199	CCTC	2	8	2846358	2846365	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53063	NC_013199	AGCA	2	8	2846366	2846373	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53064	NC_013199	TTA	2	6	2846376	2846381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53065	NC_013199	AGTT	2	8	2846389	2846396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53066	NC_013199	TCGC	2	8	2846425	2846432	0 %	25 %	25 %	50 %	258540991
53067	NC_013199	ACT	2	6	2846433	2846438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540991
53068	NC_013199	ATC	2	6	2846439	2846444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540991
53069	NC_013199	CTA	2	6	2846494	2846499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540991
53070	NC_013199	CAGC	2	8	2846505	2846512	25 %	0 %	25 %	50 %	258540991
53071	NC_013199	ATA	2	6	2846547	2846552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540991
53072	NC_013199	TGC	2	6	2846585	2846590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540991
53073	NC_013199	CAC	2	6	2846664	2846669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540991
53074	NC_013199	CAC	2	6	2846843	2846848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540991
53075	NC_013199	CAT	2	6	2846855	2846860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540991
53076	NC_013199	TCG	2	6	2847012	2847017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540991
53077	NC_013199	ATA	2	6	2847105	2847110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540991
53078	NC_013199	TTG	2	6	2847120	2847125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540991
53079	NC_013199	GGC	2	6	2847145	2847150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540991
53080	NC_013199	TTC	2	6	2847201	2847206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540991
53081	NC_013199	GTC	2	6	2847232	2847237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540991
53082	NC_013199	TTA	2	6	2847308	2847313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540991
53083	NC_013199	T	6	6	2847321	2847326	0 %	100 %	0 %	0 %	258540991
53084	NC_013199	TTTGA	2	10	2847378	2847387	20 %	60 %	20 %	0 %	258540991
53085	NC_013199	CTTG	2	8	2847389	2847396	0 %	50 %	25 %	25 %	258540991
53086	NC_013199	A	6	6	2847399	2847404	100 %	0 %	0 %	0 %	258540991
53087	NC_013199	GATA	2	8	2847440	2847447	50 %	25 %	25 %	0 %	258540991
53088	NC_013199	TTG	2	6	2847546	2847551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540991
53089	NC_013199	ATTGGC	2	12	2847567	2847578	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258540991
53090	NC_013199	AGC	2	6	2847586	2847591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540991
53091	NC_013199	TAA	2	6	2847613	2847618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540991
53092	NC_013199	T	7	7	2847650	2847656	0 %	100 %	0 %	0 %	258540991
53093	NC_013199	GTT	2	6	2847676	2847681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540991
53094	NC_013199	ACT	2	6	2847795	2847800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540991
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53096	NC_013199	TGC	2	6	2847864	2847869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540992
53097	NC_013199	CTT	2	6	2847876	2847881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540992
53098	NC_013199	CTT	2	6	2847921	2847926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540992
53099	NC_013199	GC	3	6	2848084	2848089	0 %	0 %	50 %	50 %	258540992
53100	NC_013199	CGC	2	6	2848098	2848103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540992
53101	NC_013199	ATG	2	6	2848133	2848138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540992
53102	NC_013199	CTT	2	6	2848222	2848227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540992
53103	NC_013199	GT	3	6	2848274	2848279	0 %	50 %	50 %	0 %	258540992
53104	NC_013199	CAT	2	6	2848297	2848302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540992
53105	NC_013199	GAA	2	6	2848327	2848332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540992
53106	NC_013199	ATC	2	6	2848418	2848423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540992
53107	NC_013199	TGC	2	6	2848589	2848594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540992
53108	NC_013199	GCT	2	6	2848692	2848697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540992
53109	NC_013199	CAA	3	9	2848708	2848716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540992
53110	NC_013199	AAGT	2	8	2848732	2848739	50 %	25 %	25 %	0 %	258540992
53111	NC_013199	TAA	2	6	2848839	2848844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540992
53112	NC_013199	TGA	2	6	2848845	2848850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540992
53113	NC_013199	CGA	2	6	2848859	2848864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540992
53114	NC_013199	CTT	2	6	2848935	2848940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540992
53115	NC_013199	CTT	2	6	2848944	2848949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540992
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53117	NC_013199	ATT	2	6	2848966	2848971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540992
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53234	NC_013199	CAC	2	6	2855220	2855225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540997
53235	NC_013199	ACA	2	6	2855249	2855254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540997
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53245	NC_013199	CAA	2	6	2855805	2855810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53302	NC_013199	CTT	2	6	2858807	2858812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53319	NC_013199	A	7	7	2859792	2859798	100 %	0 %	0 %	0 %	258541002
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53333	NC_013199	AGCA	2	8	2860520	2860527	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53334	NC_013199	GAC	2	6	2860532	2860537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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53336	NC_013199	TTGA	2	8	2860575	2860582	25 %	50 %	25 %	0 %	258541004
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53340	NC_013199	TCCAT	2	10	2861023	2861032	20 %	40 %	0 %	40 %	258541004
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53342	NC_013199	TGTT	2	8	2861142	2861149	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53343	NC_013199	AAC	2	6	2861150	2861155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53345	NC_013199	AAT	2	6	2861178	2861183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53346	NC_013199	TGC	2	6	2861309	2861314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53347	NC_013199	GGT	2	6	2861316	2861321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53348	NC_013199	GCTC	2	8	2861322	2861329	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53349	NC_013199	TGG	2	6	2861565	2861570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258541005
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53468	NC_013199	GTT	2	6	2867353	2867358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258541012
53469	NC_013199	CAG	2	6	2867399	2867404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53470	NC_013199	A	6	6	2867424	2867429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53471	NC_013199	A	6	6	2867445	2867450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53472	NC_013199	T	6	6	2867467	2867472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53480	NC_013199	TGCT	2	8	2867894	2867901	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53481	NC_013199	CTTG	2	8	2867909	2867916	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53482	NC_013199	GA	3	6	2867935	2867940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53483	NC_013199	TCGCAG	3	18	2867994	2868011	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53484	NC_013199	TGG	2	6	2868173	2868178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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53495	NC_013199	TGGG	2	8	2868890	2868897	0 %	25 %	75 %	0 %	258541014
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53499	NC_013199	CCA	2	6	2869046	2869051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258541014
53500	NC_013199	CTT	2	6	2869084	2869089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258541014

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