MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 55378

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_013199	GGC	2	6	2678760	2678765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540835
50003	NC_013199	TTC	2	6	2678766	2678771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540835
50004	NC_013199	GCA	2	6	2678981	2678986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540835
50005	NC_013199	TAG	2	6	2678992	2678997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540835
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50007	NC_013199	AGT	2	6	2679085	2679090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50010	NC_013199	GAT	2	6	2679171	2679176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50017	NC_013199	ATC	2	6	2679798	2679803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50018	NC_013199	GCAA	2	8	2679826	2679833	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50019	NC_013199	TAA	2	6	2680029	2680034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50051	NC_013199	T	6	6	2681853	2681858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50103	NC_013199	T	6	6	2684170	2684175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50120	NC_013199	GCT	2	6	2685132	2685137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540843
50121	NC_013199	GAA	2	6	2685152	2685157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540843
50122	NC_013199	CAA	2	6	2685173	2685178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540843
50123	NC_013199	CGC	2	6	2685197	2685202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540843
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50150	NC_013199	CAA	2	6	2686664	2686669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540844
50151	NC_013199	GTT	2	6	2686741	2686746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540844
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50153	NC_013199	GCC	3	9	2686925	2686933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540844
50154	NC_013199	CGC	2	6	2686962	2686967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540844
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50156	NC_013199	AGG	2	6	2687242	2687247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50157	NC_013199	CAA	2	6	2687310	2687315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540845
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50209	NC_013199	TAT	2	6	2689915	2689920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50211	NC_013199	ATA	2	6	2689953	2689958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50212	NC_013199	CAGCAT	2	12	2689975	2689986	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50213	NC_013199	CCT	2	6	2690015	2690020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50214	NC_013199	ATC	2	6	2690036	2690041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50215	NC_013199	ACC	2	6	2690053	2690058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50216	NC_013199	TCTTG	2	10	2690095	2690104	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50217	NC_013199	ATG	2	6	2690108	2690113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50218	NC_013199	T	6	6	2690159	2690164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50219	NC_013199	TGAAC	2	10	2690168	2690177	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50220	NC_013199	CTAT	2	8	2690269	2690276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50221	NC_013199	GA	3	6	2690300	2690305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50222	NC_013199	AT	3	6	2690312	2690317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50223	NC_013199	TCAT	2	8	2690351	2690358	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50224	NC_013199	AT	3	6	2690379	2690384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50225	NC_013199	A	6	6	2690427	2690432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50226	NC_013199	GCA	2	6	2690626	2690631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540847
50227	NC_013199	ATG	2	6	2690741	2690746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540847
50228	NC_013199	AAC	2	6	2690750	2690755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540847
50229	NC_013199	CA	3	6	2690840	2690845	50 %	0 %	0 %	50 %	258540847
50230	NC_013199	GAA	2	6	2690900	2690905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540847
50231	NC_013199	CAG	2	6	2690907	2690912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540847
50232	NC_013199	GCA	2	6	2690975	2690980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540847
50233	NC_013199	CCAA	2	8	2690981	2690988	50 %	0 %	0 %	50 %	258540847
50234	NC_013199	GCG	2	6	2691021	2691026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540847
50235	NC_013199	GGT	2	6	2691125	2691130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540847
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50353	NC_013199	CAT	2	6	2698302	2698307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540854
50354	NC_013199	ATA	2	6	2698318	2698323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540854
50355	NC_013199	TGC	2	6	2698352	2698357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540854
50356	NC_013199	CCA	2	6	2698402	2698407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540854
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50470	NC_013199	GATTC	2	10	2704308	2704317	20 %	40 %	20 %	20 %	258540862
50471	NC_013199	TGA	2	6	2704378	2704383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540862
50472	NC_013199	TTA	2	6	2704467	2704472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540862
50473	NC_013199	TGA	2	6	2704568	2704573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540862
50474	NC_013199	GAA	2	6	2704607	2704612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540862
50475	NC_013199	CTT	2	6	2704639	2704644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540862
50476	NC_013199	TCT	2	6	2704674	2704679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540862
50477	NC_013199	CTT	2	6	2704703	2704708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540862
50478	NC_013199	GC	3	6	2704805	2704810	0 %	0 %	50 %	50 %	258540862
50479	NC_013199	GCC	2	6	2704841	2704846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540862
50480	NC_013199	CTT	2	6	2705002	2705007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540862
50481	NC_013199	TTTA	2	8	2705035	2705042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50482	NC_013199	ATC	2	6	2705045	2705050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50483	NC_013199	ATC	2	6	2705111	2705116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540863
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50497	NC_013199	TTC	2	6	2705999	2706004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540864
50498	NC_013199	CATT	2	8	2706032	2706039	25 %	50 %	0 %	25 %	258540864
50499	NC_013199	AGC	2	6	2706098	2706103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540864
50500	NC_013199	AAG	2	6	2706122	2706127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540864

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