MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 56093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_013198	TAAA	2	8	1050375	1050382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19502	NC_013198	T	6	6	1050494	1050499	0 %	100 %	0 %	0 %	258508029
19503	NC_013198	TAA	2	6	1050521	1050526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258508029
19504	NC_013198	CAGC	2	8	1050529	1050536	25 %	0 %	25 %	50 %	258508029
19505	NC_013198	CGA	2	6	1050677	1050682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508029
19506	NC_013198	ATA	2	6	1050710	1050715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258508029
19507	NC_013198	TAA	2	6	1050910	1050915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258508029
19508	NC_013198	ATA	2	6	1050953	1050958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258508029
19509	NC_013198	TCC	2	6	1050962	1050967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258508030
19510	NC_013198	TTGA	2	8	1050968	1050975	25 %	50 %	25 %	0 %	258508030
19511	NC_013198	GC	3	6	1050991	1050996	0 %	0 %	50 %	50 %	258508030
19512	NC_013198	AAC	2	6	1051190	1051195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508030
19513	NC_013198	TGA	2	6	1051211	1051216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19514	NC_013198	CA	3	6	1051246	1051251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19515	NC_013198	CAA	2	6	1051277	1051282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19516	NC_013198	GCT	2	6	1051292	1051297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19517	NC_013198	ATTT	2	8	1051333	1051340	25 %	75 %	0 %	0 %	258508031
19518	NC_013198	CA	3	6	1051371	1051376	50 %	0 %	0 %	50 %	258508031
19519	NC_013198	TG	3	6	1051386	1051391	0 %	50 %	50 %	0 %	258508031
19520	NC_013198	GCG	2	6	1051427	1051432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508031
19521	NC_013198	TGC	2	6	1051473	1051478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508031
19522	NC_013198	TGATA	2	10	1051497	1051506	40 %	40 %	20 %	0 %	258508031
19523	NC_013198	AGCG	2	8	1051564	1051571	25 %	0 %	50 %	25 %	258508031
19524	NC_013198	TCT	2	6	1052080	1052085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508031
19525	NC_013198	TGA	2	6	1052146	1052151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508031
19526	NC_013198	CAA	2	6	1052179	1052184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508031
19527	NC_013198	TCA	2	6	1052248	1052253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19528	NC_013198	TAC	2	6	1052255	1052260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19529	NC_013198	GTT	2	6	1052271	1052276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19530	NC_013198	TGATG	2	10	1052334	1052343	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19531	NC_013198	TGG	2	6	1052410	1052415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508032
19532	NC_013198	GTT	2	6	1052425	1052430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508032
19533	NC_013198	TTGA	2	8	1052432	1052439	25 %	50 %	25 %	0 %	258508032
19534	NC_013198	CAG	2	6	1052452	1052457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508032
19535	NC_013198	AATC	2	8	1052473	1052480	50 %	25 %	0 %	25 %	258508032
19536	NC_013198	TCAA	2	8	1052574	1052581	50 %	25 %	0 %	25 %	258508032
19537	NC_013198	CCG	2	6	1052614	1052619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258508032
19538	NC_013198	GCT	2	6	1052733	1052738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508032
19539	NC_013198	ATG	2	6	1052760	1052765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508032
19540	NC_013198	GC	3	6	1052787	1052792	0 %	0 %	50 %	50 %	258508032
19541	NC_013198	GGT	2	6	1052879	1052884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508032
19542	NC_013198	ACA	2	6	1053001	1053006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508032
19543	NC_013198	TGATA	2	10	1053046	1053055	40 %	40 %	20 %	0 %	258508032
19544	NC_013198	GAC	2	6	1053077	1053082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508032
19545	NC_013198	TGG	2	6	1053170	1053175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508032
19546	NC_013198	CAC	2	6	1053176	1053181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258508032
19547	NC_013198	CGATGA	2	12	1053280	1053291	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258508032
19548	NC_013198	ATA	2	6	1053321	1053326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258508032
19549	NC_013198	C	6	6	1053339	1053344	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19550	NC_013198	CTCAAT	2	12	1053366	1053377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508033
19551	NC_013198	GAC	2	6	1053400	1053405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508033
19552	NC_013198	GCG	2	6	1053417	1053422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508033
19553	NC_013198	TCA	2	6	1053461	1053466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508033
19554	NC_013198	TAATGA	2	12	1053476	1053487	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	258508033
19555	NC_013198	ATTG	2	8	1053595	1053602	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19556	NC_013198	TGAA	2	8	1053656	1053663	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19557	NC_013198	AGAA	2	8	1053682	1053689	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19558	NC_013198	A	6	6	1053688	1053693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19559	NC_013198	GT	4	8	1053830	1053837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19560	NC_013198	GCTCAC	2	12	1053972	1053983	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19561	NC_013198	TGT	2	6	1054000	1054005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19562	NC_013198	GAC	2	6	1054015	1054020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508034
19563	NC_013198	TTAT	2	8	1054024	1054031	25 %	75 %	0 %	0 %	258508034
19564	NC_013198	ATCGGC	2	12	1054042	1054053	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258508034
19565	NC_013198	GGC	3	9	1054051	1054059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508034
19566	NC_013198	TGG	2	6	1054110	1054115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508034
19567	NC_013198	CTG	2	6	1054116	1054121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508034
19568	NC_013198	AGC	2	6	1054212	1054217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508034
19569	NC_013198	GCA	2	6	1054296	1054301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508034
19570	NC_013198	AGC	2	6	1054364	1054369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508034
19571	NC_013198	TTA	2	6	1054430	1054435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258508034
19572	NC_013198	CAA	2	6	1054500	1054505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508034
19573	NC_013198	ATC	2	6	1054510	1054515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508034
19574	NC_013198	GGT	2	6	1054553	1054558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508034
19575	NC_013198	CTG	2	6	1054609	1054614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508034
19576	NC_013198	GGC	2	6	1054620	1054625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508034
19577	NC_013198	AGC	2	6	1054682	1054687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508034
19578	NC_013198	GCA	2	6	1054705	1054710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508034
19579	NC_013198	ACC	2	6	1054738	1054743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19580	NC_013198	A	6	6	1054868	1054873	100 %	0 %	0 %	0 %	258508035
19581	NC_013198	TAC	2	6	1054958	1054963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508035
19582	NC_013198	GAT	2	6	1055003	1055008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508035
19583	NC_013198	CAA	2	6	1055014	1055019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508035
19584	NC_013198	CAT	2	6	1055023	1055028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508035
19585	NC_013198	ATG	2	6	1055052	1055057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508035
19586	NC_013198	GCA	2	6	1055071	1055076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508035
19587	NC_013198	A	6	6	1055113	1055118	100 %	0 %	0 %	0 %	258508035
19588	NC_013198	A	6	6	1055147	1055152	100 %	0 %	0 %	0 %	258508035
19589	NC_013198	GCTCAC	2	12	1055476	1055487	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19590	NC_013198	A	7	7	1055491	1055497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19591	NC_013198	GTAG	2	8	1055559	1055566	25 %	25 %	50 %	0 %	258508037
19592	NC_013198	TCT	2	6	1055569	1055574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508037
19593	NC_013198	ATC	2	6	1055604	1055609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508037
19594	NC_013198	TCA	2	6	1055758	1055763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508037
19595	NC_013198	TGA	3	9	1055836	1055844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508037
19596	NC_013198	GTG	2	6	1055847	1055852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508037
19597	NC_013198	A	6	6	1055878	1055883	100 %	0 %	0 %	0 %	258508037
19598	NC_013198	TTTAG	2	10	1055938	1055947	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19599	NC_013198	GTG	2	6	1055956	1055961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19600	NC_013198	AAT	2	6	1055988	1055993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19601	NC_013198	GTGA	2	8	1056056	1056063	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19602	NC_013198	GC	3	6	1056182	1056187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19603	NC_013198	AGG	2	6	1056202	1056207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19604	NC_013198	GGAT	2	8	1056243	1056250	25 %	25 %	50 %	0 %	258508038
19605	NC_013198	GCG	2	6	1056273	1056278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258508038
19606	NC_013198	TCA	2	6	1056317	1056322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508038
19607	NC_013198	TTG	2	6	1056484	1056489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258508038
19608	NC_013198	CTT	2	6	1056553	1056558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508038
19609	NC_013198	AGC	2	6	1056572	1056577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508038
19610	NC_013198	CAT	3	9	1056624	1056632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508038
19611	NC_013198	TTC	2	6	1056668	1056673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258508038
19612	NC_013198	T	6	6	1056686	1056691	0 %	100 %	0 %	0 %	258508038
19613	NC_013198	GGT	2	6	1056732	1056737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508038
19614	NC_013198	TATT	2	8	1056755	1056762	25 %	75 %	0 %	0 %	258508038
19615	NC_013198	GTG	2	6	1056832	1056837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258508038
19616	NC_013198	GC	3	6	1056855	1056860	0 %	0 %	50 %	50 %	258508038
19617	NC_013198	AAC	2	6	1056902	1056907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258508038
19618	NC_013198	TGC	2	6	1056965	1056970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258508038
19619	NC_013198	GAT	2	6	1056993	1056998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508038
19620	NC_013198	GAAGCA	2	12	1057035	1057046	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	258508038
19621	NC_013198	TCA	2	6	1057121	1057126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508038
19622	NC_013198	GGA	2	6	1057213	1057218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19623	NC_013198	AGC	2	6	1057295	1057300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508039
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19631	NC_013198	CG	3	6	1057965	1057970	0 %	0 %	50 %	50 %	258508039
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19648	NC_013198	ATC	2	6	1058807	1058812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258508040
19649	NC_013198	GAT	2	6	1058845	1058850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258508040
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19654	NC_013198	GCTCAC	2	12	1059065	1059076	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258508041
19655	NC_013198	GC	3	6	1059179	1059184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19656	NC_013198	GCA	2	6	1059250	1059255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258508042
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19859	NC_013198	TCA	2	6	1069463	1069468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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