MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 56093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
39501	NC_013198	ATG	2	6	2121749	2121754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509063
39502	NC_013198	CGATTT	2	12	2121756	2121767	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	258509063
39503	NC_013198	T	6	6	2121765	2121770	0 %	100 %	0 %	0 %	258509063
39504	NC_013198	GTC	2	6	2121785	2121790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509063
39505	NC_013198	GAAC	2	8	2121806	2121813	50 %	0 %	25 %	25 %	258509063
39506	NC_013198	ATG	2	6	2121859	2121864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509063
39507	NC_013198	ATA	2	6	2122002	2122007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39508	NC_013198	ACTA	2	8	2122026	2122033	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39509	NC_013198	AAGTGT	2	12	2122040	2122051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39510	NC_013198	GGCTGG	2	12	2122115	2122126	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
39511	NC_013198	GTG	2	6	2122143	2122148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39512	NC_013198	CAC	2	6	2122236	2122241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39513	NC_013198	AAC	2	6	2122290	2122295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39514	NC_013198	CCAA	2	8	2122357	2122364	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39515	NC_013198	A	6	6	2122363	2122368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39516	NC_013198	CGCT	2	8	2122388	2122395	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39517	NC_013198	TCA	2	6	2122417	2122422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39518	NC_013198	CGA	2	6	2122486	2122491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509064
39519	NC_013198	TGA	2	6	2122531	2122536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509064
39520	NC_013198	AAT	2	6	2122642	2122647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258509064
39521	NC_013198	CCGCAG	2	12	2122750	2122761	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258509064
39522	NC_013198	TGG	3	9	2122939	2122947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509064
39523	NC_013198	GTT	2	6	2123025	2123030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509064
39524	NC_013198	GAT	2	6	2123059	2123064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509064
39525	NC_013198	CGGC	2	8	2123085	2123092	0 %	0 %	50 %	50 %	258509064
39526	NC_013198	ATCA	2	8	2123135	2123142	50 %	25 %	0 %	25 %	258509064
39527	NC_013198	TGC	2	6	2123160	2123165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509065
39528	NC_013198	TGT	2	6	2123170	2123175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509065
39529	NC_013198	GGT	2	6	2123209	2123214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258509065
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39531	NC_013198	GTTT	2	8	2123269	2123276	0 %	75 %	25 %	0 %	258509065
39532	NC_013198	TGT	2	6	2123288	2123293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509065
39533	NC_013198	CAT	2	6	2123337	2123342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509065
39534	NC_013198	GCCGAC	2	12	2123391	2123402	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258509065
39535	NC_013198	CAT	2	6	2123451	2123456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509065
39536	NC_013198	GCACC	2	10	2123588	2123597	20 %	0 %	20 %	60 %	258509065
39537	NC_013198	AACCGT	2	12	2123618	2123629	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258509065
39538	NC_013198	CAGG	2	8	2123664	2123671	25 %	0 %	50 %	25 %	258509065
39539	NC_013198	TGC	2	6	2123723	2123728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509065
39540	NC_013198	CCG	2	6	2123831	2123836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509065
39541	NC_013198	TGT	2	6	2123849	2123854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509065
39542	NC_013198	GCG	2	6	2124036	2124041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509065
39543	NC_013198	GTC	2	6	2124177	2124182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509065
39544	NC_013198	AAAT	2	8	2124191	2124198	75 %	25 %	0 %	0 %	258509065
39545	NC_013198	GATT	2	8	2124257	2124264	25 %	50 %	25 %	0 %	258509065
39546	NC_013198	TGT	2	6	2124267	2124272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509065
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39555	NC_013198	CGG	2	6	2124729	2124734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509066
39556	NC_013198	CGGC	2	8	2124741	2124748	0 %	0 %	50 %	50 %	258509066
39557	NC_013198	TCA	2	6	2124754	2124759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509066
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39567	NC_013198	TTG	2	6	2125548	2125553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509067
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39569	NC_013198	TTAT	2	8	2125639	2125646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39570	NC_013198	T	7	7	2125749	2125755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39571	NC_013198	TCAAA	2	10	2125802	2125811	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39572	NC_013198	AGG	2	6	2125813	2125818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39573	NC_013198	GGCA	2	8	2125881	2125888	25 %	0 %	50 %	25 %	258509068
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39578	NC_013198	GAA	3	9	2126063	2126071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509068
39579	NC_013198	AAGTTG	2	12	2126123	2126134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509068
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39581	NC_013198	CGA	2	6	2126158	2126163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509068
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39585	NC_013198	A	7	7	2126331	2126337	100 %	0 %	0 %	0 %	258509068
39586	NC_013198	CTAAT	2	10	2126407	2126416	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39587	NC_013198	CATCT	2	10	2126435	2126444	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39588	NC_013198	ATTC	2	8	2126510	2126517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39589	NC_013198	GCCA	2	8	2126623	2126630	25 %	0 %	25 %	50 %	258509069
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39591	NC_013198	GAT	2	6	2126658	2126663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509069
39592	NC_013198	TAG	2	6	2126677	2126682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509069
39593	NC_013198	TGCG	2	8	2126695	2126702	0 %	25 %	50 %	25 %	258509069
39594	NC_013198	CGG	2	6	2126715	2126720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509069
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39598	NC_013198	ATT	2	6	2126921	2126926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509070
39599	NC_013198	CAA	2	6	2126976	2126981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258509070
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39601	NC_013198	GCG	2	6	2127018	2127023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509070
39602	NC_013198	ACG	2	6	2127091	2127096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509070
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39604	NC_013198	ACGC	2	8	2127159	2127166	25 %	0 %	25 %	50 %	258509070
39605	NC_013198	CAT	2	6	2127359	2127364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509070
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39608	NC_013198	GCC	2	6	2127512	2127517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509070
39609	NC_013198	TGC	2	6	2127568	2127573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509070
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39611	NC_013198	TCA	2	6	2127727	2127732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509070
39612	NC_013198	GAA	2	6	2127762	2127767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258509070
39613	NC_013198	GCG	3	9	2127806	2127814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258509070
39614	NC_013198	ACC	2	6	2127859	2127864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509070
39615	NC_013198	TGA	2	6	2127895	2127900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509070
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39970	NC_013198	TTG	2	6	2147388	2147393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258509083
39971	NC_013198	CGC	2	6	2147412	2147417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509083
39972	NC_013198	TCA	2	6	2147482	2147487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509083
39973	NC_013198	CAT	2	6	2147513	2147518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509083
39974	NC_013198	CG	3	6	2147639	2147644	0 %	0 %	50 %	50 %	258509083
39975	NC_013198	GTC	2	6	2147683	2147688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509083
39976	NC_013198	TTA	2	6	2147701	2147706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258509083
39977	NC_013198	GCT	2	6	2147723	2147728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509083
39978	NC_013198	TG	3	6	2147784	2147789	0 %	50 %	50 %	0 %	258509083
39979	NC_013198	TGA	2	6	2147804	2147809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509083
39980	NC_013198	ATC	2	6	2147820	2147825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509083
39981	NC_013198	ATG	2	6	2147830	2147835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258509083
39982	NC_013198	GCC	2	6	2147850	2147855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509083
39983	NC_013198	GAA	2	6	2147917	2147922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39984	NC_013198	CCG	2	6	2147932	2147937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39985	NC_013198	TCA	2	6	2147939	2147944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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39988	NC_013198	CTG	2	6	2148018	2148023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509084
39989	NC_013198	GTC	2	6	2148107	2148112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509084
39990	NC_013198	TCA	2	6	2148159	2148164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509084
39991	NC_013198	CAG	2	6	2148190	2148195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258509084
39992	NC_013198	ACCTT	2	10	2148308	2148317	20 %	40 %	0 %	40 %	258509084
39993	NC_013198	ACC	2	6	2148490	2148495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258509084
39994	NC_013198	TGC	2	6	2148598	2148603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258509084
39995	NC_013198	CGC	2	6	2148606	2148611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509084
39996	NC_013198	CG	3	6	2148646	2148651	0 %	0 %	50 %	50 %	258509084
39997	NC_013198	CCCAT	2	10	2148653	2148662	20 %	20 %	0 %	60 %	258509084
39998	NC_013198	CCG	2	6	2148725	2148730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258509084
39999	NC_013198	TCA	2	6	2148803	2148808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258509084
40000	NC_013198	TCT	2	6	2148819	2148824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258509084

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