MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 56093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_013198	TGA	2	6	639801	639806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507621
12003	NC_013198	TGG	2	6	639814	639819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507621
12004	NC_013198	GTT	2	6	639829	639834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507621
12005	NC_013198	AGGT	2	8	639843	639850	25 %	25 %	50 %	0 %	258507621
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12007	NC_013198	CATG	2	8	639988	639995	25 %	25 %	25 %	25 %	258507622
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12012	NC_013198	TCA	2	6	640176	640181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507622
12013	NC_013198	GAC	2	6	640190	640195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507622
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12015	NC_013198	CAT	2	6	640267	640272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507622
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12121	NC_013198	TGA	2	6	646211	646216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507628
12122	NC_013198	CAT	2	6	646224	646229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507628
12123	NC_013198	GCC	2	6	646264	646269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507628
12124	NC_013198	CGC	2	6	646289	646294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507628
12125	NC_013198	AAGA	2	8	646296	646303	75 %	0 %	25 %	0 %	258507628
12126	NC_013198	CCAC	2	8	646367	646374	25 %	0 %	0 %	75 %	258507628
12127	NC_013198	AGA	2	6	646400	646405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507628
12128	NC_013198	A	6	6	646456	646461	100 %	0 %	0 %	0 %	258507628
12129	NC_013198	AAACC	2	10	646479	646488	60 %	0 %	0 %	40 %	258507628
12130	NC_013198	TCAT	2	8	646543	646550	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12131	NC_013198	ACG	2	6	646588	646593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12133	NC_013198	A	7	7	646673	646679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12134	NC_013198	TA	3	6	646697	646702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12135	NC_013198	GAT	2	6	646718	646723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12137	NC_013198	A	6	6	646785	646790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12138	NC_013198	CAA	3	9	646795	646803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12139	NC_013198	TCA	2	6	646839	646844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12142	NC_013198	CGC	2	6	647106	647111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507629
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12149	NC_013198	A	6	6	647921	647926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12150	NC_013198	GTT	2	6	647977	647982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12162	NC_013198	GGT	2	6	648532	648537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507630
12163	NC_013198	CATTCG	2	12	648566	648577	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	258507630
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12184	NC_013198	GTC	2	6	649866	649871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12221	NC_013198	T	6	6	651890	651895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12222	NC_013198	AGGA	2	8	651967	651974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12223	NC_013198	TTA	2	6	652003	652008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507634
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12231	NC_013198	ATT	2	6	652430	652435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507634
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12234	NC_013198	CAG	2	6	652678	652683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507634
12235	NC_013198	GATTA	2	10	652728	652737	40 %	40 %	20 %	0 %	258507634
12236	NC_013198	TCGC	2	8	652757	652764	0 %	25 %	25 %	50 %	258507634
12237	NC_013198	AGC	2	6	652803	652808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12238	NC_013198	TAA	2	6	652835	652840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507635
12239	NC_013198	CAC	2	6	652860	652865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507635
12240	NC_013198	GCGATT	2	12	652914	652925	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258507635
12241	NC_013198	AGC	2	6	652953	652958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507635
12242	NC_013198	TGC	2	6	652970	652975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507635
12243	NC_013198	GGC	2	6	652977	652982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507635
12244	NC_013198	TGA	2	6	653182	653187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507635
12245	NC_013198	GAT	2	6	653205	653210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507635
12246	NC_013198	GTT	2	6	653261	653266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507635
12247	NC_013198	TCA	2	6	653362	653367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507635
12248	NC_013198	CACG	2	8	653405	653412	25 %	0 %	25 %	50 %	258507635
12249	NC_013198	CGT	2	6	653489	653494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507635
12250	NC_013198	TTAC	2	8	653501	653508	25 %	50 %	0 %	25 %	258507635
12251	NC_013198	GTT	2	6	653546	653551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507635
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12254	NC_013198	CAA	2	6	653618	653623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507635
12255	NC_013198	AGG	2	6	653645	653650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258507635
12256	NC_013198	GTG	2	6	653835	653840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507636
12257	NC_013198	ATGG	2	8	653854	653861	25 %	25 %	50 %	0 %	258507636
12258	NC_013198	TAC	2	6	653921	653926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507636
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12261	NC_013198	TGA	2	6	654231	654236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507636
12262	NC_013198	GCA	2	6	654303	654308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12263	NC_013198	A	6	6	654410	654415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12264	NC_013198	CGA	2	6	654433	654438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12265	NC_013198	ACG	2	6	654509	654514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507637
12266	NC_013198	TG	3	6	654573	654578	0 %	50 %	50 %	0 %	258507637
12267	NC_013198	CGT	2	6	654643	654648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507637
12268	NC_013198	CA	3	6	654881	654886	50 %	0 %	0 %	50 %	258507637
12269	NC_013198	GCA	2	6	654965	654970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507637
12270	NC_013198	TCT	2	6	655226	655231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507638
12271	NC_013198	TTG	2	6	655281	655286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507638
12272	NC_013198	CCCAA	2	10	655304	655313	40 %	0 %	0 %	60 %	258507638
12273	NC_013198	TCA	2	6	655327	655332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507638
12274	NC_013198	CCG	2	6	655389	655394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507638
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12277	NC_013198	ATCGT	2	10	655600	655609	20 %	40 %	20 %	20 %	258507638
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12280	NC_013198	GC	3	6	655718	655723	0 %	0 %	50 %	50 %	258507638
12281	NC_013198	CAT	2	6	655778	655783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507638
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12290	NC_013198	AAGT	2	8	656164	656171	50 %	25 %	25 %	0 %	258507638
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12293	NC_013198	CAT	3	9	656441	656449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507638
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12300	NC_013198	TCAA	2	8	656905	656912	50 %	25 %	0 %	25 %	258507638
12301	NC_013198	GCT	2	6	656935	656940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507638
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12304	NC_013198	ATG	2	6	657081	657086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12305	NC_013198	GAAT	2	8	657108	657115	50 %	25 %	25 %	0 %	258507639
12306	NC_013198	CTTG	2	8	657120	657127	0 %	50 %	25 %	25 %	258507639
12307	NC_013198	GTG	2	6	657128	657133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507639
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12315	NC_013198	TGA	2	6	657495	657500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507639
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12336	NC_013198	AGT	2	6	658717	658722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12337	NC_013198	TA	3	6	658728	658733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12338	NC_013198	ATA	2	6	658735	658740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12339	NC_013198	AT	3	6	658779	658784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12340	NC_013198	AATT	2	8	658851	658858	50 %	50 %	0 %	0 %	258507640
12341	NC_013198	T	7	7	658857	658863	0 %	100 %	0 %	0 %	258507640
12342	NC_013198	GGTTG	2	10	658965	658974	0 %	40 %	60 %	0 %	258507640
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12347	NC_013198	GCC	2	6	659184	659189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507640
12348	NC_013198	CCA	2	6	659202	659207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507640
12349	NC_013198	GCA	2	6	659252	659257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507640
12350	NC_013198	GCA	2	6	659263	659268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507640
12351	NC_013198	ATC	2	6	659286	659291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507640
12352	NC_013198	TGCG	2	8	659342	659349	0 %	25 %	50 %	25 %	258507640
12353	NC_013198	CGG	3	9	659414	659422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507640
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12357	NC_013198	ATG	2	6	659566	659571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507640
12358	NC_013198	CCT	2	6	659573	659578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12359	NC_013198	ATGT	2	8	659718	659725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12361	NC_013198	ATT	2	6	659816	659821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12484	NC_013198	T	6	6	666299	666304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12485	NC_013198	CAAA	2	8	666318	666325	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12486	NC_013198	A	6	6	666359	666364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12487	NC_013198	TAAAA	2	10	666404	666413	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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