MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 56093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_013198	AATA	2	8	2356877	2356884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44002	NC_013198	T	6	6	2356902	2356907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44003	NC_013198	GTG	2	6	2356953	2356958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44004	NC_013198	ATC	2	6	2356961	2356966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44005	NC_013198	GCAA	2	8	2356984	2356991	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44006	NC_013198	ATA	2	6	2357025	2357030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509279
44007	NC_013198	TGT	2	6	2357066	2357071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509279
44008	NC_013198	AAC	2	6	2357170	2357175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509279
44009	NC_013198	AAG	2	6	2357216	2357221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509279
44010	NC_013198	CGC	2	6	2357296	2357301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509279
44011	NC_013198	AAAC	2	8	2357304	2357311	75 %	0 %	0 %	25 %	258509279
44012	NC_013198	CGT	2	6	2357314	2357319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509279
44013	NC_013198	CAT	2	6	2357370	2357375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509279
44014	NC_013198	T	6	6	2357380	2357385	0 %	100 %	0 %	0 %	258509279
44015	NC_013198	GAT	2	6	2357550	2357555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509279
44016	NC_013198	TGC	2	6	2357687	2357692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509279
44017	NC_013198	CTT	2	6	2357731	2357736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509279
44018	NC_013198	CTTG	2	8	2357802	2357809	0 %	50 %	25 %	25 %	258509279
44019	NC_013198	GCA	2	6	2357813	2357818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509279
44020	NC_013198	A	6	6	2357879	2357884	100 %	0 %	0 %	0 %	258509279
44021	NC_013198	ATA	2	6	2358124	2358129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509279
44022	NC_013198	TAT	2	6	2358213	2358218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509279
44023	NC_013198	ACA	2	6	2358299	2358304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509279
44024	NC_013198	AAT	2	6	2358312	2358317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509279
44025	NC_013198	AT	3	6	2358329	2358334	50 %	50 %	0 %	0 %	258509279
44026	NC_013198	AAG	2	6	2358374	2358379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509279
44027	NC_013198	TTGA	2	8	2358421	2358428	25 %	50 %	25 %	0 %	258509279
44028	NC_013198	ACCA	2	8	2358490	2358497	50 %	0 %	0 %	50 %	258509279
44029	NC_013198	TTC	2	6	2358559	2358564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509280
44030	NC_013198	TTC	2	6	2358573	2358578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509280
44031	NC_013198	CTG	2	6	2358618	2358623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509280
44032	NC_013198	TCT	2	6	2358656	2358661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509280
44033	NC_013198	ACA	2	6	2358760	2358765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509280
44034	NC_013198	GA	3	6	2358790	2358795	50 %	0 %	50 %	0 %	258509280
44035	NC_013198	T	6	6	2358914	2358919	0 %	100 %	0 %	0 %	258509280
44036	NC_013198	TTTG	2	8	2358992	2358999	0 %	75 %	25 %	0 %	258509280
44037	NC_013198	T	7	7	2359036	2359042	0 %	100 %	0 %	0 %	258509280
44038	NC_013198	CTGC	2	8	2359190	2359197	0 %	25 %	25 %	50 %	258509280
44039	NC_013198	TCAT	2	8	2359408	2359415	25 %	50 %	0 %	25 %	258509280
44040	NC_013198	TAA	2	6	2359421	2359426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509280
44041	NC_013198	A	6	6	2359434	2359439	100 %	0 %	0 %	0 %	258509280
44042	NC_013198	CAT	2	6	2359634	2359639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509280
44043	NC_013198	ACC	2	6	2359690	2359695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509280
44044	NC_013198	ATC	2	6	2359776	2359781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509280
44045	NC_013198	AAC	2	6	2359825	2359830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509280
44046	NC_013198	ATC	2	6	2359887	2359892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509280
44047	NC_013198	AGA	2	6	2359945	2359950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509280
44048	NC_013198	GCGCTT	2	12	2359983	2359994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509280
44049	NC_013198	GGCA	2	8	2360025	2360032	25 %	0 %	50 %	25 %	258509280
44050	NC_013198	TGA	2	6	2360042	2360047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509280
44051	NC_013198	GTTA	2	8	2360105	2360112	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44052	NC_013198	ATTA	2	8	2360130	2360137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44053	NC_013198	TATC	2	8	2360158	2360165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44054	NC_013198	ACT	2	6	2360243	2360248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44055	NC_013198	A	6	6	2360266	2360271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44056	NC_013198	AT	3	6	2360279	2360284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44057	NC_013198	A	8	8	2360379	2360386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44058	NC_013198	ATT	2	6	2360396	2360401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44059	NC_013198	TCA	2	6	2360416	2360421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44060	NC_013198	A	6	6	2360424	2360429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44061	NC_013198	CCA	2	6	2360435	2360440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44062	NC_013198	T	6	6	2360464	2360469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44063	NC_013198	A	6	6	2360510	2360515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44064	NC_013198	CAA	2	6	2360537	2360542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44065	NC_013198	CAT	2	6	2360834	2360839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509281
44066	NC_013198	CTT	3	9	2360855	2360863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509281
44067	NC_013198	AAT	2	6	2360899	2360904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509281
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44070	NC_013198	TTC	2	6	2361130	2361135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509281
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44072	NC_013198	GTA	2	6	2361156	2361161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509281
44073	NC_013198	CTT	2	6	2361309	2361314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509281
44074	NC_013198	CGC	2	6	2361333	2361338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509281
44075	NC_013198	CG	3	6	2361386	2361391	0 %	0 %	50 %	50 %	258509281
44076	NC_013198	TAA	2	6	2361398	2361403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509281
44077	NC_013198	ATC	2	6	2361414	2361419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509281
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44080	NC_013198	GTA	2	6	2361576	2361581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509281
44081	NC_013198	ACC	2	6	2361634	2361639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509281
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44084	NC_013198	TAA	2	6	2361773	2361778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509281
44085	NC_013198	GCC	2	6	2361781	2361786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509281
44086	NC_013198	AGC	2	6	2361813	2361818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509281
44087	NC_013198	GCT	3	9	2361863	2361871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509281
44088	NC_013198	CCG	2	6	2361887	2361892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509281
44089	NC_013198	TGT	2	6	2361918	2361923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509281
44090	NC_013198	CGTGTT	2	12	2361945	2361956	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	258509281
44091	NC_013198	CTTA	2	8	2362005	2362012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44092	NC_013198	CGA	2	6	2362075	2362080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44093	NC_013198	CAA	2	6	2362106	2362111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44094	NC_013198	AAT	2	6	2362118	2362123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44095	NC_013198	CAA	2	6	2362131	2362136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44096	NC_013198	GTC	2	6	2362137	2362142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44097	NC_013198	GCA	2	6	2362160	2362165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509282
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44099	NC_013198	ATA	2	6	2362315	2362320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509282
44100	NC_013198	A	6	6	2362478	2362483	100 %	0 %	0 %	0 %	258509282
44101	NC_013198	CGG	2	6	2362524	2362529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509282
44102	NC_013198	TCA	2	6	2362652	2362657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509282
44103	NC_013198	AAAAGA	2	12	2362740	2362751	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44104	NC_013198	AATG	2	8	2362783	2362790	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44105	NC_013198	TGCT	2	8	2362873	2362880	0 %	50 %	25 %	25 %	258509283
44106	NC_013198	TCAT	2	8	2362902	2362909	25 %	50 %	0 %	25 %	258509283
44107	NC_013198	CTT	2	6	2362949	2362954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509283
44108	NC_013198	GAT	2	6	2362970	2362975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509283
44109	NC_013198	CAT	2	6	2363120	2363125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509283
44110	NC_013198	TGG	2	6	2363126	2363131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509283
44111	NC_013198	CAA	2	6	2363197	2363202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509283
44112	NC_013198	CAG	2	6	2363221	2363226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509283
44113	NC_013198	CTG	2	6	2363309	2363314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509283
44114	NC_013198	TCG	2	6	2363364	2363369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509283
44115	NC_013198	CTT	2	6	2363407	2363412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509283
44116	NC_013198	AGC	2	6	2363447	2363452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509283
44117	NC_013198	T	6	6	2363471	2363476	0 %	100 %	0 %	0 %	258509283
44118	NC_013198	TCC	2	6	2363492	2363497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44119	NC_013198	CTTCGA	2	12	2363584	2363595	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258509284
44120	NC_013198	GAGC	2	8	2363604	2363611	25 %	0 %	50 %	25 %	258509284
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44122	NC_013198	GTTCG	2	10	2363726	2363735	0 %	40 %	40 %	20 %	258509284
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44237	NC_013198	CGG	2	6	2369376	2369381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509288
44238	NC_013198	CAT	2	6	2369383	2369388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509288
44239	NC_013198	TCT	2	6	2369402	2369407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509288
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44241	NC_013198	AGC	2	6	2369542	2369547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509288
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44243	NC_013198	CTT	2	6	2369620	2369625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509288
44244	NC_013198	CCT	2	6	2369685	2369690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44245	NC_013198	TGA	2	6	2369702	2369707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509289
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44307	NC_013198	TTTC	2	8	2372832	2372839	0 %	75 %	0 %	25 %	258509291
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44311	NC_013198	A	6	6	2373039	2373044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44342	NC_013198	GAAT	2	8	2374499	2374506	50 %	25 %	25 %	0 %	258509293
44343	NC_013198	GAC	2	6	2374582	2374587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509293
44344	NC_013198	CCGC	2	8	2374611	2374618	0 %	0 %	25 %	75 %	258509293
44345	NC_013198	GCT	2	6	2374658	2374663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509293
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44349	NC_013198	TGAT	2	8	2374985	2374992	25 %	50 %	25 %	0 %	258509294
44350	NC_013198	TCT	2	6	2375032	2375037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509294
44351	NC_013198	TCT	2	6	2375047	2375052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509294
44352	NC_013198	TTC	4	12	2375075	2375086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509294
44353	NC_013198	AAC	2	6	2375090	2375095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509294
44354	NC_013198	ATC	2	6	2375111	2375116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509294
44355	NC_013198	CTG	2	6	2375127	2375132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509294
44356	NC_013198	GTT	2	6	2375137	2375142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509294
44357	NC_013198	CTG	2	6	2375206	2375211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509294
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44371	NC_013198	GTG	2	6	2375840	2375845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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44437	NC_013198	TTGA	2	8	2379079	2379086	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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44454	NC_013198	ACTT	2	8	2380397	2380404	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44455	NC_013198	GAT	2	6	2380523	2380528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44456	NC_013198	TG	3	6	2380543	2380548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44457	NC_013198	ACGC	2	8	2380592	2380599	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44458	NC_013198	TCG	2	6	2380603	2380608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44459	NC_013198	TCA	2	6	2380622	2380627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44460	NC_013198	TAA	2	6	2380664	2380669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44461	NC_013198	GGT	2	6	2380679	2380684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44462	NC_013198	GTTGCA	2	12	2380722	2380733	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44463	NC_013198	AT	3	6	2380829	2380834	50 %	50 %	0 %	0 %	258509301
44464	NC_013198	CTG	2	6	2380839	2380844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509301
44465	NC_013198	GC	3	6	2380878	2380883	0 %	0 %	50 %	50 %	258509301
44466	NC_013198	TGA	2	6	2380915	2380920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509301
44467	NC_013198	TGAGC	2	10	2380987	2380996	20 %	20 %	40 %	20 %	258509301
44468	NC_013198	GC	3	6	2381005	2381010	0 %	0 %	50 %	50 %	258509301
44469	NC_013198	AC	3	6	2381146	2381151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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44471	NC_013198	ATT	2	6	2381243	2381248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44499	NC_013198	ATAC	2	8	2382462	2382469	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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