MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 56093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_013198	TGT	2	6	2570076	2570081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48002	NC_013198	AT	3	6	2570204	2570209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48003	NC_013198	T	7	7	2570240	2570246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48004	NC_013198	TTG	2	6	2570253	2570258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48005	NC_013198	ACG	2	6	2570279	2570284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48006	NC_013198	CAA	2	6	2570317	2570322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48007	NC_013198	A	7	7	2570334	2570340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48008	NC_013198	T	6	6	2570353	2570358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48009	NC_013198	CAC	2	6	2570398	2570403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48010	NC_013198	GCC	2	6	2570435	2570440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48011	NC_013198	CGAT	2	8	2570535	2570542	25 %	25 %	25 %	25 %	258509503
48012	NC_013198	GGC	2	6	2570565	2570570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509503
48013	NC_013198	TCA	2	6	2570601	2570606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509503
48014	NC_013198	TGCC	2	8	2570626	2570633	0 %	25 %	25 %	50 %	258509503
48015	NC_013198	T	6	6	2570635	2570640	0 %	100 %	0 %	0 %	258509503
48016	NC_013198	GCT	2	6	2570643	2570648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509503
48017	NC_013198	ACGCTG	2	12	2570660	2570671	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258509503
48018	NC_013198	CAA	2	6	2570743	2570748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509503
48019	NC_013198	CAA	2	6	2570836	2570841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509503
48020	NC_013198	AAG	2	6	2570850	2570855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509503
48021	NC_013198	ATA	2	6	2570862	2570867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509503
48022	NC_013198	TCA	2	6	2570907	2570912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509503
48023	NC_013198	GGC	2	6	2571068	2571073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509503
48024	NC_013198	GCG	2	6	2571126	2571131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509503
48025	NC_013198	CCA	2	6	2571222	2571227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509503
48026	NC_013198	CAATG	2	10	2571254	2571263	40 %	20 %	20 %	20 %	258509503
48027	NC_013198	GT	3	6	2571296	2571301	0 %	50 %	50 %	0 %	258509503
48028	NC_013198	CAC	2	6	2571322	2571327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509503
48029	NC_013198	CGC	2	6	2571595	2571600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509503
48030	NC_013198	CTT	2	6	2571629	2571634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509503
48031	NC_013198	CTTTAC	2	12	2571724	2571735	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	258509503
48032	NC_013198	CAT	2	6	2571746	2571751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509503
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48034	NC_013198	GTC	2	6	2571800	2571805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509503
48035	NC_013198	TTC	2	6	2571815	2571820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509503
48036	NC_013198	TGC	2	6	2571830	2571835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509503
48037	NC_013198	GTGC	2	8	2571839	2571846	0 %	25 %	50 %	25 %	258509503
48038	NC_013198	CGC	2	6	2571906	2571911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509503
48039	NC_013198	TCC	2	6	2571969	2571974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48040	NC_013198	TGA	3	9	2571996	2572004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48041	NC_013198	TCAA	2	8	2572065	2572072	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48042	NC_013198	ATC	2	6	2572092	2572097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48043	NC_013198	GC	4	8	2572137	2572144	0 %	0 %	50 %	50 %	258509504
48044	NC_013198	TCA	2	6	2572164	2572169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509504
48045	NC_013198	GCT	2	6	2572212	2572217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509504
48046	NC_013198	CGAG	2	8	2572229	2572236	25 %	0 %	50 %	25 %	258509504
48047	NC_013198	ATA	2	6	2572250	2572255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509504
48048	NC_013198	GCT	2	6	2572257	2572262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509504
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48050	NC_013198	T	6	6	2572342	2572347	0 %	100 %	0 %	0 %	258509504
48051	NC_013198	CG	3	6	2572348	2572353	0 %	0 %	50 %	50 %	258509504
48052	NC_013198	TGC	2	6	2572427	2572432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509504
48053	NC_013198	CCA	2	6	2572438	2572443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509504
48054	NC_013198	TCA	2	6	2572464	2572469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509504
48055	NC_013198	GTT	2	6	2572534	2572539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509504
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48057	NC_013198	GCT	2	6	2572582	2572587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509504
48058	NC_013198	CATG	2	8	2572600	2572607	25 %	25 %	25 %	25 %	258509504
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48065	NC_013198	CAA	2	6	2573191	2573196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509505
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48092	NC_013198	TG	3	6	2575320	2575325	0 %	50 %	50 %	0 %	258509509
48093	NC_013198	TGC	2	6	2575330	2575335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509509
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48105	NC_013198	CTT	2	6	2575697	2575702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509509
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48117	NC_013198	GAT	2	6	2576087	2576092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509509
48118	NC_013198	GCT	2	6	2576100	2576105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509509
48119	NC_013198	T	6	6	2576105	2576110	0 %	100 %	0 %	0 %	258509509
48120	NC_013198	GAA	2	6	2576189	2576194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509509
48121	NC_013198	TACCAG	2	12	2576239	2576250	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258509509
48122	NC_013198	TCT	3	9	2576352	2576360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509509
48123	NC_013198	TCA	2	6	2576434	2576439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509509
48124	NC_013198	GCC	3	9	2576450	2576458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509509
48125	NC_013198	GCCT	2	8	2576462	2576469	0 %	25 %	25 %	50 %	258509509
48126	NC_013198	TCA	3	9	2576473	2576481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509509
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48128	NC_013198	TCA	2	6	2576494	2576499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509509
48129	NC_013198	TGA	2	6	2576500	2576505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509509
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48131	NC_013198	TCC	2	6	2576556	2576561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258509509
48132	NC_013198	TTG	2	6	2576580	2576585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509509
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48134	NC_013198	CAT	2	6	2576620	2576625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509509
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48141	NC_013198	TGT	2	6	2576834	2576839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509509
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48144	NC_013198	ATG	2	6	2576889	2576894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509509
48145	NC_013198	GTTTT	2	10	2576924	2576933	0 %	80 %	20 %	0 %	258509509
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48147	NC_013198	TAC	2	6	2576978	2576983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48148	NC_013198	CAA	2	6	2577140	2577145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509510
48149	NC_013198	TTTGC	2	10	2577190	2577199	0 %	60 %	20 %	20 %	258509510
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48155	NC_013198	TCA	2	6	2577545	2577550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509510
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48189	NC_013198	CTTT	2	8	2579049	2579056	0 %	75 %	0 %	25 %	258509512
48190	NC_013198	CAT	2	6	2579069	2579074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509512
48191	NC_013198	TGCG	2	8	2579131	2579138	0 %	25 %	50 %	25 %	258509512
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48202	NC_013198	CAA	2	6	2579652	2579657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48222	NC_013198	TTG	2	6	2580826	2580831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509515
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48230	NC_013198	GGC	2	6	2581141	2581146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509515
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48232	NC_013198	TGGC	2	8	2581232	2581239	0 %	25 %	50 %	25 %	258509515
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48234	NC_013198	CTG	3	9	2581433	2581441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509515
48235	NC_013198	GCC	2	6	2581462	2581467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509515
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48239	NC_013198	TCG	2	6	2581615	2581620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509515
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48242	NC_013198	A	6	6	2581760	2581765	100 %	0 %	0 %	0 %	258509515
48243	NC_013198	TTG	2	6	2582063	2582068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509515
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48245	NC_013198	TTA	2	6	2582152	2582157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509516
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48308	NC_013198	CTT	2	6	2585694	2585699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48309	NC_013198	TTC	2	6	2585705	2585710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48310	NC_013198	TCA	2	6	2585734	2585739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48311	NC_013198	TTAA	2	8	2585758	2585765	50 %	50 %	0 %	0 %	258509517
48312	NC_013198	TCA	2	6	2585772	2585777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509517
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48323	NC_013198	GAA	2	6	2586398	2586403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48324	NC_013198	TGC	2	6	2586466	2586471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48325	NC_013198	AGTA	2	8	2586495	2586502	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48326	NC_013198	CTGA	2	8	2586519	2586526	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48327	NC_013198	AGTC	2	8	2586686	2586693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48328	NC_013198	TGCA	2	8	2586746	2586753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48329	NC_013198	GAT	2	6	2586764	2586769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48330	NC_013198	CTATGC	2	12	2586844	2586855	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258509518
48331	NC_013198	TTG	2	6	2586891	2586896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509518
48332	NC_013198	AAG	2	6	2586965	2586970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509518
48333	NC_013198	CTG	2	6	2586978	2586983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509518
48334	NC_013198	GTT	2	6	2587013	2587018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509518
48335	NC_013198	CTG	2	6	2587023	2587028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509518
48336	NC_013198	CTC	2	6	2587032	2587037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258509518
48337	NC_013198	TTG	2	6	2587098	2587103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509518
48338	NC_013198	TCT	2	6	2587134	2587139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509518
48339	NC_013198	TGC	2	6	2587144	2587149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509518
48340	NC_013198	GTT	2	6	2587211	2587216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509518
48341	NC_013198	AT	3	6	2587300	2587305	50 %	50 %	0 %	0 %	258509518
48342	NC_013198	TGG	2	6	2587357	2587362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509518
48343	NC_013198	AGA	2	6	2587405	2587410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509518
48344	NC_013198	GCT	2	6	2587445	2587450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509518
48345	NC_013198	ATC	2	6	2587457	2587462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509518
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48347	NC_013198	GACC	2	8	2587657	2587664	25 %	0 %	25 %	50 %	258509518
48348	NC_013198	GAA	3	9	2587667	2587675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509518
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48350	NC_013198	CCA	2	6	2587867	2587872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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