MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52501	NC_013199	CAT	2	6	2815886	2815891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540965
52502	NC_013199	TTC	2	6	2815911	2815916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540965
52503	NC_013199	CCG	2	6	2815928	2815933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540965
52504	NC_013199	T	6	6	2816039	2816044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52505	NC_013199	TCTAA	2	10	2816230	2816239	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52506	NC_013199	GTAA	2	8	2816268	2816275	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52507	NC_013199	AAT	2	6	2816353	2816358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540966
52508	NC_013199	ATG	2	6	2816379	2816384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540966
52509	NC_013199	CAG	2	6	2816438	2816443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540966
52510	NC_013199	T	6	6	2816525	2816530	0 %	100 %	0 %	0 %	258540966
52511	NC_013199	TCC	2	6	2816535	2816540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258540966
52512	NC_013199	GTTC	2	8	2816547	2816554	0 %	50 %	25 %	25 %	258540966
52513	NC_013199	T	6	6	2816613	2816618	0 %	100 %	0 %	0 %	258540966
52514	NC_013199	CAC	2	6	2816709	2816714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540966
52515	NC_013199	TGC	2	6	2817045	2817050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540966
52516	NC_013199	TCA	2	6	2817053	2817058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540966
52517	NC_013199	TAA	2	6	2817092	2817097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540966
52518	NC_013199	ACT	2	6	2817102	2817107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540966
52519	NC_013199	TACCAA	2	12	2817167	2817178	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	258540966
52520	NC_013199	GTC	2	6	2817251	2817256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540966
52521	NC_013199	T	6	6	2817402	2817407	0 %	100 %	0 %	0 %	258540966
52522	NC_013199	GACT	2	8	2817528	2817535	25 %	25 %	25 %	25 %	258540966
52523	NC_013199	A	6	6	2817595	2817600	100 %	0 %	0 %	0 %	258540966
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52526	NC_013199	ACC	2	6	2817775	2817780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540966
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52529	NC_013199	ATA	2	6	2817910	2817915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540966
52530	NC_013199	ATC	2	6	2817940	2817945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52531	NC_013199	GTC	2	6	2817996	2818001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52532	NC_013199	A	6	6	2818002	2818007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52533	NC_013199	TATC	2	8	2818035	2818042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52534	NC_013199	CAA	2	6	2818109	2818114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52535	NC_013199	CAG	2	6	2818138	2818143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52536	NC_013199	AGT	2	6	2818213	2818218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52537	NC_013199	TTG	2	6	2818224	2818229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52538	NC_013199	TGT	2	6	2818240	2818245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52539	NC_013199	CA	3	6	2818251	2818256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52540	NC_013199	AATT	2	8	2818292	2818299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52541	NC_013199	TCT	2	6	2818307	2818312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52542	NC_013199	TGATT	2	10	2818351	2818360	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52543	NC_013199	AATT	2	8	2818385	2818392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52544	NC_013199	AACTT	2	10	2818398	2818407	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52545	NC_013199	AAAG	2	8	2818473	2818480	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52546	NC_013199	A	7	7	2818558	2818564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52547	NC_013199	CGA	2	6	2818632	2818637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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52554	NC_013199	GAT	2	6	2819326	2819331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540968
52555	NC_013199	AAC	2	6	2819369	2819374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540968
52556	NC_013199	TAAA	2	8	2819380	2819387	75 %	25 %	0 %	0 %	258540968
52557	NC_013199	CAT	2	6	2819408	2819413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540968
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52559	NC_013199	GTT	2	6	2819445	2819450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52560	NC_013199	CTT	3	9	2819571	2819579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52561	NC_013199	ATC	2	6	2819590	2819595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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52564	NC_013199	ACATC	2	10	2819895	2819904	40 %	20 %	0 %	40 %	258540969
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52569	NC_013199	CG	3	6	2820304	2820309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52570	NC_013199	GGTA	2	8	2820328	2820335	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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52604	NC_013199	ATA	2	6	2822250	2822255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52605	NC_013199	CA	3	6	2822265	2822270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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52974	NC_013199	CCTT	2	8	2841460	2841467	0 %	50 %	0 %	50 %	258540986
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