MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 56093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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49002	NC_013198	GCT	2	6	2622661	2622666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509552
49003	NC_013198	TG	3	6	2622682	2622687	0 %	50 %	50 %	0 %	258509552
49004	NC_013198	TGT	3	9	2622744	2622752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509552
49005	NC_013198	TGC	2	6	2622760	2622765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509552
49006	NC_013198	GCC	2	6	2622774	2622779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509552
49007	NC_013198	TCT	2	6	2622816	2622821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509552
49008	NC_013198	TTA	2	6	2622845	2622850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509552
49009	NC_013198	CTT	2	6	2622862	2622867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509552
49010	NC_013198	ACT	2	6	2622940	2622945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509552
49011	NC_013198	A	7	7	2623018	2623024	100 %	0 %	0 %	0 %	258509552
49012	NC_013198	GCC	2	6	2623026	2623031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509552
49013	NC_013198	ATT	2	6	2623043	2623048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509552
49014	NC_013198	T	6	6	2623047	2623052	0 %	100 %	0 %	0 %	258509552
49015	NC_013198	ACC	2	6	2623163	2623168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509552
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49018	NC_013198	CAA	2	6	2623246	2623251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509552
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49020	NC_013198	TGC	2	6	2623297	2623302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509552
49021	NC_013198	CGG	2	6	2623312	2623317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509552
49022	NC_013198	TGG	2	6	2623371	2623376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509552
49023	NC_013198	ACTA	2	8	2623502	2623509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49024	NC_013198	TCA	2	6	2623550	2623555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509553
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49030	NC_013198	TTA	2	6	2623873	2623878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509553
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49033	NC_013198	GCA	2	6	2623952	2623957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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49037	NC_013198	T	6	6	2624050	2624055	0 %	100 %	0 %	0 %	258509554
49038	NC_013198	TGCT	2	8	2624087	2624094	0 %	50 %	25 %	25 %	258509554
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49043	NC_013198	TTGA	2	8	2624295	2624302	25 %	50 %	25 %	0 %	258509554
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49046	NC_013198	CA	3	6	2624506	2624511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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49105	NC_013198	ACA	2	6	2627526	2627531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49106	NC_013198	AG	3	6	2627661	2627666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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49108	NC_013198	CAAAA	2	10	2627945	2627954	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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49231	NC_013198	GCA	2	6	2635059	2635064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509566
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49234	NC_013198	T	6	6	2635191	2635196	0 %	100 %	0 %	0 %	258509566
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49237	NC_013198	CAGC	2	8	2635375	2635382	25 %	0 %	25 %	50 %	258509567
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49276	NC_013198	TAT	2	6	2637289	2637294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49354	NC_013198	AGC	2	6	2641794	2641799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509575
49355	NC_013198	TCT	2	6	2641921	2641926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509575
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49364	NC_013198	CTG	2	6	2642655	2642660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509575
49365	NC_013198	ACCATT	2	12	2642676	2642687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509575
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49413	NC_013198	TAT	2	6	2645241	2645246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49469	NC_013198	AGC	2	6	2648670	2648675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509582
49470	NC_013198	CCA	2	6	2648728	2648733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509582
49471	NC_013198	ATC	2	6	2648762	2648767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509582
49472	NC_013198	GTCA	2	8	2648813	2648820	25 %	25 %	25 %	25 %	258509582
49473	NC_013198	ATC	2	6	2648936	2648941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509582
49474	NC_013198	TGC	2	6	2648972	2648977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509582
49475	NC_013198	ATCA	2	8	2649107	2649114	50 %	25 %	0 %	25 %	258509582
49476	NC_013198	ATA	2	6	2649152	2649157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509582
49477	NC_013198	TGAC	2	8	2649179	2649186	25 %	25 %	25 %	25 %	258509582
49478	NC_013198	CAA	2	6	2649229	2649234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509582
49479	NC_013198	CATA	2	8	2649310	2649317	50 %	25 %	0 %	25 %	258509582
49480	NC_013198	AAT	2	6	2649361	2649366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509582
49481	NC_013198	CGA	2	6	2649371	2649376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509582
49482	NC_013198	CCA	2	6	2649384	2649389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509582
49483	NC_013198	CAA	3	9	2649395	2649403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509582
49484	NC_013198	TAG	2	6	2649441	2649446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509582
49485	NC_013198	CTT	2	6	2649475	2649480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509582
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49487	NC_013198	TCT	2	6	2649886	2649891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49488	NC_013198	ACGTT	2	10	2649904	2649913	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49489	NC_013198	CGCA	3	12	2649929	2649940	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49490	NC_013198	TACT	2	8	2649949	2649956	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49491	NC_013198	TAC	2	6	2649964	2649969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49492	NC_013198	A	7	7	2650009	2650015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49493	NC_013198	TGC	3	9	2650102	2650110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509584
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49497	NC_013198	CCG	2	6	2650497	2650502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509584
49498	NC_013198	TGG	2	6	2650516	2650521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509584
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